Dokuya özgü kopyalama faktörleri, memelilerde çeşitli hücresel işlevlere katkıda bulunur. Örneğin, hemoglobinin önemli bir bileşeni olan beta globin geni, vücudun tüm hücrelerinde mevcuttur. Bununla birlikte, beta globin geninin promoter sekanslarına bağlanabilen transkripsiyon faktörleri gibi sadece bu hücrelerde eksprese edildiğinden, sadece kırmızı kan hücrelerinde eksprese edilir. Dokuya özgü transkripsiyon faktörleri ayrıca, bu faktörlerdeki mutasyonların, tüm organizmayı etkilemeden yalnızca belirli dokuların veya vücut parçalarının işlevini bozabilmesini sağlar.
Kombinatoryal kontrol uygulayan ökaryotlarda transkripsiyon faktörleri tarafından ek bir karmaşıklık katmanı eklenir. Bu, birkaç transkripsiyon faktörü tarafından sağlanan girdinin, tek bir genin ekspresyonunu eşzamanlı olarak düzenlediği anlamına gelir. Çeşitli transkripsiyonel aktivatörlerin ve baskılayıcıların kombinasyonu, bir genin farklı şekilde düzenlenmesini ve ek genlere ihtiyaç duymadan çeşitli çevresel değişikliklere adapte olmasını sağlar.
