تحتوي البروتينات البسيطة ومركبات البروتين على أحماض أمينية فقط. وعلى النقيض من ذلك ، فإن العديد من البروتينات الأخرى ، التي تسمى البروتينات المترافقة ، ترتبط تساهميًا مع شقوق غير بروتينية.
البروتينات النووية عبارة عن مجمعات بروتينية تحتوي على أحماض نووية ، مصنفة على أنها بروتينات نووي ريبونية منزوعة الأكسجين (DNPs) أو بروتينات نووية ريبية (RNPs) على التوالي. يعتبر النوكليوسوم مثالًا نموذجيًا على DNP حيث يرتبط الحمض النووي ببروتينات هيستون. المستضد الرئيسي لفيروس Covid-19 SARS-CoV هو RNP وهو أمر بالغ الأهمية لتكاثر جينوم الفيروس.
البروتينات السكرية هي بروتينات مترافقة توجد عادةً على سطح الخلايا. تتكون سلسلة الكربوهيدرات القصيرة الخاصة بهم من بقايا السكر التي تخرج للخارج من الخلية. يعد مجال الكربوهيدرات ضروريًا لالتصاق الخلايا الخلوية والتعرف الخلوي ونقل الإشارة.
البروتينات الدهنية عبارة عن بروتينات مقترنة بقشرة بروتينية فوق نواة دهنية تحتوي على الكوليسترول أو الدهون الثلاثية أو كليهما. تسهل البروتينات الدهنية للثدييات النقل الجماعي للدهون غير القابلة للذوبان بين مواقع تركيبها في الكبد إلى خلايا أخرى. هناك عدة أنواع من البروتينات الدهنية مصنفة حسب كثافتها. عندما تصبح كمية واحد أو أكثر من البروتينات الدهنية عالية جدًا ، يصبح جزء من المركب غير قابل للذوبان. يمكن للبروتينات الدهنية غير القابلة للذوبان أن تترسب وتسد الشريان التاجي ، مما يؤدي إلى سكتة دماغية أو نوبة قلبية.
تتضمن بعض أنواع البروتينات المترافقة الأخرى البروتينات الفوسفاتية والبروتينات الدموية والبروتينات الفلافوبروتينات المعدنية والبروتينات النباتية والكرومات السيتوكرومية والأوبسين. الهيموغلوبين ، المسؤول عن نقل الأكسجين في الأوعية الدموية ، هو بروتين مترافق يحتوي على الحديد في مجموعته الاصطناعية الهيم.
