Les protéines intrinsèquement désordonnées sont un groupe de protéine qui ne se replie pas dans des structures tridimensionnelles spécifiques. Leur flexibilité structurelle leur permet de compléter des protéines ordonnées pour exécuter des fonctions inaccessibles aux structures rigides. Elles sont plus fréquentes chez les eucaryotes que chez les procaryotes et peuvent être exclusivement des protéines intrinsèquement désordonnées ou hybrides, constitués d’un mélange de régions ordonnées et désordonnées. L’absence d’une structure rigide dans ces protéines peut être attribuée à une abondance de résidus d’acides aminés polaires et chargés et relativement moins d’acides aminés hydrophobes, promouvant une structure ordonnée.
Plusieurs facteurs influencent la forme et le niveau de désordre dans une protéine, tels que le pH et la température. De plus, d’autres protéines auxquelles elles se lient ou auxquelles elles s’associent peuvent également influencer leur forme. Cette liaison peut se produire à travers de multiples sites de liaison et peut entraîner le repliement permanent ou temporaire d’une protéine ou d’une région intrinsèquement désordonnée. Des modifications structurelles sont apportées en raison de caractéristiques de reconnaissance moléculaire : fragments de protéines désordonnées pouvant facilement subir des transitions de désordre à ordre lors de la liaison à d’autres protéines avec des structures définies.
Les modifications post-traductionnelles pendant ou après la synthèse des protéines contribuent également à la structure des protéines intrinsèquement désordonnées. Celles-ci pourraient inclure le clivage enzymatique d’une liaison peptidique dans la protéine précurseur, la formation de liaisons disulfure et des modifications covalentes de protéines avec d’autres molécules ou groupes chimiques.
