Подобно фотосистеме II, в фотосистеме I, фотоны также поглощаются молекулами пигмента в светособирающем комплексе, чтобы связать энергию с центром реакции и после окисления, высокоэнергетический электрон передаётся к первичному электронному акцептору. Однако на этот раз, отсутствующие электроны у пары хлорофилла А заменены электронами, перемещающимися из фотосистемы II через электронную транспортную цепь. Из молекулы носителя, пластохинона, к белку, цитохромному комплексу, и к другому белку, пластоцианину.Энергия, высвобождаемая в результате этого процесса, используется для закачивания протонов в тилакоидное пространство через цитохромный комплекс, создавая градиент протонов, который генерирует ATФ через хемиосмос. После прохождения электрона через этот центр реакции, он входит во вторую электронную транспортную цепь, начиная с белкового комплекса ферредоксина. Отсюда принимается одиночный электрон с помощью NADP+редуктазы, наряду с другими электроном и протоном, которые в конечном счёте формируют энергетический проект NADPH.