We beschrijven een protocol voor het extraheren van hoogwaardige kernen uit gecryopreserveerde geïnduceerde pluripotente stamcel-afgeleide stromale/endotheel- en bloedceltypen ter ondersteuning van single-nucleus next-generation sequencing-analyses. Het produceren van hoogwaardige, intacte kernen is noodzakelijk voor multiomics-experimenten, maar kan voor sommige laboratoria een barrière zijn voor toegang tot het veld.