Journal
/
免疫与感染
/
Transkripsjonsanalyse med høy gjennomstrømning for undersøkelse av vertspatogeninteraksjoner
JoVE 杂志
免疫与感染
Author Produced
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 免疫与感染
High-Throughput Transcriptome Analysis for Investigating Host-Pathogen Interactions

Transkripsjonsanalyse med høy gjennomstrømning for undersøkelse av vertspatogeninteraksjoner

DOI:
10.3791/62324-v

•

14:58 min

•

March 05, 2022

•

, , , , ,
1Laboratory of Pathology of Infectious Diseases, Department of Pathology, Medical School,University of São Paulo, 2Scientific Platform Pasteur USP, 3Department of Clinical and Toxicological Analyses, School of Pharmaceutical Sciences,University of São Paulo, 4Hospital Israelita Albert Einstein

Chapters

  • 00:07Introduction
  • 01:15Docker Desktop Installation
  • 04:25Quality Control
  • 05:10Mapping and Annotation Steps
  • 05:51Differentially Expressed Genes Process
  • 06:10Transfer Data to the Personal Computer
  • 12:02Representative Results
  • 14:22Conclusions

Summary

自动翻译

自动翻译

Protokollen som presenteres her beskriver en komplett rørledning for å analysere RNA-sekvensering transkripsjonsdata fra rålesninger til funksjonell analyse, inkludert kvalitetskontroll og forbehandlingstrinn til avanserte statistiske analytiske tilnærminger.

Tags

– High-throughput Transcriptome Analysis- Host-pathogen Interactions- Quality Control- Sequencing And Annotations- Statistical And Co-expression Analysis- Molecular Degree Of Perturbation Analysis- Functional Analysis- Docker Container- Chikungunya Virus- RNA Sequencing- Reference Genome- Gene Annotation

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

Use of an Optical Trap for Study of Host-Pathogen Interactions for Dynamic Live Cell Imaging

Use of the EpiAirway Model for Characterizing Long-term Host-pathogen Interactions

High-throughput Detection Method for influensavirus

Kvantitativ Høy gjennomstrømming encellede Cytotoksisitet analysen for T celler

En komparativ tilnærming til preger landskapet av Host-patogenfrie Protein-protein interaksjoner

Høy gjennomstrømming Screening for Bredspektret Chemical hemmere av RNA-virus

Høy throughput Gene Tagging i<em> Trypanosoma brucei</em

En ny metode for kvalitativ Multi-skala analyse av bakterielle biofilmer på Trådformede soppkolonier Bruke Confocal og elektronmikroskopi

Evaluering av Host-patogen svar og vaksinen i mus

Høy gjennomstrømming co-kultur analyser for etterforskning av mikrobielle interaksjoner

Read Article