Journal
/
免疫与感染
/
호스트-병원체 상호 작용을 조사하기 위한 고처리량 전사 분석
JoVE 杂志
免疫与感染
Author Produced
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 免疫与感染
High-Throughput Transcriptome Analysis for Investigating Host-Pathogen Interactions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

호스트-병원체 상호 작용을 조사하기 위한 고처리량 전사 분석

DOI:
10.3791/62324-v

•

14:58 min

•

March 05, 2022

•

, , , , ,
1Laboratory of Pathology of Infectious Diseases, Department of Pathology, Medical School,University of São Paulo, 2Scientific Platform Pasteur USP, 3Department of Clinical and Toxicological Analyses, School of Pharmaceutical Sciences,University of São Paulo, 4Hospital Israelita Albert Einstein

Chapters

  • 00:07Introduction
  • 01:15Docker Desktop Installation
  • 04:25Quality Control
  • 05:10Mapping and Annotation Steps
  • 05:51Differentially Expressed Genes Process
  • 06:10Transfer Data to the Personal Computer
  • 12:02Representative Results
  • 14:22Conclusions

Summary

自动翻译

自动翻译

여기에 제시된 프로토콜은 고급 통계 분석 접근법에 품질 관리 및 전처리 단계를 포함하여 원시 읽기에서 기능 분석에 RNA-시퀀싱 전사 데이터를 분석하는 완전한 파이프라인을 설명합니다.

Tags

– High-throughput Transcriptome Analysis- Host-pathogen Interactions- Quality Control- Sequencing And Annotations- Statistical And Co-expression Analysis- Molecular Degree Of Perturbation Analysis- Functional Analysis- Docker Container- Chikungunya Virus- RNA Sequencing- Reference Genome- Gene Annotation

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

동적 라이브 셀 이미징에 대한 호스트 병원체 상호 작용 연구를위한 광학 트랩의 사용

장기 호스트 병원체 상호 작용을 특성화에 대한 EpiAirway 모델의 사용

인플루엔자 바이러스에 대한 높은 처리량 검출 방법

T 세포 양적 높은 처리량 단일 세포 세포 독성 분석

호스트 병원체 단백질 - 단백질 상호 작용의 풍경의 특성을 비교 접근

RNA 바이러스의 넓은 스펙트럼 화학 억제를위한 높은 처리량 검사

높은 처리량 유전자 태그에<em> 트리파노소마 (Trypanosoma) brucei</em

새로운 방법 사상 진균 식민지에 세균 바이오 필름의 질적 다중 스케일 분석을 위해 사용 공 촛점 및 전자 현미경

호스트 병원 체 응답 및 쥐에 백신의 효능 평가

미생물 상호 작용의 조사를 위한 높은 처리량 공동 문화 애세서

Read Article