Journal
/
遗传学
/
Una plataforma de máquina virtual para profesionales no informáticos para usar el aprendizaje profundo para clasificar secuencias biológicas de datos metagenómicos
JoVE 杂志
遗传学
Author Produced
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 遗传学
A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Una plataforma de máquina virtual para profesionales no informáticos para usar el aprendizaje profundo para clasificar secuencias biológicas de datos metagenómicos

DOI:
10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

,
1Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, 2Center for Quantitative Biology,Peking University, 3State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Chapters

  • 00:07Introduction
  • 01:35The Installation of the Virtual Machine
  • 04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
  • 06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
  • 07:27Train and Test the Artificial Neural Network
  • 08:12Result
  • 08:52Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

Este tutorial describe un método simple para construir un algoritmo de aprendizaje profundo para realizar la clasificación de secuencias de 2 clases de datos metagenómicos.

Tags

Virtual MachineDeep LearningBiological Sequence ClassificationMetagenomic DataSpecies ClassificationGene Function ClassificationHost ClassificationDeep Learning FrameworkSequence ClassificationVirtualBoxUbuntu

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

Una plataforma robótica para de alto rendimiento de protoplastos aislamiento y Transformación

Las perturbaciones de circulación miRNAs en el Síndrome del Intestino Irritable detectó utilizando una plataforma de expresión de genes de multiplexado de alto rendimiento

Análisis metagenomic de ensilaje

El uso de un TMEM184A GFP-etiquetados Constructo para la Confirmación de heparina receptor de Identidad

Protocolos para el ensamblaje estándar de ADN de C-Brick usando Cpf1

Robusto de ADN y la secuenciación de alto rendimiento biblioteca construcción de especímenes de herbario

Integración dirigida CRISPR/Cas9-mediada In Vivo mediante una estrategia basada en unirse a final mediada por homología

Análisis informático de datos de la secuencia de lote levadura híbrida 2 pantallas

Captura de alto rendimiento identificación de secuencias reguladoras de genes utilizando secuenciación de próxima generación de conformación Circular cromosoma (4C-seq)

Una pantalla de supresor asistida por secuenciación profunda, espontánea en la levadura de fisión Schizosaccharomyces pombe

Read Article