De experimentella förfarandena för att utföra diethylpyrocarbonate-baserade kovalement märkning med massa spektroskopisk detektion beskrivs. Diethylpyrocarbonat blandas helt enkelt med protein- eller proteinkomplexet av intresse, vilket leder till modifiering av lösningsmedelskomliga aminosyrarester. De modifierade resterna kan identifieras efter proteolytisk matsmältning och vätskekromatografi/masspektrometrianalys.