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ペプチド生合成酵素を調べた水素重水素交換質量分析(HDX-MS)プラットフォーム
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JoVE 杂志 生物化学
A Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS) Platform for Investigating Peptide Biosynthetic Enzymes
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ペプチド生合成酵素を調べた水素重水素交換質量分析(HDX-MS)プラットフォーム

DOI:
10.3791/61053-v

•

11:32 min

•

May 04, 2020

•

,
1Department of Chemistry,McGill University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:36Bottom-Up Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Reference Sample Workflow Preparation
  • 01:18Reference Data Processing and Peptide List Definition
  • 05:05Hydrogen-Deuterium Exchange (HDX) Reactions
  • 06:36HDX Data Processing, Analysis, and Visualization
  • 09:03Results: Reapresentative HDX-MS Peptide Biosynthetic Enzyme Evaluation
  • 10:44Conclusion

Summary

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ランチペプチド合成酵素は、ペプチド天然物の生合成中に多段階反応を触媒する。ここでは、ランチペプチド合成酵素の立体ダイナミクス、ならびにペプチド天然物生合成に関与する他の同様の酵素を研究するために使用できる、連続的なボトムアップ、水素重水素交換質量分析(HDX-MS)ワークフローについて述べています。

Tags

Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS)Protein Conformational DynamicsProtein Of InterestQuench BufferBottom-up Liquid Chromatography Mass SpectrometryProteomic Software ProgramFASTA FormatElectrospray MSEGlucan One Fiber No Peptide BNonspecific DigestCarbamidomethyl CApex 3DPeptide 3DIon Accounting

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