Journal
/
生物学
/
Interactome-Seq: Um protocolo para a construção da biblioteca de Domainome, a validação e a seleção por Phage Display e a próxima geração de sequenciamento
JoVE 杂志
生物学
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 生物学
Interactome-Seq: A Protocol for Domainome Library Construction, Validation and Selection by Phage Display and Next Generation Sequencing

Interactome-Seq: Um protocolo para a construção da biblioteca de Domainome, a validação e a seleção por Phage Display e a próxima geração de sequenciamento

DOI:
10.3791/56981-v

•

12:04 min

•

October 03, 2018

•

, , , , , , , , ,
1Department of Health Sciences,Università del Piemonte Orientale & IRCAD, Novara, Italy, 2Institute of Biomedical Technologies,National Research Council, Segrate, Milan, Italy, 3Institute of Biomedical Technologies,National Research Council, Bari, Italy, 4Department of Life Sciences,University of Trieste, Italy, 5Institute of Genetic and Biomedical Research,National Research Council, Rozzano, Milan, Italy, 6Humanitas Clinical and Research Center, Rozzano, Milan, Italy

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:19Construction of the ORF Library
  • 02:38Preparation of the Filtering Vector
  • 03:40Ligation and Transformation
  • 06:47pFILTER-ORF Library Validation and Collection
  • 09:10Phage Library Deep Sequencing Platform, Index PCR Followed by Qualitative and Quantitative Evaluation of the Sequencing Library
  • 10:07Results: Use of a Phagemid Vector to Construct, Characterize and Select a Domainome Library
  • 11:23Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

Os protocolos descritos permitem a construção, caracterização e seleção (contra o destino de escolha), de uma biblioteca de "domainome", feita a partir de qualquer fonte de DNA. Isto é conseguido por um pipeline de pesquisa que combina diferentes tecnologias: a exibição do fago, repórter dobrável e sequenciamento de próxima geração com uma ferramenta web para análise de dados.

Tags

Keywords: InteractomeDomainome LibraryPhage DisplayNext-generation SequencingProtein ResearchFunctional StudiesORF LibrarySonicationAgarose Gel ElectrophoresisDNA FragmentationVector PreparationDNA PurificationEnzyme Treatment

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

check_url/cn/56981?article_type=v

Primer-Free Seleção Aptamer usando uma biblioteca de DNA Aleatório
check_url/cn/56981?article_type=v

Peptídeos de Phage Biblioteca Mostrar modular a expressão de genes em células mesenquimais e potenciar a osteogênese em defeitos ósseos unicorticais
check_url/cn/56981?article_type=v

Microscopia de fluorescência de Triagem e seqüenciamento da próxima geração: Ferramentas úteis para a identificação de genes envolvidos na integridade das Organelas
check_url/cn/56981?article_type=v

Um protocolo para exibição Fago e Affinity Seleção Usando Iscas proteína recombinante
check_url/cn/56981?article_type=v

O sequenciamento de próxima geração de 16S RNA ribossomal Gene amplicons
check_url/cn/56981?article_type=v

Alvejado DNA análise de metilação por Sequenciação de próxima geração
check_url/cn/56981?article_type=v

Amplificação, sequenciamento de próxima geração, e Genomic DNA Mapeamento das retrovirais Integração Sites
check_url/cn/56981?article_type=v

3' final de preparação da biblioteca com A-seq2 de sequenciamento
check_url/cn/56981?article_type=v

Caracterização de Microbiome carrapato de próxima geração 16S rRNA Amplicon sequenciação
check_url/cn/56981?article_type=v

Análise de microbiota usando PCR de duas etapas e sequenciamento do gene 16S rRNA de próxima geração

Read Article