Этот протокол описывает разделение функциональных комплексов транспортной цепи митохондриальных электронов (Cx) IV и их суперкомплексов с использованием нативного электрофореза для раскрытия информации об их сборке и структуре. Нативный гель можно подвергать иммуноблоттингу, в-гель-анализе и очищать путем электроэлюции для дальнейшего характеристики отдельных комплексов.