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Bio3D-webとのタンパク質配列構造ダイナミクスの関係の研究
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生物化学
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JoVE 杂志 生物化学
Investigating Protein Sequence-structure-dynamics Relationships with Bio3D-web
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Bio3D-webとのタンパク質配列構造ダイナミクスの関係の研究

DOI:
10.3791/55640-v

•

09:51 min

•

July 16, 2017

•

, , ,
1Department of Computational Medicine and Bioinformatics,University of Michigan Medical School, 2Department of Biomedicine,University of Bergen

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:40Structure Search and Selection (SEARCH)
  • 01:46Multiple Sequence Alignment Analysis (ALIGN)
  • 02:51Structure Fitting and Analysis (FIT)
  • 03:52Principle Component Analysis (PCA)
  • 05:24Ensemble Normal Mode Analysis (eNMA)
  • 06:52Results: Bio3D-web Analysis of Adenylate Kinase
  • 08:01Conclusion

Summary

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Bio3D-webを用いたタンパク質配列 - 構造 - 動態関係のオンライン調査のためのプロトコールを提示する。

Tags

Protein Sequence-structure-dynamicsBio3D-webProtein AnalysisInteractive AnalysisSequence AlignmentStructure SuperimpositionResidue Conservation

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