Coxiella burnetii er en obligat intracellulær Gram-negativ bakterie er ansvarlig for zoonotisk sygdom Q-feber. Her beskriver vi fremgangsmåder til generering af Coxiella fluorescerende transposon mutanter samt automatiseret identifikation og analyse af de resulterende internalisering, replikations- og cytotoksiske fænotyper.