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게놈 DNA에서 도보로 5 hydroxymethylcytosine의 선택적 캡처
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Selective Capture of 5-hydroxymethylcytosine from Genomic DNA
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게놈 DNA에서 도보로 5 hydroxymethylcytosine의 선택적 캡처

DOI:
10.3791/4441-v

•

06:26 min

•

October 05, 2012

•

, , ,
1Department of Human Genetics,Emory University School of Medicine, 2Department of Chemistry and Institute for Biophysical Dynamics,The University of Chicago

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:20Genomic DNA Fragmentation
  • 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
  • 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
  • 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
  • 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
  • 06:01Conclusion

Summary

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설명이 쉽고 밀도에 독립적 인 강화를위한 비오틴 링커를 전송할 클릭 화학에 이어, 5 HMC에 azide - 포도당를 전송하는 β-glucosyltransferase (β-GT)를 사용하여 두 단계 라벨 프로세스입니다. 이 효율적이고 특정 라벨 방식은 차세대 시퀀싱을 통해 매우 낮은 배경과 높은 처리량 epigenomic 매핑과 5 HMC의 농축이 가능합니다.

Tags

Selective Capture5-hydroxymethylcytosineGenomic DNA5-methylcytosineBiological FunctionsGene ExpressionGenome IntegrityParental ImprintingX-chromosome InactivationDevelopmentAgingCancerMammalian CellsEmbryonic Stem CellsNeuronal CellsTET Family Iron (II)/α-ketoglutarate-dependent DioxygenasesMES CellsNormal HematopoiesisMalignanciesZygote DevelopmentBisulfite SequencingLabeling And CaptureBacteriophage EnzymeGlucose MoietyGlucosyltransferase

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