Makrofager spiller en central rolle i homeostase og patologi i mange væv. Protokollen præsenteres her beskriver metoder til nedbrydende makrofager<em> In vivo</em> Afledt polariserede makrofager fra knoglemarvsaspirater, og adoptivt overfører makrofager i mus. Disse teknikker tillader bestemmelse af den rolle, polariserede makrofager spiller i sundhed og sygdom.