Journal
/
生物学
/
База данных ITS2
JoVE 杂志
生物学
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE 杂志 生物学
The ITS2 Database
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

База данных ITS2

DOI:
10.3791/3806-v

•

16:17 min

•

March 12, 2012

•

, , , , , , ,
1Department of Bioinformatics, Biocenter,University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry,University of Würzburg

Chapters

  • 00:03Title
  • 01:55Correct Annotation of ITS2 Sequence
  • 03:30Secondary Structure Prediction
  • 06:38Motif Search
  • 08:07Search and Browse
  • 10:21ITS2 BLAST
  • 12:23Multiple Sequence-structure Alignment
  • 13:46Phylogenetic Tree
  • 14:47Additional Software
  • 15:25Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

База данных ITS2 является рабочее место для филогенетических выводов одновременно учитывая последовательность и вторичная структура внутреннего транскрипции Spacer 2. Это включает в себя сбор данных с точной аннотацией, предсказания структуры, несколько последовательность структуры выравнивание и быстрый расчет дерева. В двух словах, это рабочее место упрощает первых анализов филогенетического в несколько кликов.

Tags

ITS2 DatabaseInternal Transcribed Spacer 2Phylogenetic MarkerITS2 SequenceSecondary StructurePhylogenetic ResolutionSpecies DelimitationNCBI GenBankReannotated SequencesHidden Markov ModelsFold PredictionHomology ModelingMotif DetectionBLAST SearchSequence-structure Information4SALEProfDistS

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

Фотообесцвечивания Анализы (FRAP и FLIP), чтобы измерить хроматина Динамика белков в живых эмбриональных стволовых клеток

Определение оксида азота и супероксид анион-радикал электронов парамагнитного резонанса от клеток с использованием спиновых ловушек

Выделение новорожденных внепеченочных холангиоцитах

Выделение Мышиный клапана эндотелиальных клеток

Использование MALDI-TOF масс-спектрометрии и пользовательскую базу данных для характеристики бактерий из числа коренных народов уникального пещерного окружающей среды (Kartchner Пещеры, AZ, США)

Визуализация пространственной реорганизацией МАРК сигнального пути с помощью переходного процесса система экспрессии Tobacco

Визуализация и количественная оценка потенциала дифференциация адипогенном мезенхимальных клеток с маркером конкретных Lineage

ADIPO ясно: Ткани, очистка метод для трехмерных изображений жировой ткани

Трудосберегающий и повторяемый сенсорный сигнализирующего мутантного протокола для изучения тигморогенеза модельного завода Arabidopsis thaliana

Инъекции куколки и взрослых для редактирования генов РНКи и CRISPR в Nasonia vitripennis

Read Article