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ITS2 धन्यवाद
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JoVE 杂志 生物学
The ITS2 Database
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ITS2 धन्यवाद

DOI:
10.3791/3806-v

•

16:17 min

•

March 12, 2012

•

, , , , , , ,
1Department of Bioinformatics, Biocenter,University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry,University of Würzburg

Chapters

  • 00:03Title
  • 01:55Correct Annotation of ITS2 Sequence
  • 03:30Secondary Structure Prediction
  • 06:38Motif Search
  • 08:07Search and Browse
  • 10:21ITS2 BLAST
  • 12:23Multiple Sequence-structure Alignment
  • 13:46Phylogenetic Tree
  • 14:47Additional Software
  • 15:25Conclusion

Summary

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ITS2 धन्यवाद वंशावली अनुमान एक साथ विचार अनुक्रम और आंतरिक लिखित 2 स्पेसर की माध्यमिक संरचना के लिए एक कार्यक्षेत्र है. यह सही एनोटेशन, संरचना भविष्यवाणी, एकाधिक अनुक्रम संरचना संरेखण और तेजी से पेड़ गणना के साथ डेटा संग्रह में शामिल हैं. संक्षेप में, इस कार्यक्षेत्र कुछ ही क्लिक करने के लिए पहली वंशावली विश्लेषण सरल है.

Tags

ITS2 DatabaseInternal Transcribed Spacer 2Phylogenetic MarkerITS2 SequenceSecondary StructurePhylogenetic ResolutionSpecies DelimitationNCBI GenBankReannotated SequencesHidden Markov ModelsFold PredictionHomology ModelingMotif DetectionBLAST SearchSequence-structure Information4SALEProfDistS

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