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Previsão do HIV-1 de uso co-receptor (tropismo) por análise de seqüência usando uma abordagem genotípica
JoVE 杂志
免疫与感染
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JoVE 杂志 免疫与感染
Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage (Tropism) by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Previsão do HIV-1 de uso co-receptor (tropismo) por análise de seqüência usando uma abordagem genotípica

DOI:
10.3791/3264-v

•

07:06 min

•

December 01, 2011

•

, , , , , , , , , , , ,
1Institute of Virology,University of Cologne, 2Max Planck Institute for Informatics, 3Institute for Immune genetics, 4Department of Gastroenterology, Hepatology and Infectiology,University of Duesseldorf, 5Department of Dermatology,University of Essen, 6Department of Internal Medicine,University of Cologne, 7Augustinerinnen Hospital

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:02Amplification of the V3 Region
  • 03:25Sequencing of the V3 Amplicon
  • 04:08Sequencing Editing, Data Interpretation, and Trophism Prediction
  • 06:31Conclusion

Summary

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A predição do uso de co-receptor de HIV-1 é necessário para a administração de uma nova classe de fármacos anti-retrovirais co-receptor, ou seja, os antagonistas. Ela pode ser realizada por análise da sequência do<em> Env</em> Gene e posterior interpretação através de um sistema de interpretação baseado na Internet (geno2pheno<sub> [Coreceptor]</sub>).

Tags

HIV-1Coreceptor UsageTropismSequence AnalysisGenotypic ApproachMaravirocCCR5CXCR4Env ProteinR5 VirusX4 VirusEntry InhibitionTarget CellTrofile AssayMOTIVATE StudyMERIT Study1029 StudyMonogram AssayRecombinant TestsResistance Testing

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