Nous décrivons le flux de travail et l’analyse des données d’un système de criblage pour évaluer la toxicité des composés chimiques en fonction de la réponse au sursaut par vibration de l’embryon de poisson-zèbre. Le système enregistre les mouvements des embryons de poisson-zèbre lorsqu’ils sont exposés à un stimulus vibratoire et permet une évaluation intégrée de la toxicité/létalité générale et de la toxicité neuromusculaire.
Nous avons développé un système de dépistage simple pour l’évaluation de la toxicité neuromusculaire et générale chez les embryons de poisson-zèbre. Le système modulaire se compose de transducteurs électrodynamiques au-dessus desquels des boîtes de culture tissulaire contenant des embryons peuvent être placées. Plusieurs paires de boîtes de culture haut-parleur-tissu peuvent être combinées. Les stimuli vibratoires générés par les transducteurs électrodynamiques induisent une réaction de sursaut et d’échappement caractéristique chez les embryons. Un entraînement linéaire par courroie positionne séquentiellement une caméra au-dessus de chaque haut-parleur pour enregistrer le mouvement des embryons. De cette façon, les altérations de la réponse de sursaut dues à la létalité ou à la toxicité neuromusculaire des composés chimiques peuvent être visualisées et quantifiées. Nous présentons un exemple de flux de travail pour le criblage des composés chimiques à l’aide de ce système, y compris la préparation des embryons et des solutions de traitement, le fonctionnement du système d’enregistrement et l’analyse des données pour calculer les valeurs de concentration de référence des composés actifs dans l’essai. L’assemblage modulaire basé sur des composants simples disponibles dans le commerce rend ce système à la fois économique et adaptable de manière flexible aux besoins de certaines installations de laboratoire et à des fins de dépistage.
Ces dernières années, le poisson-zèbre est devenu un organisme modèle très populaire pour l’évaluation des effets des composés chimiques, englobant des domaines de recherche allant du développement de médicaments à la toxicologie environnementale1. En tant que vertébrés, les poissons-zèbres partagent de nombreux aspects de leur constitution génétique et de leur physiologie globale avec les humains 2,3. Par conséquent, les résultats obtenus dans ce modèle sont souvent directement pertinents pour la santé humaine. Plusieurs candidats médicaments actuellement en essais cliniques ont été identifiés dans des cribles composés utilisant le poisson-zèbre4.
L’évaluation de la toxicité est une application majeure où les essais utilisant les stades embryonnaires du poisson-zèbre sont intéressants. Il existe diverses lignes directrices de l’Organisation de coopération et de développement économiques (OCDE) pour l’utilisation du poisson-zèbre dans les essais de toxicité environnementale 5,6. La petite taille et le développement rapide des embryons de poisson-zèbre les rendent très adaptés aux approches de criblage à une échelle de débit moyen à élevé 1,3,4. Les paramètres toxicologiques ciblés par ces criblages comprennent les malformations embryonnaires et la létalité7, la perturbation endocrinienne8, la toxicité pour les organes9 et les évaluations comportementales indiquant une toxicité neuronale10,11. Les tests comportementaux sont possibles parce que les embryons de poisson-zèbre présentent différents types de réponses locomotrices à différents stimuli en fonction de leur stade de développement. Par exemple, les embryons 1 jour après la fécondation (dpf) présentent un enroulement spontané de la queue12 et répondent à une séquence d’impulsions lumineuses par une séquence typique de mouvements, appelée réponse photomotrice (PMR)10. Après l’éclosion, qui se produit généralement environ 48 à 72 heures après la fécondation (hpf), les éleuthéroembryons13 nageant librement développent progressivement des réponses de sursaut et d’échappement aux stimuli vibratoires à partir d’environ 4 dpf14. Ces réponses sont caractérisées par une courbure distinctive dans la direction opposée à la direction du stimulus (appelée courbure en C ou C), qui est suivie d’une contre-courbure plus petite et d’un comportement de nage 14,15,16,17. Notamment, les comportements embryonnaires sont régis par des circuits neuronaux utilisant divers systèmes de neurotransmetteurs, ce qui permet de sonder les effets des composés chimiques ciblant ces systèmes. Par exemple, le test PMR a révélé les effets des composés interférant avec la signalisation cholinergique, adrénergique et dopaminergique10, tandis que la réponse de sursaut implique les neurones cholinergiques, glutamatergiques et glycinergiques 16,18. De plus, les composés qui endommagent les muscles ou l’interface neuro-musculaire affecteront également ces comportements, tout comme les composés toxiques pour les cellules ciliées de l’oreille interne et de la ligne latérale19,20. L’observation du comportement locomoteur du poisson-zèbre en réponse à un stimulus est donc un moyen approprié pour évaluer non seulement la neurotoxicité, mais également l’ototoxicité et la myotoxicité. L’évaluation du comportement locomoteur sert également d’indicateur pour l’évaluation générale de la toxicité/létalité puisque les embryons morts ne bougent pas. Ainsi, les comportements de locomotion embryonnaire représentent une lecture intégrative pour une approche de dépistage de la toxicité de premier niveau, qui indique les effets des composés létaux et neuromusculaires dans une seule configuration. Étant donné que les éleuthéroembryons sont déjà capables de métaboliser des composés, l’approche peut également détecter les effets des produits de transformation métabolique 7,21,22. Il est important de noter que les embryons de poisson-zèbre ne sont pas considérés comme des stades de vie protégés en vertu de certaines législations sur la protection des animaux jusqu’au stade de l’alimentation libre après 120 hpf13. Par conséquent, ils sont considérés comme une alternative aux tests de toxicité sur les animaux.
Figure 1 : Configuration du système de réponse au sursaut par vibration. (A) Présentation du système. Des plaques contenant des embryons exposés aux composés testés sont placées sur le réseau de transducteurs électrodynamiques (« haut-parleurs »). La caméra est déplacée séquentiellement par l’entraînement linéaire par courroie dans la position d’enregistrement au-dessus du transducteur ciblé. (B) Vue détaillée du transducteur/haut-parleur avec une boîte de culture tissulaire insérée sur le dessus. Les plaques sont éclairées par le bas par une feuille lumineuse LED à 4000-5000 lux. Une lumière LED à côté du haut-parleur s’allume pendant que le stimulus est donné. (C) Image fixe de la vidéo enregistrée par la caméra lors de la stimulation des embryons. (D) Capture d’écran du fichier de configuration. (E) Capture d’écran de l’interface du logiciel d’enregistrement. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Ici, nous décrivons un protocole de test pour l’évaluation des effets composés sur la réponse de sursaut par vibration à l’aide d’un dispositif de test simple construit en interne basé sur des stimuli vibratoires générés par des transducteurs électrodynamiques couplés à un enregistrement vidéo automatisé de plusieurs embryons en mouvement libre dans une boîte de culture tissulaire23. Le système est modulaire et permet un enregistrement séquentiel à partir de plusieurs boîtes de culture tissulaire en parallèle. Dans la configuration actuellement utilisée, cinq transducteurs électrodynamiques fournissent un stimulus vibratoire (500 Hz, durée 1 ms) à des boîtes de culture tissulaire contenant 20 embryons placés dessus (Figure 1). Les plaques sont éclairées par le bas à 4000-5000 lux avec des feuilles lumineuses LED. Une lumière LED à côté de chaque transducteur indique les périodes d’application du stimulus, et un oscilloscope indique les formes d’onde et la fréquence du stimulus appliqué (pour plus de détails, voir Réf. 23). Le comportement des embryons est enregistré par une caméra à grande vitesse (Table of Materials) à 1000 images par seconde (fps), qui est déplacée au-dessus du haut-parleur ciblé par un entraînement linéaire par courroie. Cette vitesse d’enregistrement est nécessaire pour résoudre de manière fiable la réponse de sursaut. Le système offre une alternative peu coûteuse et adaptable individuellement aux systèmes commerciaux actuels. Le flux de travail précis détaillé ci-dessous est actuellement effectué dans le cadre de l’initiative Precision Toxicology24 afin de déterminer les conditions d’exposition appropriées pour l’acquisition de données OMICS à partir d’embryons de poisson-zèbre traités avec un ensemble sélectionné de toxiques.
Nous présentons le flux de travail et l’analyse des données pour l’évaluation des composés chimiques à l’aide d’une configuration d’essai de sursaut par vibration d’embryon de poisson-zèbre sur mesure. Le flux de travail génère des données robustes qui permettent de calculer des paramètres typiques spécifiant la toxicité du composé, tels que la concentration/dose de référence (BMC/BMD). La modularité de l’installation permet de s’adapter aux différents besoins en termes de débit et d’espace. Comme le système est fabriqué à partir de composants de base à faible coût, après une configuration relativement simple, il offre une alternative bon marché aux systèmes commerciaux existants, qui sont généralement conçus pour plusieurs types de tests à la fois, reposent sur des logiciels propriétaires et restent relativement coûteux.
Ces systèmes commerciaux et d’autres systèmes sur mesure permettent d’évaluer des embryons ou des larves uniques dans des plaques multipuits (p. ex.,34 à 12 puits,32 à 35 à 16 puits,20, 33, 36 à 24 puits,37 à 48 puits,38, 39, 40, 41, 42 et même 384 puits4 [comme puits 4×96]43), mais la restriction spatiale dans les puits rend plus difficile l’analyse de certains paramètres de données de la réponse d’évacuation (p. ex., la distance parcourue). De plus, dans certaines de ces configurations, l’imagerie est limitée à un sous-ensemble des puits de la plaque, ce qui réduit le débit36,39. L’imagerie des embryons dans des boîtes permet de mieux évaluer les paramètres de réponse d’échappement et d’enregistrer le comportement de plusieurs embryons à la fois (jusqu’à 30 dans une boîte de 6 cm, par exemple). Habituellement, l’imagerie en boîte est limitée à une boîte par cycle 44,45,46,47,48 (les exceptions effectuent l’imagerie en parallèle sur 6 boîtes avec une larve chacune49 ou sur 4 larves dans 2 boîtes divisées50), un inconvénient qui peut être résolu par des conceptions parallèles comme dans notre cas. Nous avons résumé certaines caractéristiques du système utilisé dans cette étude et d’autres solutions commerciales et sur mesure dans le tableau 2 20,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43, 44,45,46,47,48,49,50,
51,52.
L’un des avantages de la méthode est une lecture capturant à la fois la létalité et les changements de comportement, ce qui peut augmenter les performances des évaluations de toxicité. Par exemple, alors qu’il a été démontré que l’essai de toxicité aiguë de l’embryon de poisson zèbre (FET)5 prédit assez bien la toxicité dans l’essai de toxicité aiguë chez le poisson adulte53 , sa précision de prédiction a été améliorée en incluant des lectures comportementales54. La raison en est la faible mortalité induite par les composés neuroactifs observés dans les embryons de poissons, probablement en raison de l’absence de syndrome d’insuffisance respiratoire provoquant une toxicité accrue chez les poissons juvéniles ou adultes. La neuroactivité peut cependant être identifiée par l’évaluation du comportement. En outre, les lectures comportementales peuvent également capturer les effets myotoxiques et ototoxiques ainsi que d’autres effets toxiques plus subtils sur la physiologie, qui sont sublétaux mais influencent les performances comportementales de l’organisme.
Lors de la réalisation de l’essai, il est essentiel de s’assurer de la manipulation appropriée des composés ainsi que de l’utilisation d’un lot d’embryons de poisson-zèbre en développement homogène. Ainsi, l’utilisation de flacons en verre pour le stockage des composés devrait minimiser la baisse des concentrations de produits chimiques, en particulier de composés hydrophobes, due à l’absorbance de la matière plastique. Dans le cas de composés à fort potentiel d’absorption du polystyrène « plastique », des plaques de verre peuvent également être utilisées pour l’incubation. Le nettoyage des ovules dans les boîtes de culture tissulaire utilisées pour le prélèvement et le prélèvement des embryons morts est une étape essentielle pour assurer le développement standard. La vitesse normale de développement est importante, car les retards de développement peuvent affecter la maturité des réseaux neuronaux sous-jacents au comportement évalué14,33. De plus, pour permettre la comparaison des effets composés, les œufs doivent provenir de la même souche car différentes souches ont été signalées comme présentant des profils comportementaux différents 38,55,56,57. Lors de l’exposition, il est important d’incuber les embryons dans une chambre humidifiée afin d’éviter une évaporation excessive du milieu E3, qui modifierait les concentrations testées.
Des témoins E3 doivent être incorporés dans chaque cycle afin de déterminer le niveau de réponse de base du lot particulier d’embryons utilisé dans la série d’essais. En règle générale, nous exécutons une plaque de contrôle le long de chaque ensemble de 5 mesures. Comme l’illustre la figure 2D, cette approche permet également de détecter des lots présentant des réponses sous-optimales en raison d’un retard de développement ou pour d’autres raisons, telles que les effets de fond génétique. En cas d’absence inattendue de réponse au stimulus, faites également attention à une défaillance potentielle du transducteur. En règle générale, les réponses de sursaut montrent un comportement concentration-réponse sigmoïdal qui permet d’ajuster la courbe à l’aide d’un modèle log-logistique. Cependant, dans de rares cas avec des réponses biphasiques, d’autres modèles peuvent devoir être utilisés, tels que les modèles gaussiens ou Cedergreen. Ils sont disponibles dans les packages R drc et bdm27,28.
L’absence de réponse au stimulus vibratoire peut indiquer simplement la mort des embryons ou une altération sévère des fonctions vitales en raison d’une cytotoxicité générale, mais peut également refléter une toxicité plus spécifique ciblant les circuits neuronaux de perception, d’intégration et de production locomotrice du stimulus. D’autres effets composés possibles sont l’interférence avec l’interface neuromusculaire ou avec la structure et la fonction musculaires. Pour distinguer ces possibilités, d’autres essais sont nécessaires. Par exemple, l’intégrité structurelle des muscles peut être évaluée avec un test de biréfringence58,59, et des lignées transgéniques sont disponibles pour évaluer la perturbation de la fonction musculaire et neuronale60,61. Cependant, les données vidéo enregistrées permettent déjà une analyse plus détaillée de la morphologie et de la réponse comportementale des embryons qui peut fournir des informations supplémentaires dans un premier temps. Seule la courbure en C est-elle altérée, ou toute motilité ? Y a-t-il encore des restes d’activité neuromusculaire, comme l’indiquent des mouvements de queue faibles ou tremblants ? Ces comportements modifiés s’accompagnent-ils de changements morphologiques, tels qu’un œdème ou une courbure accrue du corps ? De plus, des paramètres tels que le temps de latence jusqu’au coude en C ou la distance parcourue pendant la réponse d’échappement peuvent être évalués (voir, par exemple, Réf. 44).
Le protocole de dépistage décrit ici permet des évaluations rapides et robustes de la toxicité des composés, avec la valeur ajoutée de détecter spécifiquement les composés neurotoxiques, ototoxiques et myotoxiques non létaux. Le flux d’analyse fourni est facile à mettre en œuvre et fournit une lecture robuste. Des modifications des protocoles de stimulus utilisés dans l’essai de sursaut par vibration ont également été utilisées pour traiter les effets composés sur des aspects plus complexes du comportement de sursaut, tels que l’inhibition pré-impulsionnelle (IPP)39,44 et l’habituation32,33, et pourraient être adaptées à la configuration de stimulus basée sur un transducteur électrodynamique utilisée dans cette étude.
L’une des principales applications des systèmes de criblage basés sur la réponse au sursaut est l’évaluation des effets des composés dans les criblages chimiques, ce qui est pertinent à la fois pour l’évaluation de la toxicité humaine et le développement de médicaments 1,4,62. Dans le même temps, en testant les premiers stades de vie d’un organisme aquatique, les résultats obtenus ont un rapport direct pour l’évaluation des risques écotoxicologiques63,64. De plus, les systèmes de réponse de sursaut peuvent être utilisés pour le phénotypage comportemental dans les cribles génétiques 65,66,67,68,69. Notre système facile à mettre en œuvre et adaptable offre une configuration abordable aux petits laboratoires qui ont l’intention de mener leurs propres projets de criblage spécifiques dans ces différents domaines d’application.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions le personnel de soutien de l’installation piscicole et du centre de dépistage IBCS-BIP pour son excellente assistance technique. Ces travaux ont reçu un financement du programme de recherche et d’innovation Horizon 2020 de l’Union européenne dans le cadre de la convention de subvention n° 965406 (PrecisionTox). Cette production ne reflète que l’opinion des auteurs, et l’Union européenne ne peut être tenue responsable de l’utilisation qui pourrait être faite des informations qu’elles contiennent.
Fine test sieves, Brass frame, pore size 250 μm | Sigma-Aldrich | Z289744-1EA | Or comparable material |
High-speed camera | XIMEA | MQ013MG-ON USB 3 | |
Laboratory Bottles, Narrow Neck, with Screw Cap | VWR | 215-3261 | Reference number for 50 mL, available up to 20 L. Or comparable material |
Pipette tip, working volume: 10 µL | SARSTEDT | 70.3010.210 | Or comparable material |
Pipette tip, working volume: 1000 µL | SARSTEDT | 70.3050.100 | Or comparable material |
Pipette tip, working volume: 20 µL | SARSTEDT | 70.3020.210 | Or comparable material |
Pipette tip, working volume: 200 µL | SARSTEDT | 70.3030.100 | Or comparable material |
Serological pipette 10 mL | SARSTEDT | 86.1254.001 | Or comparable material |
Serological pipette 25 mL | SARSTEDT | 86.1685.001 | Or comparable material |
Serological pipette 5 mL | SARSTEDT | 86.1253.001 | Or comparable material |
Tissue culture dish 60,0 mm/15,0 mm vented (Polystyrene) | Greiner bio-one | 628102 | Or comparable material |
Tissue culture dish 100, suspension (Polystyrene) | SARSTEDT | 83.3902.500 | Or comparable material |
Transfer pipette 6 mL | SARSTEDT | 86.1175 | Or comparable material |
Tube 15 mL 120 mm x 17 mm PP | SARSTEDT | 62.554.502 | Or comparable material |
Tube 50 mL 114mm x 28 mm PP | SARSTEDT | 62.5472.54 | Or comparable material |