Bu el yazmasında, moleküllerin bakterilere (Candidatus Liberibacter asiaticus) veya böcek vektörüne (Diaphorina citri, Kuwayama) karşı etkinliğini taramak için yeni bir doğrudan bitki infüzyon cihazı tanımlanmaktadır.
Bitkilerde terapötik bileşiklerin işlevinin test edilmesi, tarımsal araştırmanın önemli bir bileşenidir. Yaprak ve toprak damlatma yöntemleri rutindir, ancak değişken alım ve test edilen moleküllerin çevresel parçalanması gibi dezavantajları vardır. Ağaçların gövde enjeksiyonu iyi bilinmektedir, ancak bunun için çoğu yöntem pahalı, tescilli ekipman gerektirir. Huanglongbing için çeşitli tedavileri taramak için, bu bileşikleri, floem sınırlı bakteri Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) ile enfekte olmuş veya floem besleyen CLas böcek vektörü Diaphorina citri Kuwayama (D. citri) ile enfekte olmuş küçük serada yetiştirilen narenciye ağaçlarının vasküler dokusuna iletmek için basit, düşük maliyetli bir yönteme ihtiyaç vardır.
Bu tarama gereksinimlerini karşılamak için, tesisin gövdesine bağlanan bir doğrudan bitki infüzyonu (DPI) cihazı tasarlanmıştır. Cihaz, naylon tabanlı bir 3D baskı sistemi ve kolayca elde edilebilen yardımcı bileşenler kullanılarak yapılmıştır. Bu cihazın bileşik alım etkinliği, floresan marker 5,6-karboksifloresein-diasetat kullanılarak narenciye bitkilerinde test edilmiştir. Markörün bitkiler boyunca düzgün bileşik dağılımı rutin olarak gözlenmiştir.
Ayrıca, bu cihaz sırasıyla CLas ve D. citri üzerindeki etkilerini belirlemek için antimikrobiyal ve böcek öldürücü moleküller vermek için kullanıldı. Aminoglikozit antibiyotik streptomisin, cihaz kullanılarak CLas ile enfekte olmuş narenciye bitkilerine verildi ve bu da CLas titresinde tedaviden 2 haftadan 4 haftaya kadar bir azalmaya neden oldu. Neonikotinoid insektisit imidacloprid’in D. citri istilasına uğramış narenciye bitkilerine verilmesi, 7 gün sonra psyllid mortalitesinde önemli bir artışa neden olmuştur. Bu sonuçlar, bu DPI cihazının, molekülleri test etmek ve araştırma ve tarama amaçlarını kolaylaştırmak için bitkilere iletmek için yararlı bir sistemi temsil ettiğini göstermektedir.
Bitkilerin ticari ve peyzaj ortamlarında yönetimi genellikle bitki büyümesini ve sağlığını optimize etmek için kimyasal bileşiklerin kullanılmasını gerektirir. Bu moleküllerin nasıl verildiği, molekülün türüne, molekülün işlevine, bitkinin türüne ve mevcut yönetim sistemine bağlıdır. Yaprak ve toprak uygulamaları en kolay dağıtım stratejileridir, ancak bazı moleküllerin alımındaki sınırlamalar doğrudan teslimatı gerektirir. Bu moleküllerin bir örneği, bitki içinde sistemik olarak hareket ettiklerinde en iyi şekilde işlev gören ancak basit topikal uygulamalarla etkili bir şekilde sağlanamayan terapötik moleküllerdir1. Bu, narenciye yeşillendirme hastalığı olarak da adlandırılan Huanglongbing (HLB) için geçerlidir. HLB, bitkinin dışında kültürlenemeyen floem sınırlı bir bakteri olan Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) veya böcek vektörü Diaphorina citri Kuwayama (D. citri)2 ile ilişkili bir hastalıktır.
Varsayılan terapötik moleküller gen ürünleri ise, bu bileşikleri ifade eden transgenik bitkiler oluşturularak test edilebilirler. Bununla birlikte, transgenik bitki üretimi zaman ve kaynak yoğun olabilir, oldukça genotipe bağımlıdır ve gen susturma3 ile inhibe edilebilir. Ek olarak, bu transgenikler umut verici sonuçlar gösterse bile, düzenleyici ve kamusal algı kısıtlamaları ticari kabul edilme olasılığını azaltır 4,5. Bununla birlikte, bileşiklerin eksojen uygulaması, biyolojik ve sentetik moleküllerin test edilmesini basitleştirir, çünkü bir molekülün etkilerini test etmek için zaman ve kaynakları azaltan kararlı veya geçici olarak eksprese eden transgenik bitkilerin üretimini gerektirmez. Eksojen bileşiklerin etkili ve verimli sistemik bitki dağıtımı için bir yöntem, çok çeşitli araştırma ve tarama amaçları için kullanılabilir.
Bu uygulamalardan biri, bir bitkinin vasküler sistemi içindeki sistemik molekül hareketinin analizidir; bu, floresan, görünür veya benzersiz kimyasal izotoplar 6,7,8,9 olsun, izlenebilir belirteçler kullanılarak yapılabilir. Yaygın olarak kullanılan bir floresan belirteç, hücre içi esterazlar tarafından 5,6-karboksifloresein (CF) içine parçalanan ve daha sonra floresan ve membran geçirimsiz10 haline gelen membran geçirgen bir boya olan 5,6-karboksifloresein-diasetattır (CFDA). CFDA, floem taşınımını, lavabo ve kaynak ilişkilerini ve bitki dokusundaki vaskülatür paternini izlemek için yaygın olarak kullanılmaktadır11,12.
Bu belirteçlere ek olarak, bazı bileşikler verimliliği artırmak veya herbisitler durumunda bitkiyi öldürmek için bitkinin fizyolojisini doğrudan değiştirebilir. Hem insektisitler hem de antimikrobiyal bileşikler, özellikle HLB varlığında bitki verimliliğini arttırmanın bir yoludur. CLas’ı kontrol etmek için kullanılan bir antimikrobiyal molekülün bir örneği streptomisin’dir. Streptomisin, başlangıçta Streptomyces griseus’tan izole edilen ve protein biyosentezinin inhibisyonu yoluyla bakteriyel büyümeyi inhibe ettiği gösterilen bir aminoglikozit antibiyotiğidir13. İnsektisitler açısından, HLB araştırmasının ana hedefi, CLas’ı ağaçtan ağaca ileten D. citri’dir 14. Bu amaçla, imidakloprid gibi neonikotinoidler, böcek zararlılarını kontrol etmek için altın standart oldukları için yaygın olarak kullanılmaktadır15. Tüm bu çeşitli kullanımlar, mevcut tesis yönetimi stratejilerinin önemli yönleridir ve yeni ürünlerin geliştirilmesi, verimli tarama analizlerine bağlıdır.
Bileşiklerin odunsu bitkilere sokulması için kullanılan bir yöntem, gövdeye doğrudan enjeksiyondur. Önceden delinmiş enjeksiyon bölgeleri için ihtiyaçlarına göre değişen çeşitli sistemler tasarlanmıştır ve bu sistemler basınca dayalı enjeksiyon veya pasif akışkullanır 16. Basınca dayalı sistemler belirli bir bileşiğin hızlı bir şekilde sokulmasına izin vermesine rağmen, sıvıyı bloke edilmiş veya embolize edilmiş vaskülatür yoluyla zorlamanın neden olduğu potansiyel fiziksel hasarın dikkate alınması gerekir17. Bileşiklerin yaprak veya damla damlası uygulamasının uygulanması daha az zaman alıcı olmasına rağmen, doğrudan bitki enjeksiyonu, hava veya toprağa verilen zararlar nedeniyle ilgilenilen bileşiğin israfını azaltır ve ayrıca bileşiklerin dış ortama maruz kalmayı azaltarak aktif bir durumda olduğu süreyi uzatabilir18. Bu yönlerin her ikisi de pahalı reaktifleri korumak ve araştırma ortamlarında replikalar arasında tutarlılık sağlamak için önemlidir.
Bu çalışma, ilgilenilen bileşiklerin bir konakçı bitkiyi nasıl etkilediğini değerlendirmek için kullanılabilecek yenilikçi bir doğrudan bitki infüzyonu (DPI) cihazının tasarımını, yapımını ve kullanımını açıklamaktadır. Hem cihazın kendisini hem de yapımıyla ilişkili çeşitli bileşenleri üretmek için standart bir 3D yazıcı kullanıldı. Bu şirket içi inşaat yöntemi, araştırmacıların cihazı ve cihaz bileşenlerini kendi özel deneysel ihtiyaçlarına göre değiştirmelerine olanak tanır ve ticari olarak temin edilebilen bitki enjeksiyon cihazlarına olan bağımlılığı azaltır. Cihaz kurulumu basit ve verimlidir ve tüm yardımcı bileşenler kolayca temin edilebilir ve ucuzdur. Sistem çeşitli bitki türleriyle kullanılmak üzere tasarlanmış olmasına rağmen, burada sunulan örnekler saksı narenciye bitkileri ile ilgilidir. Ek olarak, bu çalışma, bu cihazın ölümcül olmasına neden olmadan genç narenciye bitkilerine sistematik olarak birden fazla bileşik türünü verimli bir şekilde verebildiğini göstermektedir. Test edilen bileşikler, bitkideki bileşik dağılımını değerlendirmek için kullanılan CFDA’yı ve bu bileşiklerin antimikrobiyal ve böcek öldürücü etkilerinin DPI yoluyla verildiğinde gözlemlendiğini doğrulamak için kullanılan streptomisin ve imidakloprid’i içeriyordu.
DPI cihazının bitkilere eksojen bileşik dağıtımı için uygun bir yöntem olarak kabul edilmesi için, çeşitli doku tiplerine sağlam ve tutarlı bileşik alımına katkıda bulunması gerekir. CFDA’yı kullanan deney, hem akropetal hem de bazipetal bileşik hareketinin yanı sıra yaprağın hem vasküler sisteminde hem de mezofil hücrelerinde açıkça göstermiştir. Ek olarak ve muhtemelen bu DPI cihazında kullanılan sıkılmış delik, bileşik alımı için büyük miktarda yüzey alanı sağladığından, CFDA, gövde enjeksiyonukullanan bitkilerde önceki boya alım çalışmalarında görüldüğü gibi, sadece cihaza bitişik vaskülatürün küçük bir alt kümesinde değil, gövdenin tüm bölümlerinde nispeten eşit miktarlarda mevcuttu 6. Ek olarak, yeşil floresan proteini ve çiçek boyasının verilmesi DPI cihazı kullanılarak test edildi ve bu bileşiklerin CFDA’ya benzer bir dağılımı gözlendi (veriler gösterilmedi). Bu veriler, cihazın sistematik olarak boyut ve moleküler yapıya göre değişen çeşitli bileşikler sunmak için kullanılabileceğini göstermektedir. Bununla birlikte, yaprak gelişim aşamasına bağlı olarak bileşik alımında farklılıklar olduğunu, genç gelişmekte olan yaprakların yaşlı yerleşik yapraklardan daha fazla bileşik aldığını belirtmek gerekir. Bu, kaynak dokuya karşı lavaboda bulunan vaskülatür özelliklerindeki değişikliklerden kaynaklanabilir ve belirli bir deney için optimize edilmelidir.
DPI cihazı, CFDA, GFP ve çiçek boyasının görselleştirilmesi için yeterli bileşik alımı gösterdi ve ayrıca sırasıyla streptomisin ve imidaklopridin antibakteriyel ve böcek öldürücü etkilerini göstermek için yeterli sürdü. Her iki bileşik de tek bir 2.0 mL tedaviden 1 hafta sonra hedef organizma canlılığında değişikliklere neden oldu. Bu veriler, DPI cihazının, mikrobiyal ve böcek zararlılarının kontrolü için çok çeşitli bileşiklerin yaşayabilirliğini test etmek için tüm bitki tahlillerinde kullanılabileceğini göstermektedir. Dahası, vasküler sistemle doğrudan teması nedeniyle, bu cihaz kökler veya epidermal hücreler tarafından verimli bir şekilde alınmayan bileşikleri test etmek için bir fırsat bile sağlayabilir. Özellikle ilgi çekici olan RNA girişimi (RNAi) olacaktır, çünkü bu, konakçı bitki, patojen veya patojen vektörü içindeki gen ekspresyonunu modüle etmek için kullanılabilir. Saç tokası RNA’sını elma ve üzüm bitkilerinin gövdesindeki delinmiş bir delikten geçiren önceki araştırmalar, RNA moleküllerinin ksilem dokusuyla sınırlı olduğunu gösterdi ve bu moleküllerin sadece çiğneme ve ksilem özsuyu besleyen organizmalara karşı etkili olabileceğini düşündürdü22. DPI cihazının benzer bir delinmiş delik dağıtım sistemi kullandığı göz önüne alındığında, bu cihazla birlikte verilen saç tokası RNA’sının da ksilem dokusuyla sınırlı olabileceği düşünülmektedir. Bununla birlikte, DPI cihazından streptomisin tedavisinden sonra floem sınırlı CLas titresinde gözlenen azalma, bu antibiyotiğin floemde mevcut olduğunu kuvvetle düşündürmektedir. Bu nedenle, DPI cihazı kullanılarak verilen bileşiklerin vasküler dağılımının boyutlarına ve kimyalarına bağlı olması muhtemeldir ve her molekül ayrı ayrı değerlendirilmelidir.
Piyasada piyasada satılan bir dizi DPI cihazı olmasına rağmen, burada açıklanan cihaz şirket içinde üretilebilir ve değiştirilebilir. Bu şekilde, kullanılan bitki türüne ve deneysel tasarıma göre iyileştirmeler ve büyüklükte değişiklikler yapılabilir ve ticari ürünlere bağlı değildir. Ek olarak, cihaz bitkiye yarı kalıcı olarak bağlanır, yani belirli bir bileşiğin çoklu işlemleri, bitkiyi birden fazla bileşik enjeksiyonu ile yeniden yaralamak zorunda kalmadan aynı anda gerçekleştirilebilir. Uyarı notunda, cihaz düzgün takılmazsa sızıntı yapabilir. Sonuç olarak, bileşik bitkiye teslim edilmek yerine çevreye kaybolur. Bu nedenle, kurulum sırasında ve sonraki ilk birkaç gün boyunca cihazı herhangi bir sızıntı belirtisi açısından kontrol etmeye özen gösterilmelidir. Ağaçta bir delik açmak potansiyel olarak zararlı olsa da, bu yöntem sağlam ve tutarlı bileşik alımını sağlamak için seçilmiştir. Ek olarak, bu deneylerde DPI cihazının takılmasından bitki sağlığı üzerinde olumsuz bir etki görülmemiştir. Bununla birlikte, belirli bir deney boyunca canlılığını kaybedebilecek olanların yerini almak için deneysel tasarıma ekstra bitkiler dahil edilmelidir. Son olarak, bu cihaz bileşikleri tanıtmak için pasif akış kullandığından, farklı bitki türleri veya aynı türün gelişim aşamaları arasındaki alım oranını tahmin etmek zor olabilir. Bu, bileşik alımının hızı sınırlayıcı bir faktörse deneyleri karmaşıklaştırabilir. En iyi sonuçlar için, deneyler, bitkinin 1 haftaya kadar sürebilen 2.5 mL bileşiği tamamen emmesi için yeterli zaman sağlanacak şekilde planlanmalıdır. Sonuç olarak, bu DPI cihazı, antimikrobiyal veya insektisidal bileşiklerin in planta aktivitesinin CLas ve vektörü D. citri’ye karşı hızlı bir şekilde değerlendirilmesi için etkili bir araçtır, böylece sistemik etkinlik ve bitki performansı üzerindeki etkisi hakkında daha önce sunulan müstakil yaprak tahlili23’ten daha fazla bilgi sağlar. Kuşkusuz, bu sistem için uygulama çeşitliliği, bu çalışmada açıklanan özel kullanımların çok ötesine ulaşmaktadır.
The authors have nothing to disclose.
Yazarlar bu çalışmada kullanılan bitkiler için Mant Acon’a teşekkür eder. Finansman, ABD Tarım Bakanlığı (USDA) CRIS projesi 8062-22410-007-000-D ve USDA NIFA hibesi 2020-70029-33176 tarafından sağlandı.
0.5 cm Diameter Steel Balls | Ballistic Products Inc. | #SHT #T | |
10 mL Luer-Lok Syringe | Becton Dickinson | 382903029952 | |
20 G 1 Syringe Needle | Becton Dickinson | 305175 | |
2 mL Screw Cap Tubes | USA Scientific | 1420-9710 | |
3/32nd Inch Black Oxide Drill Bit | Sears | 964077 | |
3D Printer | Markforged | F-PR-2027 | |
3D Printing Software | Markforged | F-SW-FDVX | |
3D Printing Software | Markforged | S-FW-OEVX | |
5(6)-CFDA (5-(and-6)-Carboxyfluorescein Diacetate) | Invitrogen | C195 | |
5/64th Inch Black Oxide Drill Bit | Sears | 964502 | |
96 Well qPCR Machine | Roche | 5815916001 | |
Centrifuge | Eppendorf | 22621408 | |
Fluorescent Microscope | Olympus | SP-BX43-BI | |
Fluorescent Microscope Filter | Chroma | 69401-ET | |
Gloss Clear Spray Paint | Rustoleum | 249117 | |
Grey Lego Baseplate | Lego | 11024 | |
Handheld Cordless Drill | Makita | 6349D | |
Homogenizer | Fisher Scientific | 15-340-163 | |
Imidacloprid 2F | Quali-Pro | 83080133 | |
Liquid Plastisol Medium Hardness | Fusion X Fishing Lures | XSOL-505 | |
Red Silicone 70 Shore A O-Ring | Grainger | Varies by Size | |
Non-Stick Cooking Spray | PAM | 64144030217 | |
NucleoSpin Plant II | Macherey-Nagel | 740770.5 | |
Parafilm | Bemis | HS234526A | |
Poly Viyl Acetate Based Glue | Elmers | E301 | |
qPCR Master Mix | Promega | A6001 | |
qPCR Primers | Integrated DNA Technologies | Varies by DNA sequence | |
Reverse Transcriptase | Promega | A5003 | |
Single Edge Razor Blade | Garvey | 40475 | |
Translucent Silicone RTV Rubber | Aero Marine Products | AM 115T | |
Transparent Silicone Tape | Maxwell | KE30S | |
Truncated Oncocin 112 | Genscript | Varies by peptide sequence | |
White 1 x 6 Lego Piece | Lego | 300901 | |
White Nylon | Markforged | F-MF-0003 |