この記事では、ベンチトップ3D懸濁バイオリアクターにおけるヒト人工多能性幹細胞由来ニューロンの生成のためのプロトコルについて説明します。
ヒト人工多能性幹細胞(hiPSC)からの神経系譜細胞の誘導は、脳研究におけるマイルストーンを示しました。最初の登場以来、プロトコルは継続的に最適化されており、現在では研究や医薬品開発で広く使用されています。しかし、これらの従来の分化および成熟プロトコルの非常に長い期間と、高品質のhiPS細胞とその神経誘導体に対する需要の高まりにより、これらのプロトコルの大規模生産への採用、最適化、および標準化の必要性が高まっています。この研究は、ベンチトップ3次元(3D)懸濁バイオリアクターを使用して、遺伝子組み換えドキシサイクリン誘導性ニューロゲニン2(iNGN2)発現hiPS細胞をニューロンに分化させるための迅速かつ効率的なプロトコルを提示します。
簡単に言うと、iNGN2-hiPS細胞の単一細胞懸濁液は24時間以内に凝集体を形成させ、ドキシサイクリンの添加によって神経系統の関与が誘導されました。凝集体は誘導の2日後に解離し、細胞は凍結保存されるか、最終成熟のために再播種されました。生成されたiNGN2ニューロンは、早期に古典的なニューロンマーカーを発現し、リプレーティング後1週間以内に複雑な神経突起ネットワークを形成し、ニューロン培養の成熟度が高まっていることを示しました。要約すると、疾患モデリング、表現型のハイスループット薬物スクリーニング、および大規模な毒性試験の出発点として大きな可能性を秘めた、3D環境でのhiPS細胞由来ニューロンの高速生成のための詳細な段階的なプロトコルが提供されます。
神経障害は、世界中の障害の主な原因です1。6人に1人が罹患しており、発生率は上昇し続けています。社会とその医療制度に対する関連する財政的負担は莫大です。2010年に欧州30カ国を評価したところ、精神障害および神経障害に関連する年間コストは8,000億ユーロと推定されています2。社会経済的負担の増大は効果的な治療戦略を要求し、疾患の病態生理学の理解は大幅に増加しましたが、診療所への翻訳はしばしば不十分です。一般に、臨床試験に入る医薬品はわずか12%であり、そのうち80%以上が、主に有効性または予期しない毒性のために、後の段階で失敗します3,4。理由はさまざまですが、前臨床段階の動物実験からヒト試験への移行可能性の限界がますます前面に出てきています5。ヒトin vitro細胞および組織モデルは、種間翻訳のギャップを埋める可能性があり、ヒト人工多能性幹細胞(hiPSC)技術の進歩はこの点で大きな可能性を秘めています。hiPS細胞は基礎研究で広く使用されており、胚破壊に関連する倫理的懸念を回避しながら、ほぼ無制限の自己複製能力や3つの胚葉すべてに分化する能力など、胚性幹細胞(hESC)と本質的な特性を共有しています6。
hESCからの神経細胞の誘導、そしてその後のhiPS細胞は、脳研究におけるマイルストーンをマークしました。初期の分化プロトコルは、胚形成中の重要なステップを模倣する成長因子の適用に基づいており、それらのほとんどは、浮遊培養または付着培養のいずれかにおける二重SMAD阻害を伴う7、8、9。成熟ニューロンは正常に生成されていますが、これらのプロトコルのいくつかの欠点は、生成されたニューロンの低収率と高いバッチ間の変動性、および長い培養時間に関連する広範な作業負荷など、医薬品開発における幅広い使用を依然として妨げています。改善は、神経新生に決定的に関与する転写因子の強制発現によって達成されており、ニューロゲニン(NGN)ファミリーのメンバー、特にNGN2が有効なドライバーとして同定されている10。hiPS細胞におけるNGN2のレンチウイルス媒介異所性発現は、神経分化の初期段階を有意に加速し、わずか1週間以内に神経細胞の運命を誘導した11。その後のアストロサイトとの共培養における終末成熟は、再現性のある特性を有する高純度および量の機能的ニューロンをもたらした。次に、アデノ随伴ウイルス組み込みサイト1(AAVS1)セーフハーバー遺伝子座の部位特異的遺伝子編集を適用して、NGN212,13の安定したドキシサイクリン誘導性発現カセットを備えたhiPSC株を作成し、レンチウイルス送達の望ましくない副作用を最小限に抑えました。
ドキシサイクリン誘導性ニューロゲニン2(iNGN2)ニューロンの堅牢で効率的な分化は、ハイスループット表現型薬物スクリーニングおよび毒性アッセイに大きな可能性を秘めています10,14,15;そして、バイオプロセシングの実質的な進歩は、スケーラブルな細胞増殖および分化のためのバイオリアクターを実装する過去10年間になされた16,17,18,19。ただし、分化プロトコルの大部分は接着培養用に最適化されており、3次元(3D)環境への変換には本質的な変更が必要になることがよくあります。最近、せん断応力を低減したベンチトップ3Dバイオリアクターの使用の成功が、hiPS細胞の拡大および肝細胞、心筋細胞、およびニューロンへの再現性のある分化のために報告されています20。ここでは、同一のベンチトップ3Dバイオリアクターを使用して、iNGN2ニューロンの生成と特性評価のための詳細なプロトコルが提供されます。
神経細胞転写因子NGN2の異所性発現は、培養後1週間以内に神経分化の初期段階を加速し、hiPS細胞における神経系統の関与を誘導することが以前に示されています12,13,20。この研究では、ベンチトップバイオリアクターを使用して、遺伝子編集されたBIONi010-C-13 hiPS細胞をiNGN2ニューロンに分化させるための詳細なプロトコルについて説明しています。
CERO 3Dバイオリアクターは、特殊チューブ用の4つのスロットを備えた少量バイオリアクターで、それぞれ最大容量は50mLです。温度とCO2レベルは連続的に制御され、培養パラメータ(回転速度や時間など)はチューブごとに調整されるため、ユーザーは独立して複数の差別化アプローチを並行して実行できます。内管壁に統合されたウェーブブレーカーは、低いせん断応力で媒体の摂動を可能にし、制御された回転中に懸濁液中の3D凝集体を維持します。栄養素へのアクセスが制限されていること、および強制的な3D細胞間および細胞-細胞外マトリックス(ECM)相互作用は、細胞の分化と行動に大きな影響を与える可能性があります24,25,26,27。
浮遊状態で3D凝集体として細胞を培養すると、これらの細胞相互作用が増加し、それによって組織または器官の生体内環境をより密接に模倣する28。媒体の付随する摂動は、機械的摩擦による凝集体のサイズを調節し、ガス交換を改善し、チューブ内の栄養素と老廃物の勾配を減少させ、骨材内の生理学的に関連する勾配を維持します29,30,31,32,33,34.培地の交換は手動で行われますが、ベンチトップバイオリアクターは静的培養フラスコと比較して労力と運用コストを削減します。また、インペラフリー設計により凝集体表面での流体力学的せん断応力を低減し、細胞の生存率を向上させるだけでなく、敏感なiPS細胞、細胞分化、および機能に対するせん断応力の影響を制限するため、全自動攪拌槽バイオリアクターに比べていくつかの利点があります35,36,37,38。
大型の垂直インペラで細胞を撹拌する垂直ホイールバイオリアクターや、電動プラットフォームに取り付けられた膨張培養バッグを使用した揺動バイオリアクターは、代替の3Dサスペンションプラットフォームです。hiPS細胞17,18,19,39,40の培養については過剰に試験されているが、神経分化アプローチへの適用性についてはほとんど知られておらず、攪拌槽バイオリアクター41,42,43,44における哺乳類およびヒトの神経前駆細胞の増殖の成功に限られており、成熟44,45。一般に、自動3Dサスペンションプラットフォームは、完全に自動化されたコンピューター制御の媒体交換の利点を提供し、それによって取り扱いのばらつきを減らし、汚染のリスクを最小限に抑えます。さらに、乳酸やグルコース濃度などの栄養素パラメータを継続的に監視できます。ただし、これらのシステムを確立するには、多くの場合、多額の初期投資、実験室スペース、および有資格者のトレーニングが必要です。ベンチトップバイオリアクターは、浮遊状態で細胞を培養するためのコンパクトで使いやすい代替品ですが、栄養素の同時モニタリングは提供していません。
3D懸濁プラットフォームでの細胞の培養に使用されるプロトコルの大部分と同様に、凝集体の初期形成は重要なステップを表します。hiPS細胞は接着性単層として培養され、その後、シングルセル懸濁液として3D環境に移されます。その段階での細胞損失を最小限に抑えるには、いくつかの側面を考慮する必要があります。ウェーブブレーカーを内蔵したチューブの設計は、最適な培地摂動を確保するために、チューブあたり10mLの最小培養量が必要であることを意味します。したがって、クリティカルボリュームは長期的にアンダーカットされるべきではありません。さらに、培養量10 mLあたり750万細胞の開始播種密度、および60 rpmの回転速度は、細胞株によっては適応が必要な場合がありますが、短期間で安定した凝集体を形成することを強くお勧めします。
hiPS細胞を懸濁液に移した後、24時間以内に凝集体が形成されるはずです。最初の中程度の変更は、アグリゲートが小さく、適切に落ち着かない可能性があるため、重要です。骨材の沈降時間は延長できますが、骨材が不均一に凝集して成長し始める可能性があるため、10分を超えてはなりません。吸引中は、5 mLの最小培養量をチューブに残し、培地の摂動を避ける必要があります。それにもかかわらず、細胞および凝集体の損失は初期段階で予想される。細胞数は、培養の最初の2日間にわたって一定の細胞収量を示し、hiPS細胞の高い増殖能力が最初の細胞損失を補うことを示しています。懸濁状態になると、穏やかな栽培と摂動により、時間の経過とともに成長し始める均質なサイズの凝集体が得られます。
神経分化は、ドキシサイクリン誘導性NGN2過剰発現13に基づく以前に発表されたプロトコルに従って実施され、個々のステップは3D培養用に最適化されました。ニューロン転写因子NGN2は、ニューロン分化におけるよく説明されたドライバーであり、ニューロン誘導を有意に加速します11、13、46。定義された成長因子を用いた従来のパターニングには数週間から数ヶ月かかりますが7、8、9、NGN2の発現は数日以内に神経細胞の運命を誘導します。培養時間の短縮に加えて、このプロトコルは、最初の浮遊培養のために高価な成長因子やコーティングマトリックスに依存しないため、培養コストをさらに削減できます。
さらに、付着培養と浮遊培養におけるNGN2による未熟ニューロンの生成を直接比較したところ、ベンチトップバイオリアクター20を用いた培養で4日後に細胞が1.36倍増加し、100万個の細胞の生成に必要な培地の量は半分になると予想されています。したがって、iNGN2ニューロンの生成にベンチトップバイオリアクターを採用することは、より少ない処理時間とコストでより多くの細胞を生産できるため、有益である可能性があります。以前の報告に沿って、ニューロン系統のコミットメントは早い段階で観察されました。NGN2誘導の2日後、TUBB3、MAP2、MAPTなどの古典的なニューロンマーカーの深い発現が明らかであり、ニューロン誘導へのベンチトップバイオリアクターの適用性を支持しました。このプロトコルに従うと、培養後4日以内に100万個のhiPS細胞から約620万個の未熟なiNGN2ニューロンを得ることができます。ただし、出力容量はバッチによって異なり、播種時の浮遊培養の量によって異なります。
収量をさらに増やすために、栽培時間はさらに3日間延長されました。しかし、凝集体は大きくなったものの、非常にコンパクトになり、凍結保存や再めっきのために適切に解離することができませんでした。3D培養アプローチの進歩にもかかわらず、接着性2Dニューロン培養は、微小電極アレイやカルシウムイメージングなどの機能分析のゴールドスタンダードです。したがって、細胞の特異化は、均質に分布したニューロン単層および神経炎ネットワークにとって重要な前提条件です。細胞のより強力な機械的剥離または粗い解離試薬は、特異化を確実にするために使用され得るが、細胞の生存率、生理機能、および再付着能力に潜在的な影響を与える可能性がある47,48。さらなる分析および成熟のための単一細胞の必要性に関して、凝集体は懸濁状態で4日後に解離し、(2日目)iNGN2ニューロンを凍結保存された。融解後のiNGN2ニューロンの分化と特性評価により、ニューロン培養の成熟度が高まり、密な神経突起ネットワークが形成されることが確認されました。
提供されたプロトコルは、多数のiNGN2ニューロンを生成します。ただし、いくつかの制限を考慮する必要があります。ほとんどの浮遊培養プラットフォームと同様に、2D接着培養から3D環境へのhiPS細胞の移行は非常に重要であり、多くの場合、深刻な細胞損失を伴います。培地交換中にさらに大きな細胞および凝集体の損失が予想されます。自動化されたプラットフォームと比較して、培地の交換を手動で行う必要があるため、ベンチトップバイオリアクターを使用した取り扱い時間と汚染リスクが高まります。自動化の欠如は別として、ベンチトップバイオリアクターは栄養素を監視する可能性を提供しておらず、チューブあたり50mLの最大容量はプロトコルのアップスケーリングの可能性を制限します。最後に、NGN2は神経系譜のコミットメントを加速しますが、終末成熟の期間は短縮されず、数週間にわたる長期培養が必要であることに注意することが重要です。神経機能、付着、および生存に対する星状細胞サポートの重要性を考えると49,50,51、共培養アプローチを検討する必要があり、長期培養に不可欠でさえあるかもしれません。
要約すると、2D分化プロトコルは、ベンチトップバイオリアクターを実装することにより、iNGN2ニューロンの迅速かつ再現性のある生成のための3D環境への変換に成功しました。記載されたプロトコルは、高品質のiPS細胞由来のニューロンを大量に生成し、複雑なモデル試験、ハイスループット薬物スクリーニング、および大規模な毒性アッセイの出発点として役立つ可能性があります。
The authors have nothing to disclose.
EBiSC2プロジェクトは、助成金契約No.821362に基づき、革新的医薬品イニシアチブ2共同事業(JU)から資金提供を受けています。JUは、欧州連合のホライズン2020研究およびイノベーションプログラムとEFPIAの支援を受けています。Nadine J. Smandzich、Helene D. M. Hemmer、Johnn-Majd Balsters、Vanessa M. Nalewajaの免疫細胞化学的および遺伝子発現解析への支援、およびHeike Arthenの優れた技術サポートに感謝します。さらに、バイオリアクタープログラムの確立についてステファニーバーに感謝します。 図2A は BioRender.com で作成されました。
2-Mercaptoethanol 50 mM | Gibco | 11528926 | |
60 mm Nunclon Delta Surface | Nunc | 734-2040 | |
Anti-beta III Tubulin antibody [TU-20] (dilution 1:1,000) | Abcam | ab7751 | |
Applied Biosystems High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit | Thermo Fisher Scientific | 10400745 | |
B-27 Supplement (50x) | Gibco | 11530536 | serum-free Supplement (50x) |
BIONi010-C-13 hiPSC line | European Bank for induced pluripotent Stem Cell (EBiSC), BIONEER as Depositor | SAMEA103988285 | Bioneer is depositor in EBiSC and owner of the hiPSC line. |
Biorender | Biorender.com | ||
BSA Cell Culture grade | Thermo Fisher Scientific | 12330023 | |
CERO 3D Incubator & Bioreactor | OLS OMNI Life Science | 2800000 | |
CEROtubes Cell culture Tubes 50 mL | OLS OMNI Life Science | 2800005 | |
Citavi 6 | Swiss Academic Software | ||
CryoStor CS10 | Stemcell | 7930 | freezing medium containing 10% DMSO |
Cytofix Fixation Solution | BD Biosciences | 554655 | fixation solution containing 4% paraformaldehyde |
DAPI (NUCBLUE FIXED CELL STAIN) | Thermo Fisher Scientific | 12333553 | |
Doxycycline hydrochloride (DOX) | Sigma-Aldrich | D3447 | |
DPBS without Calcium and Magnesium (DPBS -/-) | Gibco | 14190250 | |
DPBS with Calcium and Magnesium (DPBS +/+) | Gibco | 11580456 | |
DMEM/F12 (-/-) | Gibco | 21331-020 | |
DMEM/F-12, GlutaMAX Supplement | Gibco | 31331-028 | |
EVOS XL Core Cell Imaging System | Thermo Fisher Scientific | ||
Goat anti-Mouse IgG (H+L) Highly Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 555 | Thermo Fisher Scientific | A21424 | |
GlutaMAX supplement | Gibco | 35050-038 | stabilized L-alanyl-L-glutamine dipeptid |
ImageJ 1.51v | National Institute of Health | ||
Insulin solution human | Sigma-Aldrich | I9278l | |
Laminin | Merck | L2020 | |
MACSQuant Analyzer | Miltenyi | ||
MAP2 Monoclonal Antibody (dilution 1: 300) | Thermo Fisher Scientific | 13-1500 | |
Matrigel Growth factor reduced, phenol-red free | Corning Life Science | 356231 | basement membrane matrix |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x) | Gibco | 11140035 | |
MicroAmp Optical Adhesive Film Kit | Thermo Fisher Scientific | 10095714 | |
mTeSR1 | Stemcell | 85850 | feeder-free iPSC maintenance medium |
N-2 Supplement (100x) | Gibco | 17502-048 | serum-free Supplement based on Bottenstein’s N-1 formulation |
Neurobasal Medium | Gibco | 11570556 | |
Nikon Eclipse TS2 | Nikon Instruments Europe B.V. | ||
NucleoCounter-NC200 | ChemoMetec A/S | ||
Origin 2021 | OriginLab | ||
Penicillin-Streptomycin | Gibco | 11548876 | |
Perm/Wash Buffer | BD Biosciences | 554723 | |
Primer assay TUBB3(Hs00801390_s1) | Thermo Fisher Scientific | 11620099 | |
Primer assay GAPDH (Hs99999905_m1) | Thermo Fisher Scientific | 11620099 | |
Primer assay GUSB (Hs99999908_m1) | Thermo Fisher Scientific | 11620099 | |
Primer assay HPRT1 (Hs99999909_m1) | Thermo Fisher Scientific | 11620099 | |
Primer assay MAP2 (Hs00258900_m1) | Thermo Fisher Scientific | 11620099 | |
Primer assay MAPT (Hs00902194_m1) | Thermo Fisher Scientific | 11620099 | |
Primer assay POU5F1 (Hs04260367_gH) | Thermo Fisher Scientific | 11620099 | |
Poly-L-ornithine 0.01% | Merck | P4957 | |
RNeasy Plus Micro Kit (50)-Kit | Qiagen | 74034 | column-based RNA isolation kit |
RLT Buffer | Qiagen | 79216 | cell lysis buffer |
Sodium Pyruvat (100 mM) | Gibco | 12539059 | |
StemPro Accutase | Gibco | 11599686 | cell dissociation enzyme |
TAQMAN FAST ADVANCED MASTER MIX | Thermo Fisher Scientific | 11380912 | qPCR master mix |
Triton-X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | |
TrypLE Select Enzym | Gibco | 12563-011 | Trypsin-EDTA solution |
UltraPure 0.5 M EDTA, pH 8.0 | Thermo Fisher Scientific | AM9260G | |
Via1-Cassette | ChemoMetec A/S | 941-0012 | |
Wide Bore Filtered Pipette Tips | Thermo Fisher Scientific | 10088880 | |
X20 OPTICAL 96WELL FAST CLEAR REACTION PLATES | Thermo Fisher Scientific | 15206343 | |
Y-27632 dihydrochloride, Rho kinase inhibitor (ROCK inhibitor) | Abcam | ab120129 |