在这里,我们提出了一个方案,描述了犬肠类器官在双室,可渗透的支持系统中的培养。描述了渗透性支撑物中的类器官接种、单层维持以及随后的药物渗透性实验。
渗透性支持系统通常与传统的二维(2D)细胞系结合使用,作为评估新治疗候选药物的口服渗透性的 体外 工具。然而,使用这些常规细胞系有局限性,例如紧密连接的表达改变,部分细胞分化以及缺乏关键的核受体。尽管存在这些缺点,Caco-2和MDCK模型在预测人体内口腔通透性 方面 被广泛接受和验证。
狗是生物医学研究的相关转化模型,因为它们在胃肠道解剖学和肠道菌群与人类相似。因此,为了支持平行药物开发,非常需要制定一种有效而准确的 体外 工具来预测狗和人类的 体内 药物渗透性特征。这种工具可以是犬肠类器官系统,其特征在于来自成体干细胞的三维(3D),自组装的上皮结构。
(1)渗透性支持播种方案描述了在插入片段中解离和播种犬类器官的实验方法。犬类器官分离、培养和收获之前在本期特刊的一组单独的实验方案中已有描述。犬肠类器官单层的一般维护方法在(2)单层维护方案中进行了彻底讨论。此外,该协议描述了通过跨上皮电阻(TEER)测量和光学显微镜评估单层结构完整性的方法。最后,(3)渗透性实验方案描述了直接在实验之前的任务,包括实验结果的 体外 验证。
总体而言,犬类器官模型与双室细胞培养技术相结合,克服了与2D实验模型相关的局限性,从而提高了对犬类和人类患者候选治疗药物的表观口服通透性预测的可靠性。
渗透性支持系统通常用于确定候选治疗药物通过肠上皮屏障1,2的表观渗透性。它们还可用于评估细胞分泌3,细胞迁移4和药物毒性5。 体外 口服药物渗透性测定是药物发现和开发过程中的关键步骤2,在药物研发生命周期的早期阶段对单个候选药物进行测试6。渗透性支撑系统是一种双室细胞培养装置,由放置在多孔板中的半孔膜的插入物组成。该系统允许直接进入在插入片段7中生长的细胞单层的顶侧和基底外侧。这些系统中使用的单层通常来源于胃肠道上皮细胞(例如,人结直肠腺癌Caco-2细胞系)8。细胞培养物在极化状态下生长,模仿肠上皮细胞的天然微结构,能够进一步分化细胞,类似的显微解剖学和功能7。透水支撑插件的详细信息可在 图 1 中找到。传统上用于评估肠道药物通透性的2D细胞培养物接种插入片段相对实惠且易于培养9。这些系统存在几个主要局限性,包括它们预测候选治疗药物10,11的肠道代谢能力有限。这适用于所有药物吸收机制,无论是通过上皮细胞之间的紧密连接处的被动吸收,通过外排的主动经上皮吸收,还是摄取转运蛋白(例如,P-糖蛋白,单羧酸盐转运蛋白1),以及由肠细胞代谢的药物。
狗与人类共享共同的环境和饮食12.犬肠解剖学和微生物组组成与人类13非常相似,这归因于过去36,000年的驯化和共享饮食14。不幸的是,这些相似之处也可能是疾病发展的常见原因/触发因素。狗发展出与人类相似的慢性发病率,例如肥胖15,炎症性肠病16,结直肠腺癌17,胃肠道间质瘤(GIST)18以及与相对长寿相关的各种其他病理19。因此,犬类器官可以成功地用于这些慢性多因素疾病的反向转化研究,本着“同一个健康倡议20”的精神。
Caco-2细胞是药物口服吸收测定中最常用的细胞系21。这些细胞目前被认为是体外肠通透性测定2,22,23的“金标准”模型。Caco-2细胞系表达在人肠道中发现的外排和摄取转运蛋白,尽管在不同的表达水平24,25,26下。Caco-2细胞也被广泛用作模型来确定药物是肠道外排转运蛋白的底物还是抑制剂22,27。虽然Caco-2细胞起源于结肠,但它们类似于肠细胞细胞。不幸的是,Caco-2细胞仅代表来自小肠9上皮层的一种细胞类型,其不能准确地概括复杂的肠上皮细胞类型组成。例如,Caco-2培养物中没有专用于粘液生产的杯状细胞,因此如果不与其他细胞系28共培养,就无法评估粘液 – 药物相互作用。此外,Caco-2 培养物不表达通常存在于肠道中的几种重要的核受体,例如孕酮 X 受体 (PXR)、类固醇 X 受体 (SXR) 和组成性雄甾烷受体 (CAR)29。因此,Caco-2 培养物无法模拟作为这些受体诱导剂的某些药物(例如利福平)对药物转运蛋白和酶的诱导30。
3D肠道类器官技术解决了其中的一些限制19.类器官是来自成体干细胞的自组装结构,可以从使用微侵入技术20收获的组织样本中建立。人诱导的多能干细胞正被用于肠道通透性模型31,32。犬类器官为人类类器官提供了相关的替代品,因为人类干细胞研究受到伦理问题的限制33.此外,犬类器官为探索犬类药物的通透性、代谢、活性转运和药物间相互作用提供了 一个体外 系统。为了解决这一技术差距,已经描述了犬肠类器官在可渗透支持系统中的持续和可靠生长34。与目前使用的测定相比,犬肠类器官的通透性测定可能潜在地预测犬肠通透性和小药物分子的代谢(Caco-2)。这些关键特征的确认使这种新颖 的体外 系统能够用于探索诱导剂对细胞内代谢和活性转运的潜在影响的工作。
犬类器官由通常存在于肠上皮层中的所有细胞类型组成。从功能和显微解剖学的角度来看,它们可靠地复制了犬类肠道上皮层的环境19,35。此外,犬肠类器官中粘液,犬类特异性药物转运蛋白和酶的存在以及整体细胞分化与狗体内看到的相当34。因此,类器官可以从患病的兽医患者中分离出来并用于模拟各种疾病过程(例如,慢性肠道炎症)对犬类口服药物通透性的影响19,36。犬肠类器官系统也可用于药物通透性实验以外的其他环境。这些3D结构也可以从先前由Chandra等人描述的用于炎症性肠病,结直肠腺癌和胃肠道间质瘤19的患病患者中分离出来。
渗透性支持播种方案描述了在插入物中建立犬肠类器官培养物的方法。第一个方案概述了分离接种在细胞外膜基质中的已建立的犬类器官培养物的方法。此外,本方案还讨论了插入片段与胶原I和细胞外膜基质的预涂层。还详细介绍了在可渗透支撑插入物中嵌入犬类器官。
第二个协议是单层维护协议,其中包括对镀在嵌件中的犬类3D类器官的一般维护。用于刷新培养物的类器官培养基的频率和体积,以及防止细胞培养损伤的方法,以及用于评估上皮单层汇合度的实验方法, 在第二个方案中提出。
最后,渗透率实验方案侧重于确定渗透性测定中的犬肠3D类器官是否已准备好进行实验使用的方法,以及在进行任何实验之前所需的验证步骤。本节还描述了渗透性实验的设置和成功执行,以及在单层培养物的腔室中孵育和取样治疗药物候选药物。还讨论了使用低渗透性荧光素异硫氰酸酯(FITC-葡聚糖)来监测单层完整性。最后,描述了一 种在 实验结束后验证结果的体外评价方法。渗透率实验是一个极其广泛的话题,Hubatsch等人很好地总结了这一点。 图 2 总结了协议的工作流程。
图1:可渗透支持系统上的犬肠类器官。 渗透性支撑插入物位于24孔板的孔中。微孔膜允许解离的犬肠类器官的接种,这些细胞最终将形成类器官2D单层。该技术允许访问单层的 AP 和 BL 侧。类器官介质被引入到可渗透支撑的AP室和BL室中。图示了候选药物的吸收(AP→BL→BL)和分泌(BL→AP),以及两种可能的药物运输方式。缩写: AP = 顶端;BL = 基底外侧。 请点击此处查看此图的大图。
图2:犬类类器官渗透性支持方案的工作流程。 将渗透性支撑插入物预涂有细胞外膜基质和胶原I的混合物,并孵育1小时。在孵育过程中,类器官培养物被解离。将单个类器官细胞接种在插入物中,接种后立即加入基底外侧室中的培养基,而在接种过程结束后24小时将培养基加入到顶端室中。类器官的维护和监测包括定期更换培养基、TEER值测量和光学显微镜检查,以评估单层的完整性。在实验之前,必须通过从培养基中除去ROCK抑制剂和GSKiβ来区分类器官。在实验当天测量TEER值,并通过光学显微镜检查类器官单层对细胞的损伤。然后将培养基更换为合适的缓冲液并在实验前孵育。FITC-葡聚糖测定在肠道通透性实验39 期间用作单层完整性的标志物。实验后进行TEER测量,光学显微镜将在24小时后验证结果。缩写:TEER =跨上皮电阻;岩石 = 罗氏相关激酶;GSKiβ = 糖原合酶激酶β;F = 荧光。 请点击此处查看此图的大图。
在可渗透支持装置中进行犬肠类器官培养是将传统药物通透性测定40 与新型 体外 犬模型41联系起来的独特概念。不同类型的犬肠类器官可以根据实验目标使用和评估,只需最小的调整。建议在每组3-4孔中测试多种浓度的目标药物。浓度可以基于药物的预期肠道浓度。此外,使用以前的研究可能有助于确定研究设计的适当时间点。应记录适当的研究设计文档,以提高可复制性并协助排除故障。
由于方法42的新颖性,该技术确实存在一些局限性,主要是由于实验设计和跨实验室执行协议缺乏标准化。这种缺乏标准化的问题已被其他43小组所承认,犬类3D类器官单层协议将导致实验室间再现性,并为该系统引入标准化。标准化的数据分析方法提高了可复制性,并且可以加强使用不同实验室渗透性支持系统中的犬类器官进行初步药物测试的结果。犬类3D类器官模型也缺乏将模型药物的 体外 Papp 值与其已知的人或犬 体内 肠道吸收进行比较的数据集,就像Caco-2细胞44,45,46一样。一旦生成了这些数据,就可以利用这种犬类器官模型来评估药物开发过程中的肠道通透性。
在可渗透支持系统上接种类器官时,必须小心谨慎,以接种足够高密度的适当解离细胞。当在严格的单层中生长时,系统的TEER值更加可靠和可重复。单层的长期培养可导致TEER值的指数增加,进一步达到肠道的生理值。然后,这种3D结构的H&E切片显示彼此上方的几层细胞,其肠细胞结构改变更靠近膜。
在犬肠类器官单层成功扩增后,可以通过计算药物的表观通透系数(Papp)公式44,以与传统2D细胞测定相同的方式分析结果。Papp 值(参见等式 (2))描述了在蜂窝单层47 上的传输速率。
(二)
这是 浓度与时间曲线(例如,nmol/s)的初始斜率。 A 是插入物的面积(cm2), C0 是供体室中药物或化合物的初始浓度37。可靠识别单层完整性是需要标准化的渗透率测定的关键部分。建议使用光学显微镜和TEER测量来评估渗透性支撑系统中的犬类器官,并帮助确定实验的正确时间。此外,零分子渗透性标记(例如,FITC-葡聚糖,路西法黄,PEG-400)可用于功能评估类器官单层完整性。如果测试的化合物受到转运蛋白的影响,则必须注意。P-糖蛋白(P-gp)被用作常见的外排泵示例。必须与众所周知的P-GP探针基板进行比较,生成一个外排比(P应用,蓝方应用,美化聚糖蓝本)。
光学显微镜(普通或相衬增强)是检查2D或3D单层和滤光片插入物完整性,同时评估可能的细胞过度生长的宝贵方法。图7可以作为识别健康犬肠类器官细胞培养物的指南。TEER值是细胞间连接形成和类器官培养物分化成完整肠上皮的重要指标。犬肠类器官分化为肠细胞和高脚杯细胞(图6)。这些产生粘液的细胞允许研究药物 – 粘液相互作用,这是使用传统的2D细胞培养物48难以实现的。Chandra等人先前已在犬肠类器官中证实了肠内分泌细胞的存在。
提供了使用TEM进一步表征来自空肠,回肠和结肠类器官的犬类器官单层。TEM图像显示了细胞微结构,包括紧密连接和微绒毛形成,进一步说明了这些类器官模型在转化医学中的复杂性和有用性。根据实验结果,在可渗透支撑物上的类器官培养物已准备好在播种后第11天和第13天之间进行实验(图9)。此时的 TEER 值介于 1,500 和 2,500 Ω.cm2 之间。TEER值的平台阶段持续非常有限的时间窗口,其中必须在TEER值开始缓慢下降之前开始实验。TEER值也可能是显示重要实验结果的关键部分,因为某些药物或药物产品赋形剂可能与单层(例如,紧密连接)相互作用,这会极大地影响TEER值读数。仅此一点就可以作为实验的数据。
双室细胞培养装置中的犬肠类器官可以应用于口腔药物渗透性以外的领域,因为所得细胞单层具有独特的结构。例如,它们可用于微生物学研究(例如,改变胃肠道微生物菌群的影响),病毒摄取研究,药物间相互作用和药物运输机制49。供体室通常充满所选的测试药物或化合物,并且在不同的时间点从受体室中取出等分试样。这些等分试样可以使用高效液相色谱、质谱、酶联免疫吸附测定或其他技术进行分析,以确定溶质通过单层渗透的量和速度。
这些研究需要完整的单层才能准确评估药物渗透性。这通常需要生长超过无法使用的井所需的单层。类器官细胞单层也可用于测量单层顶侧或基底侧的病毒摄取,读数包括免疫荧光测定 – 利用抗体来检测病毒的细胞摄取。最后,可以将多种药物(即底物和抑制剂)施用于供体室,以鉴定基于转运蛋白的药物间相互作用。
根据目前的观察结果,这些方法将不仅适用于培养插入物中的犬类器官,而且还适用于其他兽医物种和器官系统,只需稍作修改以最适合所选物种或器官模型。犬肠类器官生长的方案必须根据培养物的独特性质进行调整。因此,该协议可以调整到另一个物种,但需要对协议进行细微的更改。修饰可以从细胞接种密度的变化开始,然后扩展到培养基组成的变化,以适当地区分感兴趣的类器官。
标准化、实验程序的详细记录以及对细胞单层的一致监测是渗透支持测定中所需的关键实践,并且不仅限于犬类系统。这些可能的物种或器官修饰对于记录和报告该领域的进一步发展至关重要。该模型有几个局限性,例如,其成本要求,实验室间变异性以及预测 体内肠道吸收能力的有限数据。在某些情况下,狗拥有与人类不同的药物转运蛋白和代谢酶50。
此外,犬类器官系统必须在来自其他制造商的各种其它双室设备上进行测试,以确定这种模型的适用性(例如,必须确定不同滤膜组合物的适用性)。另一个缺点是,手稿的药物渗透性实验部分比前几部分描述性较差。这是由此字段中的信息过多引起的。这部分手稿的目的是以可修改的方式描述这些方法,同时不削减这些实验的基石。Hubatsch等人收集了有关渗透率实验的更详细信息。此外,可渗透插入片段可用于共培养、细胞迁移和侵袭测定实验4.
总之,双室培养装置中的犬肠类器官具有用于广泛应用的潜力,包括生物医学领域和转化医学,仅举几例。这些协议创建了几种策略来计划实验,并促进整个生物学领域类器官模型的实验室间数据可靠性。
The authors have nothing to disclose.
我们要感谢爱荷华州立大学兽医诊断实验室的员工,即海莉·兰伯特,艾米丽·拉赫,罗莎琳·布拉纳曼,维多利亚·格林和詹妮弗·格罗尔茨-画眉,及时处理样品。我们还要感谢乔迪·史密斯和贝桑·瓦伦丁为渗透率实验提供了材料。我们还要感谢大卫·迪亚兹-里根对图 9 的帮助。除图 6 外,所有数字均以 BioRender.com 创建。作者希望感谢教师创业公司,ISU VPR米勒奖,ISU VPR米勒奖和NSF SBIR子奖项对ISU # 1912948的支持。
Organoid media | |||
ROCK inhibitor (Y-27632) | EMD Millipore Corp. | SCM 075 | |
[Leu15]-Gastrin I human | Sigma | G9145-.5MG | |
A-83-01 | PeproTech | 9094360 | |
Advanced DMEM/F12 | Gibco | 12634-010 | |
B27 supplement | Gibco | 17504-044 | |
FBS | Corning | 35-010-CV | |
Glutamax | Gibco | 35050-061 | glutamine substitute |
HEPES | VWR Life Science | J848-500ML | |
Human R-Spondin-1 | PeproTech | 120-38-500UG | |
Murine EGF | PeproTech | 315-09-1MG | |
Murine Noggin | PeproTech | 250-38-250UG | |
Murine Wnt-3a | PeproTech | 315-20-10UG | |
N2 supplement | Gibco | 17502-048 | |
N-Acetyl-L-cysteine | Sigma | A9165-25G | |
Nicotinamide | Sigma | N0636-100G | |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | |
SB202190 (P38 inhibitor) | Sigma | S7067-25MG | |
Stemolecule CHIR99021 (GSK3β) | Reprocell | 04-0004-base | |
TMS (trimethoprim sulfate) | Sigma | T7883-5G | |
Reagents | |||
Acetic Acid, Glacial | Fisher Chemical | A38-500 | |
alpha-D(+)-Glucose, 99+%, anhydrous | Acros Organics | 170080010 | |
Cell Recovery Solution | Corning | 354253 | |
Collagen I, Rat Tail 3 mg/mL | Gibco | A10483-01 | |
FITC-CM-Dextran | Millipore Sigma | 68059-1G | |
Formaldehyde (37%) | Fisher Chemical | F79P-4 | |
Glutaraldehyde solution | Sigma | G5882 | |
HBSS (1x) | Gibco | 14025-076 | |
Matrigel Matrix For Organoid Culture | Corning | 356255 | Extracellular Membrane Matrix |
Paraformaldehyde, 97% | Alfa Aesar | A11313 | |
PBS, 1x (Phosphate-Buffered Saline) | Corning | 21-040-CM | |
TrypLE Express | Gibco | 12604-021 | Trypsin-like Protease |
Materials and Equipment | |||
15 mL Centrifuge Tube | Corning | 430766 | |
9" Pasteur Pipets | Fisherbrand | 13-678-6B | |
Corning Transwell 6.5 mm Polyester Membrane Inserts Preloaded in 24-Well Culture Plates, Pore Size: 0.4 µm, Sterile | Corning | 3470 | Permeable Support |
Millicell ERS (Probes) | Millipore Sigma | MERSSTX01 | |
Millicell ERS-2 Voltohmmeter | Millipore Sigma | MERS00002 | |
Panasonic incubator | Panasonic | MCO-170ML-PA | |
Parafilm M Wrapping Film | Bemis Company Inc | PM996/EMD | Flexible Laboratory Film |
Tissue Culture Plate 24 wells | Fisherbrand | FB012929 |