Summary

呼吸器ウイルス感染時の自然免疫細胞活性化研究のための非接触共培養モデル

Published: February 28, 2021
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Summary

このプロトコルは、ウイルス感染した鼻上皮細胞と先天性細胞活性化との間の初期の相互作用の調査を詳述する。免疫細胞の個々のサブセットは、ウイルス感染に応答したそれらの活性化に基づいて区別することができる。その後、それらをさらに調査して、早期の抗ウイルス反応に対するそれらの効果を決定することができる。

Abstract

ウイルス感染中の鼻上皮層と自然免疫細胞との間の初期の相互作用は、依然として未調査の領域である。ウイルス感染における自然免疫シグナル伝達の重要性は、高い先天性T細胞活性化を示す呼吸器感染症の患者がより良い疾患転帰を示すにつれて大幅に増加している。したがって、これらの初期の自然免疫相互作用を解剖することは、それらを支配するプロセスの解明を可能にし、ウイルス感染の早期進行を抑制または予防するための潜在的な治療標的および戦略の開発を促進する可能性がある。このプロトコルは、ウイルス感染気道上皮細胞によって分泌される因子からの自然免疫細胞の早期クロストーク、相互作用、および活性化を研究するために使用できる汎用性の高いモデルを詳述しています。H3N2インフルエンザウイルス(A/Aichi/2/1968)を代表的なウイルスモデルとして用い、共培養末梢血単核球(PBMC)の先天性細胞活性化をフローサイトメトリーを用いて解析し、ウイルス感染に応答して上皮から放出される可溶性因子によって活性化される細胞のサブセットを調べた。この結果は、細胞のサブセットを分化させるためのゲーティング戦略を実証し、PBMCの活性化集団と、対照および感染した上皮とのクロストークとの間の明確な違いを明らかにした。活性化されたサブセットをさらに分析して、それらの機能および細胞に特異的な分子変化を決定することができる。このようなクロストーク調査からの知見は、ウイルス感染の進行を制御および抑制するのに有益である重要な先天性細胞集団の活性化に重要な因子を明らかにする可能性がある。さらに、これらの要因は、異なるウイルス疾患、特に新たに出現したウイルスに普遍的に適用され、そのようなウイルスが素朴なヒト集団で最初に循環するときの影響を和らげることができる。

Introduction

呼吸器ウイルスは、おそらく深刻な医療と経済的負担を引き起こす最も広範な病原体の1つです。新興流行株(H1N1、H5N1、H3N2、MERS、COVID-19など)の定期的な世界的な流行から、毎年のインフルエンザの季節性株まで、ウイルスは公衆衛生にとって絶え間ない脅威です。ワクチンは、これらの世界的な公衆衛生上の課題に対する対応の主な部分を占めていますが、これらの対策が単に応答性が高いことに注意するのは冷静です1,2。さらに、新しい感染株の出現とそのワクチンの開発の成功との間の遅れは避けられず3、ウイルスの拡散を抑制するために利用可能な措置が非常に限られている期間につながる。

これらの遅れは、社会経済的および社会的に負わされるコストによってさらに強調されています。季節性インフルエンザだけでも、米国では年間約80億ドルの間接費、32億ドルの医療費、363万人の死亡の原因となっています4。これは、ワクチン開発に資金を提供するために必要な研究費を考慮する前のことです。重症急性呼吸器症候群コロノウイルス2(SARS-CoV-2)5,6,7の出現と急速な拡大によって引き起こされる世界的な混乱によって証明されるように、流行の流行は社会にさらに深刻な影響を及ぼし、毎年のグローバリゼーションの速度の増加によって悪化しています。

最近の研究では、活性化された先天性T細胞の集団が多い感染患者は、より良い疾患転帰を有する傾向があることが示されている8,9,10さらに、先天的T細胞集団は、粘膜関連不変T(MAIT)細胞、Vδ1γδT細胞、Vδ2γδT細胞、およびナチュラルキラーT(NKT)細胞の複数のサブグループに分類される。先天性T細胞のこれらのサブグループはまた、それらの集団内で不均一性を示し、自然免疫応答に関与する細胞集団間の相互作用の複雑さを増大させる11。したがって、これらの先天的T細胞を活性化するメカニズムおよび先天的T細胞の特定のサブグループの知識は、特にワクチン開発の期間中に、ヒト宿主に対するこれらのウイルスの感染効果を抑制するための異なる研究手段を提供する可能性がある。

インフルエンザに感染した上皮細胞は、先天性のT細胞を急速に活性化する因子を産生する121314この知見に基づいて、この非接触気液界面(ALI)共培養モデルは、感染初期の鼻上皮層とPBMCとの間の初期の化学的相互作用(感染上皮層によって放出される可溶性因子によって媒介される)を模倣することを目的としている。鼻上皮層(膜挿入物上で培養)とPBMC(下のチャンバー内)との間の物理的分離および上皮の完全性は、ウイルスによるPBMCの直接感染を防ぎ、PBMCに対する上皮由来可溶性因子の影響の詳細な研究を可能にする。したがって、同定された因子は、インフルエンザ感染から保護し得る適切な先天性T細胞集団を誘導する際のそれらの治療可能性についてさらに調査することができる。したがって、この論文は、上皮由来可溶性因子からの先天的T細胞活性化の研究のための共培養を確立する方法を詳述した。

Protocol

メモ: このプロトコルで使用されるメディアのレシピについては、 表 1 を参照してください。注:12ウェルトランスウェルで増殖したhNECSは、インフルエンザウイルスに感染すると可溶性因子が基底チャンバーに容易に到達するために、より最適な厚さに成長することが分かっている。したがって、共培養には12ウェルサイズのトランスウェルの使用が推奨されます。 <p class="…

Representative Results

従来のT細胞はウイルス感染に対する適応免疫応答の主なレパートリーを形成してウイルスクリアランスを促進するが、先天的T細胞集団はより広いスペクトルにわたって働き、後の段階で効果的なクリアランスのためにウイルス負荷を抑制する。したがって、このプロトコルは、同じドナーからの上皮および免疫細胞サンプルを必要とせずに、インフルエンザ感染後?…

Discussion

ウイルスに対する自然免疫応答は、抗ウイルス管理における研究の過小評価されている分野です。気道上皮細胞と自然免疫細胞は、ウイルス量がチェックにとどまらない場合、過活動適応応答の決定因子として機能するだけでなく、感染中のウイルス複製を抑制するために協調して働く12,13,17。しかしながら、適切な抗ウ?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

NUS耳鼻咽喉科と微生物学・免疫学部門の研究スタッフの皆様には、hNECの培養・ウイルス培養関連業務にご協力いただき、誠にありがとうございます。また、国立大学病院耳鼻咽喉科の外科医と外科チームには、研究に必要な細胞および血液サンプルの提供に協力していただき、感謝申し上げます。
この研究は、シンガポール国立医学研究評議会によって資金提供されました。NMRC/CIRG/1458/2016 (De Yun Wang宛) および MOH-OFYIRG19may-0007 (Kai Sen Tan宛).カイ・セン・タンは、欧州アレルギー・臨床免疫学(EAACI)リサーチフェローシップ2019からフェローシップ支援を受けています。

Materials

0.5% Trypsin-EDTA Gibco 15400-054
0.5 M Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), pH 8.0, RNase-free Thermofisher AM9260G 0.5M EDTA
1.5 mL SafeLock Tubes Eppendorf 0030120086 1.5mL Centrifuge Tube
10 mL K3EDTA Vacutainer Tubes BD 366643 10mL Blood Collection Tubes
10x dPBS Gibco 14200-075
10x PBS Vivantis PC0711
12-well Plate Corning  3513
12-well Transwell Insert Corning  3460 membrane insert
1x FACS Lysing Solution BD 349202
2.0 mL SafeLock Tubes Eppendorf 0030120094 2 mL centrifuge tube
24-well Plate Corning  3524
24-well Transwell Insert Corning  3470
3% Acetic Acid with Methylene Blue STEMCELL Technologies 07060
3,3',5-triiodo-l-thyronine Sigma T-074
37% Formaldehyde Solution w 15% Methanol as Stabilizer in H2O Sigma 533998
5810R Centrifuge Eppendorf 5811000320
5 mL polypropylene tubes (flow tubes) BD 352058
70 µm Cell Strainer Corning  431751
A-4-62 Rotor Eppendorf 5810709008
Accutase Gibco A1110501 Cell Dissociation Reagent
Antibiotic-Antimycotic Gibco 15240-062
Avicel CL-611 FMC Biopolymer NA Liquid Overlay
Bio-Plex Manager 6.2 Standard Software Bio-Rad Laboratories, Inc 171STND01 Multiplex Manager Software
Butterfly Needle 21 G BD 367287
Cholera Toxin Sigma C8052
Crystal Violet  Merck C6158
Cytofix/Cytoperm Solution BD 554722 Fixation and Permeabilization Solution
Dispase II Sigma D4693 Neutral Protease
DMEM/High Glucose GE Healthcare Life Sciences SH30243.01
DMEM/Nutrient Mixture F-12 Gibco-Invitrogen 11320033
dNTP Mix Promega U1515 dNTP Mix
EMEM (w L-Glutamine) ATCC 30-2003
EVOM voltohmmeter device WPI, Sarasota, FL, USA 300523
FACS Lysing Solution BD 349202 1x Lysing Solution
Falcon tube 15 mL CellStar 188271 15 mL tube
Falcon tube 50 mL CellStar 227261 50 mL Tube
Fast Start Essential DNA Probes Master Roche 6402682001 qPCR Master Mix
Ficoll Paque Premium Research Instruments 17544203 Density Gradient Media
H3N2 (A/Aichi/2/1968)  ATCC VR547
H3N2 M1 Forward Primer Sequence Sigma 5'- ATGGTTCTGGCCAGCACTAC-3'
H3N2 M1 Reverse Primer Sequence Sigma 5'- ATCTGCACCCCCATTCGTTT-3'
H3N2 NS1 Forward Primer Sequence Sigma 5'- ACCCGTGTTGGAAAGCAGAT-3'
H3N2 NS1 Reverse Primer Sequence Sigma 5'- CCTCTTCGGTGAAAGCCCTT-3'
Heat Inactivated Fetal Bovine Serum Gibco 10500-064
hNESPCs Human Donors NA
Human Epithelial Growth Factor Gibco-Invitrogen PHG0314
Hydrocortisone STEMCELL Techonologies 7925 Collected from nasal biopsies during septal deviation surgeries
Insulin Sigma I3536
Lightcycler 96 Roche 5815916001 qPCR Instrument
Live/DEAD Blue Cell Stain Kit *for UV Excitation Thermofisher L23105 Viability Stain
MILLIPLEX MAP Human Cytokine/Chemokine Magnetic Bead Panel II – Premixed 23 Plex Merck Pte Ltd HCP2MAG-62K-PX23 Immunology Multiplex Assay
Mitomycin C Sigma M4287
M-MLV 5x Buffer Promega M1705 RT-PCR 5x Buffer
M-MLV Reverse Transcriptase Promega M1706 Reverse Transcriptase
N-2 supplement Gibco-Invitrogen 17502-048
NIH/3T3 ATCC CRL1658
Perm/Wash Buffer BD 554723 Permeabilization Wash Buffer
PneumaCult-ALI 10x Supplement STEMCELL Techonologies 5001
PneumaCult-ALI Basal Medium STEMCELL Techonologies 5001
PneumaCult-ALI Maintenance Supplement (100x) STEMCELL Techonologies 5001
Random Primers Promega C1181 Random Primers
Recombinant Rnasin Rnase Inhibitor Promega N2511 RNase Inhibitor
RNA Lysis Buffer Qiagen Part of 52904
RPMI 1640 (w L-Glutamine) ATCC 30-2001
STX2 electrodes WPI, Sarasota, FL, USA STX2 Electrode
T25 Flask Corning 430639
T75 Flask Corning 430641U
TPCK Trypsin Sigma T1426
Trypan Blue Hyclone SV30084.01
Viral RNA Extraction Kit Qiagen 52904 Viral RNA Extraction Kit
V-Shaped 96-well Plate Corning 3894

References

  1. Monto, A. S. Vaccines and antiviral drugs in pandemic preparedness. Emerging Infectious Diseases. 12 (1), 55-60 (2006).
  2. Lightfoot, N., Rweyemamu, M., Heymann, D. L. Preparing for the next pandemic. The British Medical Journal. 346, 364 (2013).
  3. Gerdil, C. The annual production cycle for influenza vaccine. Vaccine. 21 (16), 1776-1779 (2003).
  4. Putri, W., Muscatello, D. J., Stockwell, M. S., Newall, A. T. Economic burden of seasonal influenza in the United States. Vaccine. 36 (27), 3960-3966 (2018).
  5. Mas-Coma, S., Jones, M. K., Marty, A. M. COVID-19 and globalization. One Health. 9, 100132 (2020).
  6. Guo, Y. R., et al. The origin, transmission and clinical therapies on coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak – an update on the status. Military Medical Research. 7 (1), 11 (2020).
  7. Guan, W. J., et al. Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China. New England Journal of Medicine. 382, 1708-1720 (2020).
  8. van Wilgenburg, B., et al. MAIT cells are activated during human viral infections. Nature Communications. 7, 11653 (2016).
  9. Chien, Y. H., Meyer, C., Bonneville, M. Gammadelta T cells: first line of defense and beyond. Annual Review of Immunology. 32, 121-155 (2014).
  10. van Wilgenburg, B., et al. MAIT cells contribute to protection against lethal influenza infection in vivo. Nature Communications. 9 (1), 4706 (2018).
  11. Dias, J., Leeansyah, E., Sandberg, J. K. Multiple layers of heterogeneity and subset diversity in human MAIT cell responses to distinct microorganisms and to innate cytokines. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114 (27), 5434-5443 (2017).
  12. Yan, Y., et al. Human nasal epithelial cells derived from multiple individuals exhibit differential responses to H3N2 influenza virus infection in vitro. Journal of Allergy and Clinical Immunology. 138 (1), 276-281 (2016).
  13. Luukkainen, A., et al. A co-culture model of PBMC and stem cell derived human nasal epithelium reveals rapid activation of NK and innate T cells upon Influenza A virus infection of the nasal epithelium. Frontiers in Immunology. 9, 2514 (2018).
  14. Tan, K. S., et al. RNA sequencing of H3N2 influenza virus-infected human nasal epithelial cells from multiple subjects reveals molecular pathways associated with tissue injury and complications. Cells. 8 (9), 986 (2019).
  15. Kim, N., et al. Effect of lipopolysaccharide on diesel exhaust particle-induced junctional dysfunction in primary human nasal epithelial cells. Environmental Pollution. 248, 736-742 (2019).
  16. Tan, K., et al. In vitro model of fully differentiated human nasal epithelial cells infected with rhinovirus reveals epithelium-initiated immune responses. Journal of Infectious Diseases. 217 (6), 906-915 (2018).
  17. Tan, K. S., et al. Comparative transcriptomic and metagenomic analyses of influenza virus-infected nasal epithelial cells from multiple individuals reveal specific nasal-initiated signatures. Frontiers in Microbiology. 9, 2685 (2018).
  18. Cytokine /Chemokine Panel II 96 Well Plate Assay. Millipore Corporation Available from: https://www.merckmillipore.com/SG/en/product/MILLIPLEX-MAP-Human-Cytokine-Chemokine-Magnetic-Bead-Panel-II-Premixed-23-Plex-Immunology-Multiplex-Assay (2020)
  19. Gamage, A. M., et al. Infection of human nasal epithelial cells with SARS-CoV-2 and a 382-nt deletion isolate lacking ORF8 reveals similar viral kinetics and host transcriptional profiles. PLoS Pathogens. 16 (12), 1009130 (2020).
  20. Zhao, X. N., et al. The use of nasal epithelial stem/progenitor cells to produce functioning ciliated cells in vitro. American Journal of Rhinology & Allergy. 26 (5), 345-350 (2012).

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Cite This Article
Lew, Z. Z. R., Liu, J., Ong, H. H., Tan, V. J., Luukkainen, A., Ong, Y. K., Thong, M., Puan, K. J., Chow, V. T. K., Tan, K. S., Wang, D. Y. Contact-Free Co-Culture Model for the Study of Innate Immune Cell Activation During Respiratory Virus Infection. J. Vis. Exp. (168), e62115, doi:10.3791/62115 (2021).

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