Summary

Contactvrij co-kweekmodel voor de studie van innate immuuncelactivering tijdens respiratoire virusinfectie

Published: February 28, 2021
doi:

Summary

Dit protocol beschrijft een onderzoek naar de vroege interacties tussen viraal geïnfecteerde neusepitheelcellen en aangeboren celactivatie. Individuele subsets van immuuncellen kunnen worden onderscheiden op basis van hun activering als reactie op virale infecties. Ze kunnen vervolgens verder worden onderzocht om hun effecten op vroege antivirale reacties te bepalen.

Abstract

De vroege interacties tussen de neusepitheellaag en de aangeboren immuuncellen tijdens virale infecties blijven een onderbelicht gebied. De betekenis van aangeboren immuniteitssignalering bij virale infecties is aanzienlijk toegenomen naarmate patiënten met luchtweginfecties die een hoge aangeboren T-celactivatie vertonen, een beter ziekteresultaat vertonen. Vandaar dat het ontleden van deze vroege aangeboren immuuninteracties de opheldering mogelijk maakt van de processen die ze beheersen en de ontwikkeling van potentiële therapeutische doelen en strategieën voor het dempen of zelfs voorkomen van vroege progressie van virale infecties kan vergemakkelijken. Dit protocol beschrijft een veelzijdig model dat kan worden gebruikt om vroege overspraak, interacties en activering van aangeboren immuuncellen te bestuderen van factoren die worden uitgescheiden door viraal geïnfecteerde luchtwegepitheelcellen. Met behulp van een H3N2-influenzavirus (A /Aichi / 2/1968) als het representatieve virusmodel, is aangeboren celactivering van co-gekweekte perifere bloedmononucleaire cellen (PBMC’s) geanalyseerd met behulp van flowcytometrie om de subsets van cellen te onderzoeken die worden geactiveerd door de oplosbare factoren die vrijkomen uit het epitheel als reactie op de virale infectie. De resultaten tonen de gating-strategie voor het differentiëren van de subsets van cellen en onthullen de duidelijke verschillen tussen de geactiveerde populaties van PBMC’s en hun kruisverwijzing met het controle- en geïnfecteerde epitheel. De geactiveerde subsets kunnen vervolgens verder worden geanalyseerd om hun functies en moleculaire veranderingen specifiek voor de cellen te bepalen. Bevindingen van een dergelijk kruisverwijzingsonderzoek kunnen factoren blootleggen die belangrijk zijn voor de activering van vitale aangeboren celpopulaties, die gunstig zijn bij het beheersen en onderdrukken van de progressie van virale infectie. Bovendien kunnen deze factoren universeel worden toegepast op verschillende virale ziekten, vooral op nieuw opkomende virussen, om de impact van dergelijke virussen te dempen wanneer ze voor het eerst circuleren in naïeve menselijke populaties.

Introduction

Respiratoire virussen behoren misschien wel tot de meest voorkomende ziekteverwekkers die ernstige gezondheids- en economische lasten veroorzaken. Van de periodieke wereldwijde uitbraken van opkomende epidemische stammen (bijv. H1N1, H5N1, H3N2, MERS, COVID-19) tot de seizoensgebonden stammen van influenza elk jaar, virussen vormen een constante bedreiging voor de volksgezondheid. Hoewel vaccins het grootste deel van het antwoord vormen op deze wereldwijde uitdagingen op het gebied van de volksgezondheid, is het ontnuchterend om op te merken dat deze tegenmaatregelen slechts responsief zijn 1,2. Bovendien is een vertraging tussen de opkomst van een nieuwe infectieuze stam en de succesvolle ontwikkeling van het vaccin onvermijdelijk3, wat leidt tot een periode waarin de beschikbare maatregelen om de verspreiding van het virus te beteugelen zeer beperkt zijn.

Deze vertragingen worden verder benadrukt door de kosten die worden toegebracht aan de samenleving – economisch en sociaal. De seizoensgriep alleen al is verantwoordelijk voor ongeveer $ 8 miljard aan indirecte kosten, $ 3,2 miljard aan medische kosten en 36,3 duizend sterfgevallen in de Verenigde Staten van Amerika per jaar4. Dit is voordat rekening wordt gehouden met de onderzoekskosten die nodig zijn om de ontwikkeling van vaccins te financieren. Epidemische uitbraken hebben nog ernstiger gevolgen voor de samenleving, verergerd door de toenemende globalisering elk jaar, zoals blijkt uit de wereldwijde verstoringen veroorzaakt door de opkomst en snelle verspreiding van ernstig acuut respiratoir syndroom coronovirus 2 (SARS-CoV-2)5,6,7.

Recente studies hebben aangetoond dat geïnfecteerde patiënten met een grotere populatie van geactiveerde aangeboren T-cellen de neiging hebben om een beter ziekteresultaat te hebben 8,9,10. Verder is de aangeboren T-celpopulatie onderverdeeld in meerdere subgroepen: de mucosaal-geassocieerde invariante T (MAIT) cellen, Vδ1 γδ T cellen, Vδ2 γδ T cellen en de natural killer T (NKT) cellen. Deze subgroepen van aangeboren T-cellen vertonen ook heterogeniteit binnen hun populaties, waardoor de complexiteit van de interacties tussen de celpopulaties die betrokken zijn bij de aangeboren immuunresponstoeneemt 11. Vandaar dat het mechanisme dat deze aangeboren T-cellen activeert en de kennis van de specifieke subgroepen van aangeboren T-cellen een andere manier van onderzoek kunnen bieden om de infectieuze effecten van deze virussen op de menselijke gastheer te beperken, vooral tijdens de periode van vaccinontwikkeling.

Epitheelcellen geïnfecteerd door influenza produceren factoren die aangeboren T-cellen snel activeren 12,13,14. Voortbouwend op die bevinding heeft dit contactloze Air-Liquid Interface (ALI) co-kweekmodel tot doel de vroege chemische interacties (gemedieerd door oplosbare factoren die vrijkomen door de geïnfecteerde epitheellaag) tussen de geïnfecteerde nasale epitheellaag en de PBMC’s na te bootsen tijdens vroege infectie. De fysieke scheiding tussen de nasale epitheellaag (gekweekt op membraaninzetstukken) en de PBMC’s (in de kamer eronder) en de epitheliale integriteit voorkomen directe infectie van de PBMC’s door het virus, waardoor een gedetailleerde studie mogelijk is van de effecten van epitheliale oplosbare factoren op de PBMC’s. De geïdentificeerde factoren kunnen daarom verder worden onderzocht op hun therapeutisch potentieel bij het induceren van de juiste aangeboren T-celpopulatie die kan beschermen tegen influenza-infectie. Dit artikel heeft daarom de methoden beschreven voor het vaststellen van een co-cultuur voor de studie van aangeboren T-celactivatie van epitheel-afgeleide oplosbare factoren.

Protocol

OPMERKING: Raadpleeg tabel 1 voor recepten van media die in dit protocol worden gebruikt.OPMERKING: hNECS gekweekt op 12-well transwell blijken te groeien tot een meer optimale dikte voor oplosbare factoren om de basale kamer gemakkelijk te bereiken wanneer ze zijn geïnfecteerd met het influenzavirus. Daarom wordt het gebruik van transwell van 12-wells formaat voor co-cultuur aanbevolen. 1. Vaststelling van de 3T3-feederlaag Inrichting uit bevroren voorraden…

Representative Results

Hoewel conventionele T-cellen het belangrijkste repertoire vormen van adaptieve immuunrespons tegen virale infectie om virale klaring te vergemakkelijken, werkt de aangeboren T-celpopulatie over een breder spectrum om de virale lading te onderdrukken voor effectieve klaring in een later stadium. Daarom creëert dit protocol specifiek een robuuste voorwaarde om aangeboren T-cellen, hun activering en hun functionele populatie na influenza-infectie te bestuderen, zonder epitheliale en immuun…

Discussion

Aangeboren immuunresponsen tegen virussen zijn een onderbelicht vakgebied in antivirale management. De luchtwegepitheelcellen en aangeboren immuuncellen werken samen om virale replicatie tijdens een infectie te onderdrukken, naast het dienen als een determinant van overactieve adaptieve respons als de virale lading niet onder controle wordt gehouden 12,13,17. De ontwikkeling van een relevant menselijk model voor de studie van ep…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We willen de onderzoeksmedewerkers van de NUS-afdeling Otolaryngologie en de afdeling Microbiologie en Immunologie bedanken voor hun hulp bij het hNEC-cultuur- en virale cultuurgerelateerde werk. We willen ook de chirurgen en het chirurgische team in het National University Hospital, Department of Otolaryngology, bedanken voor hun hulp bij het verstrekken van de cel- en bloedmonsters die nodig zijn voor de studie.
Deze studie werd gefinancierd door de National Medical Research Council, Singapore No. NMRC/CIRG/1458/2016 (aan De Yun Wang) en MOH-OFYIRG19may-0007 (aan Kai Sen Tan). Kai Sen Tan is een ontvanger van fellowship-ondersteuning van European Allergy and Clinical Immunology (EAACI) Research Fellowship 2019.

Materials

0.5% Trypsin-EDTA Gibco 15400-054
0.5 M Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), pH 8.0, RNase-free Thermofisher AM9260G 0.5M EDTA
1.5 mL SafeLock Tubes Eppendorf 0030120086 1.5mL Centrifuge Tube
10 mL K3EDTA Vacutainer Tubes BD 366643 10mL Blood Collection Tubes
10x dPBS Gibco 14200-075
10x PBS Vivantis PC0711
12-well Plate Corning  3513
12-well Transwell Insert Corning  3460 membrane insert
1x FACS Lysing Solution BD 349202
2.0 mL SafeLock Tubes Eppendorf 0030120094 2 mL centrifuge tube
24-well Plate Corning  3524
24-well Transwell Insert Corning  3470
3% Acetic Acid with Methylene Blue STEMCELL Technologies 07060
3,3',5-triiodo-l-thyronine Sigma T-074
37% Formaldehyde Solution w 15% Methanol as Stabilizer in H2O Sigma 533998
5810R Centrifuge Eppendorf 5811000320
5 mL polypropylene tubes (flow tubes) BD 352058
70 µm Cell Strainer Corning  431751
A-4-62 Rotor Eppendorf 5810709008
Accutase Gibco A1110501 Cell Dissociation Reagent
Antibiotic-Antimycotic Gibco 15240-062
Avicel CL-611 FMC Biopolymer NA Liquid Overlay
Bio-Plex Manager 6.2 Standard Software Bio-Rad Laboratories, Inc 171STND01 Multiplex Manager Software
Butterfly Needle 21 G BD 367287
Cholera Toxin Sigma C8052
Crystal Violet  Merck C6158
Cytofix/Cytoperm Solution BD 554722 Fixation and Permeabilization Solution
Dispase II Sigma D4693 Neutral Protease
DMEM/High Glucose GE Healthcare Life Sciences SH30243.01
DMEM/Nutrient Mixture F-12 Gibco-Invitrogen 11320033
dNTP Mix Promega U1515 dNTP Mix
EMEM (w L-Glutamine) ATCC 30-2003
EVOM voltohmmeter device WPI, Sarasota, FL, USA 300523
FACS Lysing Solution BD 349202 1x Lysing Solution
Falcon tube 15 mL CellStar 188271 15 mL tube
Falcon tube 50 mL CellStar 227261 50 mL Tube
Fast Start Essential DNA Probes Master Roche 6402682001 qPCR Master Mix
Ficoll Paque Premium Research Instruments 17544203 Density Gradient Media
H3N2 (A/Aichi/2/1968)  ATCC VR547
H3N2 M1 Forward Primer Sequence Sigma 5'- ATGGTTCTGGCCAGCACTAC-3'
H3N2 M1 Reverse Primer Sequence Sigma 5'- ATCTGCACCCCCATTCGTTT-3'
H3N2 NS1 Forward Primer Sequence Sigma 5'- ACCCGTGTTGGAAAGCAGAT-3'
H3N2 NS1 Reverse Primer Sequence Sigma 5'- CCTCTTCGGTGAAAGCCCTT-3'
Heat Inactivated Fetal Bovine Serum Gibco 10500-064
hNESPCs Human Donors NA
Human Epithelial Growth Factor Gibco-Invitrogen PHG0314
Hydrocortisone STEMCELL Techonologies 7925 Collected from nasal biopsies during septal deviation surgeries
Insulin Sigma I3536
Lightcycler 96 Roche 5815916001 qPCR Instrument
Live/DEAD Blue Cell Stain Kit *for UV Excitation Thermofisher L23105 Viability Stain
MILLIPLEX MAP Human Cytokine/Chemokine Magnetic Bead Panel II – Premixed 23 Plex Merck Pte Ltd HCP2MAG-62K-PX23 Immunology Multiplex Assay
Mitomycin C Sigma M4287
M-MLV 5x Buffer Promega M1705 RT-PCR 5x Buffer
M-MLV Reverse Transcriptase Promega M1706 Reverse Transcriptase
N-2 supplement Gibco-Invitrogen 17502-048
NIH/3T3 ATCC CRL1658
Perm/Wash Buffer BD 554723 Permeabilization Wash Buffer
PneumaCult-ALI 10x Supplement STEMCELL Techonologies 5001
PneumaCult-ALI Basal Medium STEMCELL Techonologies 5001
PneumaCult-ALI Maintenance Supplement (100x) STEMCELL Techonologies 5001
Random Primers Promega C1181 Random Primers
Recombinant Rnasin Rnase Inhibitor Promega N2511 RNase Inhibitor
RNA Lysis Buffer Qiagen Part of 52904
RPMI 1640 (w L-Glutamine) ATCC 30-2001
STX2 electrodes WPI, Sarasota, FL, USA STX2 Electrode
T25 Flask Corning 430639
T75 Flask Corning 430641U
TPCK Trypsin Sigma T1426
Trypan Blue Hyclone SV30084.01
Viral RNA Extraction Kit Qiagen 52904 Viral RNA Extraction Kit
V-Shaped 96-well Plate Corning 3894

References

  1. Monto, A. S. Vaccines and antiviral drugs in pandemic preparedness. Emerging Infectious Diseases. 12 (1), 55-60 (2006).
  2. Lightfoot, N., Rweyemamu, M., Heymann, D. L. Preparing for the next pandemic. The British Medical Journal. 346, 364 (2013).
  3. Gerdil, C. The annual production cycle for influenza vaccine. Vaccine. 21 (16), 1776-1779 (2003).
  4. Putri, W., Muscatello, D. J., Stockwell, M. S., Newall, A. T. Economic burden of seasonal influenza in the United States. Vaccine. 36 (27), 3960-3966 (2018).
  5. Mas-Coma, S., Jones, M. K., Marty, A. M. COVID-19 and globalization. One Health. 9, 100132 (2020).
  6. Guo, Y. R., et al. The origin, transmission and clinical therapies on coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak – an update on the status. Military Medical Research. 7 (1), 11 (2020).
  7. Guan, W. J., et al. Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China. New England Journal of Medicine. 382, 1708-1720 (2020).
  8. van Wilgenburg, B., et al. MAIT cells are activated during human viral infections. Nature Communications. 7, 11653 (2016).
  9. Chien, Y. H., Meyer, C., Bonneville, M. Gammadelta T cells: first line of defense and beyond. Annual Review of Immunology. 32, 121-155 (2014).
  10. van Wilgenburg, B., et al. MAIT cells contribute to protection against lethal influenza infection in vivo. Nature Communications. 9 (1), 4706 (2018).
  11. Dias, J., Leeansyah, E., Sandberg, J. K. Multiple layers of heterogeneity and subset diversity in human MAIT cell responses to distinct microorganisms and to innate cytokines. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114 (27), 5434-5443 (2017).
  12. Yan, Y., et al. Human nasal epithelial cells derived from multiple individuals exhibit differential responses to H3N2 influenza virus infection in vitro. Journal of Allergy and Clinical Immunology. 138 (1), 276-281 (2016).
  13. Luukkainen, A., et al. A co-culture model of PBMC and stem cell derived human nasal epithelium reveals rapid activation of NK and innate T cells upon Influenza A virus infection of the nasal epithelium. Frontiers in Immunology. 9, 2514 (2018).
  14. Tan, K. S., et al. RNA sequencing of H3N2 influenza virus-infected human nasal epithelial cells from multiple subjects reveals molecular pathways associated with tissue injury and complications. Cells. 8 (9), 986 (2019).
  15. Kim, N., et al. Effect of lipopolysaccharide on diesel exhaust particle-induced junctional dysfunction in primary human nasal epithelial cells. Environmental Pollution. 248, 736-742 (2019).
  16. Tan, K., et al. In vitro model of fully differentiated human nasal epithelial cells infected with rhinovirus reveals epithelium-initiated immune responses. Journal of Infectious Diseases. 217 (6), 906-915 (2018).
  17. Tan, K. S., et al. Comparative transcriptomic and metagenomic analyses of influenza virus-infected nasal epithelial cells from multiple individuals reveal specific nasal-initiated signatures. Frontiers in Microbiology. 9, 2685 (2018).
  18. Cytokine /Chemokine Panel II 96 Well Plate Assay. Millipore Corporation Available from: https://www.merckmillipore.com/SG/en/product/MILLIPLEX-MAP-Human-Cytokine-Chemokine-Magnetic-Bead-Panel-II-Premixed-23-Plex-Immunology-Multiplex-Assay (2020)
  19. Gamage, A. M., et al. Infection of human nasal epithelial cells with SARS-CoV-2 and a 382-nt deletion isolate lacking ORF8 reveals similar viral kinetics and host transcriptional profiles. PLoS Pathogens. 16 (12), 1009130 (2020).
  20. Zhao, X. N., et al. The use of nasal epithelial stem/progenitor cells to produce functioning ciliated cells in vitro. American Journal of Rhinology & Allergy. 26 (5), 345-350 (2012).

Play Video

Cite This Article
Lew, Z. Z. R., Liu, J., Ong, H. H., Tan, V. J., Luukkainen, A., Ong, Y. K., Thong, M., Puan, K. J., Chow, V. T. K., Tan, K. S., Wang, D. Y. Contact-Free Co-Culture Model for the Study of Innate Immune Cell Activation During Respiratory Virus Infection. J. Vis. Exp. (168), e62115, doi:10.3791/62115 (2021).

View Video