Hier wird eine wirksame Methode beschrieben, wie man hohe virale Titerbestände an Hepatitis-E-Viren (HEV) produziert, um Häpatomzellen effizient zu infizieren. Mit der vorgestellten Methode können sowohl nicht umhüllte als auch umhüllte Viruspartikel geerntet und zur Impfung verschiedener Zelllinien verwendet werden.
Hepatitis E Virus ist die Hauptursache für Leberzirrhose und Leberversagen mit zunehmender Prävalenz weltweit. Das einsträngige RNA-Virus wird überwiegend durch Bluttransfusionen, unzureichende hygienische Bedingungen und kontaminierte Lebensmittel übertragen. Bis heute ist das off-Label-Medikament Ribavirin (RBV) für viele Patienten die Behandlung der Wahl. Dennoch muss noch eine spezifische HEV-Behandlung identifiziert werden. Bisher wurde das Wissen über den HEV-Lebenszyklus und die Pathogenese durch das Fehlen eines effizienten HEV-Zellkultursystems stark behindert. Ein robustes Zellkultursystem ist für die Untersuchung des viralen Lebenszyklus unerlässlich, der auch die virale Pathogenese umfasst. Mit der hier beschriebenen Methode kann man virale Titer von bis zu 3 x 106 Fokusbildeinheit/ml (FFU/ml) von nicht umhüllter HEV und bis zu 5 x 104 FFU/ml umhüllter HEV produzieren. Mit diesen Partikeln ist es möglich, eine Vielzahl von Zellen unterschiedlicher Herkunft zu infizieren, einschließlich Primärzellen und menschlichen, sowie tierischen Zelllinien. Die Produktion von infektiösen HEV-Partikeln aus Plasmiden stellt eine unendliche Quelle dar, die dieses Protokoll außerordentlich effizient macht.
Hepatitis E ist eine ziemlich unterschätzte Krankheit mit zunehmender Verbreitung weltweit. Etwa 20 Millionen Infektionen führen zu mehr als 70.000 Todesfällen pro Jahr1. Das zugrunde liegende Mittel, das Hepatitis-E-Virus (HEV), wurde vor kurzem neu zugewiesen und ist nun in der Familie Hepeviridae einschließlich der Gattungen Orthohepevirus und Piscihepevirus klassifiziert. HEV verschiedener Herkunft werden innerhalb der Art Orthohepevirus A-D einschließlich Isolate n. Mensch, Schwein, Kaninchen, Ratten, Vögel und andere Säugetiere2eingestuft. Derzeit wurden acht verschiedene Genotypen (GT) des positiv-orientierten, einsträngigen RNA-Virus identifiziert2. Obwohl sie sich in ihrer Sequenzidentität, den Übertragungswegen und der geographischen Verteilung unterscheiden, ist ihre genomische Struktur stark konserviert. Genauer ist, dass das 7,2 kbp HEV Genom in 3 große offene Leserahmen (ORF1-3) unterteilt ist. Während ORF1 alle Enzyme kodiert, die für eine erfolgreiche Replikation innerhalb der Hostzelle benötigt werden, kodiert ORF2 das Capsid-Protein und das ORF3-Protein als funktioneller Ionenkanal, der für die Montage und Freisetzung von InfektiösePartikelnbenötigt wird 3 . Einmal in das Basal- oder apikales Lumen freigesetzt, existiert HEV sowohl bei quasi umhüllten als auch bei nicht umhüllten/nackten Arten, je nachdem, ob das Virus aus Blut oder Kot stammt bzw.4,5.
Während GT1 und GT2 hauptsächlich in Entwicklungsländern gefunden werden, die Menschen6 nur über den fäkal-oralen Weg infizieren, GT3, GT4 und GT7 kommen vorwiegend in entwickelten Ländern1,7 mit einer Vielzahl von Arten als Reservoirs dienen, z.B., Schweine8, Ratte9, Huhn10,11, Hirsch12, Mongoose13, Fledermaus14, Kaninchen15,16, Wildschwein17 und viele mehr 77,18,19, beweise Zoonose7,20,21,22. Neben unzureichenden sanitären Bedingungen23 und kontaminierte Lebensmittel12,24,25,26, Übertragung über Bluttransfusion und Organtransplantationen ist auch möglich27,28. HEV ist eine häufige Ursache für Leberzirrhose und Leberversagen29 vor allem bei Patienten mit bereits bestehenden Lebererkrankungen, immungeschwächten Personen (Genotyp 3, 4 und 7) und Schwangeren (Genotyp 1). Bemerkenswert ist, dass es auch extrahepatische Manifestationen wie hämatopoetische Erkrankungen30,31,32, neurologische Erkrankungen33 und Nierenverletzungen34.
Bis heute ist das off-Label-Medikament Ribavirin (RBV) die Behandlung der Wahl für viele infizierte Patienten35,36. Jedoch, Fälle von Behandlungsversagen und schlechte klinische langfristige Ergebnisse wurden berichtet. Behandlungsversagen wurde mit viraler Mutagenese und erhöhter viraler Heterogenität bei chronisch infizierten Patienten37,38,39zusammengebracht. Im Gegenteil, eine kürzlich durchgeführte europäische retrospektive multizentrische Studie war nicht in der Lage, Polymerase-Mutationen mit Einem Fehler bei der RBV-Behandlung40zu korrelieren. In klinischen Beobachtungen und In-vitro-Experimenten haben Interferon41,42,43, sofosbuvir44,45, Zinksalze46 und Silvestrol47,48 ebenfalls antivirale Wirkungen gezeigt. Dennoch bleibt eine spezifische HEV-Behandlung zu finden, die durch das mangelnde Wissen über den HEV-Lebenszyklus und seine Pathogenese behindert wird. Daher ist ein robustes Zellkultursystem für virologische Studien und die Entwicklung neuer antiviraler Medikamente dringend erforderlich49.
Leider ist HEV, wie andere Hepatitis-Viren, in konventionellen Zelllinien schwer zu vermehren und entwickelt sich in der Regel sehr langsam, was zu niedrigen Virusbelastungen führt. Dennoch waren einige Gruppen in der Lage, die Viruslast durch die Erzeugung von Zelllinien-Subklonen50 oder die Einstellung von Medienergänzungen51zu steigern. Kürzlich die Erzeugung von cDNA-Klone52 und die Anpassung von Primären-Patientenisolaten durch Passaging53,54 weiter verbesserte HEV-Vermehrung in der Zellkultur55. In diesem Protokoll verwendeten wir das Genom eines zellkulturangepassten Kernow-C1-Stamms (bezeichnet als p6_WT)54 und einen mutierten Stamm, der eine replikationsverstärkende Mutation (p6_G1634R)37. Kernow-C1 ist die am häufigsten verwendete Sorte in der HEV-Zellkultur und ist in der Lage, hohe Viruslasten zu produzieren. Durch die Bewertung viraler RNA-Kopierzahlen kann die HEV-Replikation in vitro überwacht werden. Diese Techniken erlauben jedoch keine Bewertung der Anzahl der erzeugten infektiösen Partikel. Daher haben wir eine Immunfluoreszenzfärbung zur Bestimmung von Fokusbildungseinheiten (FFU/ml) etabliert.
Die hier beschriebene Methode56 kann verwendet werden, um infektiöse Viruspartikel in voller Länge zu produzieren, die in der Lage sind, eine Vielzahl von Zelltypen unterschiedlicher Herkunft zu infizieren, einschließlich Primärzellen und Säugetierzelllinien. Dies ist eine grundvoraussetzung, um wichtige Aspekte der HEV-Infektion und des Tropismus zu entschlüsseln. Es besteht keine Notwendigkeit für impfungen mit in der Regel begrenzten Patientenisolaten. Die Produktion von infektiösen HEV-Partikeln aus Plasmiden stellt eine unendliche Quelle dar, die dieses Protokoll vergleichsweise effizient macht. Darüber hinaus kann dieses System für die Reverse-Genetik verwendet werden, die die Untersuchung der in vivo identifizierten Genomveränderung und ihrer Auswirkungen auf die HEV-Replikation und -Fitness ermöglicht. Diese Technik überwindet viele Einschränkungen und kann den Weg für die Arzneimittelentwicklung, Mutagenesestudien und die Bewertung von Virus-Host-Wechselwirkungen wie Restriktions- oder Eintrittsfaktoren ebnen.
Beginnend mit der Plasmidpräparation sollten die DNA-Erträge 150 ng/l überschreiten, um eine multiple Linearisierung aus demselben Plasmidbestand durchführen zu können, was das Risiko einer durch Bakterien induzierten Mutagenese wichtiger Genomsequenzen minimiert. Darüber hinaus ist es wichtig, den Restriktionsdigest für die vollständige Plasmid-Linearisierung durch Gelelektrophorese zu überprüfen (Abbildung 8b). Ein Mangel an linearisierter Plasmid-DNA würde eine Rollkreisverstä…
The authors have nothing to disclose.
Wir sind Suzanne Emerson für den Klon des Hepatitis-E-Virus p6 dankbar. HEV-spezifisches Kaninchenhyperimmunserum wurde freundlicherweise von Rainer Ulrich, Friedrich-Loeffler-Institut, Deutschland, zur Verfügung gestellt. Darüber hinaus danken wir allen Mitgliedern des Fachbereichs Molekulare und Medizinische Virologie der Ruhr-Universität Bochum für ihre Unterstützung und Diskussion. Die Zahlen 1-7 wurden mit BioRender.com erstellt.
0.45 µm mesh | Sarstedt | 83.1826 | Harvest extracellular Virus |
4 % Histofix | CarlRoth | P087.4 | Immunofluorescence |
Acetic acid | CarlRoth | 6755.1 | Collagen working solution |
Amicon Ultra-15 | Merck Millipore | UFC910024 | Virus harvesting |
Ampicillin | Sigma-Aldrich | A1593 | Selection of transformed bacteria |
ATP | Roche | 11140965001 | in vitro transcription and electroporation |
BioRender | BioRender | Figure Generation | |
CaCl2 | Roth | 5239.2 | Cytomix |
Collagen R solution 0.4 % sterile | Serva | 47256.01 | Collagen working solution |
CTP | Roche | 11140922001 | in vitro transcription |
Cuvette | Biorad | 165-2088 | Electroporation |
DAPI | Invitrogen | D21490 | Immunofluorescence |
DMEM | gibco | 41965-039 | Cell culture |
DNAse | Promega | M6101 | in vitro transcription |
DTT | Promega | included in P2077 | in vitro transcription |
EGTA | Roth | 3054.3 | Cytomix |
Escherichia coli JM109 | Promega | L2005 | Transformation |
Fetal bovine serum | gibco | 10270106 | Cell culture |
Fluoromount | SouthernBiotech | 0100-01 | Immunofluorescence |
GenePulser Xcell Electroporation System | BioRad | 1652660 | Electroporation |
Gentamycin | gibco | 15710049 | Cell culture |
GTP | Roche | 11140957001 | in vitro transcription |
H2O | Braun | 184238001 | Immunofluorescence |
Hepes | Invitrogen | 15630-03 | Cytomix |
Horse serum | gibco | 16050122 | Immunofluorescence |
K2HPO4 | Roth | P749.1 | Cytomix |
KCL | Roth | 6781.3 | Cytomix |
KH2PO4 | Roth | 3904.2 | Cytomix |
L-Glutamin | gibco | 25030081 | Cell culture |
L-Glutathione reduced | Sigma-Aldrich | G4251-5G | Cytomix |
MEM | gibco | 31095-029 | Cell culture |
MEM NEAA (100×) | gibco | 11140-035 | Cell culture |
MgCl2 | Roth | 2189.2 | Cytomix |
Microvolume UV-Vis spectrophotometer NanoDrop One | Thermo Fisher | ND-ONE-W | DNA/RNA concentration |
MluI enzyme | NEB | R0198L | Linearization |
NEB buffer | NEB | included in R0198L | Linearization |
NucleoSpin Plasmid kit | Macherey & Nagel | 740588.250 | Plasmid preparation |
NucleoSpin RNA Clean-up Kit | Macherey & Nagel | 740948.250 | RNA purification |
PBS | gibco | 70011051 | Cell culture |
Pen/Strep | Thermo Fisher | 15140122 | Cell culture |
Plasmid encoding full-length HEV genome (p6_G1634R) | Todt et.al | Virus production | |
Plasmid encoding full-length HEV genome (p6_WT) | Shukla et al. | GenBank accession no. JQ679013 | Virus production |
Primary antibody 1E6 | LS-Bio | C67675 | Immunofluorescence |
Primary antibody 8282 | Rainer Ulrich, Friedrich Loeffler Institute, Germany | ||
QIAprep Spin Miniprep Kit | Qiagen | 27106 | DNA extraction |
Ribo m7G Cap Analog | Promega | P1711 | in vitro transcription |
RNase away | CarlRoth | A998.3 | RNA purification |
RNasin (RNase inhibitor) | Promega | N2515 | in vitro transcription |
Secondary antibody donkey anti-mouse 488 | Thermo Fisher | A-21202 | Immunofluorescence |
Secondary antibody goat anti-rabbit 488 | Thermo Fisher | A-11008 | Immunofluorescence |
Sodium Pyruvat | gibco | 11360070 | Cell culture |
T7 RNA polymerase | Promega | P2077 | in vitro transcription |
Transcription Buffer | Promega | included in P2077 | in vitro transcription |
Triton X-100 | CarlRoth | 3051.3 | Immunofluorescence |
Trypsin-EDTA (0.5 %) | gibco | 15400054 | Cell culture |
ultra-low IgG | gibco | 1921005PJ | Cell culture |
UTP | Roche | 11140949001 | in vitro transcription |