Мы описываем использование новой, частотно-домен люминесценции жизни камеры для отображения 2D O2 распределения с оптическим датчиком фольги. Описаны камеры системы и процедуры анализа изображений наряду с подготовкой, калибровкой и применением сенсорной фольги для визуализации микросреды O2 в rhizosphere водных растений.
Мы описываем метод изображения растворенного кислорода (O2),в 2D при высоком пространственном (Злт; 50-100 мкм) и временном (Злт; 10 с) разрешением. Метод использует O2 чувствительных люминесцентных фольги датчика (планар оптод) в сочетании со специализированной системой камеры для визуализации люминесценции жизни в частотном домене. Планарные оптоиды готовятся путемрастворения O 2-чувствительного крася индикатора в полимере и распространения смеси на твердую опору в определенной толщине через покрытие ножом. После испарения растворителя планарная оптода помещается в тесном контакте с образцом интереса – здесь продемонстрированы корни водного растения Littorella uniflora. O2 концентрации-зависимых изменений в люминесценции жизни индикатора красителя в планере оптод изображен через заднюю часть прозрачной фольги перевозчика и аквариумстены стены с помощью специальной камеры. Эта камера измеряет срок службы люминесценции (к) через сдвиг в фазе угла между модулированным сигналом возбуждения и сигналом выбросов. Этот метод превосходит методы визуализации интенсивности люминесценции, так как сигнал не зависит от концентрации красителя или интенсивности источника возбуждения, и опирается исключительно на время распада люминесценции, которое является внутренне ссылкапара. Следовательно, дополнительный эталонный краситель или другие средства ссылки не нужны. Мы демонстрируем использование системы для макроскопической визуализации Ризосферы растений O2, но система камеры также может быть легко соединена с микроскопом.
Распределение и динамика растворенных газов и ионов в отложениях и почвах обеспечивают ключевую информацию о биогеохимических процессах, таких как микробное дыхание1,2,или потеря радиального кислорода из корней растений3,4,5, и химическая микросреда микробов6,7, корневища растений5,8,9 и животных норы10, 11,12. Биологическая и химическая активность в таких средах с ограниченным диффузией может создавать крутые градиенты химических субстратов или продуктов биогеохимических процессов. В частности, доступность O2 оказывает огромное влияние на биогеохимические процессы и, таким образом, на биологию и экологию системы13. Поэтому анализ концентраций O2 при высоком пространственном и временном разрешении имеет первостепенное значение в водных и наземных науках. Во-первых, электрохимические и оптические микросенсоры14,15 были разработаны для измерения этого важного анализ. Позже, 2 мерных (2D) изображения O2 с планарными оптодами был введен12,16,17,18,19, что позволило визуализации и количественной визуализации неоднородных O2 распределения в почвах и отложениях.
Planar O2 оптод состоят из O2-чувствительныйиндикатор красителя20, который растворяется в подходящем полимере21. Краситель индикатора возбуждается на определенных оптических длинах волн и излучает красный сдвинутый свет при расслаблении в виде люминесценции. В присутствии O2, возбужденный краситель индикатора может передавать свою энергию молекуле O2 при столкновении, которая называется свечением на основе столкновений, утоляющим22. Таким образом, интенсивность люминесценции, а также люминесценции жизни снижается с увеличением концентрации O2 23. В идеальном случае изменение интенсивности и продолжительности жизни следует уравнению Стерна-Волмера (уравнение 1), используя либо интенсивность люминесценции или продолжительность жизнив отсутствие (I0;0),либо присутствие (I, q) O2 при заданной концентрации. Константа Стерн-Волмер (Ksv) является мерой для чувствительности оптода к O2; KSV зависит от экологических переменных, таких как температура и давление.
(1)
Запись таких изменений в люминесценции над фольгой планарного датчика с системой камеры может быть использована для визуализации соответствующих изменений в распределении O2. Первоначально, простой интенсивности люминесценции на основе O2 изображения был использован18. Однако такая методология очень чувствительна к внешним помехам, которые ставят под угрозу надежность результатов из-за разнородного освещения, колебаний источника возбуждения или камеры, а также неравномерного распределения красителя индикатора в рамках планарного оптода.
Некоторые из этих ограничений можно облегчить с помощью планарных оптодов для социеметрической визуализации17,24, где O2-чувствительныйкраситель индикатора совместно иммобилизован в полимерном слое планарного оптода с нечувствительным эталонным красителями, испускающим в другом спектральном диапазоне, чем O2-индикатор. На основе изображений выбросов, полученных в двух спектральных окнах, сигнал O2-чувствительныйэмиссионный сигнал делится на эталонный сигнал, генерируя изображение соотношения, которое менее подвержено вышеупомянутым помехам5,17. Метод требует использования второго красителя, который в идеале может быть возбужден одним и тем же источником возбуждения, но испускает на другой длине волны (без значительного спектрального перекрытия), в другом спектральном окне камеры (например, в другом цветном канале камеры RGB).
Кроме того, Изображение O2 может быть основано на количественной оценке O2-зависимогоизменения в сроке службы свечения красителя индикатора, который не зависит от неравномерного освещения или неоднородности в концентрации индикатора25. Первый люминесценции жизни на основе O2 визуализации системы были основаны на времени домена измерений с воротами в состоянии заряженного совместного устройства (CCD) камеры системы26, где импульсный источник возбуждения используется и люминесценции изображения принимаются в течение определенных временных интервалов в пределах возбуждения или выбросовиндикатора 8,23,27. Из таких изображений, люминесценции жизни может быть определена и коррелирует с соответствующей концентрации O2 в калибровке. Впоследствии изображения люминесценции для данного образца, прижатые к планарной оптоде, могут быть преобразованы в изображения соответствующего 2D-распределения концентрации O2. Эта система была использована во многих приложениях как в лаборатории, так и на situ16,28, но основные ворота в состоянии CCD камеры больше не коммерчески доступны.
Недавно была выпущена другая система камеры люминесценции, которая приобретает изображения в частотном домене8. Система опирается на постоянно модулированный источник света для возбуждения. Это может быть синусоидальная или квадратная волна вместо импульсного возбуждения, которое используется для приобретения изображения в домене времени. Эта модуляция приводит к модулированному излучению люминесценции красителя индикатора O2, который смещается по фазе под углом, а это зависит от срока службы свечения красителя индикатора (см. уравнение 2).
(2)
Изменение между возбуждением и эмиссионной амплитудой (т.е. так называемым индексом модуляции или глубиной (амплитуда, разделенная на постоянную люминесценцию) также зависит от жизни люминесценции. Таким образом, установив известную частоту модуляции, специальный датчик изображения CMOS в камере способен измерять срок службы люминесценции в диапазоне нс до диапазона,как подробно описано в другом месте 8,29,30. Общее руководство по принципу операции можно найти (с помощью следующей ссылки https://www.youtube.com/watch?v=xPAB_eVWOr8).
В следующем протоколе, мы демонстрируем использование новой системы камеры для визуализации распределения концентрации O2 вокруг корней водного пресноводного растения Littorella унифлоры в 2D9,31. Мы хотели бы подчеркнуть, что этот метод ни в коем случае не ограничивается этим приложением. Чувствительные к кислороду оптоды или сенсорные частицы27 в сочетании с различными методами визуализации были использованы в медицинских исследованиях32, в биопечати33, для чувствительных к давлению красок34,35, или для изучения фотосинтетических систем2,36,37, просто назвать несколько других областей применения.
В этом протоколе охватывается весь рабочий поток от подготовки оптодов к анализу изображений O2. Следуя этому протоколу, химические изображения могут быть получены с помощью новой частоты домена основе люминесценции жизни камеры. В зависимости от применения, планар оптод может быть изготовленв в различных размерах и толщиной слоя слоя сенсорного слоя, начиная от надежных 50-100 мкм толщиной планар оптод несколько десятых квадратных сантиметров до микроскопа крышка скользит с lt;1 мкм толщиной датчика слоев6,40. Потенциал этого метода был продемонстрирован с конкретным применением, но не ограничивается только O2 изображения в растениях rhizospheres12,28.
Этот метод имеет несколько преимуществ по сравнению с чистой люминесценции интенсивности на основе химических методов визуализации. Люминесценция жизни изображения не является, или, по крайней мере, гораздо меньше, пострадавших от неравномерного освещения, неравномернотолотачение толщины, и фото отбеливания25. Кроме того, этот метод позволяет избежать использования дополнительного эталонного красителя, распространенного в коэффициентеметрической визуализации17,37. По сравнению с другими системами камер на основе жизни, таких как широко используемые закрытые камеры тайм-домен8,26, новая система камеры и протокол, представленный здесь может доставить сопоставимые результаты. В недавней публикации были сопоставлены аналитические характеристики этих двух систем, и было установлено, что система люминесценции на основе частотного домена, по крайней мере, сопоставима с прекращенным предшественником на основе тайм-домена8.
Мы представили простейшую оптоду O2, состоящую только из индикатора в полимерной матрице. Помимо нескольких других возможных индикаторов O22, которые могут быть использованы добавки могут быть включены, т.е. рассеяния агентов, таких как TiO 2 или алмазный порошок2 для увеличения сигнала датчика при одновременном снижении прозрачности оптоды. Также дополнительные красители могут быть использованы для повышения интенсивности сигнала с помощью передачи энергии41.
Для изготовления планарного оптода мы рекомендуем использовать зазор в устройстве покрытия ножом 75 – 120 мкм, чтобы дать окончательный сенсорный слой толщиной около 7,5 до 12 мкм после испарения растворителя (около 10% от используемого зазора), при использовании описанного состава датчика коктейль. Это хороший компромисс между интенсивностью сигнала, который может быть изменен более высокой загрузкой красителя, или путем выбора индикатора и эталонных красителей более высокой яркости и времени отклика. Увеличение толщины слоя приводит к увеличению времени отклика, так как временной промежуток, необходимый для поиска термодинамического равновесия в сенсирующем слое с окружающими носителями, увеличивается на12.
Оптоды, как описано здесь, реагируют на изменения концентрации O2 в течение нескольких секунд17, имея при этом достаточно сильный сигнал люминесценции. Ультратонкие сенсорные покрытия с субсекундным временем отклика могут быть реализованы со спин-покрытием6. Если опоры или устройство для покрытия ножом не хорошо очищены, это может привести к неоднородным слоям датчика. Кроме того, когда коктейль не является полностью однородным или применяется слишком быстро после распространения перед устройством покрытия такой нежелательный результат может наблюдаться. Поэтому, возможно, потребуется некоторая практика для подготовки оптимальных оптодов.
Метод может быть использован для изображения образцов, которые могут быть помещены в тесном контакте с оптодой, таких как некоторые морские животные42, биопленки6 и почвы31 просто назвать несколько. Мы представляем автономную установку с помощью цели, однако, камера может быть легко соединена с микроскопом для химического изображения более высокого разрешения43.
В то время как время домена на основе люминесценции жизни изображения включенповпой фоновой флуоресценции26, это проблема при использовании новой частоты домена на основе камеры системы8. Благодаря непрерывному приобретению изображения, эта камера будет записывать любой фон флуоресценции образца, которые могут быть возбуждены по выбранному светодиоду и испускает в выбранном спектральном окне, как это определено фильтром выбросов на цели камеры. Это приведет к явно более низкому сроку службы и, следовательно, к ложным показаниям. В случае, если вы работаете с образцами со значительным внутренней флуоресценции перекрытия с O2 датчик возбуждения и выбросов, важно применять дополнительную оптическую изоляцию на верхней части оптоды, путем покрытия дополнительный слой, содержащий углеродный черный2,17. Таким образом, только люминесценция, излучаемых из планара оптод достигнет камеры. Для того, чтобы проверить на фоне люминесценции изображение без оптоды может быть принято, что затем будет исключительно показать внутреннюю люминесценцию образца. Также можно добавить рассеяния агентов, таких как TiO2 или алмазный порошок2,44, к датчику коктейль, чтобы увеличить интенсивность люминесценции красителя индикатора. Тем не менее, это также может привести к более быстрому отбеливанию фотографий и TiO2 является известным фотокатализатором, который может ухудшить фотостабильность красителя41. Еще одним аспектом для рассмотрения является фоновый свет. При визуализации люминесценции жизни, фоновый свет необходимо избегать как можно более эффективно. Таким образом, этот метод визуализации требует установки, которая будет помещена в темную среду и любой внешний источник света должен быть временно выключен во время приобретения изображения.
Таким образом, люминесценция жизни изображения является надежным химическим методом визуализации, которые могут быть адаптированы к различным приложениям. Этот протокол (см. раздел 1 – 5) охватывает все основные шаги для создания изображения O2 и использует в настоящее время наиболее гибкую систему визуализации люминесценции частотного домена, которая может заменить прекращенную закрытой временной домен камеры для 2D O2 изображений с планарными оптодами.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим Софи Линдегор Якобсен (Копенгагенский университет) и Ларса Боррегора Педерсена (Орхусский университет) за техническую помощь. Финансирование этого исследования было получено за результат гранта Sapere-Aude Advanced от Независимого исследовательского фонда Дании (DFF-1323-00065B; МК), гранты на проекты от Независимого исследовательского фонда Дании естественные науки (DFF-8021-00308B; МК) и технические и производственные науки (DFF-8022-00301B и DFF-4184-00515B; МК), Датский национальный исследовательский фонд (DNRF136) и Фонд Поул Ду Йенсена (KK).
Air pump with air stone and water pump | Local aquarium store | ||
Chloroform | Sigma Aldrich | 67-66-3 | |
DC4 silicone compound | Dow Corning GmbH | 2793695 | |
Gas mixer | Vögtlin Instruments GmbH | red-y compact meter GCM | This is just one possible instrument. Several companies offer gas mixing devices |
Glass plates and aquaria | Local aquarium or hardware store | ||
ImageJ Software | ImageJ | Freely available imaging software (imagej.nih.gov/ij/index.html) | |
Knife-coating device | BYK-GARDNER GMBH byk.com |
2021 | This is a four sided film applicator enabling easy variation of the film thickness. Other versions are also available. We recommend a thickness of the applied film between 75-120 µm, which yields a final sensor layer thickness of ~10% of the applied thickness before solvent evaporation. |
LED lamp, Reflector PAR38 | Megaman | MM17572 | |
LED LEDHUB | Omicon Laserage, Germany | Can be configured with a variety of LEDs. For the presented example, the green LED (528 nm) is essential | |
LOCTITE AA 3494 | Henkel AG & Co. KGaA | NA | Acrylic-based instant adhesive |
NIS Elements AR Software | Nikon Inc | Software package used for image acquisition | |
pco.flim | PCO AG, Germany | Frequency domain based luminescence lifetime camera | |
platinum(II)-5,10,15,20-tetrakis-(2,3,4,5,6-pentafluorphenyl)-porphyrin (PtTFPP) | Frontier Scientific | PtT975 | O2 indicator |
polyethylene terephthalate (PET) foil | Goodfellow | 320-992-72 | Such foils might also be found from other providers and serve as solid support |
Polystyrene (PS) | Sigma Aldrich | 9003-53-6 | Polymer matrix |
Schott RG610 filter | www.uviroptics.com | Here 52mm screw on Filters can obtained. Other sources offer square glass filters from Schott glass that can be fixed in front of the objective | |
Vinyl electrical tape | Scotch, Super 33+ | NA | |
Zeiss Makro Planar 2/100 with Hama C for Nikon adaptor | delivered with the camera | Here any other objective might also be used in combination with an adaptor if the objective does not have a C-mount |