Linee di cellule di Drosophila sono importanti reagenti per la ricerca biomedica sia fondamentale. Questo articolo fornisce i protocolli per lo scongelamento, subcoltura e la crioconservazione delle varietà di cellula di Drosophila comunemente usati per aiutare i ricercatori a che prevedano l’impiego di questi reagenti nella loro ricerca.
Ci sono attualmente oltre 160 distinte linee cellulari di Drosophila distribuiti da Drosophila Genomics Resource Center (DGRC). Con ingegneria di genoma, il numero di linee cellulari romanzo si pensa che aumenti. La DGRC mira a familiarizzare i ricercatori con l’utilizzo di linee di cellule di Drosophila come uno strumento sperimentale per integrare e guidare la loro agenda di ricerca. Sono disponibili procedure per l’utilizzo di una varietà di linee di cellule di Drosophila con caratteristiche distinte, inclusi i protocolli per lo scongelamento, coltura e cryopreserving linee cellulari. D’importanza, questa pubblicazione illustra le migliori pratiche necessarie per lavorare con linee cellulari di Drosophila per ridurre al minimo il rischio di contaminazioni da microrganismi accidentale o da altre linee cellulari. I ricercatori che acquisire familiari con queste procedure saranno in grado di approfondire le molte applicazioni che utilizzano cellule di Drosophila coltivate tra cui biochimica, biologia cellulare e genomica funzionale.
L’uso di Drosophila coltivato le cellule complementi in vivo l’analisi genetica per volare e serve come strumento di indagine primaria per affrontare molte questioni biologiche di base1,2,3. Linee cellulari di Drosophila offrono unici popolazioni omogenee di cellule derivate da fonti differenti del tessuto con distinti ambiti di provenienza genetici. Le linee cellulari sono adatte per numerose applicazioni tra cui espressione genica transgenici, genomica, trascrittomica, proteomica, metabolomica, schermi di throughput elevato RNA interferenza (RNAi), biologia cellulare e microscopia. D’importanza, l’uso della coltura delle cellule della drosofila facilita la caratterizzazione delle risposte temporale immediate agli stimoli noti. Inoltre, coltura delle cellule della drosofila è favorevole al genoma CRISPR-Cas9 editing, che lo rende relativamente facile creare nuove linee di cellule con genoma specifiche modifiche4,5,6, 7.
La Drosophila Genomics Resource Center (DGRC) funge da centro di repository e distribuzione per linee di cellule di Drosophila . Uno degli obiettivi della DGRC è di assistere i membri della comunità della ricerca nell’utilizzo di risorse di cultura delle cellule della drosofila . Questo articolo presenta protocolli di base per la gestione di linee di cellule di Drosophila . Esso integra le risorse esistenti per aiutare i ricercatori familiarizzano con la manipolazione di colture di cellule di Drosophila e raggiungere un livello di autonomia nelle loro esperimenti1,2,8,9 ,10.
Le linee di cellule di Drosophila più comunemente usate sono: Schneider linee11, Kc16712, Mitsubishi/Miyake immaginale disco e sistema nervoso centrale (SNC) linee13,14, linee di Milner laboratorio immaginale disco 15, le cellule ovariche adulte linee16,17e il Ras linee18 (tabella 1). Le linee di Schneider e Kc167 sono linee cellulari per tutti gli usi generali per l’uso in biochimica, espressione genica transgenici ricombinante e schermi di genetici inverso. Le linee di laboratorio (ML) di Mitsubishi/Miyake sono stata derivate da dischi immaginali larvale o del sistema nervoso centrale (SNC) e sono stati utili per studi relazionati a neurosecretoria, regolazione della trascrizione ed elaborazione del RNA. Le linee di disco Milner (CME) sono state importanti per lo studio della trasduzione del segnale. Le linee cellulari di fGS/OSS derivate dalle ovaie adulte mutante rimangono importanti reagenti per studiare l’impatto di non-codificazione piccolo biologia di RNA in cellule germinali manutenzione e differenziazione17,19. Infine, le linee di Ras sono uniche perché si tratta di linee cellulari derivate da embrioni ectopically che esprime l’oncogene Ras. Essi hanno la firma trascrizionale delle cellule del precursore del muscolo ed esprime attivo piRNA macchinari20. Recenti articoli di revisione e capitoli di libri coprono le applicazioni di queste linee cellulari popolari con più dettagli2,3,9.
Tutte queste linee cellulari possono essere una subcoltura e congelate. Non ci sono requisiti diversi lievi ma importanti come ogni linea cellulare è mantenuta e preparato per la crioconservazione. Ad esempio, le linee distinte delle cellule richiedono diversi media e integratori (tabella 1). Le linee variano anche in proprietà di aderenza superficiale, morfologie (Figura 1 e Figura 2), genotipo e tempo di raddoppiamento (tabella 2). Presentiamo protocolli di base ed evidenziamo le differenze uniche per la gestione delle varie linee di cellulari di Drosophila ampiamente usate.
Colture di cellule di Drosophila sono reagenti primari per gli schermi basati su celle a resa elevata. Loro uso integra anche la ricerca genetica in vivo fornendo una popolazione omogenea delle cellule per biochimica, rapido test di costrutti transgenici prima di iniettare in mosche, biologia cellulare, microscopia e, più recentemente, genetica delle cellule somatiche manipolazioni di genoma editing1,2,3,8,9,10.
La vitalità e il recupero di cellule congelate di Drosophila è sensibile alle fluttuazioni drastiche anche a basse temperature. La DGRC memorizza linee cellulari congelati in fase liquida di N2 (-196 ° C) e li trasporta in ghiaccio secco (-78,50 ° C). Fiale congelati che sono stati trasportati in ghiaccio secco non dovrebbero essere trasferiti nuovamente in liquido N2 o in un congelatore-80 ° C per la conservazione. Invece, le cellule congelate dovrebbero essere scongelate, reseeding una densità alta cella appena possibile all’arrivo (protocollo sezione 1) e coltivate per i loro scopi sono destinati (protocollo sezione 3). Se le linee cellulari non vengono immediatamente utilizzate per esperimenti, la cella linee dovrebbero essere crioconservati (sezione 6 del protocollo) finché non sono pronti per l’uso.
Alcune linee cellulari, quali le linee ML-BG2-c2 e Ras servono alcuni giorni per riprendersi dagli effetti di essere ripresa dallo stato crioconservato. Una notevole quantità di detriti cellulari accompagna queste linee cellulari i primi giorni dopo lo scongelamento. Lasciata indisturbata, le cellule recupererà e proliferare. Molte linee cellulari di Drosophila presso il DGRC sono state adattate a crescere in M3 basata media22. Per linee cellulari che sono lenti a riprendersi dagli effetti del disgelo, l’uso dei media condizionati può essere utile. Media condizionati probabilmente contenga fattori di crescita secernuti dalle cellule nel media che può favorire il recupero e la proliferazione delle cellule dopo lo scongelamento.
Linee cellulari generalmente seguono una curva di crescita stereotypical costituito da una fase di latenza, fase esponenziale, fase del plateau e una fase di deterioramento. Molte linee cellulari di Drosophila proliferano in ritardo-fase di crescita, quando essi sono coltivate ad una densità tra 1 x 106 e 1 x 107 cellule/mL a 25 ° C. È essenziale che le linee cellulari sono attraversate tale che essi sono sempre in fase di crescita esponenziale.
La confluenza di una cultura, espressa in percentuale, descrive l’area della superficie di crescita è coperto dalle cellule. Confluenza di cella per una linea cellulare dipende dalla sua cella di forma e dimensione. Linee cellulari distinti hanno diverse morfologie e proprietà di aderenza. Di conseguenza, diverse linee cellulari approssimativamente simile confluenza possono avere densità nettamente distinte delle cellule (Figura 1). Confluenza di cultura non può essere un indicatore ideale per passaggio di colture di cellule di Drosophila perché Drosophila linee cellulari continuano a proliferare mediante palificazione uno sopra l’altro come i fuochi o in sospensione, anche dopo che la superficie di crescita è stato coperto (Figura 1). Tuttavia, gli utenti esperti con linee cellulari specifiche possono spesso utilizzare confluenza come guida visiva rapida per quando alla subcoltura.
Mentre è possibile far crescere Drosophila linee presso ambiente RT tra 19−25 ° C, non è consigliabile perché le fluttuazioni di temperatura ambiente potrebbero influenzare il tasso di proliferazione. È consigliato l’uso di un incubatore dedicato 25 ° C. L’incubatore per colture di cellule di Drosophila non ha bisogno di facilitare lo scambio di gas di CO2 perché i terreni di coltura delle cellule della drosofila non utilizzano CO2 per il buffer. L’umidità all’interno dell’incubatore per la coltura di linee cellulari è un fattore importante non devono essere trascurati quando la coltura delle cellule in piastre. A seconda del tipo in incubatrice e l’ambiente di lavoro, può essere necessario posizionare un recipiente di acqua sterile all’interno dell’incubatrice. Per minimizzare evaporazione media, utilizzare T-muffola chiusa o conservare piatti di coltura in un contenitore di plastica sigillato ermeticamente mentre all’interno dell’incubatrice.
È importante sviluppare una pianificazione per subcoltura linee di cellule di Drosophila . Per stimare la consistenza di monitor e tasso di crescita, è conveniente alla subcoltura un rapporto anche geometriche (split rapporto 1:2, 1:4, 1:8). Ad esempio, un piatto di 10ml confluenti di cellule Kc167 a 8 x 106 cellule/mL può essere suddiviso in rapporto di 1:8 per ottenere una densità di semina di 1 x 106 cellule/mL (1,25 mL di sospensione cellulare diluito in 8,75 mL di terreno fresco). In 72 h, Kc167 culture dovrebbero proliferano ad una densità di 8 x 106 cellule/mL, dato il suo tempo di raddoppiamento di 24 h. Il rapporto di divisione è quindi determinato per facilitare una routine di sottocultura conveniente di fino a due volte alla settimana, garantendo che le cellule sono coltivate sempre nella loro fase di registro esponenziale di crescita. Questo permette una pianificazione regolare per subcoltura le cellule in modo che il momento di confluenza è troppo lungo né troppo breve. Se il tempo a confluenza è troppo breve, le cellule sono una subcoltura ad una densità di cella inferiore (più alto rapporto di divisione). Allo stesso modo, se il tempo per raggiungere la confluenza è troppo lungo, le cellule sono una subcoltura a una maggiore densità delle cellule (rapporto di divisione inferiore). È importante notare che la maggior parte delle linee di cellule di Drosophila sono molto sensibili a densità bassa delle cellule (< 1 x 105 cellule/mL), in cui le cellule difficilmente proliferano e possono anche morire.
Linee cellulari di Drosophila variano in morfologia e caratteristiche di crescita. Di conseguenza, linee cellulari con proprietà distinte potrebbero essere necessario essere gestiti in modo diverso. La maggior parte delle linee di cellule di Drosophila sono semi-aderente. A bassa densità cellulare, essi aderiscono più forte alla superficie di crescita e come la cultura diventa confluente, le cellule diventano meno aderenti e staccano facilmente. Questo cambiamento graduale nella adesione cellulare facilita la facile subcoltura di più ampiamente usate linee di cellule di Drosophila (Schneider, Kc, disco immaginale e CNS linee) in quanto permette all’operatore di erogare semplicemente media sopra strato monomolecolare della cellula a cacciarli dalla superficie di crescita quando la cultura è densa. Per le linee che sono superficie aderente come la guaina somatica staminali/ovarico di germe-linea femminile (fGS/OSS) e le linee di Ras, è essenziale per incubare le cellule in tripsina per una breve durata per gli aiuti a staccare le cellule dalla superficie di crescita.
Aggiunte di media per la maggior parte delle linee di cellule di Drosophila includono siero fetale di vitello (FCS). Insulina ed Estratto di volare adulto (FEX) sono necessari per alcune linee specifiche. FEX contiene indefiniti componenti essenziali per la crescita delle linee di disco immaginale larvale specifico e le linee cellulari ovariche adulto. La DGRC prepara e rende disponibile FEX adulto derivato da 1 settimana vecchia Oregon-R-modENCODE mosche (RRID: BDSC_25211) in aliquote di 2,5 mL e 10 mL. La DGRC fornisce inoltre le istruzioni per la preparazione di FEX su piccola scala sul suo sito Web . Preparazione di FEX, tuttavia, richiede tempo e richiede una grande quantità di mosche adulte.
La crioconservazione delle varietà di cellula di Drosophila fa risparmiare tempo e reagenti per la manutenzione delle linee cellulari non in uso immediato. Crioconservazione avviene lentamente congelamento delle cellule (-1 ° C/min) a-80 ° C in un mezzo contenente DMSO, un agente crioprotettivo. La fase del raffreddamento lenta è critica per la crioconservazione di successo. In un congelatore a-80 ° C, la fiala delle cellule viene raffreddata ad un tasso di-1 ° C/min quando inserito in un contenitore di congelamento riempito con isopropanolo. A partire da 25 ° C di temperatura ambiente, ci vorranno fino a 2 h per la temperatura in fiale per raggiungere-80 ° C. Si consiglia di lasciare le fiale di congelare durante la notte.
Fiale congelati quindi devono essere rapidamente trasferiti in fase liquida di azoto per una conservazione prolungata. A temperatura ambiente, il cryovial sarà riscaldare rapidamente a circa 10 ° C/min e la redditività sarà compromessa presso sopra-50 ° C23. Per mantenere il trasferimento rapido, gestire fiale in piccoli lotti per ridurre al minimo l’esposizione a temperatura ambiente. In alternativa, posizionare il cryovials congelati sul ghiaccio secco mentre si prepara per il loro trasferimento in liquido N2. Se azoto liquido non è disponibile, le cellule possono essere conservate in un congelatore a-80 ° C, anche se con un rischio di deterioramento significativo nel corso del tempo.
Densità delle cellule è critica per successo crioconservazione e la successiva rinascita di linee cellulari. In generale, la nuova cella linee devono essere congelati per creare l’iniziale congelare (1−3 fiale) appena un eccesso di cellule diventa disponibile. Una volta che la linea cellulare è stato ulteriormente coltivata stabile, deve essere creato un azione congelate di 10−20 fiale. Questo stock è poi scongelato per verificare per il suo recupero post-congelamento delle cellule e la redditività, dopo di che viene propagato per sperimentazioni o per sostituire il brodo quando il numero di fiale stock congelati scende di sotto di cinque. Infine, è importante convalidare che le cellule scongelate conservano le caratteristiche del suo stock parentale come linee cellulari sono noti per evolvere3,24.
In conclusione, questo articolo presenta un primer per l’utilizzo di colture di cellule di Drosophila , fornendo le informazioni fondamentali sulle varie linee, best practice e protocolli di audiovisivi per la gestione di base delle varietà di cellula di Drosophila . Questa risorsa accessibile si intende senza intoppi agevolano l’introduzione di lavorare con le cellule coltivate di Drosophila e integrare le guide di formazione esistenti presso qualsiasi laboratorio di ricerca.
The authors have nothing to disclose.
Ringraziamo il National Institutes of Health (premio NIH P40OD010949) e la comunità di ricerca per utilizzare le varie risorse del DNA/vettore/cella d. melanogaster curate presso la DGRC.
100 mm tissue culture plates | Corning | 430167 | Subculturing |
25 cm2 T-flask | Corning | 430168 | Subculturing |
35HC Liquid Nitrogen Storage Tank | Taylor-Wharton | 35HCB-11M | Cryopreservation |
Automated Cell counter | BIO-RAD | TC20 | Counting |
Bactopeptone | BD BioSciences | 211677 | Medium additions |
Counting Slides | BIO-RAD | 145-0011 | Counting |
Cryovial 1 mL | Greiner | 123263 | Cryopreservation |
DMSO | Sigma Aldrich | D5879 | Cryopreservation |
Freezing Box | Nalgene | 5029-0909 | Cryopreservation |
Freezing Container | Fisher Scientific | 15-350-50 | Cryopreservation |
Hematocytometer | Fisher Scientific | #0267110 | Counting |
Human Insulin | Millipore Sigma | I9278 | Medium additions |
Hyclone CCM3 media | GE Healthcare Life Sciences | SH30061.03 | Medium |
Hyclone Fetal Bovine Serum | GE Healthcare Life Sciences | SH30070.03 | Medium additions |
L-Glutamic acid potassium salt monohydrate | Millipore Sigma | G1149 | Medium additions |
L-Glutathione reduced | Millipore Sigma | G6013 | Medium additions |
Potassium Bicarbonate | Millipore Sigma | 237205 | Medium additions |
Select Yeast Extract | Millipore Sigma | Y1000 | Medium additions |
Shields and Sang's M3 Insect medium | Millipore Sigma | S8398 | Medium |
Trpsin-EDTA (0.05 %), phenol red | ThermoFisher Scientific | 25300054 | Subculturing |
Trypan Blue (0.4%) | BIO-RAD | 145-0013 | Counting |