Burada, bir protokol kültür insan enteroid veya ana bilgisayar microbiota epitel etkileşimleri hücresel ve biyokimyasal düzeyde çalışmaya sağlam bariyer fonksiyonu var colonoid monolayers mevcut.
Crypt temel kök hücrelerden elde edilen insan 3 boyutlu (3D) enteroid veya colonoid kültürler şu anda bağırsak epitel en gelişmiş ex vivo modeli vardır. Onların kapalı yapılar ve önemli destek hücre dışı matriks nedeniyle, 3D kültürlerin ana bilgisayar-patojen çalışmaları için ideal değildir. Enteroids veya colonoids-ebilmek var olmak her ikisi de manipülasyon luminal izin vermek için geçirgen doku kültürü membranlar üzerinde epitel monolayers olarak yetiştirilen ve demiri hücre yüzeyleri ve eşlik eden sıvı. Bu gelişmiş luminal yüzey erişilebilirlik enterohemorrhagic E. coli (EHEC) kolon epiteli üzerinde mukus aşağılayıcı yeteneği gibi bakteriyel konak epitel etkileşimleri modelleme kolaylaştırır. 3D kültür parçalanma, monolayer tohum ve confluency ve farklılaşma doğru ilerlemesini izlemek için transepithelial elektriksel direnç (TER) ölçümleri için bir yöntemi açıklanmıştır. Colonoid monolayer farklılaşma tarafından ayirt veya immunoblotting teknikleri eğitimi salgılanan mukus verir. Daha genel olarak, enteroid veya colonoid monolayers tarafından patojen veya komensal microbiota hedefleyebilir belirli hücre popülasyonlarının değerlendirmek fizyolojik ilgili bir platform sağlar.
Bağırsak organoids, enteroids ve colonoids kök hücre davranış, bağırsak geliştirme, bariyer/Aktarım işlevi ve hücresel başkalaşım anlamada birçok gelişmeler yol açmıştır. 1 ancak, 3D kültür ana bilgisayar epitel patojen etkileşim çalışma çünkü Lümen bakteri için doğrudan erişilebilir değil ya da kapalı yapılar için mikroenjeksiyon tabi olan sürece virülans faktörleri sınırlar. 2 , 3 Ayrıca, küçük moleküller, proteinler, gibi malzemeler salgılanan veya mukus kolayca aşağı akım analizi için 3D kültüründen örnek olamaz. Epitel bariyer fonksiyonu4 ve iyon taşıma5 Patojen ajanlara etkisini floresan boyalar ve hızlandırılmış mikroskobu kullanarak 3D kültüründe değerlendirilmiştir ama geçirgen doku kültürü destekler üzerinde yetiştirilen monolayers için mükellef bulunmaktadır TER ölçüm ve Ussing odası/gerilim kelepçe yazmak gibi ek teknikleri. 6 , 7
Çok sayıda yayın iletişim kuralları için enteroids/colonoids 2D veya monolayer kültürünü anlatmıştık. Epitel hücre eki tanıtmak için bulunan malzemeler dahil kollajen hydrogels,8,%9 0,1 jelatin,10 ince katmanlı fare sarkomu kaynaklı membran matris (BMM),11,12, 13 ve insan kollajen IV. 6 , 7 , 14 , 15 , 16 , 17 tohumlama yaklaşım mekanik parçalanma6,14,15 ve/veya ayrılma Tripsin,10,11 kullanarak hücre adezyon faktörlerin pipetting tarafından içerir dispase,13 veya EDTA. 9 tohum için gözenekli olmayan doku kültürü plasticware birkaç protokolleri kullanır, ancak çoğu uygulamalar geçirgen doku kültürü ekler üzerinde bağlıdır bu yüzden bu demiri erişimi kısıtlar. İstikrarlı Konfluent monolayer oluşumu ve bakım belgelerine yaygın yayınları arasında değişir. Ayrıca, insan kültürler için büyüme ve farklılaşma medya besteleri ve çeşitli gruplar arasında farklı olarak daha fazla araştırmacılar kabul ve onların uygulama ve kullanılabilir kaynakları uygun yöntemi ayarlamak gelişmeye devam.
Ana bilgisayar-patojen etkileşim çalışmaları 3D bağırsak epitel kültürünün sınırlamaları gidermek için biz 3D insan enteroids veya colonoids bir monolayer dönüştürmek için değiştirilmiş bir iletişim kuralı mevcut. Confluency bir mezar odası gibi olgunlaşmamış devlet elde sonra büyüme faktörleri WNT3A, RSPO1 ve A-83-01 ve SB 202190 inhibitörleri geri çekilmesi farklılaşma küçük bağırsak villus veya yüzey kolon epiteli temsilcisi yol açar. Biz tanımlamak ideal matrix, insan kollajen tip IV, ekler ceket ve üniforma enteroid veya colonoid parçaları için kaplama elde etmek için. Bu iletişim kuralı Konfluent monolayer bir yüksek TER. Colonoid monolayers kalın apikal mukus tabakası salgılar üreten ex vivo çalışmalar patojen-mukus etkileşim yolu ile immunoblotting ya da immunostaining için izin göstermektedir. İmmunostaining kolon mukus tabakası korumak için değiştirilmiş fiksasyon yordam Ayrıca açıklanmıştır. Bu yöntem en erken bağırsak ana bilgisayar-patojen etkileşimleri enfeksiyon üzerine çalışmaya uysal bir modeli sunmayı amaçlamaktadır.
Enteroid/colonoid monolayers başarılı oluşumu için kritik parametreleri içerir 1) sağlıklı, Proliferasyona 3D olarak başlangıç materyali kültürler 2) monolayer tohum önce insan kollajen IV ile hücre kültür Ekle yüzey kaplama; 3) parçalanma 3D kültürlerin mekanik veya enzimatik, tek hücre düzeyi için değil.
Sırasında yalıtım 3D enteroids/colonoids, optimum sallama hızını verilen shaker manken Dönme çapı bağlı olarak değişebilir. Niyet olduğu için sadece tahrik plaka verimli bir karıştırma için ama aynı zamanda hücre süspansiyon plaka kapak veya sıçramasına önlemek için bitişik kuyu içine. < 30 dk kuluçka dönemleri kalan BMM eki ve ekler üzerinde kaplama zaman tek tip hücre monolayers oluşumu engelleyebilir hücreleri, sıkı bir verim. Geniş kuluçka (≥ 1 h) önemli ölçüde azalma hücre canlılığı ortaya çıkarır.
Toz 3D enteroids/colonoids ayırmak için gerekli ölçüde piston sertlik ve kullanıcı el becerisi ile değişebilir. Bir faz kontrast ışık mikroskobu üzerinde iyi içindekiler periyodik muayene sırasında toz, parça başına yaklaşık 30 hücre amacı ile parçası tekdüzelik belirlemek için önerilir. Pazarlanabilirlik ve veya toz yanı sıra, süspansiyon kısaca tripsin ile daha küçük üniforma parçaları elde etmek için sindirmek. Tripsin Özet monolayers 3D benzeri yapıları aksi takdirde tek bir epitel tabaka arasında büyük bir kısmı içeriyorsa istenebilir. Ancak, bu önemli ölçüde hücre canlılığı azaldıkça ayrılma tek hücrelere arzu değil. Enteroids/colonoids 35 μL BMM damlacık içinde kültürlü bir kuyu genellikle 2-3 ekler doldurmak için yeterli olacaktır ancak bu faktör sayısı ve ortalama boyutu enteroids/colonoids bağlı olarak değişebilir.
Onlar ayırt etmek gibi Colonoid monolayers önemli bir birim apikal orta absorbe. Kısmi üst TMMOB kurutma monolayer canlılığı veya aşağı akım deneyleri işlevinde olumsuz etkileyen için görünmüyor olsa da bu üst Ekle Odası (150-200 μL), ek DM uygulayarak atlatılabilir. Farklılaşma yaklaşık 4-5 gün sonra colonoid monolayers DM dikkatli aspirasyon sonra hücre yüzeyinde kalın/jelatinimsi malzemesi olarak görülebilir ekstraselüler mukus geliştirmek.
EHEC dış mukus katman etkileşim için düzenli olarak iletişim kuralında belirtilen bakteriyel titresi ve kuluçka dönemi kullanın. Ancak, benzersiz bakteri suşları başlangıçta birden çok konsantrasyonları ve istenen etkiyi uygun parametrelerini belirlemek için kuluçka dönemleri denetlesinler.
Mukus fiksasyon sırasında apikal orta aspirating ekstrasellüler bekâr mukus tabakasının en büyük olasılıkla kaldırır. Bu nedenle, dikkatli bir şekilde orta dökmek önemlidir. Orta INSERT tarafından yüzey gerilimi korunur, yüzey gerilimi kırmak ve Dış saha orta çoğunu fitil katlanmış laboratuvar mendil köşesine kullanın. Fiksasyon boyama sonra mukus tabakası istemeden yerinden ve INSERT filtre bir coverglass montaj sırasında basık. Mukus yükseklik korumak için filtre ortam takma bir damla üzerinde yerleştirin ve dikkatle üzerinde filtre coverglass yer. Dokunun veya bu önemli ölçüde mukus tabakası dümdüz gibi coverglass üzerinde bastırın değil.
Polarize monolayer 3D kültüründe hücreleri oluşturmak için demiri membran integrinler bağırsak epitel hücre ve hücre dışı Matriks (ECM) proteinler arasındaki etkileşimi yeniden oluşturmak gereklidir. Laminin, kollajen IV, fibronektin ve Proteoglikanlar dizisi bağırsak epitel ECM oluşturmaktadır. 21 , 22 biz insan hücre kaynaklı laminin, fibronektin, kollajen IV ve BMM antikorundan kaynaklı Ekle kaplamalar göre. Sadece kollajen IV istikrarlı, uzun vadeli (4 hafta) oluşumu desteklenen Konfluent enteroid/colonoid monolayers (şekil 1-2). Küçük yamalar monolayer benzeri büyüme her diğer test matrisler üzerinde elde edildi, ama bu bölgeler confluency için ilerleme başarısız oldu. ECM vekil birçok avantajı olduğu gibi insan kollajen IV kullanın. Oysa insan kollajen IV piyasada bulunan ve genellikle daha düşük maliyetli BMM Engelbreth-Holm-Swarm (EHS üzerinden fare sarkomu hücreler insan kökenli, değildir) türetilmiş. Ayrıca, BMM proteinler doğasında değişkenliği ile karmaşık bir karışımı ve büyüme sarkomu tarafından salgılanan gen ekspresyonu etkileyen faktörleri içerebilir. 23
Bağırsak epitel hücreleri ve bağırsak epitel iadesi temel ECM arasındaki etkileşimler hala eksik olarak anlaşılmaktadır. Kollajen IV ancak değil laminin, önemini bir yapışma ligand insan colonocytes24 ve bağırsak crypt epitel hücre iadesi25 artırıcı olarak kollajen eki engelledi IV karşı antikor kullanmayı önerdi . Epitel ifade β1-integrin β1-integrin için belirli bir antikor önemli ölçüde colonocytes IV kollajen yazın yapışma engellenmiş olarak ECM etkileşim için önemli gibi görünüyor. 24 kollajen IV güvenilir ECM sağlarken enteroid/colonoid monolayer için ekler, ECM zaman içinde remodeling epitel oluşumu henüz bu modelde değerlendirilmemiştir, ne de daha karmaşık ve tanımlanmış ECM karışımları etkisi vardır kollajen IV, laminin ve fibronektin.
İnsan enteroids/colonoids (şekil 1-4) monolayer biçiminde manipülasyonlar etkinleştirmek ve bu örnekleme hantal veya 3D matris gömülü kültürler kullanarak elde etmek mümkün olacaktır. 3D enteroids/colonoids boyutu, yapısal karmaşıklık ve luminal birim değişir ve böylece mikroplar veya küçük moleküller mikroenjeksiyon doğru bir şekilde quantitate zor. Ayrıca, monolayers (Tablo 1) aksine, iyonlar, besin, sitokinler veya salgılanan faktörler fizyolojik veya Etyopatogenezi işlemlerle ilişkili ölçmek için her iki luminal ve demiri yüzeyler için doğrudan erişim 3D kültürler önlemek . Confluency (şekil 1-2) enteroid/colonoid monolayer kurulması sadece besin fizyolojik degradeler, iyonlar ve diğer oluştururlar,16 ama aynı zamanda uygun bariyer oluşturmak için gerekli ana özelliklerini biridir luminal microbiota ve steril Mezenkimal/bağışıklık hücre doldurulan serozal ortamları arasında. Bu kısıtlamalar dahil enteroid/colonoid monolayers daha karmaşık fizyolojik modelleri oluşturmak için Mezenkimal, bağışıklık veya nöronal hücre tipleri ile gelecekteki çalışmaları için dikkate almak önemlidir.
Sıvı kesme stres ve mekanik streç/sıkıştırma (peristaltizm) gibi fiziksel güçleri eksikliği ve normalde bağırsak tarafından deneyimli bir anaerobik apikal ortam yokluğunda burada açıklanan hücre kültür Ekle modelinin kaydetti sınırlamaları içerir epiteli içinde vivo. Bu öğeleri daha sofistike microphysiological platformları,26 ile ele alınması için potansiyel var ama onlar da ek masraf, ekipman ve uygulamak için uzmanlık gerektirir. Bu bileşenler kasıtlı girmediğiniz sürece hem 3D hem monolayer kültürleri ile etkileşimleri veya bağırsak microbiome, stromal hücre popülasyonlarının ve bağışıklık sistemi olmadan da vardır.
Enteroid/colonoid monolayer kollajen IV kaplı hücre kültür ekler üzerinde gelecekteki uygulamalar diğer çalışmalar patojen veya komensal mikrobiyal etkileşim, uyuşturucu ya da besin alımı, toksisite, metabolizma, bariyer fonksiyonu, içerebilir ve fonksiyonel ek bağırsak hücre tipleri ile ortak kültür tarafından katalize ayný ölçüde geçerlidir. İçinde vivo fenotipleri ex vivo enteroid/colonoid kültür korunmuş gibi kurulan sağlanan değil sadece epiteli sağlıklı bağış aynı zamanda bireylerin Genetik mutasyonlar veya bağırsak bozuklukları, içinde değerlendirme yapılabilir.
The authors have nothing to disclose.
Bu eser NIH hibe P01 AI125181, K01 DK106323 (JGI) ve K01 DK113043 (JFA) tarafından desteklenmiştir. James Kaper (Maryland Üniversitesi, Baltimore, MD, ABD) E. coli verdiğiniz için teşekkür ederiz HS ve EHEC süzüyorlar. Ayrıca entegre fizyolojisi ve Hopkins Conte sindirim hastalıkları temel ve Translational araştırma çekirdek Merkezi (P30 DK089502) ve Johns Hopkins kütle spektrometresi ve proteomik çekirdek çekirdek görüntüleme anıyoruz.
2-Amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propanediol | Sigma | T4661 | Tris base, Component of lysis buffer |
A-83-01 | Tocris | 2939 | ALK4/5/7 inhibitor |
Acetic acid, glacial | Fisher Scientific | A38 | |
Advanced DMEM/F12 | Life Technologies | 12634-010 | Component of growth medium |
Alexa Fluor 488 phalloidin | Life Technologies | A12379 | Fluorescent probe for F-actin |
Antibiotic/antimycotic cocktail | Invivogen | ant-pm-2 | Primocin (100x) |
B27, 50x | Life Technologies | 17504-044 | Component of growth medium |
Cell culture inserts | Corning | 3470 | Transwell, PET membrane, 0.4 μm pore, 24-well plate |
CHIR 99021 | Tocris | 4423 | GSK3β inhibitor |
Click-iT Plus EdU Alexa Fluor 594 Imaging Kit | Life Technologies | C10639 | |
Collagen IV, from human placenta | Sigma | C5533 | |
Cultrex Organoid Harvesting Solution | Trevigen | 3700-100-01 | Depolymerizes basement membrane matrix |
Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) | Kaper lab, University of Maryland | ||
Epithelial voltohmmeter | World Precision Instruments | EVOM2 | |
Epithelial voltohmmeter electrode | World Precision Instruments | STX3 | |
Escherichia coli strain HS | Kaper lab, University of Maryland | ||
Ethanol, absolute | Pharmco | 111000200 | |
FluorSave mounting medium | Millipore | 345789 | For mounting insert membrane on microscope slide |
GlutaMAX | Life Technologies | 35050-061 | L-alanyl-L-glutamine dipeptide, 200 mM |
HEK293T/Noggin-Fc cell line | van den Brink lab, Tytgat Institute for Liver and Intestinal Research | For production of Noggin conditioned medium | |
HEK293T/RSPO1-Fc-HA cell line | Trevigen | 3710-001-K | For production of Rspondin-1 conditioned medium |
HEPES, 1 M | Life Technologies | 15630-080 | Component of growth medium |
Heraeus Multifuge X1R Centrifuge | Thermo Fisher Scientific | 75004250 | |
Hoechst 33342 | Life Technologies | H3570 | Fluorescent nuclear dye |
Human epidermal growth factor (EGF) | R&D Systems | 236-EG-01M | Component of growth medium |
IGEPAL CA-630 | Sigma | I8896 | Component of lysis buffer |
Inverted cell culture light microscope | Olympus | CKX51 | |
LB broth | EMD Millipore | 1.10285.0500 | |
L-WNT3A cell line | ATCC | CRL-2647 | For production of Wnt3a conditioned medium |
Matrigel, growth factor reduced | Corning | 356231 | Basement membrane matrix for 3D culture |
Mini cell scraper | United BioSystems | MCS-200 | |
MUC2 antibody, mouse monoclonal | Abcam | ab11197 | Use at 1:100 for immunostaining, 1:500 for immunoblotting |
MUC2 shRNA lentiviral particles | GE Dharmacon | RHS4531 | GIPZ lentiviral shRNA, ID: 4583 |
Orbital shaker | Grant Instruments | PSU-10i | |
Penicillin-streptomycin, 100x | Life Technologies | 15140-122 | Component of growth medium |
Phosphate buffered saline | Corning | 21-031 | |
Probe sonicator with microtip | Branson Ultrasonics | 450 | |
Protease inhibitor cocktail for mammalian cells | Sigma | P8340 | Component of lysis buffer |
SB 202190 | Tocris | 1264 | p38 MAPK inhibitor |
Sodium chloride | Sigma | S3014 | Component of lysis buffer |
Sodium dexoycholate | Sigma | D6750 | Component of lysis buffer |
Sodium dodecyl sulfate | Sigma | L3771 | Component of lysis buffer |
TrypLE Express, 1x | Life Technologies | 12605-010 | Trypsin, for digesting enteroid/colonoid fragments |
Vinculin antibody, rabbit monoclonal | Abcam | ab129002 | Use at 1:1000 for immunoblotting |
Water, tissue culture grade, sterile filtered | Corning | 25-055 | |
Y-27632 | Tocris | 1254 | RhoA/ROCK inhibitor |