Dit protocol beschrijft een zeer gevoelige en hoge doorvoer neutrofiele extracellulaire val (NET) assay voor de semi-automatische kwantificering van ex vivo NET vorming door immunofluorescentie driedimensionale confocale microscopie. Dit protocol kan worden gebruikt voor het evalueren van de netto vorming en afbraak na verschillende prikkels en kan worden gebruikt voor het bestuderen van potentiële NET-gerichte therapieën.
Neutrofiele vallen extracellulaire (netten) immunogene extracellulaire DNA structuren die kunnen worden vrijgegeven door neutrofiele granulocyten op een breed scala aan triggers. Netten zijn aangetoond om te dienen als een belangrijke gastheer afweermechanisme dat overlapt en doodt micro-organismen. Aan de andere kant, zijn ze betrokken bij verschillende systemische auto-immune ziekten. Netten zijn immunogeen en giftige structuren die een pool van relevante autoantigens bevatten, met inbegrip van Antineutrofiele cytoplasmatische antistoffen (ANCA)-geassocieerde vasculitis (AAV) en systemische lupus erythematosus (SLE). Verschillende vormen van netten kunnen afhankelijk van de stimulus worden opgewekt. Het bedrag van de netten kan worden gekwantificeerd aan de hand van verschillende technieken, waaronder DNA release in supernatant, meting van DNA-complexvorm met NET-moleculen zoals myeloperoxidase (MPO) of neutrophil elastase (NE), meten van de aanwezigheid van citrullinated meten histonen door fluorescentie microscopie, of stroom cytometrische detectie van NET-componenten die alle verschillende functies met betrekking tot hun specificiteit, de gevoeligheid, de objectiviteit en de hoeveelheid. Hier is een protocol te kwantificeren ex vivo NET vorming in een zeer gevoelige en high-throughput wijze met behulp van drie-dimensionale immunofluorescentie confocale microscopie. Dit protocol kan worden toegepast om verschillende onderzoeksvragen over netto vorming en afbraak in gezondheid en ziekte.
De vorming van neutrofiele extracellulaire vallen (netten) is het proces waarin neutrofielen vrij hun DNA in een extracellulaire driedimensionale (3D) web zoals structuur, complexvorm met een breed scala van antimicrobiële en gevaarlijke moleculen, korrelig en cytoplasmatische enzymen, peptides en proteïnen. Deze immunogeen en giftige structuren hebben een belangrijke fysiologische rol in het aangeboren immuunsysteem verdediging van gezonde individuen door overlapping en doden infectieziekten pathogenen1. Echter, ze hebben ook aangetoond worden betrokken bij trombose2 en verschillende systemische auto-immune ziekten, met inbegrip van Antineutrofiele cytoplasmatische antistoffen (ANCA)-geassocieerde vasculitis (AAV)3, systemische lupus erythematosus (SLE )4,5, antiphospholipid syndroom (APS)2,6, reumatoïde artritis (RA), psoriasis en jicht7,8,9.
In vitro netto vorming is wijd bestudeerd met het chemisch samengestelde phorbol 12-myristaat 13-acetaat (PMA), die enorme netto vorming induceert. Meest fysiologische prikkels veroorzaken echter veel lagere niveaus van netto vorming10. Studie NET-triggers in, bijvoorbeeld, een auto-immuunziekte omgeving, is een gestandaardiseerde, gevoelige, high-throughput kwantitatieve bepaling nodig om te detecteren en kwantificeren van netto vorming. Kwantificering van netten heeft bewezen te zijn uitdagend en wordt momenteel uitgevoerd door verschillende methoden, elk met hun eigen voordelen en beperkingen11. Een veelgebruikte methode is de opsporing van DNA in het supernatant12, die doelstelling, maar discrimineert niet tussen de oorsprong van het DNA (apoptotic, necrotische, netten), en daarom niet zeer specifiek voor netten. Ten tweede enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) van DNA-complexvorm met NET-specifieke eiwitten, bijvoorbeeld myeloperoxidase (MPO) of neutrophil elastase (NE), een meer specifieke benadering te detecteren van netten en werden gedemonstreerd te correleren goed met citrullinated Histon-3 (CitH3) positieve netten13. Het is echter niet bekend of deze methode gevoelig genoeg is voor het halen van alle netten (b.v., MPO, NE, en CitH3 negatieve netten). Een derde benadering is immunofluorescentie microscopie die wordt gebruikt voor het detecteren van de co lokalisatie van NET-geassocieerde moleculen (NE, MPO, CitH3) met extracellulaire DNA te kwantificeren van netten. Deze methode is in het algemeen specifiek voor netten, maar het kan niet worden toegepast als een hoge-doorvoer-methode en is niet doelstelling als gevolg van de waarnemer bias. Bovendien, houdt deze methode niet rekening MPO-, NE-, CitH3-negatieve netten die zich vaak ophouden afhankelijk van het gebruikte NET-trigger14,15. Stroom cytometry benaderingen detecteren netten via een gewijzigde vooruit/zijwaartse scatter (FSC/SSC) met vermelding van de zwelling van de kern in NET-ting neutrofielen16. Deze methode houdt niet rekening te houden met de verschillende vormen van netto formatie die zijn geïdentificeerd, waarbij zwelling van de kern, zoals vitale netto vorming17niet mogelijk. Tot slot, immunofluorescentie confocale microscopie is toegepast om te visualiseren en te kwantificeren van netto vorming door direct kleuring extracellulaire DNA met een cel-ondoordringbare kleurstof die extracellulaire DNA12,18 vlekken. In het algemeen 5 tot 10 high-power velden zijn handmatig geplukt en beoordeeld, die betrekking heeft op 1-5% van elk putje van een 96-wells-plaat11,17. Handmatige selectie van afbeeldingen is niet altijd objectief, naar voren gebogen aan bias en niet aantrekkelijk voor high-throughput analyse. Een geautomatiseerde, hoge-doorvoer netto kwantificering assay werd onlangs ontwikkeld, die beeld 11% van de put op 3D-wijze die betrekking hebben op 13 µm door Z-gestapeld immunofluorescentie confocale microscopie, waardoor een zeer gevoelige techniek te beoordelen van netten vergeleken met de conventionele methoden10. Het huidige verslag beschrijft het meest recente protocol om te kwantificeren netto vorming door middel van een geautomatiseerde, zeer gevoelige bepaling met behulp van 3D confocale microscopie, die bereikt een verbeelde oppervlakte van 45% van elk putje en omvat 27 µm door Z-stacks. Dit protocol is geschikt om te kwantificeren, met een hoge gevoeligheid, lage niveaus van netto vorming op objectieve en onpartijdige wijze.
Het meest kritische deel van deze bepaling is de noodzaak om vers geïsoleerde neutrofielen voor elk experiment omdat neutrofielen kortstondige zijn en sterven wanneer bevroren. Dit vereist een gezonde donor die telkens weer andere, sommige variaties als gevolg van de kenmerken van de donor kan betrekken. Een van deze variaties is de status van de activering van de neutrofielen. Neutrofielen kon al in vivo voorafgaand aan isolatie worden geactiveerd. Bovendien, neutrofielen kunnen worden geactiveerd tijdens de stappen van isolatie met name tijdens lysis van de erythrocyten, daarom een ervaren handler van neutrofielen is vereist om te minimaliseren van de activering van neutrofielen. In het algemeen, isolatie van neutrofielen dient te worden uitgevoerd zo spoedig mogelijk na bloed tekenen en het experiment moet niet worden onderbroken om te voorkomen dat buitensporige spontane activering. Ten tweede, ruwe behandeling van neutrofielen moet worden vermeden. Als zodanig is het bekende voordeel van het beschreven protocol de minimale pipetting interventies zodra neutrofielen worden overgeënt in een 96-wells-plaat. Nog belangrijker is, wordt de status van de activering van de neutrofielen best beoordeeld in de ongestimuleerde voorwaarde waarin deze bepaling gevoelig lage niveaus van netto vorming kan detecteren. Een andere factor die de bepaling kan beïnvloeden is het gebruik van FCS in het medium. Het percentage van FCS is verlaagd van 10% tot 2% om te voorkomen dat de mogelijke afschaffing van netto vorming door anti-oxidant activiteit19,20 of de mogelijke activering van de neutrofielen ondanks warmte inactivatie. Cultuur zonder FCS of met het gebruik van verschillende types van media is nog niet uitgeprobeerd. Een ongestimuleerde of middelgrote controle is altijd meegenomen bij het uitvoeren van de bepaling dat een indicatie van het signaal van de achtergrond (bijvoorbeeld, status van de activering van de neutrofielen). De-voudige toename voor elke stimulans in vergelijking met het ongestimuleerde monster wordt weergegeven om consistente resultaten over verschillende experimenten met behulp van de dezelfde stimulus.
Een belangrijke factor voor een mogelijk hoge achtergrond is kleuring van extracellulaire DNA dat niets te maken met het proces van de vorming van de netto. De huidige bepaling geprobeerd te verminderen dit doordat de extracellulaire DNA kleuring onmiddellijk na de korte incubatietijd van 15 min en door het analyseren van de plaat direct na fixatie. Daarom is het essentieel om te gebruiken een geavanceerde confocal microscoop met voldoende snelheid en analytische kracht te vangen van de 96-wells-plaat binnen 1 tot 2 h. automatische instelling van de blootstellingstijd en de focus wordt aanbevolen. Als zodanig, is de instelling van de microscoop kan variëren tussen elk monster en experimenteren met betrekking tot de kleurdrempel intensiteit die nodig voor de algehele optimale beeldkwaliteit is. De laatste invloeden het uiteindelijke vermogen om correct te kwantificeren neutrofielen en netten en de optimale instelling moet derhalve worden bevestigd met behulp van meerdere controlemonsters (bijvoorbeeld serum van gezonde controles). Tijdens de analyse van opnames zorgt het gebruik van een pixel drempel en de drempel voor grootte in de analyseprogramma voor een betere selectie van netto vorming.
Extracellulaire DNA afgeleid van netto vorming kunnen het resultaat van verschillende dood trajecten, met inbegrip van NETosis, necroptosis, pyroptosis, ferroptosis of zelfs niet-lytische proces van vitale netto vorming1. Als zodanig is een beperking van de huidige bepaling dat door kleuring alleen voor extracellulaire DNA er geen onderscheid gemaakt tussen netto vorming en andere relevante cel dood trajecten mogelijk wordt. Het is mogelijk om dit te bereiken door gebruik te maken van beide selectieve inhibitors van verschillende dood opleidingstrajecten te discrimineren tussen de verschillende vormen die netto vorming of de aanwezigheid van specifieke netto markers, zoals citH3 en NE, door aparte immunostainings te bevestigen Co gelokaliseerd met DNA. De co lokalisatie van extracellulaire DNA met citH3 en NE heeft onlangs bevestigd voor deze bepaling10. Het voordeel van het vermijden van netto specifieke markers in deze test, toestaat om te beoordelen alle vormen van netto vorming leidde tot de extrusie van DNA door neutrofiele granulocyten zo volledig en zo objectief mogelijk met de mogelijkheden van high-throughput screening. De toepasselijkheid van dit protocol is gebleken bij het bestuderen van lage niveau netto inductie gemedieerd door immuuncomplexen in auto-immuun ziekte waarin de mogelijkheid om te detecteren van kwalitatieve en kwantitatieve verschillen misschien wel belangrijker dan het soort proces betrokken10,21,22. Illustreren dat deze roman netto kwantificering assay voor verschillende onderzoekers te onderzoeken van verschillende aspecten van de vorming van de netto toegevoegde waarde kan zijn. Kleine aanpassingen aan de bepaling zijn eenvoudig toe te passen: aanpassing van de stimulatie-periode, het gebruik van een favoriete netto marker te concentreren op één specifieke dood traject leidt tot de vorming van de netto, het gebruik van een verschillende vergroting of het gebruik van verschillende netto criteria in de kwantificering en analyse.
Kortom, is het protocol geboden een zeer gevoelige breed toepasbare assay voor de semi-automatische kwantificering van netto formatie voor de evaluatie van ex vivo inductie van netten op verschillende stimuli.
The authors have nothing to disclose.
Het werk van Eline J. Arends en Y.K. Onno Teng wordt ondersteund door de Nederlandse Kidney Foundation (17OKG04), klinische Fellowship van de Nederlandse organisatie voor wetenschappelijkonderzoek (90713460). Laura S. van Dam werk wordt ondersteund door de Foundation for Research in Reumatologie (FOREUM).
Aqua Sterile H2O | B. Braun, Melsungen, Germany | 12604052 | |
Fetal bovine serum (FCS) | Bodinco, Alkmaar, The Netherlands | Used in high concentrations it could influcence NET formation | |
Ficoll 5,7% – amidotrizoaat 9% density 1,077 g / mL | LUMC, Leiden, The Netherlands | 97902861 | |
Immunofluorescence confocal microscope | Image Xpress Micro Confocal (Molecular Devices, Sunnyvale, CA, USA) | ||
Neutralization PBS (10x) | Gibco, Paisley, UK | 70011-036 | |
Penicillin / streptomycin (p/s) | Gibco, Paisley, UK | 15070063 | |
Phenol red free RPMI 1640 (1x) | Gibco, Paisley, UK | 11835-063 | Phenol red can interfere with the immunofluorescence signal |
Phosphate-buffered saline (PBS) | B. Braun, Melsungen, Germany | 174628062 | |
PKH26 2 uM Red fluorescent cell linker | Sigma Aldrich Saint-Louis, MO, USA | PKH26GL-1KT | PKH are patented fluorescent dyes and a cell labeling technology named after their discoverer Paul Karl Horan |
Program for scientific multidimensional images analysis | ImageJ, Research Services Branch, National Institute of Mental Health, Bethesda, Maryland, USA | ||
RPMI medium 1640 (1x) | Gibco, Paisley, UK | 52400-025 | |
Sytox green 5 mM Impermeable DNA dye | Gibco, Paisley, UK | 57020 | |
Trypan blue stain 0,4% | Sigma Aldrich, Germany | 17942E | |
96 well, black, flat bottom, tissue culture treated plate | Falcon, NY, USA | 353219 |