Hier präsentieren wir ein Protokoll für die live-Imaging Wunde Reparatur und der damit verbundenen entzündlichen Reaktion bei hoher räumlich-zeitliche Auflösung in Vivo. Diese Methode nutzt das Puppenstadium Drosophila Entwicklung ermöglichen langfristige imaging und Verfolgung von bestimmten Zellpopulationen im Laufe der Zeit und ist kompatibel mit effizienten RNAi vermittelte gen-Inaktivierung.
Während die rasche entzündliche Reaktion auf Gewebeschäden sind Zellen des angeborenen Immunsystems schnell zur Verletzung Aufstellungsort rekrutiert. Einmal an der Wunde führen angeborene immune Zellen eine Reihe von wesentlichen Funktionen, wie z. B. Bekämpfung von Infektionen, clearing-nekrotische Schutt und anregende Matrix Deposition. Um die vielfältigen Signalisierung Veranstaltungen zu verstehen, die diese Immunreaktion regulieren, ist es wichtig, die komplexen Verhaltensweisen von (und Interaktionen, die zwischen auftreten) beobachten mehrere Zelle Linien in vivo und in Echtzeit mit den hohen räumlich-zeitliche Auflösung. Die optische Durchsichtigkeit und der genetischen Lenkbarkeit von Drosophila Embryos haben Drosophila als von unschätzbarem Wert-Modell zum live-Bild und sezieren grundlegende Aspekte der entzündlichen Zelle Verhalten, einschließlich der Mechanismen der Developmental Zerstreuung, Räumung von apoptotischen Leichen und/oder mikrobiellen Krankheitserregern und Rekrutierung von Wunden. Jedoch neuere Arbeiten hat nun gezeigt, dass mit einem viel späteren Stadium im Lebenszyklus Drosophila – Drosophila -Puppe – eine Reihe von Vorteilen bietet, einschließlich der RNAi-Effizienzsteigerung, längere Perioden, imaging und deutlich größere Immunzelle Zahlen. Hier beschreiben wir ein Protokoll zur bildgebenden Wunde Reparatur und der damit verbundenen entzündlichen Reaktion mit hoher räumlich-zeitliche Auflösung in live Drosophila -Puppen. Um die Dynamik der Re Epithelisierung und Entzündungen zu folgen, verwenden wir eine Reihe von spezifischen in Vivo fluoreszierenden Marker für das Epithel und angeborenen immunen Zellen. Wir zeigen auch die Wirksamkeit von Foto-Cabrio Fluorophore wie Kaede, für folgende spezifische Immunzellen Teilmengen, um ihr Verhalten zu verfolgen, wie sie auf, zu migrieren und Entschlossenheit aus Verletzung Aufstellungsort.
Eine effiziente und effektive entzündliche Reaktion ist von zentraler Bedeutung für jeden Organismus Infektionen bekämpfen, klar, Schutt und orchestrieren die Reparatur des verletzten Gewebes1. Obwohl diese Reaktion ein unvermeidliches Ergebnis der meisten Gewebeschäden ist, erfordert Entzündung strenge Regelung denn eine unangemessene Entzündungsreaktion mit einer Vielzahl von verschiedenen Krankheiten des Menschen (einschließlich chronische nicht-heilende Wunden verbunden worden ist übermäßiger Narbenbildung und Prädisposition für Krebs)1,2,3. Diese klinischen Relevanz gegeben, ist es entscheidend, ein genaueres Verständnis der molekularen und zellulären Mechanismen fahren die entzündliche Reaktion um neue prognostische Indikatoren und Strategien zur Behandlung von unterschiedlichsten chronischen entzündlichen entwickeln zu erhalten Bedingungen, die Reparatur von Gewebe von einer längeren und unnötige Entzündung schützen könnte.
In den letzten Jahren geworden Drosophila etablierte und wertvolle Modellsystem, Grundzüge der entzündlichen Reaktion auf menschliche4,5von Insekten konserviert zu zergliedern. Drosophila bietet weitaus größere genetische Lenkbarkeit als bisher in anderen experimentellen Modellen (z.B. Mäuse oder Zebrafisch) erlaubt präzise räumlich-zeitliche Genmanipulation in Vivo (inaktivieren oder über express jedes Gen des Interesses in bestimmten Zelltypen zu einem definierten Entwicklungs-Zeitpunkt) und Leichtigkeit der genomweiten Bildschirme6,7. Traditionell wurden die meisten live-Imaging-Studien der Heilung von Wunden und Entzündungen in Drosophila in einem embryonalen Stadium durchgeführt wie Embryonen unbeweglich (im Gegensatz zu Drosophila Larven oder Erwachsene) und optisch transparent ermöglicht beispiellos hohe Auflösung in Vivo imaging-8. Dies hat es erlaubt Forschern, die schnelle und robuste Einstellung von Drosophila angeborenen immunen Zellen (Hemocytes) an der Wundstelle als Reaktion auf die mechanische oder Laser-induzierte Schädigung der embryonalen Epithel9, zu visualisieren 10 , 11 , 12 , 13 , 14. durch die Kombination dieser live-Imaging-Studies mit der genetischen Manipulation, Studien bei Drosophila Embryos haben viele wichtige Immunzelle Proteine, die entzündliche Zelle Verhalten in VivoSteuern entdeckt. Zum Beispiel die CED-1 Homolog Draper (ein ITAM Domäne-haltige Protein) identifiziert worden als eine wichtige beschädigen-Rezeptor vermittelt, dass die Rekrutierung Drosophila Immunzellen ein H2O2-abhängigen Weise zu Stätten der beschädigen Sie15. Draper Ebenen innerhalb Immunzellen werden wiederum durch Kalzium-induzierte JNK Signal- und erhöhten flussabwärts von apoptotischen Leiche Aufnahme12geregelt. Hemocyte Motilität weiter erfordert komplexe Zellskelett Änderungen gerichtete Migration in die Wunde zu koordinieren und ist abhängig von der Aktivität des Zytoskeletts Regulierungsbehörden wie der Aktin-Bündelung Protein Fascin16 und der Rho-Familie kleiner GTPasen Rac und Rho9.
Drosophila ist ein holometabolous Insekt, die durch die zusätzliche Larven und pupal Stadien nach Embryogenese, vor dem Erreichen des Erwachsenenalters17geht. Die Drosophila -Puppe wurde entwickelt als ein zusätzliches Modell für nicht-invasive Leben-Aufnahmen von einer Vielzahl dynamischer zelluläre Ereignisse, einschließlich developmental Cell Migration18, Zellteilung19, Zelle Wachstum20und Muskel Kontraktion21. Vor kurzem wurde es als eine neuartige Modell, in dem die Dynamik der Wunde Reparatur und Entzündungen in Vivo22,23eingerichtet.
Genau wie in der embryonalen Phase sind Drosophila Puppen unbeweglich und optisch transparent, nach sorgfältiger Präparation aus ihrer undurchsichtigen pupal Fällen18. Durch die Nutzung dieser optischen Transparenz, kann man das in Vivo Verhalten des angeborenen immunen Zellen (Hemocytes) als Reaktion auf Gewebeschäden in Drosophila pupal Geweben, wie z. B. die pupal Flügel22folgen. Die pupal Flügel existiert als eine einfache bilayered Struktur, bestehend aus zwei großen flachen epithelialen Blätter, die an der Peripherie des Flügels verbunden sind; die extrazelluläre Raum zwischen diesen beiden epithelialen Schichten ist voller Hämolymphe (Insekt Blut) und eine große Zahl von bewegliche Hemocytes24. Ebenso wie in Embryonen löst mechanische oder Laser-induzierte Schädigung der Flügel Epithel eine schnelle Rekrutierung von Hemocytes bis die Verletzung Seite23. Das Puppenstadium bietet jedoch einige deutliche Vorteile für die Bildgebung über früher embryonalen Phase. Verletzte Puppen können über viel längere Zeiträume (für mindestens 5 h) abgebildet werden, mehr Gewebebereich steht der experimentellen Störung (z. B. Erzeugung von mehreren Wunden) und gibt es wesentlich größere Zahl von Hemocytes an dieser Bühne ( Bereitstellung von mehr Zelle Flugbahnen aus weiter Entfernung für verbesserte statistische Aussagekraft während der mathematischen Analysis). Darüber hinaus ist die Effizienz der RNAi-vermittelten gen-Inaktivierung in pupal Stadien, so dass viele Gene “in einem Gewebe oder die Zeit-spezifische Art und Weise im Vergleich zu den traditionelleren ganze mutierten Ansatz der Embryonen geworfen werden” erheblich verbessert.
Um die Dynamik der Wunde Re Epithelisierung und die begleitende Entzündungsreaktion innerhalb dieses neuen pupal Modell zu folgen, müssen zwei unterschiedliche Zellpopulationen gekennzeichnet werden: das pupal Epithel und die angeborenen immunen Zellen (Drosophila Hemocytes). Eine Reihe von verschiedenen Markern (Table of Materials) sind diese beiden unterschiedlichen Zellpopulationen zu beschriften – die Wahl des Markers hängt von der bestimmten Prozess untersucht werden. Anlässlich der pupal Epithel, Drosophila Zeilen, die entweder werden ein ubiquitär ausgedrückt GFP-Tags E-Cadherin (das Adherens Junctions Etiketten) routinemäßig genutzt, um die Positionen von den Zellenrändern oder alternativ ein GLP-Tags angeben Actin-bindende Domäne des Moesin (das das Aktin-Zytoskelett Etiketten), die Wunde-Rand kontraktilen Aktin Ring und führende Vorsprünge zu visualisieren. Die Drosophila Hemocytes, ein Hemocyte-spezifische Srp-Gal425 Antrieb Ausdruck des nuklearen RFP (für nukleare Tracking), zytoplasmatischen GFP oder GLP-markierten Moesin (Zytoplasma oder Aktin-Zytoskelett, bzw. beschriften) beschriften oder eine Photoconvertible Fluorophore (z. B. Kaede) dienen. In der Tat ist es oft vorteilhaft, mehrere Immunzelle Marker in Kombination verwenden, um simultane Analyse von der Atom-Bewegung und der Zellmorphologie (siehe repräsentative Ergebnisse) zu aktivieren. Da dieses Protokoll die Verwendung von Drosophila Puppen beinhaltet, werden jedoch nur Kombinationen von genetischen Markern, die tragfähige bis Mitte pupal Stadien genutzt werden können. Darüber hinaus werden embryonale tödliche Aktien nicht geeignet. Dies ist unwahrscheinlich, dass ein Problem sein, wenn bildgebende Kontrolle (oder Wild-Typ) Puppen aber ist wichtig zu berücksichtigen, wenn Gene sollen abgerissen werden oder überexprimiert, um ihre Auswirkungen auf den Wundverschluss oder Entzündung zu beurteilen. Bei frühen Letalität verursacht durch gen-Knockdown (oder Überexpression), eine Gal80ts Konstrukt kann induzieren die Gal4-driven Zuschlag später in der Entwicklung verwendet werden (siehe Diskussion).
In unseren jüngsten Studien hat Einzug in das Puppenstadium ermöglicht Datenerfassung ausreichend Immunzelle Flugbahn um entzündliche Verhalten mit anspruchsvolle mathematische Modellierung, der wiederum neue Details der Wunde ableiten konnte zu analysieren entzündlichen Lockstoff signalisiert23. Zum Beispiel offenbart dieser Ansatz, dass die Wunde lockstoffgradient breitet sich langsam durch das entzündete Gewebe bei 200 μm2/min, einer Rate weit langsamer als bisher vorgeschlagen kleine Kandidat Moleküle wie ATP oder H2O2 gemeldet werden diffuse26,27,28,29; Diese kleine “Schäden” Moleküle sind stattdessen wahrscheinlich als freizügige Signale handeln. Darüber hinaus folgt das langfristige Verhalten der angeborenen immunen Zellen wie sie weg von einer anfänglichen Wunde lösen und eine zweite (gemacht an verschiedenen Zeitpunkten nach der ersten) ausgesetzt sind, haben wir einen temporären “Desensibilisierung” Zeitraum, in denen Immunzellen entdeckt sind blind für spätere Verletzungen23. Durch Nutzung des langfristigen bildgebenden Potenzials des Modells pupal zusammen mit Drosophila genetische Lenkbarkeit, kann man das Verhalten von bestimmten Immunzellen Populationen (z. B. nur jene Immunzellen an der Wundstelle rekrutiert) in folgen. Antwort auf nachfolgenden Beleidigungen, mit der Photoconvertible Fluorophor30 , die ausschließlich innerhalb der Immunzelle Linie23ausgedrückt werden kann.
Hier beschreiben wir ein Protokoll, um die Dynamik der Wunde Reparatur und assoziierten Entzündungsreaktion mit hoher räumlich-zeitliche Auflösung mit lebenden visualisieren Drosophila Puppen. Wir bieten eine detaillierte Methode um die Schritte für die Vorbereitung der ersten Puppen (Dissektion und Montage) und die anschließenden Laser-vermittelten Verwundung und Zeitraffer Imaging zu decken. Wir beschreiben auch die Verwendung von Foto-Cabrio Fluorophore ermöglicht die Kennzeichnung von bestimmten Immunzellen Teilmengen in Vivo. Auf lange Sicht stellen wir uns, dass dieses neue Drosophila pupal Modell sezieren die komplexe Signaltechnik Dynamik zugrunde liegt die entzündliche Reaktion auf Gewebeschäden spannende Möglichkeiten eröffnet. Durch die Anwendung komplexer statistischer Analysen könnte man Funktionen der Antwort aufdecken, die sonst experimentell unzugänglich blieben, während die verbesserte Effizienz der RNAi sich für die Anwendung der genomweiten Screening innerhalb eignet könnte Immunzellen in Vivo zu identifizieren, neue Spieler Immunzelle Verhalten regulieren.
Die Akute entzündliche Reaktion auf Gewebeschäden ist ein komplexer und sehr dynamischen Prozess, der unerlässlich ist, die Reparatur von verletzten Geweben, einschließlich die Clearance von nekrotischen Schutt und der Kampf gegen die Infektion zu orchestrieren. Um vollständig zu verstehen und grundlegende Aspekte dieser Reaktion zu entwirren, ist es entscheidend, dass Studien durchgeführten in-Vivo auf 3-dimensionale lebenden Proben in Reihenfolge für das genaue Verhalten und Interaktionen der verschiedenen-Linien beteiligt Zell zu beachten genau im Laufe der Zeit. Echtzeit-Analyse von diesen Zelldynamik ermöglicht eine genauere Charakterisierung der mutierten Phänotypen als statische einzelnen Zeitpunkten von örtlich festgelegten Proben mit klassischen Immunohistochemistry Techniken. Bisher wurden die meisten live-Imaging-Studien mit dem genetisch gefügig Drosophila -Modell die embryonale Phase der Fruchtfliege Entwicklung aufgrund seiner optischen Transluzenz und Unbeweglichkeit im Vergleich zu den späteren Entwicklungsstadien4 verwendet. , 5. jedoch vor kurzem unserer Gruppe und andere entwickelten Drosophila -Puppe als neuartige Modell, hoher Auflösung und langfristige Bildgebung des Wunde Reparatur und Entzündung gleichzeitig durchzuführen in Vivo8,22 ,23. Dieser neue Ansatz bietet ein spannende langfristiges Potenzial für entwirren grundlegende Aspekte des Verhaltens entzündliche Zelle und kann weiter angepasst werden, um das dynamische Verhalten der anderen Zelle Linien (z. B. Drosophila Adipozyten untersuchen 38) nach Gewebeschädigung.
Es gibt eine Reihe von kritischen Faktoren bei der Vorbereitung und Darstellung der Verwundeten Drosophila -Puppen, die die Qualität der oben beschriebenen bildgebenden Ergebnisse feststellen. Wohl ist der schwierigste Schritt beschriebene Protokoll die sorgfältige Präparation und präzise Positionierung der Puppen vor Verwundung und Bildgebung. Puppen in dieser Entwicklungsphase sind extrem empfindlich und auch kleine Unfallschäden an die Puppen während zubereitungsschritten wird das Experiment erheblich beeinträchtigen; alle Puppen, die unbeabsichtigte Schäden erlitten haben können müssen aus dem Experiment verworfen werden, da diese Schäden eine eigene Entzündungsreaktion aktivieren konnte führen könnte zu mehr weit verbreitet (oder auch systemische) Effekte auf entzündliche Zelle Verhalten an anderer Stelle in die Puppe. Aufgrund der Weiterentwicklung der Puppen, die in diesen Experimenten (die bedeutende Gewebe Umgestaltungen um Gewebe für Erwachsensein vorzubereiten durchmachen), verwendet gelegentlich Puppen bewegt sich im Laufe der Bildgebung. Pupal Rollen ist, aber, wahrscheinlicher, wenn die Puppen nicht korrekt mit der flachsten Oberfläche des Flügels (oder anderes Gewebe zu abgebildet werden) im direkten Kontakt mit dem Deckglas; montiert wurden Verwendung von Heptan Leim, die Puppen auf dem Deckglas zu stabilisieren sollte diese unerwünschte Bewegung minimieren. Aus diesem Grund muss auch sehr darauf geachtet werden, um zu vermeiden, verdrängen die Puppen aus ihren sorgfältig ausgerichteten Positionen beim Wechsel der Proben zwischen Mikroskope; im Idealfall wird der Verwundung Laser zum gleichen Mikroskop für nachfolgende Zeitraffer Bildgebung und Foto-Konvertierung zu verwendende beizufügen.
Neben die Ausprägung der pupal Dissektion und Montageschritte wird die exakte Genotyp der Drosophila -Puppen verwendet erhebliche Auswirkungen auf die Qualität der Bilddaten erzeugt haben. Die Anzahl der Kopien des Gal4 -Treiber und UAS-Konstrukte (z.B. FH-GFP oder UAS-Kaede) innerhalb einer einzelnen pupal Genotyp bestimmen beispielsweise, das Signal-Rausch-Verhältnis während der nachfolgenden Bildgebung. Als Faustregel desto mehr Kopien eines Gal4 oder UAS konstruieren Gegenwart, desto größer die Gesamthöhe des fluoreszierenden Proteins (z. B. GFP oder Kaede) innerhalb des Gewebes. Das optimale Niveau der fluoreszierenden Proteins werden jedoch eine sorgfältige Balance zwischen erhebend Gewebe Fluoreszenz genug, um qualitativ hochwertige Bildgebung (Aktivieren der Verwendung von niedrigeren Laserleistungen, Reduzierung der Immunofluoreszenz und imaging über längeren Zeitraum Perioden) aber ohne Fluorophor-induzierte zelluläre Toxizität; die optimale Anzahl von Gal4 und UAS Konstrukte in jedem Experiment variiert je nach der bestimmten Treiber und Fluorophore verwendet wird. Vorsicht, die Puppen bei 25 ° C (oder höher, bis zu 29 ° C) zu erhöhen, weil das Gal4-UAS-System temperaturempfindlich ist und bei niedrigeren Temperaturen31unwirksam werden. Um zusätzliche Ebenen der Kontrolle über das Gewebe oder Zeit-Spezifität des Gal4 –getrieben Ausdruck zu erreichen, kann die Gal4-UAS-System-Repressor Gal80 auch in die pupal Genotyp39aufgenommen werden. Gal80 kann entweder zur Gal4-Aktivität in einem bestimmten Gewebe (mit einem gewebespezifischen Gal80) oder zu einem bestimmten Zeitpunkt zu unterdrücken (mit einer Temperatur empfindliche Gal80). Das Gal4-UAS-System weiter mit anderen unabhängigen binären Systemen (z. B. die LexA –LexAop und QF –QUAS Systeme) kombinierbar um Drosophila zu erzeugen, die mehrere Konstrukte (z.B. Fluorophore, RNAi Zeilen hat oder anderen genetischen Konstrukte) gleichzeitig in einer Reihe von verschiedenen Geweben39ausgedrückt.
Verwendung dieses neuen Drosophila pupal Modells bietet eine Reihe von Vorteilen gegenüber dem traditionellen Embryo-Ansatz. Im Vergleich zu den kurzfristigen Bildgebung (max. 3 h) erhältlich in 15 Embryonen (die Bühne an dem meisten embryonalen Verwundung Studien werden durchgeführt), Puppen können über wesentlich längere Zeiträume (im Prinzip erst im Erwachsenenalter nach 96 h pupal Entwicklung abgebildet werden ). Darüber hinaus weit größere Zahl von Hemocytes (Drosophila angeborenen immunen Zellen) sind vorhanden in den pupal Geweben (und für die Bildgebung) im Vergleich zu den begrenzteren innerhalb der Embryo vorhanden und Dies ermöglichte uns, sammeln deutlich mehr Bilddaten auf Hemocyte Verhalten unter Verwendung der gleichen Gesamtzahl der Proben. Entscheidend ist, hat dies wiederum ermöglicht gelten komplexeren mathematischen Modellierung um Hemocytes Verhalten zu analysieren und extrahieren Neuerungen der Wunde Lockstoffe und entzündliche Reaktion, die sonst experimentell geblieben wären unzugänglichen23. Ein weiterer Vorteil des pupal Modells ist die RNAi vermittelte gen-Knockdown ist deutlich effizienter als um früher embryonalen Phase, so dass verbesserte Analyse des Gewebes oder Zeit-spezifischen gen-Inaktivierung mit binären Systemen wie dem Gal4-UAS-system 39. die Effizienz der RNAi in diesem Stadium eröffnet somit das Potenzial, große Skala (oder sogar unvoreingenommene genomweite) durchführen RNAi-Bildschirme zur Suche nach neuartigen Akteure in Wunde Reparatur oder entzündliche Zelle Verhalten.
Jedoch Drosophila -Puppen klar können nicht verwendet werden, studieren die Phänotypen, die durch genetische Mutationen, die embryonale sind tödlich; funktionelle und live-Imaging Studien von Genen, die für die embryonale Entwicklung wesentlich sind müssen daher noch in Embryonen, durchgeführt werden, sofern RNAi vermittelte gen-Knockdown in einer Zeit oder gewebespezifische Weise Entwicklung ermöglicht durch pupal Stadien auftreten. Der Embryo bleibt auch das Modell der Wahl, um zu studieren und live-Bild bestimmte Funktionen von Immunzellen Verhalten, einschließlich die Entwicklungsstörungen Zerstreuung von Immunzellen von ihrem Ursprung, Kontakt-Hemmung der Fortbewegung und Phagozytose apoptotischer Leichen erzeugt bei Entwicklungsstörungen Gewebe Bildhauerei5,8 , die noch nicht im pupal Modelle beobachtet wurden. Obwohl Studien bei Drosophila Larven und Erwachsenen einen wichtigen Einblick in die Mechanismen, die Wunde Reparatur und Entzündungen40,41,42,43, zur Verfügung gestellt haben 44 live-Imaging-Studien in diesen Phasen haben schwierig, da die von Natur aus mobilen Charakter der Proben bewiesen. Während Larven betäubt werden können, ermöglichen kurze Perioden der Leben-Bildgebung kann aufgrund vorübergehender Art der Narkose, nur kurze Momentaufnahmen der live Wunde reparieren oder entzündliche Reaktion visualisierte45. Eine kürzlich durchgeführte Studie hat nun eine verbesserte Protokoll entwickelt, die längerfristige Bildgebung der Larven Wundheilung46, erlaubt, obwohl Vorbereitung und imaging noch deutlich schwieriger bleiben als in Embryonen oder Puppen. Auf lange Sicht stellen wir uns, die durch die Nutzung der am besten geeigneten Entwicklungsphase um jede spezifische Frage, Studien in allen vier diese verschiedenen Phasen der Drosophila – von Embryonen durch Larven und pupal Perioden bis zum Erwachsenenalter (jeweils mit Ihre eigene einzigartige Vorteile und Grenzen) – geben ergänzende Einblicke in die molekularen und zellulären Mechanismus Wunde Reparatur und Entzündungen.
In Zukunft dieses Protokoll für verletzte und langfristige Imaging von Drosophila Puppen lässt sich leicht anpassen, eine Reihe von Entzündungen-bezogene Phänomene zu studieren und hat weitreichende Potenzial für Aufdeckung Neuerungen der entzündliche Wunde Antwort. Die Kombination von langfristigen Bildgebung sowie die Anwendung der Photoconvertible Fluorophore (z. B. Kaede), sind von großem Wert für das Verständnis der Dynamik der angeborenen Immunzelle Verhalten und vor allem die weit weniger verstanden Auflösung Phase des die Wunde entzündliche Reaktion. Durch speziell Beschriftung entweder einzelne oder Subpopulationen von Immunzellen (z. B. die rekrutierten auf eine Wunde) wird es möglich sein, analysieren, wie Exposition gegenüber einer ökologischen Cue (z. B. einer Leiche oder Verletzung) beeinflusst die Immunzelle nachfolgende Antwort zu einem späteren Zeitpunkt Cue. Entzündliche Verhalten von Drosophila Hemocytes durch frühere Erfahrungen geändert werden – zum Beispiel, sie sind grundiert Gewebeverletzung reagieren durch vorherige Phagozytose apoptotischer Leichen während der Entwicklung12 aber es bleibt abzuwarten ob weitere ökologische Hinweise ähnliche Priming Ereignisse auslösen. Obwohl Studien pupal Wunden so weit auf die angeborene Entzündungsreaktion konzentriert haben, die pupal Flügel Modell bietet eine ideale Gelegenheit, sowohl live-Bild und sezieren die Mechanismen epithelialen Wunde Reparatur. Darüber hinaus könnte dieser pupal bildgebende Verfahren auch angepasst werden, um das dynamische Verhalten der anderen Zelle Linien als Reaktion auf Gewebe Schaden38, entweder in die pupal Flügel selbst oder andere leicht zugängliche pupal Gewebe (z. B. die Augen, Beine oder Thorax) zu untersuchen. Schließlich konnte durch die Kombination der genetischen Lenkbarkeit von Drosophila zusammen mit der Leichtigkeit der langfristigen pupal Bildgebung, Roman epithelialen Reparatur oder entzündliche Aufsichtsbehörden aufgedeckt durch die Anwendung der unvoreingenommene genomweite Knock-Down-werden Ansätze.
The authors have nothing to disclose.
Wir möchten die Martin, Nobes, Richardson und Holz Übungseinheiten für hilfreiche Diskussion danken. Wir danken auch die Wolfson Bioimaging Anlage (University of Bristol, UK), Bloomington Lager Zentrum (Universität von Indiana, USA) und Vienna Drosophila Resource Centre (für Drosophila Bestände) und Flybase (für aktuell Drosophila gen Anmerkung). Diese Arbeit wurde unterstützt durch einen MRC Projekt Zuschuss an Uhr und W.W (MR/J002577/1), ein Wellcome Trust Senior Fellowship, w. und ein Wellcome Trust Investigator Award bis Uhr.
Drosophila stocks | |||
ubiquitous GFP-tagged E-cadherin ;Ubi-p63E-shg.GFP; (chrII) |
Kyoto Stock Center, DGRC | #109007 | Ubi-p63E promoter sequences drive expression of Drosophila E-cadherin (shotgun) tagged at the C-terminal end with GFP. |
ubiquitous GFP-tagged E-cadherin ;;Ubi-p63E-shg.GFP (III) |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #58742 | Ubi-p63E promoter sequences drive expression of Drosophila E-cadherin (shotgun) tagged at the C-terminal end with GFP. |
ubiquitous GFP-tagged Moesin P{sGMCA}3.1 |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #59023 | The ubiquitously expressed sqh promoter/enhancer drives expression of a fragment of Moesin (that includes the actin binding sequences) tagged with GFPS65T. |
hemocyte specific serpent-Gal4 driver ;srp-Gal4; |
Generated by Katja Bruckner | Generated by Katja Bruckner | Expression of ScerGAL4 fused to a polyA tail is under the control of 2 genomic sequences from upstream of Drosophila serpent. Ref: Brückner, K., Kockel, L., Duchek, P., Luque, C.M., Rørth, P., Perrimon, N. The PDGF/VEGF receptor controls blood cell survival in Drosophila. Dev Cell. 7 (1), 73–84, doi: 10.1016/j.devcel.2004.06.007 (2004). |
UAS-nuclearRFP w1118;;P{UAS-RedStinger}6 |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #8545 or #8547 | UAS regulatory sequences drive expression of the DsRed.T4 form of RFP which is tagged at the C-terminal end with a nuclear localisation signal |
UAS-cytoplasmicGFP ;;P{UAS-GFP.S65T} |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | Multiple stocks available (e.g. #1522) | Expression of the S65T version of GFP by UAS regulatory sequences; the S65T variant exhibits increased brightness. |
UAS-photoconvertibleKaede w1118;; P{UAS-Kaede.A}3 |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #26161 | Kaede protein emits bright green fluorescence after synthesis, but changes efficiently to a bright stable red fluorescence on irradiation with UV. |
GFP-tagged spaghetti squash w1118;;P{sqh-GFP.RLC} |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #57145 | The sqh coding region, which is tagged at the C-terminal end with a T:AvicGFPS65T tag, is expressed under the control of the natural sqh promoter. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Ingredients for fly food media | Fly food media is made according to standard procedures (see Greenspan, R. 1997. Fly Pushing: The Theory and Practice of Drosophila Genetics. Cold Spring Harbor Press. 1-191 pp.) | ||
maize | Wild Oats, Bristol, UK (or equivalent supplier) | Contact supplier direct | organic |
soya flour | Wild Oats, Bristol, UK (or equivalent supplier) | Contact supplier direct | organic |
malt extract | Wild Oats, Bristol, UK (or equivalent supplier) | Contact supplier direct | organic |
molasses | Wild Oats, Bristol, UK (or equivalent supplier) | Contact supplier direct | organic |
Difco agar | BD Biosciences, Fisher Scientific | DF0142-15-2 | For preparation of fly food |
Propionic acid | Sigma | 402907 | For preparation of fly food |
Nipagen | Sigma | 79721 | For preparation of fly food |
Dried baker's yeast | Redstar, Dutscher Scientific, UK LTD | Redstar, Dutscher Scientific, UK LTD | For preparation of fly food |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Sample preparation and mounting | |||
Parafilm | Sigma | P7793-1EA | For preparation of heptane glue |
Fine sable paintbrush | Daler-Rowney (or equivalent) | #0 or 1 | |
Forceps | Fisher Scientific (or Fine Science Tools) | NC9404145 | Dumont #5 |
Glass bottomed dishes for imaging | MatTek | P35G-0-10-C | We suggest using 35mm petri dishes, with at least a 10mm Microwell, 0.085-0.13mm cover glass, uncoated. Dishes with larger microwells will enable increasing numbers of pupae to be mounted and imaged in a single experiment. |
Heptane | Sigma | 51730-5ML | For preparation of heptane glue |
Double sided sticky tape (e.g. Scotch) | Agar Scientific | AGG263 | For preparation of heptane glue |
50ml tube (for heptane glue) | Falcon tubes from Fisher Scientific | 14-432-22 | For preparation of heptane glue |
Glass microscope slides | Agar Scientific | AGL4244 | For dissection of Drosophila pupae |
Dissecting stereo microscope with brightfield | Leica (or equivalent) | M50 | For dissection of Drosophila pupae |
Microscissors | John Weiss International | 103123 | Miniature Research Scissors (straight) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Laser ablation and imaging | |||
Nitogen ablation laser | Spectra-Physics (or Andor equivalent) | Model VSL-337ND-S | For wounding, this should be attached to a widefield imaging system |
Multilaser confocal laser-scanning microscope (CLSM) | Leica (or equivalent) | TCS AOBS SP8 or SP5-II attached to a Leica DMi8 inverted epifluorescence microscope (or equivalent) | Ideally including a motorised stage for multi-site and 'mosaic' scanning, plus ‘hybrid’ GaAsP detectors (that offer much greater sensitivity and boosting of low signal) |
Environmental chamber | Life Imaging Services (or equivalent) | "Microscope Temperature Control System" | Attached to Confocal microscope for temperature control during imaging |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Image Analysis Software | |||
FRAP software module | Leica (or equivalent) | CLSM FRAP software module | For performing photoconversion of photoconvertible fluorophores such as Kaede |
ImageJ (image analysis software) | National Institutes of Health (NIH) | https://imagej.nih.gov/ij/ | Schneider, C.A., Rasband, W.S., Eliceiri, K.W. "NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis". Nature Methods 9, 671-675, 2012. |
ImageJ plugin "Manual Tracking" | National Institutes of Health (NIH) | https://imagej.net/Manual_Tracking | |
ImageJ plugin "TrackMate" | ImageJ, NIH | https://imagej.net/TrackMate | Tinevez, JY.; Perry, N. & Schindelin, J. et al. (2016), "TrackMate: An open and extensible platform for single-particle tracking.", Methods 115: 80-90, PMID 27713081 |
Volocity (high performance 3D imaging software) | Perkin Elmer | Volocity 6.3 | For image analysis |
IMARIS (image analysis software) | Bitplane | IMARIS for Cell Biologists | For image analysis |