이 문서 시드 방울에 세포의 캡슐화 능률을 제공 하기 위해 물방울 미세 장치에 피 펫 팁을 사용 하 여 셀의 부족 한 인구를 위한 프로토콜을 제공 합니다.
다양 한 미세 플랫폼 디자인 세포 분석에 자주 사용 되, 사이 방울-마이크로 분리 하 고 세포에 외부 요인의 영향을 제거 하 여 세포를 단일 세포 수준에서 분석 하기 위한 강력한 도구를 제공 합니다. microenvironment입니다. 방울에 세포의 캡슐화는 각 방울에 존재 하는 셀의 수와 물방울의 부피 당 세포의 평균 수의 함수로 포아송 분포값에 의해 결정 됩니다. 1 차 셀, 특히 면역 세포, 또는 임상 표본 부족 수 있으며 셀의 무손실 캡슐화 유지 도전. 이 문서에서 우리는 로드 셀 셀의 상당한 손실 없이 미세 물방울 기반 장치에에 피 펫 팁을 사용 하는 새로운 방법론 제시. 다양 한 세포 유형으로 밀접 하 게 캡슐화 효율 포아송 분포에 의해 예측에 해당 하는 물방울에 효율적인 셀 캡슐화를 설명 합니다. 우리의 방법은 미세 플랫폼 셀의 무손실 로드를 보장 하 고 다운스트림 단일 세포 분석, 예를 들어, 다른 세포 유형 사이 세포 상호 작용 해독을 위해 쉽게 적용할 수 있습니다.
최근 몇 년 동안, 단일 세포 수준에서 세포 분석을 위한 강력 하 고 다양 한 플랫폼으로 마이크로의 사용 급속 하 게 증가1있다. 이러한 플랫폼 단일 세포 및 높은 정밀도와 감도 매우 작은 샘플 볼륨2,,34를 사용 하 여 생물학 분자의 높은 처리량 검열을 제공 합니다. 미세 디자인의 다른 종류 중에서 물방울 기반 플랫폼 세포 정확 하 고 정확한 통제를 허용 하는 혼합할 수 없는 단계에 의해 포위 하는 수성 단계 물방울에서 그들을 분리 하 여 단일 셀의 높은 처리량 분석을 사용 microenvironment5,6. 드롭릿 기반 마이크로 제공 유연성을 단일 또는 다중 셀에, 둘 다, 수성 및 히드로 방울 고 단백질 분 비 또는 세포질 상호 작용7, 등의 복잡 한 세포 동작을 프로 빙에 가치가 있다 8 , 9. 신호 및 면역 세포 사이 잡담 microenvironment10에 있는 다른 세포와의 상호 작용에 의해 좌우 될 수 있다. 방울에 단일 셀의 절연 효과적인 잡음이 분석 실험실을, 더 효율적이 고 정확한 결과11,12에 대 한 외부 환경 요인의 영향에서 무료 제공합니다. 여러 종류의 세포 세포 상호 작용을 통해 셀 페어링12,13공부 캡슐화 가능 여러 후미와 물방울 미세 플랫폼의 디자인 수정
방울에 세포의 캡슐화 과정 무작위 이며 포아송 분포14,15에 대 한 수식을 사용 하 여 세포의 캡슐화의 속도 통계적으로 결정 될 수 있다. 캡슐화의이 속도 방울에 셀의 도착의 평균 속도 고려 하 여 예상할 수 있는 그리고 각 셀의 도착의 도착에서 독립 된 세포16. 독립적인 셀 도착을 보장할 수 없습니다, 비록 띄엄띄엄 분산된 셀의 경우, 독립의 가정으로 간주 될 수 있습니다. 및 셀의 수의 기능으로 하나 이상의 셀을 포함 하는 작은 물방울의 확률을 예측할 수 있습니다. 각 방울 방울16,17당 세포의 평균 수에 존재. 하나는 입구에서 세포의 농도 증가 셀 각 방울 에 평균 수를 늘릴 것 이라고 하는 것을 건의 할 수 있다 방울 세포 캡슐화의이 추정이 각 방울에 존재 하는 셀의 수에 따라 이기 때문에, 16. 따라서, 단일 세포 캡슐화를 위해 셀 농도 감소 되어야 한다 이것은 종종 단서 하지만 빈 물방울18의 다 수.
첨부 파일, 침전, 또는 주사기에 응집, 튜브, 또는 생산 장치에 의해 로드 하는 동안 세포의 손실은 일반적인 단점 예측된 캡슐화 값19 에서 실제 캡슐화 값의 편차에 대 한 책임 . 이 문제는 때 그들은 이미 인구에 부족 하 고 몇 가지 셀만, 훨씬 더 낮은의 캡슐화 예상 보다 제공 하지 않습니다 충분 한 데이터 실험 분석에 대 한 희귀 면역 세포 또는 임상 표본 시드 과장 더 가져옵니다. Plasmacytoid 수지상 세포 (pDCs)만 구성 하는 면역 세포의 드문 하위 집합은 약 0.2-0.6%의 전체 화이트 혈액 세포 인구20. 이 세포의 대량 분 비 interferons 활성화 유형 I와 함으로써 면역 반응21에 중요 한 역할. 방울 같은 희귀 세포의 세포질 행동 공부, 시드 셀 및 캡슐화22동안 세포 손실을 방지 하기 위해 필수적입니다. 몇 방울 방울 포함의 세대에 대 한 음향 또는 전기 힘과 같은 다른 물리적 힘을 활용 하는 적극적인 캡슐화 방법을 사용 하 여 단일 셀의 캡슐화 보장 관련된 개발 디자인 있다 단일 셀23,24. 그러나, 이러한 방법은 방울 생산16측면에서 그들의 자신의 한계를 가진다.
이 연구에서 우리는 강력 하 고 간단한 메서드를 circumvents 미세 장치 하나 또는 여러 개의 셀을 로드 하기 위한 전통적인 방법의 단점 설립. 우리의 노 외.에 의해 영감을 중요 한 샘플 손실 없이 물방울 미세 플랫폼 희귀 면역 세포의 작은 볼륨을 시드를 위한 다르게 크기의 피 펫 팁을 활용 하 여 메서드와 이론적으로 일관 된 결과 굴복 예측25. 이 방법론 쉽게 될 수 있습니다 및 성공적으로 하 게 물방울 기반 마이크로 관련 된 여러 응용 프로그램에 대 한 적응 하 고 다양 한 세포 유형 또는 심지어 미에 대 한 적용.
이 프로토콜에서 우리는 로드 셀 높은 처리량, 단일 세포 분석용 방울에 캡슐화 하 고 통제 세포 세포 상호 작용 연구에 대 한 연결을 수행 하는 효율적이 고 간단한 기법을 증명 하고있다. 또한, 우리 로드 셀 미세 장치를 몇 가지 기존의 방법을 비교 하 고 접근을 로드 하는 우리의 끝 다른 방법에 비해 더 효율적인 기술 이다 보여주었다.
공부 임상 표본 또는 희귀 세포 유형 드롭릿 기반 마이크로 수에 부족 한 몇 가지 고유의 과제를 소유한 다. 처럼 우리는 또한 증명 하고있다, 셀 하는 경향이 주사기와 튜브의 표면에 퇴적, 예측된 값에 맞게 세포 캡슐화를 방지. 이 문제를 피하기 위해, 일부 그룹은 주사기에 교 반 막대를 사용 합니다. 그러나, 희귀 하 고 제한 된 세포 인구를 사용할 경우 요약 셀 볼륨도 제한 됩니다, 따라서, 큰 주사기의 사용을 제한 하 고 교 반 바. 또한, 우리 또한 테플론으로 코팅 셀 첨부 파일을 방지 하기 위해 튜브와 더 일반적으로 사용 되는 튜브를 교체 하지만이 메서드는 결과 개량 하지 않았다 고 튜브 너무 긴 경우 셀 첨부 파일 문제 악화 (데이터 표시 되지 않음). 또는, 우리 큰 주사기 볼륨에서 셀의 손실을 방지 하기 위해 주사기에 튜브에 셀 로드 어디 수직 튜브 로딩 방식을 사용. 이 기술을 사용 하 여, 작은 샘플 볼륨 셀 로드할 수 있습니다, 예를 들어, Pdc는 희귀 하 고 제한. 또한, 튜브에서 샘플 셀 침전을 방지 하기 위해 수직으로 장치에 로드 됩니다. 시드 셀 사용 하는 튜브 작은 크기 있으며 microchannels 비교 될 수 있다. 튜브에서 흐름 압력 중심 이며 포물선 속도 프로 파일26. 최대 흐름 속도 배관의 중심에는 및 최소 속도 튜브27의 가장자리에는 의미 합니다. 튜브를 통해 세포의 인구 홍 조, 속도 그라데이션 경계에서 속도가 0에 가까이 있기 때문에 그들은 진정 어디 가장자리 쪽으로 밀어 세포 발생 합니다. 침전 또는 셀에 튜브에서의 정착, 실험 데이터 예측 모델과 일치 하지 않는 대표적인 결과 같이 캡슐화 효율 감소.
드롭릿 마이크로 함께 일 하는 과학자 들에 의해 사용 되는 다른 일반적으로 적응된 솔루션 밀도 일치 하는 주사기19셀 침전을 방지 하기 위해 Iodinaxol와 같은 시 약의 추가 의해 세포 배양의 밀도 증가 하는. 그러나, 일치 하는 시 약 밀도 세포 행동 영향을 미칠 수 및 부정적인 cytokine 분 비 영향으로 세포가 (데이터 표시 되지 않음)28.
기존의 셀 기술 로드에 여러 크고 작은 수정 캡슐화 효율성에 약간의 개선을 보였다, 비록 획득된 실험 결과 여전히 않았다 일치 하지 이론적인 계산. 그러나, 접근을 로드 팁 우리는 극복 이전 메서드 및 캡슐화 효율의 한계 제어 포아송 통계 수 있습니다. 이 기술은 뿐만 아니라 현 탁 액 셀 로드에 유리 하지만 기본 keratinocytes 등 A549 미세 칩을 부착 셀 로드 되었을 수도 있습니다. 풍부한 셀 라인, 예를 들면 A549, K562, 등, 사용 하는 경우 더 큰 샘플 볼륨을 사용할 수 있습니다. 따라서, 샘플의 볼륨에 따라 다른 크기의 피 펫 팁을 사용할 수 있습니다 그리고이 간단한 기술은 단일 셀 캡슐화 및 여러 셀 캡슐화에 대 한 적용할 수 있습니다.
동안 낮은 셀 농도 방울에서 단일 세포의 캡슐화 확인 하는 데 필요한, 더 높은 세포 농도 셀 쌍에 관련 된 연구에 대 한 각 방울에 셀의 평균 수를 늘리기 위해 원하는. 이전에 미세 칩 또는 ﹙ nanowells29,,3031쌍 면역 세포를 설명 하는 여러 단일 셀 방법이 있다. 드롭릿 마이크로, 포아송 통계 두 개의 서로 다른 세포 유형 대 한 쌍을 1:1 셀 최적의 세포 농도에서 달성 될 수 있다 지시 한다. 푸아송 예측을 바탕으로, 또한 있다 확률 방울 다른 조합이 포함 될 수 있습니다. 1:1 셀 쌍 수 있지만 단일 셀 수준 및 증가 세포 이해에 결과에서 세포 상호 작용을 공부 하는 것이 좋습니다, 주요 이점이 있다 또한 여러 셀 페어링. 다른 셀 형식에 대 한 셀 형식의 여러 셀의 영향을 이해할 수 있습니다. 다른 면역 세포 간의 크로스 토크 여러 감염 및 병원 체에 대 한 효과적인 면역 반응을 생성 하는 데 도움이 하 고 또한 우리의 면역 시스템32에 견고성을 추가 합니다. 따라서, 셀룰러 통신 고유한 컨텍스트, 예를 들어, 1:1, 2:1, 1:2, 2:2, 3:1, 등에서 고정밀 심문 수 있습니다. 어떻게 단일에 저조한 증가 이해 또는 셀의 면역 반응의 유도 제어합니다. 이 특히 연구 예를 들어 순차적으로 세포를 죽 일 그들의 각각 대상 자연 킬러 세포 또는 세포 독성 T 세포의 용량 흥미롭습니다.
언급 했 듯이, 방울, 셀의 여러 캡슐화에 대 한 높은 셀 농도 원하는 됩니다. 그러나, 세포 샘플의 높은 농도 셀 캡슐화에 대 한 하나의 입구에서 세포를 로드할 때 셀 하면 입구에서 집계를. 이 결과 낮은 캡슐화 속도 이론에서 높은 편차. 이 문제를 피하기 위해, 셀 뿐만 아니라 두 개의 별도 후미에서 로드할 수 있습니다. 이론적으로, 그것은 셀 수 x에 평균 보증은 세포 캡슐화의 더 높은 수준을 달성 하기 위해 여러 개의 후미와 다른 미세 소자를 개발할 수 것입니다. 이 연구에서 우리는 하나의 입구와 같은 총 농도 사용 하 여 두 후미에서 로드 하 고 비슷한 캡슐화 효율을 얻은 Jurkat T 세포의 캡슐화 효율 조사. 이 수정 칩에 쌍 다른 세포 유형에 연구자를 수 있습니다.
이 메서드는 셀 셀의 상당한 손실 없이 미세 장치 로드에 에이즈, 동안 명심 될 필요가 있는 특정 예방 조치가 있다. 공기 방울의 미네랄 오일과 피 펫 팁에서 셀 샘플을 발음 주사기를 채울 때 피해 야 한다 하 고 전체 시스템 공기 무료. 그것은 또한 미네랄 오일 샘플 혼합 하지 해야 하는 것을 명심 하는 것이 중요입니다. 피 펫 팁, 포함 하는 샘플, 미세 장치와 누설 하 고 공기 방울의 추가 설립을 방지 하기 위해 최대한 예방의 후미에 단단히 삽입 한다. 요약 하면, 팁-로드 비용 효율적인 방식으로 셀의 상당한 손실 없이 세포 캡슐화를 통해 세포 행동의 높은 처리량 분석을 허용 하는 간단 하지만, 강력한 기술입니다. 입구에서 최적의 샘플 농도 함께 사용 하면 로드 셀 피 펫 팁의이 방법은 매우 유연 하며 다른 세포 유형, 특히 드문 기본 면역 세포에 대 한에 가까운 높은 캡슐화 효율를 위해 적응 시킬 수 있다 예측된 모델입니다.
The authors have nothing to disclose.
우리는 아인트호벤 공대 관대 한 지원에 대 한 감사합니다.
1H,1H,2H,2H-Perfluoro-1-octanol | Sigma-Aldrich | 171468-5G | |
1H,1H,2H,2H-Perfluorooctyltriethoxysilane | Fluorochem/UK | S13150 | Silane (toxic) |
Agarose (Ultra-low Gelling Temperature) | Sigma-Aldrich | 9012-36-6 | |
BD Wegwerpspuiten met Luer-Lok-punten | Fisher Scientific | 10630694 | Syringe |
Biopsy Punch 1.2 mm | Harris Uni-Core | ||
Cell Proliferation Dye eFluro 670 | eBioscience | 65-0840-85 | |
CellTrace CFSE | Invitrogen | C34554 | |
CellTrace Far Red Cell | Invitrogen | C34564 | |
Eppendorf Tubes | Eppendrof Tubes | Safe-Lok tubes 1 mL and 2 mL | |
Glass Slide | Sigma Aldrich | CLS294775X38-72EA | Corning microscope slides, plain L × W 75 mm × 38 mm |
Harvard Pumps | Harvard Apparatus | C-400750; C-400727 | Syringe pumps |
HFE-7500 3M Novec Engineered fluid | Fluorochem/UK | 51243 | Flourinated oil |
Kai Biopsy Punch 5 mm | Amstel Medical | 1980130 | |
Luer stub | Instechlabs/USA | LS20S | Luer stub, 20ga (pink) x 0.5in (12mm), non-sterile |
Mineral oil (Light) | Sigma Aldrich | M8410-1L | |
Phosphate buffered saline | Sigma-Aldrich | P4417-50TAB | Tablets |
Pico-Surf 1 (5%in Novec 7500) | Sphere Fluidics | 020317-09 | Surfactant |
Plasma Asher | Emitech | K1050X | Plasma asher |
RPMI 1640 Medium | Gibco | 11875093 | |
Silicone Elastomer Base 184 | Sylgard | 9355218 | PDMS base |
Silicone Elastomer Curing Agent | Sylgard | 9355218 | Curing Agent |
Stainless steel catheter coupler | Instechlab/USA | SC20/15 | 20ga x 15mm, non-sterile |
TFE Teflon Tubing | Sigma-Aldrich | 58696-U | PTFE Tubing L × O.D. × I.D. 50 ft × 1/16 in. × 0.031 in. |
Thinky mixer ARE-250 | EX-4025F | Conditioning mixture |