מאמר זה מציג עבור זריעה נדיר אוכלוסיית תאים באמצעות פיפטה-טיפים droplet microfluidic התקנים על מנת לספק יעילות גבוהה יותר כימוס של תאים בטיפות פרוטוקול.
בין העיצובים פלטפורמה microfluidic שונים בשימוש תכוף לניתוח הסלולר, רביב-מיקרופלואידיקה מספק כלי חזקים בידוד וניתוח תאים ברמת תא בודד על-ידי ביטול השפעת גורמים חיצוניים על הטלפון הסלולרי microenvironment. כימוס של תאים בטיפות מוכתב על ידי התפלגות פואסון כפונקציה של מספר התאים המצויים לכל droplet ואת המספר הממוצע של תאים לכל אמצעי אחסון של droplet. ראשי תאים, במיוחד תאים חיסוניים, או דגימות הקליני יכול להיות נדיר, אובדן-פחות ומגעים תאים נותר מאתגר. בנייר זה, אנו מציגים מתודולוגיה חדשה המשתמשת פיפטה-טיפים כדי לטעון לתאים התקנים מבוסס-droplet microfluidic ללא אובדן משמעותי של תאים. עם סוגי תאים שונים, נדגים היעילה תא אנקפסולציה בתוך טיפות שמתאים מקרוב היעילות כימוס שמנבאת את התפלגות פואסון. השיטה שלנו מבטיח הפסד-פחות הטעינה של תאים microfluidic פלטפורמות וניתן בקלות להתאים לניתוח במורד הזרם תא בודד, למשל, כדי לפענח אינטראקציות סלולרי בין סוגי תאים שונים.
בשנים האחרונות השימוש מיקרופלואידיקה כפלטפורמה חזקים ופסיביות לניתוח הסלולר ברמת תא בודד יש במהירות מוגברת1. פלטפורמות אלה מספקים ההקרנה תפוקה גבוהה של תאים בודדים ומולקולות ביולוגיות ברמת דיוק גבוהה ורגישות באמצעות מדגם קטן מאוד נפח2,3,4. בין סוגים שונים של עיצובים microfluidic, פלטפורמות מבוססות-droplet לאפשר ניתוח תפוקה גבוהה של תאים בודדים על-ידי בידוד אותם ב- droplet פאזה מימית מוקף שלב immiscible המאפשר שליטה מדויקת על הטלפון הסלולרי 5,microenvironment6. מיקרופלואידיקה מבוסס-droplet מעניק את הגמישות לבודד יחיד או מרובות-תאים בשני, מימית, טיפות הידרוג הוא ערך שם בודק את התנהגות הסלולר מורכבים, כגון חלבון הפרשת או סלולרי אינטראקציות7, 8 , 9. האיתות, צולבות לדבר בין תאים חיסוניים יכול להיות מושפע על ידי אינטראקציות עם שאר התאים microenvironment10. בידוד של תאים בודדים בטיפות מספק יעיל ללא רעש האנליטית, חופשי מהשפעת גורמים סביבתיים חיצוניים יותר יעיל ומדויק תוצאות11,12. שינוי העיצוב של פלטפורמה רביב-microfluidic עם אינלטס מרובים מאפשר כימוס של סוגי תאים מרובים ללמוד אינטראקציות סלולרי באמצעות תיאום תא12,13.
התהליך של כימוס של תאים בטיפות אקראי, הקצב של כימוס של תאים יכול מבחינה סטטיסטית להיקבע באמצעות הנוסחה עבור התפלגות פואסון ה-14,15. קצב זה הסגירות להיות מוערך על ידי בהתחשב הקצב הממוצע על ההגעה של תאים בצומת droplet, בהנחה כי הגעתו של כל תא הוא עצמאי הגעתו של השני תאים16. אף כי לא ניתן להבטיח את ההגעה תא עצמאית, במקרים של תאים בדלילות מבוזרת, ההשערה של אי-תלות יכול להיחשב, ההסתברות של droplet המכיל תאים אחד או יותר ניתן לחזות כפונקציה של מספר התאים נוכח כל droplet ואת המספר הממוצע של תאים לכל droplet16,17. מאז זה הערכה של כימוס הסלולר בטיפות תלויה מספר התאים המצויים לכל droplet, אחד יכול להציע כי הגדלת ריכוז התאים-הים יגדיל את המספר הממוצע של תאים המצויים לכל droplet 16. לכן, כדי להבטיח כימוס תא בודד, הריכוזים התא צריך להיות מופחת אבל זה בדרך כלל מוביל למספר רב של טיפות ריקה18.
אובדן של תאים במהלך טעינת קובץ מצורף, משקעי סחף, ו/או clumping במזרק, אבובים, או התקן ההפקה היא חיסרון משותף אחראי על הסטייה של כימוס בפועל ערכים ערכים כימוס החזוי19 . בעיה זו מקבל מוגזמות עוד יותר כאשר זריעה תאים חיסוניים נדיר או דגימות קלינית וגם הם כבר נדיר באוכלוסיה העטיפה של רק כמה תאים, נמוך בהרבה ממה שציפיתי, אינה מספקת מספיק נתונים לשם ניתוח ניסיוני. Plasmacytoid תאים דנדריטים (שיתפקדו) הם סוג נדיר של תאים חיסוניים שמהווה רק כ 0.2 – 0.6 אחוזים של הלבן כולו דם תא האוכלוסייה20. תאים אלו מפרישים כמויות אדירות של מסוג האינטרפרונים בעת ההפעלה, ובכך לשחק תפקיד קריטי תגובות חיסוניות21. כאשר הלומדים את ההתנהגות הסלולר של תאים כאלה נדירים של טיפות, זה הכרחי כדי למנוע איבוד תאים במהלך תא זריעה וכימוס22. יש עיצוב מספר התפתחויות הקשורות הבטיחו את ומגעים תאים בודדים בטיפות בשיטות כימוס פעיל לנצל כוחות פיזיים שונים כגון כוחות אקוסטית או חשמלית לדור של טיפות המכיל חד-תאים23,24. עם זאת, שיטות אלה יש המגבלות שלהם במונחים של ייצור droplet16.
במחקר זה, הקמנו שיטה חזקה וישירה העוקפות את החסרונות של שיטות מסורתיות עבור טעינת בודד או מספר תאים למכשירים microfluidic. השיטה שלנו, בהשראת רו. et al., מנצל טיפים פיפטה בגודל שונה זריעה כרכים קטנים של תאים חיסוניים נדירים כדי droplet פלטפורמות microfluidic ללא הפסד משמעותי הדגימה, הניב תוצאות שאינן קוהרנטי עם תיאורטי תחזיות25. מתודולוגיה זו ניתן להגיע בקלות הותאם עבור מספר יישומים מעורבים מיקרופלואידיקה מבוסס-droplet בהצלחה, מיושם עבור מגוון רחב של סוגי תאים או אפילו microparticles.
ב פרוטוקול זה, הראו טכניקה פשוטה ויעילה אל לטעון, לתמצת בתאים טיפות לניתוח תפוקה גבוהה, תא בודד, כדי לבצע התא מבוקרת זיווג ללימודי אינטראקציה הסלולר. יתר על כן, אנו יש לעומת מספר גישות קונבנציונליות כדי לטעון את התאים microfluidic התקנים, הראה כי עצה שלנו גישת הטעינה היא טכניקה יעילה יותר לעומת שיטות אחרות.
דגימות קליניות לומד או סוגי תאים נדיר נדיר במספר מאת מיקרופלואידיקה מבוסס-droplet בעלי כמה אתגרים הטבועה. כמו גם הראו, התאים נוטים משקעים מזרקים, השטח של הצנרת, ובכך, מניעת כימוס הסלולר לציית הערכים החזויים. כדי להתחמק מהבעיה, כמה קבוצות להשתמש ברים מלהיב תארגן את הדברים. עם זאת, בעת שימוש נדיר ומוגבל תא אוכלוסיות, נפח התאים הכולל הוא גם מוגבל, ובכך, הגבלת השימוש של מזרקים גדולים זע ברים. יתר על כן, גם החלפנו לצנרת וללחצנים שבשימוש עם אבובים כדי למנוע התא מצורף מצופה טפלון אך שיטה זו לא שיפר את התוצאות, אם לאורך צינור ארוך מדי, הבעיה של התא מצורף המחמירה (נתונים לא מוצג). לחלופין, השתמשנו צינור אנכי גישת הטעינה שבו התאים היו טעונים הצנרת ולא את המזרק כדי למנוע האובדן של תאים מזרק גדול כרכים. בעזרת טכניקה זו, תאים עם מדגם קטן נפח ניתן לטעון, למשל, שיתפקדו שהינם נדירים ומוגבל. כמו כן, הדוגמה של הצנרת טעון למכשיר אנכית כדי למנוע שקיעת תא הצנרת המשמשים תא זריעה יש מידות קטנות, ניתן להשוות microchannels. הזרם ב לאורך צינור לחץ מונע ונוהליו פרופיל מהירות פרבולית26. זה מרמז כי מהירות זרימת המקסימום היא במרכז של הצנרת, מהירות מינימלית ויש בקצוות של אבובים27. שטיפה אוכלוסיה של תאים דרך הצנרת, מעבר הצבע מהירות גורמת התאים להיות דחף לכיוון הקצוות איפה הם להתיישב כי המהירות על הגבול היא קרובה לאפס. משקעי סחף או התיישבות בתאים הצנרת, ובכך, מפחית את היעילות כימוס כמוצג בתוצאות נציג שבו לא תאמה נתוני הניסוי עם המודל החזוי.
עוד פתרון מותאם בדרך כלל בשימוש על ידי מדענים, עבודה עם מיקרופלואידיקה רביב, הוא להגביר את הצפיפות של התקשורת התרבות התא על ידי תוספת של צפיפות התאמת ריאגנטים כגון Iodinaxol כדי למנוע שקיעת תא מזרקים19. עם זאת, צפיפות התאמת ריאגנטים יכולים להשפיע על התנהגות הסלולר, לרעה משפיע על הפרשת ציטוקינים על ידי תאים (נתונים לא מוצג)28.
אף-על-פי מספר שינויים קטנים וגדולים בתא קונבנציונאלי טעינת טכניקות הראו שיפורים קלים כימוס היעילות, תוצאות הניסוי שהושג עדיין לא תאמה החישובים התיאורטיים. עם זאת, כשהרטיב את גישת הטעינה שיכולנו את ולהתגבר על המגבלות של שיטות קודמות ויעילות כימוס נשלטת על ידי פואסון נתונים סטטיסטיים. טכניקה זו היא לא רק יתרון עבור טעינת ההשעיה תאים אבל גם יכול להיות מיושם עבור טעינת תאים חסיד, כגון keratinocytes הראשי A549 microfluidic שבבי. בעת שימוש שורות תאים שופע, לדוגמה A549, K562, וכו, נפח דגימה גדול יכול לשמש. לכן, בהתאם לנפח של המדגם, פיפטה בגדלים שונים-טיפים יכול לשמש גם, טכניקה פשוטה זו ניתן להתאים כימוס תא בודד וגם כימוס תאים מרובים.
בזמן הריכוז נמוך תא נדרש כדי להבטיח את ומגעים תאים בודדים בטיפות, ריכוז גבוה של תאים הם הרצוי כדי להגדיל את המספר הממוצע של תאים במארז לכל droplet על מחקרים בנושא התא זיווג. ישנן מספר שיטות תא בודד בעבר שתוארו לתאי מערכת החיסון זוג על שבבי microfluidic או microfabricated nanowells29,30,31. ב- droplet מיקרופלואידיקה, סטטיסטיקה פואסון מכתיב תא 1:1 זה זיווג של שני סוגי תאים שונים יכולה להיות מושגת בריכוזים אופטימליים תא. על סמך התחזית פואסון, יש גם הסתברות כי טיפות עשוי להכיל שילובים אחרים. אמנם זיווג של 1:1 התא יכול להיות רצוי ללמוד אינטראקציות סלולרי ברמה תא בודד, תוצאות בהבנה הסלולר מוגברת, זיווג תאים מרובים יש גם יתרונות חשובים. זה מאפשר להבין את ההשפעה של תאים מרובים מסוג תא אחד על הסוג תא אחר. הצלב דיבורים בין תאים חיסוניים שונים לעזור כדי ליצור תגובה חיסונית יעילה נגד דלקות, פתוגנים מספר ומוסיף גם החוסן שלנו המערכת החיסונית32. ככזה, תקשורת סלולרית יכולה להיחקר עם דיוק גבוהה בהקשרים שונים, למשל, 1:1, 2:1, 1:2, 2:2, 3:1, וכו ‘. מניב הבנה גוברת על איך יחיד או זוגות של תאים לשלוט על אינדוקציה של תגובות חיסוניות. . זה מעניין במיוחד ללמוד לדוגמה הקיבולת של תאים רוצח טבעי או T ציטוטוקסיים להרוג תאי מטרה בהתאמה שלהם באופן סדרתי.
כפי שפורט, לצורך כימוס מרובים של תאים בטיפות, ריכוז גבוה של התא הרצוי. עם זאת, בעת טעינת תאים מפני כניסת אחד עבור תא כימוס, ריכוז גבוה של דגימות התאים יכול לגרום תאים להפעיל עליה פונקציית צבירה-מפרצון. התוצאה נמוכים כימוס וסטיות גבוה מהערכים תיאורטי. להתחמק בעיה זו, ניתן לטעון את התאים מכל שני אינלטס נפרד גם כן. באופן תיאורטי, זה יהיה אפשרי לפתח מכשירים אחרים microfluidic עם אינלטס מרובים כדי להשיג ברמה גבוהה יותר של כימוס התא שבו נדרש ממוצע על x מספר תאים. במחקר זה חקרנו את היעילות כימוס של תאי Jurkat T כאשר נטען כניסת אחד והן שני פתחי הכניסה באמצעות ריכוז מוחלט באותו והשיג יעילות עיטוף דומה. שינוי זה מאפשר לחוקרים לסוגי תאים שונים זוג השבב.
בעוד ששיטה זו מסייעת טעינת תאים microfluidic התקנים ללא אובדן משמעותי של תאים, ישנם מספר כללי זהירות שצריך לזכור. בעת מילוי של המזרקים עם שמן מינרלי וכ רפה בעברית המדגם תא בטיפים פיפטה, יש להימנע התאגדות של בועות אוויר, המערכת כולה צריכה להיות נטולת אוויר. חשוב גם לזכור כי שמן מינרלי אינו צריך לערבב עם הדוגמה. טיפים פיפטה, המכיל דוגמאות, צריך להיות מוכנס בחוזקה, פתחי הכניסה של המכשיר microfluidic, עם זהירות מירבית, כדי למנוע דליפה נוספת התאגדות של בועות אוויר. לסיכום, עצה העמסה היא טכניקה פשוטה, עדיין חזקה המאפשרת לניתוח תפוקה גבוהה של התנהגות הסלולר דרך כימוס תא ללא אובדן משמעותי של תאים באופן יעיל. בעת שימוש עם ריכוזים מדגם אופטימלי-הים, גישה זו של טעינת תאים עם פיפטה-טיפים מאוד גמיש, ניתן להתאים לסוגי תאים שונים, במיוחד עבור תאים חיסוניים העיקרי נדיר, כדי להשיג יעילות גבוהה יותר כימוס, קרוב מודלים החזוי.
The authors have nothing to disclose.
אנו מודים האוניברסיטה הטכנולוגית של איינדהובן לתמיכה נדיבה.
1H,1H,2H,2H-Perfluoro-1-octanol | Sigma-Aldrich | 171468-5G | |
1H,1H,2H,2H-Perfluorooctyltriethoxysilane | Fluorochem/UK | S13150 | Silane (toxic) |
Agarose (Ultra-low Gelling Temperature) | Sigma-Aldrich | 9012-36-6 | |
BD Wegwerpspuiten met Luer-Lok-punten | Fisher Scientific | 10630694 | Syringe |
Biopsy Punch 1.2 mm | Harris Uni-Core | ||
Cell Proliferation Dye eFluro 670 | eBioscience | 65-0840-85 | |
CellTrace CFSE | Invitrogen | C34554 | |
CellTrace Far Red Cell | Invitrogen | C34564 | |
Eppendorf Tubes | Eppendrof Tubes | Safe-Lok tubes 1 mL and 2 mL | |
Glass Slide | Sigma Aldrich | CLS294775X38-72EA | Corning microscope slides, plain L × W 75 mm × 38 mm |
Harvard Pumps | Harvard Apparatus | C-400750; C-400727 | Syringe pumps |
HFE-7500 3M Novec Engineered fluid | Fluorochem/UK | 51243 | Flourinated oil |
Kai Biopsy Punch 5 mm | Amstel Medical | 1980130 | |
Luer stub | Instechlabs/USA | LS20S | Luer stub, 20ga (pink) x 0.5in (12mm), non-sterile |
Mineral oil (Light) | Sigma Aldrich | M8410-1L | |
Phosphate buffered saline | Sigma-Aldrich | P4417-50TAB | Tablets |
Pico-Surf 1 (5%in Novec 7500) | Sphere Fluidics | 020317-09 | Surfactant |
Plasma Asher | Emitech | K1050X | Plasma asher |
RPMI 1640 Medium | Gibco | 11875093 | |
Silicone Elastomer Base 184 | Sylgard | 9355218 | PDMS base |
Silicone Elastomer Curing Agent | Sylgard | 9355218 | Curing Agent |
Stainless steel catheter coupler | Instechlab/USA | SC20/15 | 20ga x 15mm, non-sterile |
TFE Teflon Tubing | Sigma-Aldrich | 58696-U | PTFE Tubing L × O.D. × I.D. 50 ft × 1/16 in. × 0.031 in. |
Thinky mixer ARE-250 | EX-4025F | Conditioning mixture |