Extracellular vesicles present in blood have been suggested as novel biomarkers for various diseases. Here, we present a protocol for the isolation of large plasma membrane-derived microvesicles from peripheral blood samples and their subsequent analysis by conventional flow cytometry and Western Blotting.
שחרור השלפוחית התאית (EVS) כולל exosomes נגזר endosomal הקטן (Exos, קוטר <100 ננומטר) microvesicles נגזרות הממברנה פלזמה גדולה (MVS, בקוטר> 100 ננומטר) הוא תהליך הסלולר בסיסי המתרחש בכל תאי החיים. חלבוני תחבורת שלפוחית אלה, שומני גרעין חומצות ספציפיים תא מוצאם במבחנה הדגישו את חשיבותם כמתווכים של תקשורת בין תאית. מכוניות חשמליות היו מבודדות בהצלחת נוזלי גוף שונים ובעיקר כלי רכב חשמליים בדם זוהו מבטיח סמנים לסרטן או מחלות זיהומיות. על מנת לאפשר את הלימוד תת-אוכלוסיות MV בדם, אנו מציגים פרוטוקול עבור הבידוד הסטנדרטי והאפיון של MVS מדגים דם היקפי. MVS הם pelleted ממדגמים פלזמה anticoagulated EDTA על ידי צנטריפוגה ההפרש ובדרך כלל בעל קוטר של 100 – 600 ננומטר. בשל הגודל הגדול שלהם, הם יכוליםבקלות להיחקר על ידי cytometry זרימה, טכניקה המשמשת באופן שיגרתי לדיאגנוסטיקה רפואית זמינה ברוב המעבדות. כמה דוגמאות עבור מבחני בקרת איכות של MVS מבודד תינתן וסמנים שיכולים לשמש אפליית subpopulations MV שונים בדם יוצגו.
בשנים האחרונות רבים במבחנה הוכיח כי שלפוחית תאית (EVS) ממלא תפקיד חשוב בתקשורת בין תאית. תאים חיים לשפוך כל הזמן שלפוחית אשר שונים בגודלם, תוכן biogenesis. כלי הרכב החשמליים למדו הטוב ביותר הם exosomes שמקורם במערכת endosomal שבו הם מאוחסנים כמו שלפוחית intraluminal בגופי multivesicular. לאחר הפתיל האחרון עם קרום הפלזמה, השלפוחית הכלולה משתחררת כמו exosomes (Exos, בקוטר 30 – 100 ננומטר 1). אוכלוסייה שנייה של EV אשר צבר תשומת לב גוברת בשנים האחרונות הם microvesicles גדול (MVS, בקוטר 100 – 1,000 ננומטר) אשר יוצאים מגוף ישירות מן קרום הפלזמה 2.
שני סוגים של שלפוחית מוקפי bilayer שומנים ומכילים חומצות גרעין, למשל, דנ"א, רנ"א שליח או מירנה 3 – 5, וכן שפע של חלבונים אשר הם יכולים להעביר ג שכנהאמות. בעוד בכלל רכב החלבון של השלפוחית משקף את מצב התא ממוצא, כמה חלבונים נראים ממוקדים סלקטיבי מועשר ב -1 EVS. אינטרס מחקר עיקרי הוא לאפיין כלי רכב חשמליים מתאיים נורמלית וחולה על מנת להגדיר חתימות EV ספציפיות עלולים לאפשר את השימוש של כלי רכב חשמלי כסמנים ביולוגיים רומן. במיוחד בסרטן, שבו לעתים קרובות בגידול עצמו אינו נגיש בקלות, ביופסיות נוזלות מיקוד מכוניות חשמליים-גידולים ספציפיים בדם עשויות לאפשר ניטור של תגובות לטיפול או לעזור המאפיינות את הגידול הראשוני ללא צורך הליכים פולשניים 6.
ואכן, EVS כבר בודדו בהצלחה נוזלים שונים בגוף, כולל שתן 7, CSF 8, השד חלב 9 או דם 10. מספר מחקרים זיהו שינויים במצבת EV וקומפוזיצית מחל אנושיות שונות. לדוגמא, בחולי אלח דם במספר MVS פרו-קרישה הואהגדיל משמעותית לעומת אנשים בריאים 11. גם בחולים עם מלריה מוחין חמור עלייה MVS הכולל בדם ניתן לצפות וספירות של MVS-derived טסיות לתאם עם תרדמת עומק תרומבוציטופניה 12. מחקרים אחרים מדווחים על מספרים גבוהים של שלפוחית נגזרות האנדותל בחולים עם זאבת אדמנתית מערכתית או אי ספיקת לב, ובמקרה של האחרון, זה עולה בקנה אחד עם הסתברות גבוהה יותר של אירועים קרדיווסקולריים 13,14.
במיוחד בסרטן, EVS בדם נדון כעת כסמנים ביולוגיים רומן עם ערך דיאגנוסטיים ופרוגנוסטיים. רמות של MVS לבטא חלבוני גידולים הקשורים כגון MUC1, EGFR או FAK נראות מורמות בדמם של חולי סרטן השד 15,16. גם עבור Exos, מחקרים שנעשו לאחרונה הראו כי Exos דם הנגזרות נושאת אנטיגנים ספציפיים הגידול כגון Glypican-1 לסרטן הלבלב או דל-1 לסרטן השד לאפשר דה המחלה בשלב מוקדםtection עם גבוהה סגולית ורגישה 17,18. בנוסף, הגידול הנגזרות בסרום Exos עשוי להכיל DNA אשר ניתן להשתמש בהם לצורך זיהוי של מוטציות כגון KRAS ו- p53 אשר מצביע על השימוש שלהם על מנת לבצע חיזוי טיפול 19. ההתקדמות שחלה באחרונה הראו כי ניתוח של Exos בדם של חולי גליובלסטומה באמצעות שבב microfluidic ספציפי המאפשר ניטור של טיפול 20. יחדיו, ממצאים אלה מרמזים כי ניתוח של תת-אוכלוסיות ספציפיות מחלות של שלפוחית נותן מידע רב ערך על האבחנה, הפרוגנוזה, כמו גם אפשרויות טיפוליות והצלחה.
עם זאת, בידוד וניתוח Exos מדם הוא גוזל זמן, דורש ציוד מעבדה מיוחד ולכן הוא עדיין לא מתאים לאבחון קליני שיגרתי. לעומת זאת, MVS ניתן לבודד הרבה יותר מהר, בשל גודלן, ניתן לנתח בקלות על ידי cytometry זרימה ללא הצורך להזדווג להם חרוזי לטקס כפי שהוא הכרחי Exos 18, 21. לכן, כאן אנו מציגים פרוטוקול שיכול לשמש עבור הבידוד הסטנדרטי של MVS מדגימה דם ואת האפיון הבא של תת-אוכלוסיות MV ידי cytometry זרימה. פרוטוקול זה יאפשר מחקר נוסף ובאפיון עומק פרופילים MV בקבוצות גדולות של מטופלים אשר יידרש על מנת להשתמש MVS לדיאגנוסטיקה רפואית היומיום.
מחקרים שנעשו לאחרונה על כלי רכב חשמליים בדם הוכיחו כי הרכב וספירת EV להשתנות במהלך הגורם מספר מחלות. לכן, הניתוח ואפיון נוסף של כלי הרכב חשמליים האלה הם של ריבית גבוהה עוד יותר להעריך פוטנציאל השימוש שלהם כסמנים ביולוגיים המחלה לאבחון ופרוגנוזה או להעריך תגובות טיפול. הפרוטוקול אנו מציגים כאן מאפשר בידוד של שלפוחית בקוטר של עד 600 ננומטר אשר אינם כוללים כל האברונים בתא. תצפיות אלו עולים בקנה אחד עם ההגדרה הנוכחית של MVS ואינן כוללות נוכחות של גופים אפופטוטיים 2. שימוש המערבי סופג, הצלחנו להוכיח כי MVS מבודדים להראות ביטוי גבוה של טובולין, בעוד tetraspanins CD9 ו- CD81 המשמשים לעתים קרובות כסמנים Exo היו רק מעט לידי ביטוי. זו מאשרת כי MVS נבדל Exos ומתאים לאפיון מעמיק האחרון והשוואה של שתי אוכלוסיות EV ידי פרוטאומיקה 25.
תוכן "> במהלך הרכישה של דגימות דם, חשוב לשמור את הזמן בין venipuncture והכין פלזמה קצרה ככל האפשר על מנת למנוע הידרדרות MV. יתר על כן, אחסון ממושך של דגימות דם יכול להוביל ההפעלה של תאי דם גורמת MV משופרת משיל ובסופו של הדבר אפופטוזיס אשר גורם לשחרור של גופים אפופטוטיים. שיקול חשוב נוסף עבור בידוד MV הוא למנוע זיהומים של הכנות MV עם חלבוני פלזמה או Exos הקטן. לכן, חשוב להסיר כמה שיותר supernatant ככל האפשר לאחר שצנח MVS ב g 14,000 x. מאחר הגלולה גלויה כרגיל במהודק אל הקיר של הצינור, supernatant ניתן להסיר בקלות עם קצה פיפטה. בניגוד Exos אשר נוטה ליצור אגרגטים במהלך ההכנה ידי ultracentrifugation במהירות גבוהה לעתים קרובות קשה resuspend, בעיה זו אינה מתרחשת עם MVS.המחקר שלנו מראה שזה possible לאפיין תת-אוכלוסיות MV נוכח הדם על ידי cytometry הזרימה. למרות גבול הגילוי של cytometers הזרימה ביותר הוא סביב 200 – 300 ננומטר, MVS נמדד reproducibly ב תורם וכן דגימות תרבית תאים עם אותם הפרמטרים של ניתוח והשערים שאפשרו ההבחנה שלהם בבירור מפני אותות רקע. חשוב לוודא לפני המדידות כי PBS המשמש בניתוחים אינו מכיל חלקיקים מזהמים שעלולים לגרום רקע גבוה במהלך cytometry זרימה (איור 3). למרות שחלק MVS קטן אולי לא ליפול בפח גישה תזרים cytometric, זיהינו MVS מכל אוכלוסיות תאים הדם הגדולים (למשל, טסיות, תאי דם אדומים, כדוריות דם לבנות, תאי אנדותל). בניתוחים שלנו השתמשנו סמנים סטנדרטיים עבור תאי הדם השונים אשר כבר נמצאו בעבר על MVS 26 – 29. יצוין כי על מנת להשיג את התוצאות הטובות ביותר על ידי זרימת cytometry, tהוא להסתכם וריכוז כל הנוגדנים יש טיטרציה על מדגם MV לבטא את האנטיגן של עניין. אם תת-אוכלוסיות MV ספציפיות בדם תזוהינה עם ייחוד גבוה, ניתן לבצע צביעה כפולה כנגד שני אנטיגנים שונים המצויים על גבי MVS בהתאמה ורק לשקול כל MVS הכפול החיובי לאחר מנתח 23. נכון לעכשיו, יש מאמצים כדי להגדיר טווח רמה תת-אוכלוסיות MV בדם של אנשים בריאים 23,30. מחקרים אלה הראו כבר כי MVS-derived טסיות מהווים את האוכלוסייה הגדולה ביותר של MVS בדם שנמצא התכתבות עם התצפיות שלנו.
אחד יתרונות של cytometry זרימה לאפיין דגימות MV שהשיטה הזאת היא הוקמה כבר היטב למטרות אבחון ברוב מרכזי הקלינית אשר תאפשרנה את השימוש האפשרי של MVS כסמנים ביולוגיים אבחון קליני יומיומי. מחקרים קודמים על כלי רכב חשמליים בדם אשר יש בעיקר להתמקדאד על Exos הקטן, להסתמך על נהלים ספציפיים מיון או לנתח את אוכלוסיית יעד Exo הרצויה סלקטיבי 31,32 או דורש זמן רב (2 ימים) תהליך בידוד עם צימוד של Exos לטקס חרוזים לפני ניתוח 18. התצפיות לא פורסמו שלנו מראות כי ניתוח התזרים cytometric של MVS מן הכנות דם כולו ואף מאפשר זיהוי של MVS כגון MVS נגזרות גידול ללא כל תהליכי מיון כזה.
יחדיו, הפרוטוקול המובא כאן מאפשר הבידוד המהיר של MVS מדגים דם היקפי עם ציוד מעבדה סטנדרטי והאפיון הבא שלהם באמצעות cytometry זרימה ו מערבי סופג. התהליך כולו יכול להתבצע סביב 2 שעות אשר יקל במחקרים עתידיים על פרופילים MV ב 'הדם החולים נדרשים להעריך את הפוטנציאל של MVS כסמנים ביולוגיים למחלה.
The authors have nothing to disclose.
The authors acknowledge Meike Schaffrinski for excellent technical assistance. We would like to thank the following people for their help in the collection of peripheral blood samples (all from University Medical Center Göttingen): Henrietta Vida (Dept. of Transfusion Medicine), Kia Homayounfar, Lena-Christin Conradi (Dept. of General, Visceral and Pediatric Surgery), Leila Siam, Bawarjan Schatlo (Dept. of Neurosurgery), Hendrik A. Wolff, Martin Canis (Dept. of Otorhinolaryngology, Head and Neck Surgery) as well as all employees of the interdisciplinary short-term oncology. We acknowledge Dirk Wenzel (Max Planck Institute for Biophysical Chemistry, Göttingen) for his help with the electron microscopy of MVs.
The study was funded by the German Ministry of Education and Research (BMBF) project MetastaSys (grant no. 0316173) as well as the German Cancer Aid (grant no. 109615).
butterfly needle (21 gauge) | Hospira Deutschland GmbH | 490P29201 | |
Bovine serum albumin Fraction V | Roth | 8076.3 | For 10x TBS weigh 24.2 g Tris base and 80 g NaCl, ad 1 L H2O and adjust pH to 7.6 |
For 1x TBS-T mix 100 mL 10x TBS with 900 mL H2O and add 1 mL Tween-20 | |||
CD235a-PE | Beckman Coulter | A07792 | use 5µl for staining |
CD45-FITC | Beckman Coulter | 7782 | use 5µl for staining |
CD62E-PE | Biolegend | 336008 | use 0.8µg for staining |
CD62P-PE | Biolegend | 304905 | use 0.1µg for staining |
CD81 antibody | Biolegend | 349501 | 1:2000 in 5%BSA in TBS-T; use non-reducing conditions for Western Blotting |
CD9 antibody | Immunotools | 21270091 | 1:1000 in 5%BSA in TBS-T; use non-reducing conditions for Western Blotting |
Chemiluminescence imager ImageQuant LAS-4000 | Fujitsu Life Sciences | ||
DC protein assay kit II | Bio-Rad | 5000112 | |
ECL detection reagent | GE Healthcare | RPN2232 | |
EDTA vacutainers for blood collection | Sarstedt | 01.1605.001 | |
FACSCanto II | BD Biosciences | ||
fetal calf serum (FCS) | Invitrogen | 10091148 | heat-inactivated (30 min, 56°C) |
filter 0.22µm | Sarstedt | 83.1826.001 | |
HRP-coupled anti-mouse secondary antibody | santa cruz | sc-2005 | use 1:10,000 in 5% milk powder in TBS-T |
HRP-coupled anti-rabbit secondary antibody | santa cruz | sc-2004 | use 1:10,000 in 5% milk powder in TBS-T |
4x Laemmli loading buffer, Roti-Load 1 | Roth | K929.1 | |
microfuge SIGMA 1-15K | Sigma Laborzentrifugen | ||
milk powder (Blotting-Grade Blocker, nonfat dry milk) | BioRad | 170-6404 | |
multifuge 3 L-R | Heraeus | ||
NanoSight LM10 | NanoSight Ltd. | ||
PBS, w/o Ca and Mg | Pan biotech | P04-36500 | |
perfusor syringe 50 mL | Braun | 8728844F | |
Ponceau-S staining solution | PanReac AppliChem | A2935,0500 | |
rotor Sw32.1 Ti for ultracentrifugation (6x 17 mL) | Beckman Coulter | ||
rotor TLA-120.2 for ultracentrifugation (10x 1.5 mL) | Beckman Coulter | ||
tubes for flow cytometry (5 mL, round-bottom) | BD Biosciences | 352054 | |
tubes for ultracentrifugation (15 mL) | Beckman Coulter | 344061 | |
tubes for ultracentrifugation (11* 34 mm) | Beckman Coulter | 343778 | |
Tubulin antibody | Millipore | 05-829 | 1:5000 in 5%BSA in TBST |
ultracentrifuge Optima L-80 XP | Beckman Coulter | ||
ultracentrifuge TL-100 | Beckman Coulter | ||
valve filter Seraplas V15 | Sarstedt | 53,428 |