Summary

Модификация и Функционализация гуанидина группы, изготовленные на предвестников

Published: April 27, 2017
doi:

Summary

Протокол для синтеза алкильных-модифицированных гуанидин, основанных на использовании соответствующих предшественников представлен.

Abstract

Группа гуанидин является одним из наиболее важных фармакофорных групп в медицинской химии. Только аминокислоты, несущая группу гуанидин представляет собой аргинин. В этой статье, простой способ для модификации гуанидин группы в пептидных лигандах обеспечиваются, с примером RGD-связывающим интегриными лигандов. Недавно было показано , что отличие модификация группы гуанидина в этих лигандов позволяет селективной модуляции подтипа (например, между подтипами αv и а5). Кроме того, ранее неизвестная стратегия для функционализации через группу гуанидин была продемонстрирована, и синтетический подход рассматривается в данном документе. Модификации , описанные здесь , включают терминально (N ω) алкилированная и ацетилированный гуанидин группу. Для синтеза, индивидуальные молекулы-предшественники синтезируются, которые затем подвергают реакции с ортогонально разблокированному амина, чтобы передать предварительно-modified гуанидин группа. Для синтеза алкилированных гуанидин, предшественники на основе N, N'-ди-Вос-1Н – пиразол-1-карбоксамидин используется для синтеза ацилированных соединений, предшественник выбора того , чтобы быть соответствующим образом ацилированной производным N -Boc- S – метилизотиомочевины, которые могут быть получены в одно- и двухступенчатых реакций.

Introduction

Среди наиболее распространенных фармакофорных групп в природных лигандов представляет собой гуанидина группу, которая участвует в множественных взаимодействий 1, 2. Например, она служит в качестве потенциального четырехкратным донора водорода при взаимодействии водородной связи и участвует в электростатических взаимодействиях, такие как солевые мостики или катион-π взаимодействий. В медицинской химии, эта группа часто встречаются в лекарственных препаратах и лекарственных средств – кандидатах 4, хотя и очень часто , как гуанидин миметики 5, 6. Причиной развития гуанидина миметиков является удаление повсеместной, положительно заряженного гуанидина группы, а также регулировка липофильности лиганда. В пептидных лигандов, единственный гуанидина, содержащий группу-аминокислота представляет собой аргинин, который, следовательно, часто встречается в биоактивного области пептидных лигандов.

Очень прominent примером для аргинин-содержащий лиганд семейства является подсемейство из RGD-связывающих интегринов. В общем, интегрины являются классом рецепторов клеточной адгезии, которые принимают более важные функции во всех высших организмов. Некоторые из этих функций включают клеточную адгезию, миграцию и выживание клеток. Таким образом, они также участвуют в патологических признаков, таких как рак и фиброз. Интегрины представляют собой трансмембранные белки гетеродимерных, состоящие из альфа- и бета-субъединицы, которые образуют 24 известных в настоящее время интегрина подтипов; 8 из них признают последовательность трипептида Arg-Gly-Asp (RGD) = в их лигандов 7. Область связывания расположена на границе между этими двумя подтипами во внеклеточной части, так называемого интегрина головной группы 8. РГД признана двух общих взаимодействий: металл-ион-зависимой адгезии сайта (MIDAS) область, которая находится в бета-субъединицы, и который связывает карбоновую кислоту в лигандов (боковые чав АСП); и гуанидин группа лигандов, которая находится в альфа-субъединицы. Большинство интегринов подтипов неразборчивы и разделяют по крайней мере часть их естественного внеклеточного матрикса (ЕСМ) лигандами 9. Таким образом, для развития искусственных интегрина лигандов, основное внимание, помимо высокой аффинности связывания, подтип селективности. Недавно мы смогли раскрыть ключевой элемент для генерации подтипа селективных лигандов: в группу гуанидина. Через различных модификаций, biselective лиганды αv- и а5-содержащие интегрин подтипов может быть превращена в селективные соединения путем простых модификаций на гуанидин группы, которые затем могут различать различные α-субъединиц 10.

В кармане αv, группа гуанидин взаимодействует бок о бидентатном через солевой мостик с Asp218 11, 12. Это взаимодействие стакже наблюдается в α5β1 (здесь, с Asp227 в а5), но , кроме того, там наблюдается 13 конечный на взаимодействии группы гуанидина с остатком Gln (Gln221). Таким образом, мы модифицировали группу гуанидина в двух противоположных направлениях: в одном случае, путем блокирования бок о взаимодействии с метилирования N б группы гуанидина, и в другом случае, с метилирования гуанидин N со, блокируя взаимодействие с торца. Удивительно, но эта небольшая модификация привела к полному смещению селективности в лигандах. В дополнении к алкилированию, новый метод функционализации был введен в данной публикации. Классический метод функционализации для этого типа pentapeptidic лиганда через боковой цепи сопряжения аминокислоты не участвуют в связывании (например, К в с (RGDfK)) 14, 15. Вот,мы покажем, что функционализации также возможны путем модификации гуанидина – которая имеет решающее значение для связывания – с ацил или алкилированным линкером. Положительный заряд , что имеет важное значение для связывания сохраняется, и модели показывают , что длинные точки цепи из кармана связывания, обеспечивая тем самое идеальную возможность для крепления дополнительных линкеров и маркировка единиц (например, флуоресцентная метка или хелатор для молекулярного томография).

В этой работе, мы сосредоточиться на препаративных шагов для модификации группы гуанидина в аргинин-содержащих лигандов. Это предполагает синтез N со | -methylated видов, а также гуанидины с более длинными единицами компоновщика. Различные модификации включают ацильные и алкильные группы.

Protocol

Примечание: Все реагенты и растворители были получены от коммерческих поставщиков и использовались без дополнительной очистки. Внимание: Пожалуйста , обратитесь все соответствующие паспорта безопасности материала (MSDS) перед использованием. Пожалуйста , используйте все не?…

Representative Results

Пептид-предшественник циклического синтезируют в виде линейного пептида, циклизуют и ортогонально Dde-деблокировали. После осаждения, чистота соединения анализировали с помощью ВЭЖХ-МС (рисунок 1). Для того, чтобы следить за ходом реакции, анализ ВЭЖХ проводил…

Discussion

Предшественником guanidinylation является ортогонально деблокировали циклический пептид производного (OrnD (Ot – Бу) Gf (N Me) V)), который синтезировали с помощью стандартного протокола Fmoc твердофазного пептидного синтеза (SPPS). Ornithin был использован в качестве защищенного производно…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

ТГК признает Международную Высшую школу по науке и технике (IGGSE) из Technische Universität München за финансовую поддержку. HK признает центр Integrated Protein Science Мюнхен (CIPSM) для их поддержки.

Materials

N,N′-Di-Boc-1H-pyrazole-1-carboxamidine, 98%  Sigma Aldrich 434167 ALDRICH
Triphenylphosphine, 99% Sigma Aldrich T84409 SIGMA-ALDRICH
Tetrahydrofuran, >99.5% Carl Roth 4745
Tetrahydrofuran anhydrous, 99.8% Carl Roth 5182
Methanol anhydrous, 99.8% Sigma Aldrich 322415 SIGMA-ALDRICH
Diisopropyl azodicarboxylate, 98% Sigma Aldrich 225541 ALDRICH
Dichlormethan, for synthesis, 99.5% Carl Roth 8424
Silica gel for flash chromtaography Sigma Aldrich 60738 SIGMA-ALDRICH
n-Pentane, 99% Carl Roth 8720
n-Hexane, 99% Carl Roth CP47
Ethylacetate, 99.5% Carl Roth 7338
Aminohexanol, 95% Sigma Aldrich A56353 ALDRICH
S-Methylisothiourea hemisulfate, 98% Sigma Aldrich M84445 ALDRICH
Di-tert-butyl dicarbonate, 99% Sigma Aldrich 205249 ALDRICH
N,N-Dimethylformamid, 99.8% Carl Roth A529
N,N-Diisopropylethylamin, 99.5% Carl Roth 2474
Acetic anhydrid, 99% Carl Roth 4483
Chlortrityl resin Carbolution CC11006
Fmoc-Gly-OH, 98% Carbolution CC05014
Piperidin, 99% Sigma Aldrich 104094 SIGMA-ALDRICH
Fmoc-Orn(Dde)-OH Iris-Biotech FAA1502
HATU, 99% Carbolution CC01011
HOAt, 99% Carbolution CC01004
Fmoc-Val-OH Carbolution CC05028
2-Nitrobenzenesulfonyl chloride, 97% Sigma Aldrich N11507 ALDRICH
2,4,6-Collidine, 99% Sigma Aldrich 27690 SIGMA-ALDRICH
Mercaptoethanol, 99%  Sigma Aldrich M6250 ALDRICH
Diazabicycloundecen, 98% Sigma Aldrich 139009 ALDRICH
Fmoc-D-Phe-OH, 98% Sigma Aldrich 47378 ALDRICH
Fmoc-Asp(OtBu)-OH, 98% Carbolution CC05008
Hexafluoroisopropanol Carbolution CC03056
Diphenylphosphoryl azide, 97% Sigma Aldrich 178756 ALDRICH
TFA, 99.9% Carl Roth P088
Triisopropylsilan, 98% Sigma Aldrich 233781 ALDRICH
Acetonitrile, HPLC grade Carl Roth HN44

References

  1. Saczewski, F., Balewski, L. Biological activities of guanidine compounds. Exp. Opin. Ther. Patents. 19 (10), 1417-1448 (2009).
  2. Saczewski, F., Balewski, L. Biological activities of guanidine compounds, 2008-2012 update. Exp. Opin. Ther. Patents. 23 (8), 965-995 (2013).
  3. Wirth, T. H., Davidson, N. Mercury (II) Comlexes of Guanidine and Ammonia, and a general discussion of the Complexing of Mercury (II) by Nitrogen Bases. J. Am. Chem. Soc. 86 (20), 4325-4329 (1964).
  4. Berlinck, R. G., Burtoloso, A. C., Kossuga, M. H. The chemistry and biology of organic guanidine derivatives. Nat. Prod. Rep. 25, 919-954 (2008).
  5. Peterlin-Mašič, L., Kikelj, D. Arginine mimetics. Tetrahedron. 57 (33), 7073-7105 (2001).
  6. Peterlin-Mašič, L. Arginine mimetic structures in biologically active antagonists and inhibitors. Curr. Med. Chem. 13 (30), 3627-3648 (2006).
  7. Hynes, R. O. Integrins: bidirectional, allosteric signaling machines. Cell. 110 (6), 673-687 (2002).
  8. Liddington, R. C. Structural aspects of integrins. Adv. Exp. Med. Biol. 819, 111-126 (2014).
  9. Plow, E. F., Haas, T. A., Zhang, L., Loftusi, J., Smith, J. W. Ligand binding to integrins. J. Biol. Chem. 275 (29), 21785-21788 (2000).
  10. Kapp, T. G., Fottner, M., Maltsev, O. V., Kessler, H. Small cause, great impact – modification of guanidine group in RGD controls subtype selectivity. Angew. Chem. Int. Ed. 55, 1540-1543 (2016).
  11. Xiong, J. P., et al. Crystal structure of the extracellular segment of integrin alpha Vbeta3. Science. 294, 339-345 (2001).
  12. Xiong, J. P., et al. Crystal structure of the extracellular segment of integrin alpha Vbeta3 in complex with an Arg-Gly-Asp ligand. Science. 296 (5565), 151-155 (2002).
  13. Nagae, M., et al. Crystal structure of α5β1 integrin ectodomain: atomic details of the fibronectin receptor. J. Cell Biol. 197 (1), 131-140 (2012).
  14. Hersel, U., Dahmen, C., Kessler, H. RGD modified polymers: biomaterials for stimulated cell adhesion and beyond. Biomaterials. 24 (24), 4385-4415 (2003).
  15. Auernheimer, J., Dahmen, C., Hersel, U., Bausch, A., Kessler, H. Photoswitched Cell Adhesion on Surfaces with RGD Peptides. J. Am. Chem. Soc. 127 (46), 16107-16110 (2005).
  16. Corradini, D., Eksteen, E., Eksteen, R., Schoenmakers, P., Miller, N. . Handbook of HPLC. , (2011).
  17. de Hoffmann, E., Stroobant, V. . Mass Spectrometry: Principles and Applications. , (2007).
  18. Frank, A. O., et al. Conformational Control of Integrin-Subtype Selectivity in isoDGR Peptide Motifs: A Biological Switch. Angew. Chem. Int. Ed. 49 (48), 9278-9281 (2010).
  19. Rossiter, S., et al. Selective substrate-based inhibitors of mammalian dimethylarginine dimethylaminohydrolase. J. Med. Chem. 48 (14), 4670-4678 (2005).
  20. Weiss, S., Keller, M., Bernhardt, G., Buschauer, A., König, B. N(G)-Acyl-argininamides as NPY Y(1) receptor antagonists: Influence of structurally diverse acyl substituents on stability and affinity. Bioorg. Med. Chem. 18 (17), 6292-6304 (2010).
  21. Hammerschmidt, F., Kvaternik, H., Schweifer, A., Mereiter, K., Aigner, R. M. Improved Synthesis of No-Carrier-Added [*I]MIBG and Its Precursor. Synthesis. 44 (21), 3387-3391 (2012).

Play Video

Cite This Article
Kapp, T. G., Fottner, M., Kessler, H. Modification and Functionalization of the Guanidine Group by Tailor-made Precursors. J. Vis. Exp. (122), e54873, doi:10.3791/54873 (2017).

View Video