Summary

Au-Interactie van SLP1 Polymeren en monolaag van<em> Lysinibacillus sphaericus</em> JG-B53 - QCM-D, ICP-MS en de AFM als gereedschap voor Biomolecuul-metal Studies

Published: January 19, 2016
doi:

Summary

To obtain basic information on the sorption and recycling of gold from aqueous systems the interaction of Au(III) and Au(0) nanoparticles on S-layer proteins were investigated. The sorption of protein polymers was investigated by ICP-MS and that of proteinaceous monolayers by QCM-D. Subsequent AFM enables the imaging of the nanostructures.

Abstract

In this publication the gold sorption behavior of surface layer (S-layer) proteins (Slp1) of Lysinibacillus sphaericus JG-B53 is described. These biomolecules arrange in paracrystalline two-dimensional arrays on surfaces, bind metals, and are thus interesting for several biotechnical applications, such as biosorptive materials for the removal or recovery of different elements from the environment and industrial processes. The deposition of Au(0) nanoparticles on S-layers, either by S-layer directed synthesis 1 or adsorption of nanoparticles, opens new possibilities for diverse sensory applications. Although numerous studies have described the biosorptive properties of S-layers 2-5, a deeper understanding of protein-protein and protein-metal interaction still remains challenging. In the following study, inductively coupled mass spectrometry (ICP-MS) was used for the detection of metal sorption by suspended S-layers. This was correlated to measurements of quartz crystal microbalance with dissipation monitoring (QCM-D), which allows the online detection of proteinaceous monolayer formation and metal deposition, and thus, a more detailed understanding on metal binding.

The ICP-MS results indicated that the binding of Au(III) to the suspended S-layer polymers is pH dependent. The maximum binding of Au(III) was obtained at pH 4.0. The QCM-D investigations enabled the detection of Au(III) sorption as well as the deposition of Au(0)-NPs in real-time during the in situ experiments. Further, this method allowed studying the influence of metal binding on the protein lattice stability of Slp1. Structural properties and protein layer stability could be visualized directly after QCM-D experiment using atomic force microscopy (AFM). In conclusion, the combination of these different methods provides a deeper understanding of metal binding by bacterial S-layer proteins in suspension or as monolayers on either bacterial cells or recrystallized surfaces.

Introduction

Als gevolg van het toenemende gebruik van goud voor verschillende toepassingen, zoals elektronica, katalysatoren, biosensoren, of medische instrumenten, de vraag van dit edelmetaal is gegroeid in de afgelopen paar jaar tijd 6-9. Goud evenals vele andere edelstenen en zware metalen in het milieu via industrieel afvalwater in verdunde concentraties, door middel van mijnbouw, en afvalverwerking 7,8,10, hoewel de meeste milieuvervuiling door zware of edele metalen is een continu proces vooral veroorzaakt door de technologische activiteiten. Dit leidt tot een aanzienlijke verstoring van de natuurlijke ecosystemen en zou kunnen bedreigen de volksgezondheid 9. Weten deze negatieve uitkomsten bevordert het zoeken naar nieuwe technieken om metalen uit vervuilde ecosystemen en verbeteringen te verwijderen in de recycling van metalen uit industrieel afvalwater. Gevestigde fysisch-chemische methoden zoals neerslaan of ionenwisseling zijn niet zo effectief, vooral in de hogely verdunde oplossingen 7,8,11. Biosorptie, hetzij met levende of dode biomassa, is een aantrekkelijk alternatief voor de behandeling van afvalwater 10,12. Het gebruik van dergelijke biologische materialen kan het gebruik van giftige chemicaliën verminderen. Veel micro-organismen zijn beschreven ophopen of immobiliseren metalen. Bijvoorbeeld, cellen Lysinibacillus sphaericus (L. sphaericus) JG-A12 toonden hoge bindingscapaciteiten van edele metalen, bijvoorbeeld Pd (II), Pt (II), Au (III) en andere toxische metalen zoals Pb (II) of U (VI) 4,13, cellen van Bacillus megaterium van Cr (VI) 14, cellen van Saccharomyces cerevisiae van Pt (II) en Pd (II) 15 en Chlorella ordinaire voor Au (III) en U (VI) 16 , 17. De binding van de voorgaande metalen zoals Au (III), Pd (II) en Pt (II) is eveneens gerapporteerd Desulfovibrio desulfuricans 18 en L. sphaericus JG-B53 19,20. Toch niet all microben binden grote hoeveelheden metalen en hun toepassing als sorptieve materiaal is beperkt 12,21. Bovendien metaal bindingscapaciteit is afhankelijk van verschillende parameters, bijvoorbeeld celsamenstelling, de gebruikte bio-component, of milieu- en experimentele condities (pH, ionsterkte, temperatuur etc.). De studie van geïsoleerde celwandfragmenten 22,23, zoals membraanlipiden, peptidoglycaan, eiwitten of andere bestanddelen, helpt metaalbindingseigenschappen processen complex geconstrueerde gehele cellen 8,21 begrijpen.

De celcomponenten gericht in deze studie zijn S-layer eiwitten. S-layer eiwitten delen van de buitenste celwand van vele bacteriën en archaea, en zij vormen ongeveer 15 – 20% van de totale proteïnemassa van deze organismen. Als eerste interface naar de omgeving, deze mobiele verbindingen sterk beïnvloeden de bacteriële sorptie-eigenschappen 3. S-layer eiwitten met molecuulgewichten variërend van veertigtot honderden kDa wordt geproduceerd in de cel, maar buiten gemonteerd waar ze kunnen lagen op lipidemembranen of polymere celwand componenten vormen. Eenmaal geïsoleerd, bijna alle S-laag eiwitten hebben de intrinsieke eigenschap om spontaan zichzelf assembleren in suspensie, aan interfaces, of op oppervlakken vormen vlakke of buis-achtige structuren 3. De dikte van het eiwit monolaag afhankelijk van de bacteriën en ligt binnen een bereik van 5 – 25 nm 24. In het algemeen kan de gevormde S-layer eiwitstructuren een schuine (p1 en p2), vierkant (p4) of zeshoekig (p3 of p6) symmetrie roosterconstanten 2,5 tot 35 nm 3,24 hebben. Het rooster formatie lijkt in veel gevallen afhankelijk van tweewaardige kationen en voornamelijk Ca 2 + 25,26, Raff, J. et al. S-laag op basis van nanocomposieten voor industriële toepassingen op basis van eiwitten Engineered nanostructuren. (eds Tijana Z. Grove & Aitziber L. Cortajarena) (Springer, 2016 (ingediend)). Toch is de volledige reactie cascade monomeer vouwen, monomeer-monomeer interactie de vorming van een rooster, en de rol van verschillende metalen, vooral van divalente kationen zoals Ca2 + en Mg2 +, zijn nog niet volledig begrepen.

De gram-positieve stam L. sphaericus JG-B53 (hernoemd van Bacillus sphaericus na nieuwe fylogenetische classificatie) 27 werd geïsoleerd uit de uraniumwinning afval stapel "Haberland" (Johanngeorgenstadt, Saksen, Duitsland) 4,28,29. De functionele S-layer-eiwit (SLP1) bezit een vierkant rooster, een molecuulgewicht van 116 kDa 30 en een dikte van ≈ 10 nm op levende bacteriecellen 31. In eerdere onderzoeken werd de in vitro vorming van een gesloten en stabiel eiwit met een dikte van ongeveer 10 nm in minder dan 10 min 19 bereikt. De gerelateerde stam L. sphaericus JG-A12, ook een isolaat uit de "Haberland" pile, bezit hoge metaal binding capaciteiten, geïsoleerde S-layer-eiwit blijkt een hoge chemische en mechanische stabiliteit en goede sorptie bekijken van edelmetalen zoals Au (III), Pt (II), en Pd (II) 4,32,33. Deze binding van edelmetalen meer of minder specifiek voor bepaalde metalen en afhankelijk van de beschikbare functionele groepen op de buitenste en binnenste eiwit oppervlak van het polymeer en in zijn poriën, ionsterkte en pH. Relevante functionele groepen voor metalen interactie door de eiwitten COOH, NH 2 -, OH, PO 4 -, SO 4 – en SO. In principe, metaal bindende capaciteiten opent een breed spectrum van toepassingen, Raff, J. et al. S-laag op basis van nanocomposieten voor industriële toepassingen op basis van eiwitten Engineered nanostructuren. (eds Tijana Z. Grove & Aitziber L. Cortajarena) (Springer, 2016 (ingediend)). bv als biosorptive componenten voor de verwijdering of het herstelopgeloste toxische of waardevolle metalen, sjablonen voor synthese of gedefinieerd afzetting van regelmatig gestructureerde metalen nanodeeltjes (NP) voor katalyse en andere bio-engineered materialen zoals bio-zintuiglijke lagen 3,5,18,33. Regelmatig gerangschikte NP arrays zoals Au (0) -NPs zouden kunnen worden voor belangrijke toepassingen gaande van moleculaire elektronica en biosensoren, ultrahoge opslagdichtheid apparaten en katalysatoren voor CO-oxidatie 34-37. De ontwikkeling van dergelijke toepassingen en slimme ontwerp van deze materialen vereist een dieper begrip van het onderliggende metaal bindende mechanismen.

Een voorwaarde voor de ontwikkeling van dergelijke materialen op biologische basis is de betrouwbare uitvoering van een tussenlaag tussen het biomolecuul en de technische oppervlak 38,39. Bijvoorbeeld, polyelektrolyten samengevoegd met de laag-voor-laag (LbL) techniek 40,41 zijn gebruikt als interface laag voor herkristallisatie van S-layer eiwitten 39 </sup>. Dergelijke interface biedt een relatief eenvoudige manier de proteïne bekleding te voeren op een reproduceerbare en kwantitatieve wijze. Door uitvoeren van verschillende experimenten met en zonder modificatie met lijm promoters, is het mogelijk om uitspraken betreffende deklaag kinetiek, layer stabiliteit en interacties van metalen met biomoleculen 19,42, Raff, J. et al maken. S-laag op basis van nanocomposieten voor industriële toepassingen op basis van eiwitten Engineered nanostructuren. (eds Tijana Z. Grove & Aitziber L. Cortajarena) (Springer, 2016 (ingediend)). Echter, het complex mechanisme van eiwitadsorptie en interactie eiwit-oppervlak niet volledig begrepen. Vooral informatie over de conformatie, patroon oriëntatie en coating dichtheden wordt nog steeds vermist.

Kwartskristalmicrobalans met dissipatie bewaking (QCM-D) techniek heeft de aandacht getrokken in de afgelopen jaren als een instrument voor het bestuderen eiwitadsorptie, coating kinetiek en interactie proprocessen op de nanometerschaal 19,43-45. Deze techniek maakt het mogelijk om gedetailleerde detectie van massa adsorptie in real-time, en kan worden gebruikt als indicator voor het eiwit zelfassemblerende proces op proteïne roosters 19,20,42,46-48 koppeling van functionele moleculen. Daarnaast QCM-D metingen opent de mogelijkheid om metalen interactie processen te bestuderen met de proteïneachtige laag onder natuurlijke biologische omstandigheden. In een recente studie, de interactie van de S-layer-eiwit met bepaalde metalen zoals Eu (III), Au (III), Pd (II) en Pt (II) is onderzocht met QCM-D 19,20. Het geadsorbeerde eiwit laag kan dienen als een vereenvoudigd model van een celwand van Gram-positieve bacteriën. Het onderzoek van deze ene component kan bijdragen tot een beter begrip van metaal interactie. Echter, alleen QCM-D experimenten geen uitspraken over oppervlaktestructuren en invloeden van metalen eiwit mogelijk te maken. Andere technieken zijn nodig om dergelijke informatie te verkrijgen. Een poswoordelijkheid voor bio-imaging nanostructuren en verkrijgen van informatie over structurele eigenschappen is de atomaire kracht microscopie (AFM).

De doelstelling van dit onderzoek was om de sorptie van goud (Au (III) en Au (0) -NPs) S-layer eiwitten te onderzoeken, met name SLP1 van L. sphaericus JG-B53. Experimenten werden uitgevoerd met charge gesuspendeerd eiwitten op schaal in een pH traject van 2,0 – 5,0 behulp van ICP-MS en geïmmobiliseerd S-lagen gebruikt QCM-D. Bovendien is de invloed van metaalzoutoplossing aan het rooster stabiliteit onderzocht latere AFM studies. De combinatie van deze technieken draagt ​​bij aan een beter begrip van de in vitro metaal interactie processen als een instrument voor het leren meer over bindende gebeurtenissen op de hele bacteriecellen over specifieke metalen affiniteiten. Deze kennis is niet alleen cruciaal voor de ontwikkeling van de toepasselijke filter materialen voor de recycling van metalen voor de bescherming van het milieu en het behoud van de rebronnen 49, maar ook voor de ontwikkeling van arrays van sterk geordende metalen NP voor diverse technische toepassingen.

Protocol

1. micro-organismen en teeltomstandigheden Opmerking:. Alle experimenten werden uitgevoerd onder steriele omstandigheden L. sphaericus JG-B53 werd verkregen uit een cryo-bewaard cultuur 29,30. Transfer cryo-bewaarde cultuur (1,5 ml) onder de schone bank tot 300 ml steriele voedingsoplossing bouillon (NB) media (3 g / l vleesextract, 5 g / l pepton, 10 g / l NaCl). De oplossing gedurende ten minste 6 uur bij 30 ° C daarna roeren om de voorkweek te verkrijgen voor…

Representative Results

Teelt van micro-organismen en SLP1 karakterisering De opgenomen gegevens van bacteriegroei geeft het einde van de exponentiële groeifase bij ongeveer 5 uur. Eerdere onderzoeken hebben aangetoond dat SLP1 kunnen worden geïsoleerd uit het ogenblik van de oogst (4,36 g / L natte biomassa (≈ 1,45 g / L (BDW)) met een maximale opbrengst 19. Niettemin optimalisatie van de teelt met gedefinieerde media…

Discussion

In dit werk onderzochte de binding van Au S-laag-eiwitten werd onderzocht met behulp van een combinatie van verschillende analysemethoden. Vooral de binding van Au is zeer aantrekkelijk, niet alleen voor de terugwinning van Au uit de mijnbouw water of procesoplossingen, maar ook voor de constructie van materialen, bijvoorbeeld sensorische oppervlakken. Voor studies van de interactie Au (Au (III) en Au (0) -NPs) met onderbroken en herkristalliseerd monolaag van SLP1 het eiwit moesten worden geïsoleerd. Daarom h…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Het huidige werk werd gedeeltelijk gefinancierd door de IGF-project "S-Sieve" (490 ZBG / 1) gefinancierd door de BMWi en de BMBF-project "Aptasens" (BMBF / DLR 01RB0805A). Speciale dank aan Tobias J. Günther voor zijn waardevolle hulp tijdens AFM studies en Erik V. Johnstone voor het lezen van het manuscript als een native speaker Engels. Verder zou de auteur van dit document graag Aline Ritter en Sabrina Gurlit bedanken (van Institute for Resource Ecology voor hulp bij het ICP-MS-metingen), Manja Vogel, Nancy Unger, Karen E. Viacava en de groep biotechnologie van het Helmholtz-instituut Freiberg voor Resource Technology.

Materials

equiment and software
Bioreactor, Steam In Place 70L Pilot System Applikon Biotechnology, Netherlands Z6X Including dO2, pH sensors of Applikon Biotechnology and BioXpert software V2
Noninvasive Biomass Monitor BugEye 2100 BugLab, Concord (CA), USA Z9X
Spectrometer Ultrospec 1000 Amersham Pharmacia Biotech, Great Britain 80-2109-10 Company now GE Healthcare Life Sciences
MiniStar micro centrifuge VWR, Germany 521-2844 For centrifugation of cultivation samples
Research system microscope BX-61 Olympus Germany LLC, Germany 037006 Microscope in combination with imaging software
Cell^P (version 3.1) Olympus Soft Imaging Solutions LLC, Münster, Germany together with microscope
Powerfuge Pilot Separation System Serie 9010-S Carr Centritech, Florida, USA 9010PLT For biomasse harvesting
T18 basic Ultra Turrax IKA Labortechnik, Germany 431-2601 For flagella removal and sample homogenization
Sorvall Evolution RC Superspeed Centrifuge Thermo Fisher Scientific, USA 728411 Used within protein isolation
Mobile high shear fluid processor, M-110EH-30 Pilot Microfluidics, Massachusetts, USA M110EH30K Used for cell rupture
Alpha 1-4 LSC Freeze dryer Martin Christ Freeze dryers LLC, Osterode, Germany 102041
UV-VIS spectrophotometry (NanoDrop 2000c) Thermo Fisher Scientific, USA 91-ND-2000C-L For determination of protein concentration
Mini-PROTEAN vertical electrophoresis chamber Bio-Rad Laboratories GmbH, Munich, Germany 165-3322 For SDS-PAGE
VersaDoc Imaging System 3000 Bio-Rad Laboratories GmbH, Munich, Germany 1708030 Used for imaging of SDS-PAGE gels
ICP-MS Elan 9000 PerkinElmer, Waltham (MA), USA N8120536 For determination of metal concentration
Zetasizer Nano ZS Malvern Instruments, Worcestershire United Kingdom ZEN3600 For determination of nanoparticle size
Q-Sense E4 device  Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-E4 ordered via LOT quantum design (software included with E4 platform)
Q-Soft 401 (data recording) Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden
Q-Tools 3 (data evaluation and modelling) Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden
QCM-D flow modules QFM 401  Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-QFM401 ordered via LOT quantum design
QSX 303 SiO2 piezoelectric AT-cut quartz sensors Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-QSX303 ordered via LOT quantum design
Ozone cleaning chamber Bioforce Nanoscience, Ames (IA), USA QS-ESA006 ordered via LOT quantum design
Atomic Force Microscope MFP-3D Bio AFM Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA MFP-3DBio AFM measurements and imaging software
Asylum Research AFM Software AR Version 120804+1223 Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA imaging software included in Cat. No. MFP-3DBio
Igor Version Pro 6.3.2.3 Software WaveMetrics, Inc., USA imaging software included in Cat. No. MFP-3DBio
BioHeater Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA Bioheater Sample heater for AFM measurements
Biolever mini cantilever,  BL-AC40TS-C2 Olympus Germany LLC, Germany  BL-AC40TS-C2 Prefered cantilever for AFM measurements
WSxM 5.0 Develop 6.5 (2013) Nanotec Electronica S.L. , Spain freeware Software for AFM analysis
Name Company Catalog Number Comments
Detergents and other equiment
Calcium chloride Dihydrate (CaCl2 ∙ 2H2O) Merck KGaA 1.02382
acidic acid, 100 %, p.A. CARL ROTH GmbH+CO.KG 3738.5 Danger, flammable and corrosive liquid and vapour. Causes severe skin burns and eye damage.
Antifoam 204 Sigma-Aldrich Co. LLC. A6426 For foam suppression
bromophenol blue, sodium salt Sigma-Aldrich Co. LLC. B5525
Coomassie Brilliant Blue R (C45H44N3NaO7S2) CARL ROTH GmbH+CO.KG 3862.1
Deoxyribonuclease II from porcine spleen Sigma-Aldrich Co. LLC. D4138 Typ IV , 2,000-6,000 Kunitz units/mg protein
Ethanol, 95% VWR, Germany 20827.467 Danger, flammable
glycerine, p.A. CARL ROTH GmbH+CO.KG 3783.1
Gold(III) chloride trihydrate (HAuCl4 ∙ 3H2O) Sigma-Aldrich Co. LLC. 520918 Danger
Guanidine hydrochloride (GuHCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 0037.1
Hellmanex III Hellma GmbH & Co. KG 9-307-011-4-507
Hydrochloric acid (HCl) (37%) CARL ROTH GmbH+CO.KG 4625.2 Danger; Corrosive, used for pH adjustment
Lysozyme from chicken egg white Sigma-Aldrich Co. LLC. L6876  Lyophilized powder, protein =90 %, =40,000 units/mg protein (Sigma) 
Magnesium chloride Hexahydrate (MgCl2 ∙ 6H2O) Merck KGaA 1.05833
Magnetic stirrer with heating,  MR 3000K Heidolph Instruments GmbH & Co.KG, Germany 504.10100.00 Standard stirrer within experiment
NB-Media DM180 Mast Diagnostica GmbH 121800
Nitric acid (HNO3) CARL ROTH GmbH+CO.KG HN50.1 Danger; Oxidizing, Corrosing
PageRuler Unstained Protein Ladder ThermoScientific-Pierce 26614
Poly(sodium 4-styrenesulfonat) (PSS) Sigma-Aldrich Co. LLC. 243051 Average Mw ~70,000
Polyethylenimine (PEI), branched Sigma-Aldrich Co. LLC. 408727 Warning; Harmful, Irritant, Dangerous for the environment; average Mw ~25,000
Potassium carbonate anhydrous (K2CO3) Sigma-Aldrich Co. LLC. 60108 Warning; Harmful
Ribonuclease A from bovine pancreas  Sigma-Aldrich Co. LLC. R5503 Type I-AS, 50-100 Kunitz units/mg protein 
Sodium azide (NaN3) Merck KGaA 106688 Danger; very toxic and Dangerous for the environment
Sodium chloride (NaCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 3957.2
Sodium dodecyl sulfate (SDS) Sigma-Aldrich Co. LLC. L-5750 Danger; toxic
Sodium hydroxide (NaOH) CARL ROTH GmbH+CO.KG 6771.1 Danger; Corrosive, used for pH regulation within cultivation and pH adjustment
Spectra/Por 6, Dialysis membrane, MWCO 50,000  CARL ROTH GmbH+CO.KG 1893.1
Sulfuric acid (H2SO4) CARL ROTH GmbH+CO.KG HN52.2 Danger; Corrosive, used for pH regulation within cultivation
Tannic acid (C76H52O46) Sigma-Aldrich Co. LLC. 16201
TRIS HCl (C4H11NO3HCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 9090.2
Tri-sodium citrate dihydrate (C6H5Na3O7 ∙ 2H2O) CARL ROTH GmbH+CO.KG 3580.2
Triton X-100 CARL ROTH GmbH+CO.KG 3051.3 Warning; Harmful, Dangerous for the environment
VIVASPIN 500, 50.000 MWCO Ultrafiltration tubes Sartorius AG VS0132
β-mercaptoethanol Sigma-Aldrich Co. LLC. M6250 Danger, toxic

References

  1. Merroun, M. L., Rossberg, A., Hennig, C., Scheinost, A. C., Selenska-Pobell, S. Spectroscopic characterization of gold nanoparticles formed by cells and S-layer protein of Bacillus sphaericus JG-A12. Mater. Sci. Eng. C. 27 (1), 188-192 (2007).
  2. Raff, J., Soltmann, U., Matys, S., Selenska-Pobell, S., Bottcher, H., Pompe, W. Biosorption of uranium and copper by biocers. Chem. Mat. 15 (1), 240-244 (2003).
  3. Sleytr, U. B., Schuster, B., Egelseer, E. M., Pum, D. S-Layers: Principles and Applications. FEMS Microbiol. Rev. , (2014).
  4. Pollmann, K., Raff, J., Merroun, M., Fahmy, K., Selenska-Pobell, S. Metal binding by bacteria from uranium mining waste piles and its technological applications. Biotechnol. Adv. 24 (1), 58-68 (2006).
  5. Raff, J., Selenska-Pobell, S. Toxic avengers. Nucl. Eng. Int. 51, 34-36 (2006).
  6. Tsuruta, T. Biosorption and recycling of gold using various microorganisms. J. Gen. Appl. Microbiol. 50 (4), 221-228 (2004).
  7. Sathishkumar, M., Mahadevan, A., Vijayaraghavan, K., Pavagadhi, S., Balasubramanian, R. Green Recovery of Gold through Biosorption, Biocrystallization, and Crystallization. Ind. Eng. Chem. Res. 49 (16), 7129-7135 (2010).
  8. Das, N. Recovery of precious metals through biosorption – A review. Hydrometallurgy. 103 (1-4), 180-189 (2010).
  9. Volesky, B. Biosorption and me. Water Res. 41 (18), 4017-4029 (2007).
  10. Vilar, V. J. P., Botelho, C. M. S., Boaventura, R. A. R., Atimtay, T. A., Sikdar, S. K. Environmental Friendly Technologies for Wastewater Treatment: Biosorption of Heavy Metals Using Low Cost Materials and Solar Photocatalysis. Security of Industrial Water Supply and Management.NATO Science for Peace and Security Series C-Environmental Security. , 159-173 (2010).
  11. Lovley, D. R., Lloyd, J. R. Microbes with a mettle for bioremediation. Nat. Biotechnol. 18 (6), 600-601 (2000).
  12. Schiewer, S., Volesky, B., Lovely, D. R. . Environmental Microbe-Metal Interactions. , 329-362 (2000).
  13. Raff, J., Berger, S., Selenska-Pobell, S. Uranium binding by S-layer carrying isolates of the genus Bacillus. Annual Report 2006 Institute of Radiochemistry. , (2006).
  14. Srinath, T., Verma, T., Ramteke, P. W., Garg, S. K. Chromium (VI) biosorption and bioaccumulation by chromate resistant bacteria. Chemosphere. 48 (4), 427-435 (2002).
  15. Godlewska-Zylkiewicz, B. Biosorption of platinum and palladium for their separation/preconcentration prior to graphite furnace atomic absorption spectrometric determination. Spectroc. Acta Pt. B-Atom. Spectr. 58 (8), 1531-1540 (2003).
  16. Hosea, M., et al. Accumulation of elemental gold on the alga Chlorella-vulgaris. Inorg. Chim. A-Bioinor. 123 (3), 161-165 (1986).
  17. Vogel, M., et al. Biosorption of U(VI) by the green algae Chlorella vulgaris. in dependence of pH value and cell activity. Sci. Total Environ. 409 (2), 384-395 (2010).
  18. Creamer, N., Baxter-Plant, V., Henderson, J., Potter, M., Macaskie, L. Palladium and gold removal and recovery from precious metal solutions and electronic scrap leachates by Desulfovibrio desulfuricans. Biotechnol Lett. 28 (18), 1475-1484 (2006).
  19. Suhr, M., et al. Investigation of metal sorption behavior of Slp1 from Lysinibacillus sphaericus. JG-B53 – A combined study using QCM-D, ICP-MS and AFM. Biometals. 27 (6), 1337-1349 (2014).
  20. Suhr, M. . Isolierung und Charakterisierung von Zellwandkomponenten der gram-positiven Bakterienstämme Lysinibacillus sphaericus JG-A12 und JG-B53 und deren Wechselwirkungen mit ausgewählten relevanten Metallen und Metalloiden. , (2015).
  21. Spain, A., Alm, E. Implications of Microbial Heavy Metal Tolerance in the Environment. Reviews in Undergraduate Research. 2, 1-6 (2003).
  22. Ledin, M. Accumulation of metals by microorganisms – processes and importance for soil systems. Earth-Sci. Rev. 51 (1-4), 1-31 (2000).
  23. Maruyama, T., et al. Proteins and Protein-Rich Biomass as Environmentally Friendly Adsorbents Selective for Precious Metal Ions. Environ. Sci. Technol. 41 (4), 1359-1364 (2007).
  24. Sara, M., Sleytr, U. B. S-layer proteins. J. Bacteriol. 182 (4), 859-868 (2000).
  25. Baranova, E., et al. SbsB structure and lattice reconstruction unveil Ca2+ triggered S-layer assembly. Nature. 487 (7405), 119-122 (2012).
  26. Teixeira, L. M., et al. Entropically Driven Self-Assembly of Lysinibacillus sphaericus S-Layer Proteins Analyzed Under Various Environmental Conditions. Macromol. Biosci. 10 (2), 147-155 (2010).
  27. Ahmed, I., Yokota, A., Yamazoe, A., Fujiwara, T. Proposal of Lysinibacillus boronitolerans gen. nov. sp. nov., and transfer of Bacillus fusiformis to Lysinibacillus fusiformis comb. nov. and Bacillus sphaericus to Lysinibacillus sphaericus comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57 (5), 1117-1125 (2007).
  28. Panak, P., et al. Bacteria from uranium mining waste pile: interactions with U(VI). J. Alloy. Compd. 271, 262-266 (1998).
  29. Selenska-Pobell, S., Kampf, G., Flemming, K., Radeva, G., Satchanska, G. Bacterial diversity in soil samples from two uranium waste piles as determined by rep-APD, RISA and 16S rDNA retrieval. Antonie Van Leeuwenhoek. 79 (2), 149-161 (2001).
  30. Lederer, F. L., et al. Identification of multiple putative S-layer genes partly expressed by Lysinibacillus sphaericus JG-B53. Microbiology. 159 ( Pt 6), 1097-1108 (2013).
  31. Günther, T. J., Suhr, M., Raff, J., Pollmann, K. Immobilization of microorganisms for AFM studies in liquids. RSC Advances. 4, 51156-51164 (2014).
  32. Fahmy, K., et al. Secondary Structure and Pd(II) Coordination in S-Layer Proteins from Bacillus sphaericus. Studied by Infrared and X-Ray Absorption Spectroscopy. Biophys. J. 91 (3), 996-1007 (2006).
  33. Pollmann, K., Merroun, M., Raff, J., Hennig, C., Selenska-Pobell, S. Manufacturing and characterization of Pd nanoparticles formed on immobilized bacterial cells. Lett. Appl. Microbiol. 43 (1), 39-45 (2006).
  34. Corti, C., Holliday, R. . Gold : science and applications. , (2010).
  35. Daniel, M. C., Astruc, D. Gold nanoparticles: assembly, supramolecular chemistry, quantum-size-related properties, and applications toward biology, catalysis, and nanotechnology. Chem. Rev. 104 (1), 293-346 (2004).
  36. Tang, J., et al. Fabrication of Highly Ordered Gold Nanoparticle Arrays Templated by Crystalline Lattices of Bacterial S-Layer Protein. Chem. Phys. Chem. 9 (16), 2317-2320 (2008).
  37. Haruta, M. Size- and support-dependency in the catalysis of gold. Catal. Today. 36 (1), 153-166 (1997).
  38. Habibi, N., et al. Nanoengineered polymeric S-layers based capsules with targeting activity. Colloids and surfaces. B, Biointerfaces. 88 (1), 366-372 (2011).
  39. Toca-Herrera, J. L., et al. Recrystallization of Bacterial S-Layers on Flat Polyelectrolyte Surfaces and Hollow Polyelectrolyte Capsules. Small. 1 (3), 339-348 (2005).
  40. Decher, G., Lehr, B., Lowack, K., Lvov, Y., Schmitt, J. New nanocomposite films for biosensors – Layer-by-Layer adsorbed films of polyelectrolytes, proteins or DNA. Biosens. Bioelectron. 9 (9-10), 677-684 (1994).
  41. Decher, G., Schmitt, J. Fine-tuning of the film thickness of ultrathin multilayer films composed of consecutively alternating layers of anionic and cationic polyelectrolytes. Progress in Colloid & Polymer Science. 89 Trends in Colloid and Interface Science VI, (1992).
  42. Günther, T. J. . S-Layer als Technologieplattform – Selbstorganisierende Proteine zur Herstellung funktionaler Beschichtungen. , (2015).
  43. Delcea, M., et al. Thermal stability, mechanical properties and water content of bacterial protein layers recrystallized on polyelectrolyte multilayers. Soft Matter. 4 (7), 1414-1421 (2008).
  44. Roach, P., Farrar, D., Perry, C. C. Interpretation of Protein Adsorption: Surface-Induced Conformational Changes. J. Am. Chem. Soc. 127 (22), 8168-8173 (2005).
  45. Zeng, R., Zhang, Y., Tu, M., Zhou, C. R., et al. Protein Adsorption Behaviors on PLLA Surface Studied by Quartz Crystal Microbalance with Dissipation Monitoring (QCM-D). Materials Science Forum. 610-613, 1219-1223 (2009).
  46. Bonroy, K., et al. Realization and Characterization of Porous Gold for Increased Protein Coverage on Acoustic Sensors. Anal. Chem. 76 (15), 4299-4306 (2004).
  47. Pum, D., Toca-Herrera, J. L., Sleytr, U. B. S-layer protein self-assembly. Int. J. Mol. Sci. 14 (2), 2484-2501 (2013).
  48. Weinert, U., et al. S-layer proteins as an immobilization matrix for aptamers on different sensor surfaces. Eng. Life Sci. , (2015).
  49. Umeda, H., et al. Recovery and Concentration of Precious Metals from Strong Acidic Wastewater. Mater. Trans. 52 (7), 1462-1470 (2011).
  50. Engelhardt, H., Saxton, W. O., Baumeister, W. 3-Dimensional structure of the tetragonal surface-layer of Sporosarcina-urea. J. Bacteriol. 168 (1), 309-317 (1986).
  51. Sprott, G. D., Koval, S. F., Schnaitman, C. A. . Methods for general and molecular bacteriology. , 72-103 (1994).
  52. Laemmli, U. K. Cleavage of Structural Proteins during Assembly of Head Bacteriophage T4. Nature. 227 (5259), 680-685 (1970).
  53. Stoscheck, C., Deutscher, M. P. [6] Quantitation of protein. Methods in Enzymology. 182, 50-68 (1990).
  54. Sleytr, U. B., Messner, P., Pum, D. Analysis of Crystalline Bacterial Surface-Layers by Freeze-Etching Metal Shadowing, Negative Staining and Ultra-Thin Sectioning. Method Microbiol. 20, 29-60 (1988).
  55. PerkinElmer. . ICP Mass Spectrometry – The 30-Min to ICP-MS. , (2001).
  56. Mühlpfordt, H. The preparation of colloidal Gold Nanoparticles using tannic-acid as an additional reducing agent. Experientia. 38 (9), 1127-1128 (1982).
  57. Hayat, M. A. . Colloidal Gold – Principles, Methods and Applications. , (1989).
  58. Amendola, V., Meneghetti, M. Size Evaluation of Gold Nanoparticles by UV−vis Spectroscopy. The Journal of Physical Chemistry C. 113 (11), 4277-4285 (2009).
  59. Schurtenberger, P., Newman, M. E., Buffle, J., van Leeuwen, H. P. . Characterization of biological and environmental particles using static and dynamic light scattering in Environmental Particles. 2, 37-115 (1993).
  60. Jain, R., et al. Extracellular Polymeric Substances Govern the Surface Charge of Biogenic Elemental Selenium Nanoparticles. Environmental Science & Technology. 49 (3), 1713-1720 (2015).
  61. Harewood, K., Wolff, J. S. Rapid electrophoretic procedure for detection of SDS-released oncorna-viral RNA using polyacrylamide-agarose gels. Anal. Biochem. 55 (2), 573-581 (1973).
  62. Penfold, J., Staples, E., Tucker, I., Thomas, R. K. Adsorption of mixed anionic and nonionic surfactants at the hydrophilic silicon surface. Langmuir. 18 (15), 5755-5760 (2002).
  63. Krozer, A., Rodahl, M. X-ray photoemission spectroscopy study of UV/ozone oxidation of Au under ultrahigh vacuum conditions. J. Vac. Sci. Technol. A-Vac. Surf. Films. 15 (3), 1704-1709 (1997).
  64. Vig, J. R. UV ozone cleaning of surfaces. J. Vac. Sci. Technol. 3 (3), 1027-1034 (1985).
  65. Sauerbrey, G. Verwendung von Schwingquarzen zur Wägung dünner Schichten und zur Mikrowägung. Zeitschrift Fur Physik. 155 (2), 206-222 (1959).
  66. Q-Sense – Biolin Scientific. . Introduction and QCM-D Theory – Q-Sense Basic Training. , (2006).
  67. Edvardsson, M., Rodahl, M., Kasemo, B., Höök, F. A dual-frequency QCM-D setup operating at elevated oscillation amplitudes. Anal. Chem. 77 (15), 4918-4926 (2005).
  68. Hovgaard, M. B., Dong, M. D., Otzen, D. E., Besenbacher, F. Quartz crystal microbalance studies of multilayer glucagon fibrillation at the solid-liquid interface. Biophys. J. 93 (6), 2162-2169 (2007).
  69. Liu, S. X., Kim, J. T. Application of Kelvin-Voigt Model in Quantifying Whey Protein Adsorption on Polyethersulfone Using QCM-D. Jala. 14 (4), 213-220 (2009).
  70. Reviakine, I., Rossetti, F. F., Morozov, A. N., Textor, M. Investigating the properties of supported vesicular layers on titanium dioxide by quartz crystal microbalance with dissipation measurements. J. Chem. Phys. 122 (20), (2005).
  71. Voinova, M. V., Rodahl, M., Jonson, M., Kasemo, B. Viscoelastic acoustic response of layered polymer films at fluid-solid interfaces: Continuum mechanics approach. Phys. Scr. 59 (5), 391-396 (1999).
  72. Fischer, H., Polikarpov, I., Craievich, A. F. Average protein density is a molecular-weight-dependent function. Protein Sci. 13 (10), 2825-2828 (2004).
  73. Schuster, B., Pum, D., Sleytr, U. B. S-layer stabilized lipid membranes (Review). Biointerphases. 3 (2), FA3-FA11 (2008).
  74. Malmström, J., Agheli, H., Kingshott, P., Sutherland, D. S. Viscoelastic Modeling of Highly Hydrated Laminin Layers at Homogeneous and Nanostructured Surfaces: Quantification of Protein Layer Properties Using QCM-D and SPR. Langmuir. 23 (19), 9760-9768 (2007).
  75. Vörös, J. The Density and Refractive Index of Adsorbing Protein Layers. Biophys. J. 87 (1), 553-561 (2004).
  76. Hillier, A. C., Bard, A. J. ac-mode atomic force microscope imaging in air and solutions with a thermally driven bimetallic cantilever probe. Rev. Sci. Instrum. 68 (5), 2082-2090 (1997).
  77. Horcas, I., et al. WSXM: A software for scanning probe microscopy and a tool for nanotechnology. Rev. Sci. Instrum. 78 (1), 013705 (2007).
  78. Merroun, M. L., Rossberg, A., Scheinost, A. C., Selenska-Pobell, S. XAS characterization of gold nanoclusters formed by cells and S-layer sheets of B. sphaericus JG-A12. Annual Report Forschungszentrum Rossendorf – Institute for Radiochemistry. , (2005).
  79. Jankowski, U., Merroun, M. L., Selenska-Pobell, S., Fahmy, K. S-Layer protein from Lysinibacillus sphaericus. JG-A12 as matrix for Au III sorption and Au-nanoparticle formation. Spectroscopy. 24 (1), 177-181 (2010).
  80. Selenska-Pobell, S., et al. Magnetic Au nanoparticles on archaeal S-Layer ghosts as templates. Nanomater. nanotechnol. 1 (2), 8-16 (2011).
  81. Caruso, F., Furlong, D. N., Kingshott, P. Characterization of ferritin adsorption onto gold. J. Colloid Interface Sci. 186 (1), 129-140 (1997).
  82. Ward, M. D., Buttry, D. A. In situ interfacial mass detection with piezoelectric transducers. Science. 249 (4972), 1000-1007 (1990).
  83. Höök, F., et al. Variations in coupled water, viscoelastic properties, and film thickness of a Mefp-1 protein film during adsorption and cross-linking: A quartz crystal microbalance with dissipation monitoring, ellipsometry, and surface plasmon resonance study. Anal. Chem. 73 (24), 5796-5804 (2001).
  84. Wahl, R. . Reguläre bakterielle Zellhüllenproteine als biomolekulares Templat. , (2003).
  85. Jennings, T., Strouse, G. . Past, present, and future of gold nanoparticles in Bio-Applications of Nanoparticles. , 34-47 (2007).
  86. Beveridge, T., Fyfe, W. Metal fixation by bacterial cell walls. Can. J. Earth Sci. 22 (12), 1893-1898 (1985).
check_url/cn/53572?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Suhr, M., Raff, J., Pollmann, K. Au-Interaction of Slp1 Polymers and Monolayer from Lysinibacillus sphaericus JG-B53 – QCM-D, ICP-MS and AFM as Tools for Biomolecule-metal Studies. J. Vis. Exp. (107), e53572, doi:10.3791/53572 (2016).

View Video