Summary

Måling Utbredelsen av ugressmiddel Metabolism i dicot Weeds med et utskåret Leaf analysen

Published: September 07, 2015
doi:

Summary

This manuscript describes how herbicide metabolism rates can be effectively quantified with excised leaves from a dicot weed, thereby reducing variability and removing any possible confounding effects of herbicide uptake or translocation typically observed in whole-plant assays.

Abstract

In order to isolate and accurately determine rates of herbicide metabolism in an obligate-outcrossing dicot weed, waterhemp (Amaranthus tuberculatus), we developed an excised leaf assay combined with a vegetative cloning strategy to normalize herbicide uptake and remove translocation as contributing factors in herbicide-resistant (R) and –sensitive (S) waterhemp populations. Biokinetic analyses of organic pesticides in plants typically include the determination of uptake, translocation (delivery to the target site), metabolic fate, and interactions with the target site. Herbicide metabolism is an important parameter to measure in herbicide-resistant weeds and herbicide-tolerant crops, and is typically accomplished with whole-plant tests using radiolabeled herbicides. However, one difficulty with interpreting biokinetic parameters derived from whole-plant methods is that translocation is often affected by rates of herbicide metabolism, since polar metabolites are usually not mobile within the plant following herbicide detoxification reactions. Advantages of the protocol described in this manuscript include reproducible, accurate, and rapid determination of herbicide degradation rates in R and S populations, a substantial decrease in the amount of radiolabeled herbicide consumed, a large reduction in radiolabeled plant materials requiring further handling and disposal, and the ability to perform radiolabeled herbicide experiments in the lab or growth chamber instead of a greenhouse. As herbicide resistance continues to develop and spread in dicot weed populations worldwide, the excised leaf assay method developed and described herein will provide an invaluable technique for investigating non-target site-based resistance due to enhanced rates of herbicide metabolism and detoxification.

Introduction

Herbicidresistens i ugress presenterer en alvorlig trussel mot den globale produksjonen av mat og fiber 1,2. Foreløpig tusenvis av resistente populasjoner og biotypes fra over hundre plantearter over hele verden har blitt dokumentert og studert tre. En viktig mekanisme som overfører herbicidresistens i planter er endring av herbicid target-site gener og proteiner, inkludert genetiske mutasjoner som påvirker ugressmiddel-proteinbindingskinetikken eller amplifikasjon av target-området gen 2. Metabolsk avgiftning via forhøyede aktiviteter av cytokrom P450 monooksygenase (P450) eller glutation S -transferase (GST) enzymer er en annen mekanisme som overfører herbicidresistens i ugress, som er forskjellig på flere måter fra target-site-baserte mekanismer 2. Metabolsk basert motstand har betydelige konsekvenser for hvorvidt anlegget fitness kostnader (aka fitness straffer) kan resultere fra ugressmiddel-motstands mechanism, så vel som med hensyn til muligheten for en enkelt avgiftning mekanisme til å meddele tverr- eller flere herbicid resistens i plantepopulasjoner 1,2,4. Vanligvis kan herbicid metabolisme hos planter deles i tre distinkte faser 5. Fase I innebærer omdannelse herbicid eller aktivering, slik som P450 hydroksylering av aromatiske ringer eller alkylgrupper, eller med N – eller O- dealkyleringsreaksjoner, som fører til øket polaritet og delvis herbicid avgiftning 5,6. Nylig innført funksjonelle grupper i fase kan jeg gi ledd nettsteder for konjugering til redusert glutation ved GST eller til glukose av UDP-avhengige glycosyltransferases i fase II 5,7. For eksempel er den store første metabolitt av primisulfuron-methyl i mais hydroksy-primisulfuron-methyl 8, som kan videre metaboliseres til hydroksy-primisulfuron-glukosid (fase II), og deretter transportert til vakuolen for langtidslagring eller videre metabolsk proling 5,6 (fase III).

Waterhemp (Amaranthus tuberculatus) er en vanskelig å kontroll, dicot årlige plantearter som hindrer produksjonen av mais (Zea mays), soyabønner (Glycine max), og bomull (Gossypium hirsutum) i USA. Den høye graden av genetisk mangfold av waterhemp er tilrettelagt av sin dioecious biologi og langdistanse vind pollinering, og en enkelt kvinne waterhemp plante kan produsere opp til en million frø 9. Disse frøene er liten og lett spre seg, som naturligvis gi gave waterhemp med en effektiv spredning mekanisme. Waterhemp viser kontinuerlig spiring gjennom hele vekstsesongen 9, og dens frø er i stand til å spire etter flere år med dvalen. Waterhemp er en C 4 plante som besitter en høyere vekst enn de fleste bredbladet ugress i dyrkbar beskjæring systemer 10. I tillegg en rekke waterhemp bestander er resistente mot flere famlige fundament av ugressmidler 3.

En populasjon av waterhemp (betegnet MCR) fra Illinois er resistent overfor 4-hydroksy-fenylpyruvat dioksygenase (HPPD) hemmende herbicider 11, slik som mesotrion, så vel som til atrazin og acetolaktat-syntase (ALS) hemmende herbicider, inkludert primisulfuron-methyl På grunn av non-target-språk baserte mekanismer 12,13. En annen populasjon av waterhemp betegnet ACR 14, som er primisulfuron-methyl-resistente (på grunn av en mutasjon i ALS-genet) og atrazin-motstandsdyktig, men følsomme for mesotrion, og en waterhemp populasjon betegnet WCS 14 som er følsom for primisulfuron-methyl, mesotrion, og atrazine ble anvendt i forhold til MCR på vår tidligere forskning 12 og aktuelle eksperimenter (oppsummert i tabell 1). Innledende studier ikke oppdage endringer i HPPD gensekvens eller uttrykk nivåer, eller redusert mesotrion opptak, i MCRbefolkningen sammenlignet med mesotrion-sensitive populasjoner 12. Men metabolismestudier med hele planter viste signifikant lavere nivåer av foreldre mesotrion ugressmiddel i MCR sammenlignet med ACR og WCS, som korrelert med tidligere fenotypiske responser til mesotrion 11,12.

Waterhemp Befolkning Forkortelse Fenotype til mesotrion Mesotrion Resistance Mechanism Fenotype til Primisulfuron Primisulfuron Resistance Mechanism
McLean fylke-Resistant MCR Resistent Metabolisme * Resistent Metabolisme
Adams fylke-Resistant ACR SensITive Resistent Target-site mutasjon i ALS 14
Wayne County-Sensitive WCS Sensitive Sensitive

* Ikke-target-språk resistensmekanismer, annet enn økt metabolisme, kan også gi mesotrion motstand i MCR befolkningen 12.

Tabell 1: Beskrivelse av waterhemp populasjoner fra Illinois brukt i denne studien.

I tillegg til å bestemme priser av ugressmiddel metabolisme i intakte waterhemp frøplanter, ble en annen eksperimentell tilnærming utviklet og anvendt i vår tidligere forskning for å undersøke stoffskifte ved hjelp av en spaltet waterhemp blad analysen 12 samt ulike P450-hemmere (f.eks tetcyclacis og malathion). Denne metoden ble tilpasset spesielt for waterhemp fra en PreviOUS etterforskning av primisulfuron-metyl metabolisme i skåret mais blader 15, siden utskåret blad analysen ennå ikke hadde blitt rapportert for å gjennomføre ugressmiddel metabolisme forskning i et dicot plante. Den organophophosate insektmiddel malathion har vært hyppig brukt for in vivo og in vitro ugressmiddel-metabolisme forskning for å indikere P450 involvering 16. For eksempel, toleranse og hurtig metabolisme av mesotrion i mais skyldes P450-katalysert ring hydroksylering, som ble bekreftet ved malathion øket følsomhet for mais mesotrion 17. Tilsvarende, malathion hemmet metabolisme av ALS inhibitor primisulfuron-methyl utskåret i mais blader 15. En stor fordel med den utskårede blad teknikken er at data som er generert er uavhengige av hel-anlegget trans mønstre, for å vurdere en viktig faktor når man vurderer metabolismen av systemiske herbicider, postemergence i planter. Derfor tillater denne metoden kvantitative ogkvalitativ metabolsk analyser for å fokusere på en enkelt behandlet blad 12.

En vegetative kloning strategi, i kombinasjon med utskåret blad protokollen, ble tidligere benyttet i waterhemp å gjennomføre metabolismestudier 12. På grunn av den outcrossing natur waterhemp (separate mannlige og kvinnelige planter), og stor grad av genetisk mangfold innenfor dioecious Amaranthus arter 9, denne protokollen sørget for at genetisk identiske waterhemp frøplanter ble analysert innenfor tidskurs eksperimenter. Denne artikkelen viser nytten av det utskårede blad metode for å måle forekomst av herbicid metabolisme i en tofrøbladet ugress (waterhemp). Mengden av basis herbicid gjenværende ble bestemt på hvert tidspunkt (figur 1) ved ikke-lineær minste kvadraters regresjonsanalyse, og er i form med en enkelt første-ordens kurve for å beregne tiden for 50% av absorbert herbicid å degradere ( DT 50). RepresentantKromatogrammene fra reversfase-væskekromatografi med høy yteevne (RP-HPLC) vises for ALS-resistente og -sensitive waterhemp populasjoner, som viser forsvinningen av moder herbicid og samtidig dannelse av polar metabolitt (er) i løpet av en tidsstudium (figur 2). Fokus for vår artikkelen er å beskrive og demonstrere nytten av utskåret blad analyse i kombinasjon med en vegetativ klonings fremgangsmåte for å bestemme nøyaktige og reproduserbare forekomst av herbicid metabolisme i tofrøbladet planter, ved hjelp av jevnt ring-merkede (URL- 14 C) i herbicider tre waterhemp populasjoner som varierer i deres hel-anlegget svar på HPPD- og ALS-hemmer ugressmidler (tabell 1).

Protocol

1. plantemateriale, vekstvilkår, og Vegetativ Cloning Merk: Tre waterhemp populasjoner ble undersøkt i denne forskningen: MCR (fra McLean County, IL), ACR (fra Adams County, IL), og WCS (fra Wayne County, IL) (tabell 1). Samle og suspen waterhemp frø i 0,1 g L -1 agar: vannløsning ved 4 ° C i minst 30 dager for å forbedre spiring. Merk: Noen waterhemp bestander er sovende, men dette trinnet bidrar til å overvinne dvalen og lage frø spirer mer je…

Representative Results

Store forskjeller i forekomst av mesotrion stoffskifte ble påvist mellom enten WCS eller ACR og MCR (figur 1). På hvert tidspunkt, hadde MCR metaboliseres mesotrion raskere enn de to mesotrion-sensitive populasjoner, WCS og ACR, som korrelerer med tidligere hel-anlegget fenotypiske responser 11. Ved kloning av nok planter fra en enkel foreldre plante fra hver populasjon, herbicid metabolisme tidsforløpet analyser er ensartet og reproduserbar på grunn av mangel av genetisk variabilitet inn…

Discussion

Det utskårede-blad metoden beskrevet her har tidligere vært brukt i forskning primisulfuron metabolisme i mais blader 15, men våre resultater viser at denne protokollen er også effektiv, nøyaktig og reproduserbar for måling av ugressmiddel metabolisme i en dicot ugrasarter 12. En stor fordel med den utskårede blad teknikk sammenlignet med hel-anlegget studier er at et utskåret blad er uavhengig av hel-anlegget trans mønstre av postemergence, systemiske herbicider eller forskjeller i opptak…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank Wendy Zhang, Austin Tom, Jacquie Janney, Erin Lemley, and Brittany Janney for assistance with plant growth and extractions, Dr. Anatoli Lygin for assistance with chromatographic analyses, and Syngenta Crop Protection for funding.

Materials

Agar Sigma-Aldrich A1296 for pre-germinating seeds
Potting medium Sun Gro Horticulture 49040233 for plant growth
Nutricote Agrivert  TOTAL BLEND 13-13-13 T100 slow-release fertilizer
Growth chamber E15 Controlled Environments Limited 20207 plant culturing
Tris base Fisher Scientific BP152-500 buffer for excised leaves
HCl (concentrated) Fisher Scientific A144500 adjust pH of buffer
Murashige and Skoog (MS) salts  Sigma-Aldrich M0404 incubation of excised leaves
Methanol Fisher Scientific A452-4 leaf washes after incubation
Acetone Sigma-Aldrich 179124 plant extractions
Acetonitrile (HPLC grade) Macron Fine Chemicals MKH07610 HPLC mobile phase
Formic acid  Mallinckrodt Analytical MK259205 acidify mobile phase pH
Micro-centrifuge Eppendorf 5417R 1.5 or 2.0 mL tubes
Centrifuge (temperature controlled) Eppendorf 5810R 15 or 50 mL tubes
Polypropylene centrifuge tube Corning Inc. 430790 15 mL, sterile
Rotary evaporator BÜCHI R200 concentrate plant samples
Liquid scintillation spectrometry (LSS) Packard Instruments 104470 quantify 14C
High-performance liquid chromatography Perkin Elmer N2910401 resolve herbicide metabolites
Flow scintillation analyzer  LabLogic System 1103303 for HPLC analysis of 14C
Hypersil Gold C18 column  Thermo-Scientific 03-050-522  reversed phase
Ultima-Flo M cocktail Perkin Elmer 6013579 for Flow-scintillation analyzer
Scintillation Cocktail (ScintiVerse BD) Fisher Scientific SX18 for LSS; biodegradable
Laboratory homogenizer Kinematica CH-6010  homogenize leaf samples

References

  1. Yu, Q., Powles, S. Metabolism-based herbicide resistance and cross-resistance in crop weeds: A threat to herbicide sustainability and global crop production. Plant Physiology. 166, 1106-1118 (2014).
  2. Powles, S. B., Yu, Q. Evolution in action: plants resistant to herbicides. Annual Reviews in Plant Biology. 61, 317-347 (2010).
  3. Heap, I., et al. Global perspective of herbicide-resistant weeds. Pest Management Science. 70 (9), 1306-1315 (2014).
  4. Délye, C., et al. Non-target-site-based resistance should be the centre of attention for herbicide resistance research: Alopecurus myosuroides as an illustration. Weed Research. 51 (5), 433-437 (2011).
  5. Kreuz, K., Tommasini, R., Martinoia, E. Old enzymes for a new job. Herbicide detoxification in plants. Plant Physiology. 111, 349-353 (1996).
  6. Riechers, D. E., Kreuz, K., Zhang, Q. Detoxification without intoxication: herbicide safeners activate plant defense gene expression. Plant Physiology. 153, 3-13 (2010).
  7. Siminszky, B. Plant cytochrome P450-mediated herbicide metabolism. Phytochemistry Reviews. 5 (2-3), 445-458 (2006).
  8. Fonné-Pfister, R., et al. Hydroxylation of primisulfuron by an inducible cytochrome P450-dependent monooxygenase system from maize. Pesticide Biochemistry and Physiology. 37 (2), 165-173 (1990).
  9. Steckel, L. E. The dioecious Amaranthus spp.: here to stay. Weed Technology. 21 (2), 567-570 (2007).
  10. Horak, M. J., Loughin, T. M. Growth analysis of four Amaranthus species. Weed Science. 48 (3), 347-355 (2000).
  11. Hausman, N. E., et al. Resistance to HPPD-inhibiting herbicides in a population of waterhemp (Amaranthus tuberculatus) from Illinois, United States. Pest Management Science. 67 (3), 258-261 (2011).
  12. Ma, R., et al. Distinct detoxification mechanisms confer resistance to mesotrione and atrazine in a population of waterhemp. Plant Physiology. 163, 363-377 (2013).
  13. Guo, J., et al. Non-target-site resistance to ALS inhibitors in waterhemp (Amaranthus tuberculatus). Weed Science. in press, (2015).
  14. Patzoldt, W. L., Tranel, P. J., Hager, A. G. A waterhemp (Amaranthus tuberculatus) biotype with multiple resistance across three herbicide sites of action. Weed Science. 53 (1), 30-36 (2005).
  15. Kreuz, K., Fonné-Pfister, R. Herbicide-insecticide interaction in maize: malathion inhibits cytochrome P450-dependent primisulfuron metabolism. Pesticide Biochemistry and Physiology. 43 (3), 232-240 (1992).
  16. Correia, M. A., Ortiz de Montellano, P. R., Ortiz de Montellano, P. R. . Cytochrome P450: Structure, Mechanism, and Biochemistry. , 247-322 (2005).
  17. Hawkes, T. R., et al. Mesotrione: mechanism of herbicidal activity and selectivity in corn. Proceedings of the Brighton Crop Protection Conference – Weeds. 2, 563-568 (2001).
  18. Patzoldt, W. L., Tranel, P. J., Hager, A. G. Variable herbicide responses among Illinois waterhemp (Amaranthus rudis and A. tuberculatus) populations. Crop Protection. 21 (9), 707-712 (2002).
  19. Jalaludin, A., Yu, Q., Powles, S. B. Multiple resistance across glufosinate, glyphosate, paraquat and ACCase-inhibiting herbicides in an Eleusine indica population. Weed Research. 55 (1), 82-89 (2015).
  20. Iwakami, S., et al. Cytochrome P450 CYP81A12 and CYP81A21 are associated with resistance to two acetolactate synthase inhibitors in Echinochloa phyllopogon. Plant Physiology. 165, 618-629 (2014).

Play Video

Cite This Article
Ma, R., Skelton, J. J., Riechers, D. E. Measuring Rates of Herbicide Metabolism in Dicot Weeds with an Excised Leaf Assay. J. Vis. Exp. (103), e53236, doi:10.3791/53236 (2015).

View Video