The methods presented provide step-by-step instructions for the performance of a collection of microplate based respirometric assays using isolated mitochondria from minimal quantities of mouse skeletal muscle. These assays are able to measure mechanistic changes/adaptations in mitochondrial oxygen consumption in a commonly used animal model.
Skeletal muscle mitochondria play a specific role in many disease pathologies. As such, the measurement of oxygen consumption as an indicator of mitochondrial function in this tissue has become more prevalent. Although many technologies and assays exist that measure mitochondrial respiratory pathways in a variety of cells, tissue and species, there is currently a void in the literature in regards to the compilation of these assays using isolated mitochondria from mouse skeletal muscle for use in microplate based technologies. Importantly, the use of microplate based respirometric assays is growing among mitochondrial biologists as it allows for high throughput measurements using minimal quantities of isolated mitochondria. Therefore, a collection of microplate based respirometric assays were developed that are able to assess mechanistic changes/adaptations in oxygen consumption in a commonly used animal model. The methods presented herein provide step-by-step instructions to perform these assays with an optimal amount of mitochondrial protein and reagents, and high precision as evidenced by the minimal variance across the dynamic range of each assay.
骨骼肌线粒体的主要生理作用是从氧化磷酸化1产生ATP。重要的是,骨骼肌线粒体的运动能力2发挥具体作用,延缓衰老3,退行性疾病4和II型糖尿病5。作为老龄化社会,和II型糖尿病是死亡在美国6的 7 个首要原因,是否需要评估线粒体功能的方法已经变得越来越在生物医学研究7,8-更普遍。具体地讲,氧的消耗的测量在线粒体功能的评估呈实用,因为它代表的线粒体和核基因组之间的协调功能,表达氧化磷酸9的功能组件。
几种技术存在,使氧消耗在完整细胞的测定和隔离ð线粒体7-10。另外,测定中已经开发了用于多种细胞类型和组织,并在各种物种,其允许线粒体途径和呼吸控制9,11,12的测定。然而,目前在文献中的空隙在问候所有这些测定中使用分离线粒体从小鼠骨骼肌中基于微孔板氧消耗的技术使用的汇编。重要的是,利用基于微孔板透气性试验越来越多线粒体生物学家中并允许使用量的分离线粒体9的最小的高通量测量。因此,基于微孔板呼吸计测定的集合被开发,允许精确定位,其中异常和/或改编可以在电子传递链(ETC)来发生的。此外,两个附加的微孔板基于呼吸计测定法开发,使协调的betwee评估n中的三羧酸(TCA)循环和ETC,和β-氧化和ETC.之间重要的是,所提出的方法提供了一个简洁明了的方法来衡量线粒体功能的常用动物模型的机械变化。
在这篇文章中介绍的方法提供一步一步的指示,使用线粒体75隔绝基于微孔板检测呼吸速率集合的性能 – 100毫克的小鼠骨骼肌。这些测定法可以以高精度来执行如由一式三份孔之间的紧密标准偏差。重要的是,这些透气性测定法允许精确定位,其中异常和/或改编可在通常使用的动物模型可发生在ETC,TCA循环,β氧化途径,衬底转运等。
它突出使用在本协议中使用的各种燃料和抑制剂的基本原理是很重要的。丙酮酸/苹果酸和谷氨酸/苹果酸盐呼吸计测定允许复合物I介导的呼吸的评估,以及它们各自的转运体的评估,以及在谷氨酸的情况下,该脱氨酶15。可替代地,组合琥珀酸/鱼藤酮使线粒体呼吸通量通过ETC的复合物II的评估,因为鱼藤酮抑制复杂我和琥珀酸通过黄素腺嘌呤二核苷酸的还原提供电子向复合物II(FADH 2)15。这些实验提供基板的具体信息以耦合效率和最大呼吸。电子流测定法是在底物和抑制剂的组合允许多种复合物的线粒体呼吸焊剂9在评估是唯一的。丙酮酸/苹果酸+ FCCP的初始衬底混允许最大呼吸络合我驱动的评价,而鱼藤酮的注射随后琥珀酸允许通过复合物II从动评估最大呼吸。注射抗霉素A的,复合物III抑制剂,接着注射抗坏血酸/ TMPD允许为呼吸自抗坏血酸由复合物IV驱动的评价/ TMPD是一个电子供体细胞色素C /复合物IV。虽然获得的耦合效率没有信息,该方法适合于那些妨碍独立运行的多个基板非常小的样本量。最后,使用棕榈酰肉碱/苹果酸盐的允许β氧化和由于来自的棕榈酸(β氧化)的氧化所产生的还原当量的ETC之间的协调的评估送入ETC通过电子转移黄素蛋白15。应当指出的是,耦合和电流测定法也可用于在串联以确定改变线粒体功能,由于一些干预(药物治疗,基因操作)。
高精度实现对这些测定主要是由于线粒体的充分混合,无论是前蛋白测定,或与基板的解决方案。沿着这些线路,一旦线粒体是resuspendend在衬底搜索解决方案纳秒,关键是混合此溶液彻底之前按照步骤2.2中所述带的加宽孔枪头加载细胞培养板。失败来混合线粒体充分将导致在测定内大的变化。此外,使用一个窄孔移液管尖端将产生的剪切力,同时混合的线粒体并增加损伤线粒体膜和细胞色素C的释放的粘附步骤(2.7)也是在这个协议中的一个关键步骤的潜力。失败旋转加载的细胞培养板长足够快/将导致线粒体的不完全粘附到孔,因此导致油井和测量之间增加变性。
所描述的方案进行了优化,包括:装载线粒体蛋白质的最佳量每孔,使用正确的浓度/制备方法,使股市和基体的解决方案,改变了试验运行,确保线粒体状态解放军teaus,和线粒体库存和线粒体/衬底混的合适的混合。在此之前,优化的努力,作者在试验运行中遇到的陷阱。下面讨论的故障排除方法/是优化这个协议有帮助修改。对于最佳的装载,装载太少线粒体不会引起一个强有力的反应,同时加载了太多的线粒体会耗尽微容器内的氧气,导致不准确的测量。 Rogers等9条规定确定每口井的线粒体最佳负载量为基于微孔板透气性检测的例子。更多的时候,太多的线粒体是每个加载以及由国家证明2率超过100-200皮摩尔/分钟/孔,状态3速率> 1500皮摩尔/分钟/孔。如果发生过载,进行一个实验,用不同浓度的线粒体蛋白(例如,在1 – 10微克),以动态R内部引起光学字符识别安格耗氧量测量机。准备和使用基材和个股的正确浓度是非常重要的。始终使用的基板/注射的酸形式和调整用氢氧化钾或盐酸的pH值;钠缓冲液/解决方案不推荐。此外,重悬基质/股在DMSO或100%的乙醇,将导致测量失败或错误。一定要使用95%的乙醇注意的地方。是很常见的棕榈酰肉碱以沉淀出95%的乙醇的解冻冷冻的储存后,从而导致大的可变性。一定要热身棕榈酰肉碱的股票和漩涡以及之前使用。此外,高度可变的丙酮酸/苹果酸盐化验结果,可能是由于丙酮酸股票之中> 2周大。一定要重拍丙酮酸冷冻等份,每2周。该法的运行被修改为2分钟测量,以确保线粒体状态高原。如果观察ADP耗尽的需要,研究人员可该“协议”选项卡下延长测量时间下的“试验向导”的论坛。最后,当线粒体库存和线粒体加底物溶液不充分均质化在装载前发生大的变化。如果井间变异是试验运行后高,一定要在底物液充分搅拌下一个实验前。切勿涡线粒体/基板解决方案,而搅拌,捣烂,与加宽孔的枪头轻轻地磨碎。
有此技术是值得注意的一些限制。首先,孔中的用于这些分析的细胞培养板的数目是相对低的(即,24个孔和指定为空白孔至少2)。如果期望在一个板上执行所有5这些测定的,研究人员仅能够检查从一只小鼠的响应的时间。但是,应该指出的是,96孔仪器可用于解释第1条- [R吞吐量。其次,有先天的优势和劣势评估线粒体功能障碍的分离线粒体相比,在完整细胞1。一些弱点包括具有较少生理学相关性相比完整细胞和从隔离过程诱导工件。最后,该方法的成功是取决于线粒体隔离工艺的质量。
虽然这些测定法已被已显影在不同的系统或在其他动物模型中已被证实,在此提出的方法是首先在一个多井氧消耗测量机使用小鼠合成所有上述测定法的最佳利用骨骼肌。重要的是,所有5这些测定可以与线粒体从〜75中分离的量来进行 – 100毫克的小鼠骨骼肌,从而提供了以最小的材料的高通量。具有十分重要的意义,多井的能力耗氧量的技术来执行检测与数量时线粒体的最小的,结合经优化的分离方法,使研究人员进行大量的其他实验用的骨骼肌组织其余(例如,蛋白质印迹,RT-PCR法,酶测定法,等),这是通常与该动物模型的斗争。
总之,本文介绍的方法提供一步一步的指示,适用于使用量的小鼠骨骼肌最小的基于微孔板检测呼吸速率集合的性能。重要的是,所提出的方法需要大量的组织和线粒体最小。一旦掌握,本文中描述的技术将允许研究人员确定在一个常用的动物模型对线粒体耗氧量的化合物或基因产物的潜在机制。
The authors have nothing to disclose.
The Fralin Life Science Research Institute and The Metabolic Phenotyping Core at Virginia Tech supported this work.
Sucrose | Sigma Aldrich | S7903 | Store at room temperature |
D-Mannitol | Sigma Aldrich | 63559 | Store at room temperature |
Potassium phosphate monobasic, minimum 99.0% | Sigma Aldrich | P5379 | Store at room temperature |
Magnesium chloride hexahydrate, ACS reagent, 99.0-102.0% | Sigma Aldrich | M9272 | Store at room temperature |
HEPES minimum 99.5% titration | Sigma Aldrich | H3375 | Store at room temperature |
EGTA | Sigma Aldrich | E4378 | Store at room temperature |
Essentially Fatty | Sigma Aldrich | A6003 | Store at 4°C |
Acid Free- BSA | |||
Pyruvic Acid, 98% | Sigma Aldrich | 107360 | Store at 4°C |
Succinic Acid | Sigma Aldrich | S9512 | Store at room temperature |
L(-) Malic Acid, BioXtra, ≥95% | Sigma Aldrich | M6413 | Store at room temperature |
L-Glutamic acid | Sigma Aldrich | G1251 | Store at room temperature |
N,N,N′,N′-Tetramethyl-p-phenylenediamine | Sigma Aldrich | T7394 | Store at room temperature |
99%, powder [TMPD] | |||
Palmitoyl L-carnitine chloride | Sigma Aldrich | P1645 | Store at -20°C |
Oligomycin A, ≥ 95% (HPLC) | Sigma Aldrich | 75351 | Store at -20°C |
Carbonyl cyanide 4-(trifluoromethoxy) | Sigma Aldrich | C2920 | Store at 2-8°C |
phenylhydrazone | |||
≥98% (TLC), powder [FCCP] | |||
Antimycin A from streptomyces sp. | Sigma Aldrich | A8674 | Store at -20°C |
Adenosine 5′-diphosphate monopotassium salt dehydrate [ADP] | Sigma Aldrich | A5285 | Store at -20°C |
Rotenone | Sigma Aldrich | R8875 | Store at room temperature |
Pierce™ BCA Protein Assay Kit | Thermo Scientific | 23225 | N/A |