The methods presented provide step-by-step instructions for the performance of a collection of microplate based respirometric assays using isolated mitochondria from minimal quantities of mouse skeletal muscle. These assays are able to measure mechanistic changes/adaptations in mitochondrial oxygen consumption in a commonly used animal model.
Skeletal muscle mitochondria play a specific role in many disease pathologies. As such, the measurement of oxygen consumption as an indicator of mitochondrial function in this tissue has become more prevalent. Although many technologies and assays exist that measure mitochondrial respiratory pathways in a variety of cells, tissue and species, there is currently a void in the literature in regards to the compilation of these assays using isolated mitochondria from mouse skeletal muscle for use in microplate based technologies. Importantly, the use of microplate based respirometric assays is growing among mitochondrial biologists as it allows for high throughput measurements using minimal quantities of isolated mitochondria. Therefore, a collection of microplate based respirometric assays were developed that are able to assess mechanistic changes/adaptations in oxygen consumption in a commonly used animal model. The methods presented herein provide step-by-step instructions to perform these assays with an optimal amount of mitochondrial protein and reagents, and high precision as evidenced by the minimal variance across the dynamic range of each assay.
Le principal rôle physiologique des mitochondries du muscle squelettique est de produire de l'ATP à partir de la phosphorylation oxydative 1. Surtout, les mitochondries des muscles squelettiques jouent un rôle spécifique dans l'exercice capacité de 2, 3 vieillissement diabète, maladie dégénérative 4 et 5 de type II. Comme une société vieillissante, et du diabète de type II étant la 7 ème cause de décès aux États-Unis 6, le besoin de méthodes qui permettent d'évaluer la fonction mitochondriale est devenu de plus en plus répandue dans la recherche biomédicale 7,8. Plus précisément, la mesure de la consommation d'oxygène a une utilité exceptionnelle pour l'évaluation de la fonction mitochondriale, car elle représente la fonction coordonnée entre les génomes mitochondriaux et nucléaires pour exprimer les composants fonctionnels de la phosphorylation oxydative 9.
Plusieurs technologies existent qui permettent la mesure de la consommation d'oxygène dans les cellules intactes et isolentd mitochondries 7-10. En outre, des essais ont été développés pour plusieurs types de cellules et de tissus, et dans une variété d'espèces qui permettent la mesure des voies respiratoires mitochondriaux et contrôle 9,11,12. Toutefois, il existe actuellement un vide dans la littérature en ce qui concerne la compilation de tous ces tests utilisant des mitochondries isolées de muscle squelettique de souris pour une utilisation dans les technologies de la consommation d'oxygène de microplaques base. Surtout, l'utilisation de microplaques basé dosages respirométriques se développe parmi les biologistes mitochondriales et permet des mesures à haut débit en utilisant des quantités minimales de mitochondries isolées 9. Par conséquent, une collection de microplaques basé dosages respirométriques ont été développés qui permettent de repérer où des anomalies et / ou adaptations peuvent se produire dans la chaîne de transport d'électrons (ETC). En outre, deux essais respirométriques sur microplaques supplémentaires ont été élaborés afin de permettre l'évaluation de la coordination between l'acide (TCA) le cycle tricarboxylique et l'ETC, et entre la ß-oxydation et la ETC. Surtout, les méthodes présentées fournissent une manière claire et concise pour mesurer les changements dans la fonction mitochondriale mécanistes dans un modèle animal couramment utilisé.
Les méthodes présentées dans cet article fournissent des instructions étape-par-étape pour la performance d'une collection de microplaques basé dosages respirométriques utilisant mitochondries isolées de 75 à 100 mg de muscle squelettique de souris. Ces analyses peuvent être effectuées avec une grande précision comme en témoigne l'écart type étanche entre des puits en triple. Surtout, ces tests permettent de repérer des respirométriques où des anomalies et / ou adaptations peuvent se produire dans l'ETC, cycle de Krebs, voie β-oxydation, les transporteurs de substrat, etc., dans un modèle animal couramment utilisé.
Il est important de souligner la justification de l'utilisation de divers carburants et les inhibiteurs utilisés dans ce protocole. Le pyruvate / malate et du glutamate / malate respirométriques dosages permettent l'évaluation du complexe I respiration médiation, ainsi que l'évaluation de leurs transporteurs respectifs, et dans le cas du glutamate, la désaminase 15. En variante, la combinaison desuccinate / roténone permet l'évaluation des flux respiratoire mitochondriale travers Complexe II de l'ETC depuis roténone inhibe complexe I et succinate fournit des électrons au complexe II via la réduction de la flavine adénine dinucléotide (FADH 2) 15. Ces essais fournissent des informations spécifiques de substrat à l'efficacité de couplage et la respiration maximale. Le dosage de flux d'électrons est unique en ce que la combinaison des substrats et inhibiteurs permet d'évaluer de multiples complexes pendant flux respiratoire mitochondriale 9. Le mélange de substrat de départ de pyruvate / malate + FCCP permet d'évaluer de respiration maximale entraîné par Complexe I, tandis que l'injection de la roténone suivie par succinate permet l'évaluation de respiration maximale entraîné par complexe II. L'injection d'antimycine A, un inhibiteur du complexe III, suivie de l'injection d'ascorbate / TMPD permettre à l'évaluation de la respiration entraînée par Complexe IV depuis la Ascorbate / TMPD est undonneur d'électrons à Cytochrome C / Complexe IV. Bien qu'aucune information sur l'efficacité de couplage est obtenu, la méthode est idéale pour les tailles d'échantillons très petits qui empêchent l'exécution de plusieurs substrats indépendamment. Enfin, l'utilisation de palmitoyl carnitine / malate permet l'évaluation de la coordination entre les β-oxydation et l'ETC depuis l'équivalent réduire produite à partir de l'oxydation de l'acide palmitique (β-oxydation) alimentation dans l'ETC par l'électron transfert flavoprotéine 15. Il est à noter que les analyses de flux de couplage et d'électrons peuvent également être utilisés en tandem pour identifier des changements dans la fonction mitochondriale en raison d'une intervention (traitement de la toxicomanie, de la manipulation génétique).
La grande précision atteinte pour ces dosages est principalement due à un mélange intime de la mitochondrie, que ce soit avant la détermination des protéines, ou des solutions de substrat. Dans cette optique, une fois que les mitochondries est resuspendend dans le substrat de solutions, il est essentiel de mélanger cette solution soigneusement avant de charger la plaque de culture cellulaire comme décrit dans l'étape 2.2 avec un orifice de l'embout de pipette élargie. Le défaut de mélanger les mitochondries soigneusement mènera à une grande variation dans le dosage. En outre, à l'aide d'une pipette de orifice étroit permettra de créer des forces de cisaillement tout en mélangeant les mitochondries et augmente le potentiel d'endommager les membranes mitochondriales et la libération de cytochrome C. L'étape de l'adhésion (2.7) est également une étape critique dans ce protocole. Échec pour faire tourner la plaque de culture cellulaire chargée long / assez vite se traduira par l'adhésion incomplète de la mitochondrie au bien, entraînant ainsi une plus grande variabilité entre les puits et les mesures.
Le protocole décrit a été optimisé pour inclure: le chargement d'une quantité optimale de protéine mitochondriale par puits, en utilisant les concentrations / méthodes de préparation correcte de faire des actions et des solutions substrat, la modification de la série de tests pour assurer mitochondrial pla de l'Etatteaux, et le mélange approprié de les mitochondriales actions et mitochondrial / substrat mélanges. Avant ces efforts d'optimisation, les auteurs ont rencontré des pièges dans la série de tests. Ce qui suit décrit les méthodes / des modifications qui ont été utiles dans l'optimisation de ce protocole dépannage. En ce qui concerne le chargement optimal, chargement trop peu de mitochondries ne seront pas provoquer une réponse robuste, tout en chargeant trop de mitochondries va épuiser l'oxygène dans la microchambre et conduire à des mesures inexactes. Rogers et al 9 fournit des exemples de détermination des montants de chargement optimales de mitochondries par puits des microplaques basé dosages respirométriques. Plus souvent, trop de mitochondries est chargé par puits comme en témoignent les taux sur l'état 2 100-200 pmol / min / puits et l'état 3 taux> 1500 pmol / min / puits. Si au cours de chargement se produit, effectuer une expérience avec des concentrations variables de la protéine mitochondriale (par exemple, entre 1 -. 10 ug) de susciter OCR dans le r dynamiqueange de la machine de mesure de la consommation d'oxygène. Préparation et en utilisant les bonnes concentrations de substrats et des stocks est d'une importance capitale. Toujours utiliser la forme acide de substrats / injections et ajuster le pH avec de l'hydroxyde de potassium ou de HCl; tampons de sodium / solutions ne sont pas recommandés. En outre, des substrats remet en suspension / stocks dans le DMSO ou 100% d'éthanol se traduira par l'échec de mesure ou d'erreurs. Veillez à utiliser 95% d'éthanol où noté. Il est commun pour palmitoyl carnitine pour précipiter hors de l'éthanol à 95% après décongélation du stock congelé, provoquant ainsi une grande variabilité. Assurez-vous de réchauffer le palmitoyl carnitine stock et vortex bien avant de l'utiliser. En outre, un pyruvate / résultat d'analyse malate très variable peut être dû à la pyruvate de stock être> 2 semaines. Soyez sûr de refaire aliquotes congelées de pyruvate toutes les 2 semaines. La série de tests a été modifié à des mesures de 2 minutes pour assurer plateaux mitochondriales de l'Etat. Si l'observation de l'épuisement des ADP est souhaitée, le chercheur peutprolonger la durée de la mesure dans l'onglet "Protocole" dans le cadre du forum "Assistant Assay". Enfin, une grande variabilité se produit lorsque le stock et les mitochondries mitochondrial ainsi substrat solutions ne sont pas entièrement homogénéisés avant le chargement. Si la variabilité entre les puits est élevé après la série de tests, assurez-vous de mélanger complètement la solution de substrat avant l'expérience suivante. Jamais vortex les solutions mitochondries / substrat, plutôt remuer, purée, et triturer doucement avec un orifice de l'embout de pipette élargie.
Il ya quelques limites de cette technique qui sont à noter. Tout d'abord, le nombre de puits sur la plaque de culture cellulaire utilisé pour ces essais est relativement faible (par exemple., 24 puits et au moins deux désignée pour puits à blanc). Si l'on souhaite effectuer toutes 5 de ces essais sur une plaque, le chercheur est seulement capable d'examiner les réponses d'une souris à la fois. Toutefois, il convient de noter que 96 les instruments et sont disponibles pour higher débit. Deuxièmement, il ya des points forts et des faiblesses inhérentes à l'évaluation de la dysfonction mitochondriale dans les mitochondries isolées par rapport à 1 dans des cellules intactes. Certaines faiblesses comprennent ayant moins pertinence physiologique par rapport à des cellules intactes et induisant des artefacts provenant du processus d'isolement. Enfin, le succès de cette méthode est tributaire de la qualité du processus d'isolement mitochondrial.
Bien que certains de ces essais ont été soit développé dans les différents systèmes ou ont été validées dans d'autres modèles animaux, les méthodes présentées ici sont le premier à synthétiser tous les tests mentionnés ci-dessus pour l'utilisation optimale dans un environnement multi-bien la machine de mesure de la consommation d'oxygène en utilisant la souris Muscle squelettique. Surtout, tous ces 5 analyses peuvent être effectuées avec la quantité de mitochondries isolées à partir de ~ 75 – 100 mg de muscle squelettique de souris, fournissant ainsi un débit élevé de matière minimale. D'une grande importance, la capacité de multi-puitstechnologies de consommation d'oxygène pour effectuer des essais avec des quantités minimales de mitochondries, combiné avec un procédé d'isolation optimisée, permet au chercheur d'effectuer une multitude d'autres expériences avec le reste du tissu de muscle squelettique (par exemple., des Western blots, RT-PCR, des essais enzymatiques, etc.), ce qui est souvent une lutte avec ce modèle animal.
En conclusion, les méthodes présentées ici fournissent des instructions étape-par-étape pour la performance d'une collection de microplaques basé dosages respirométriques utilisant des quantités minimales de muscle squelettique de souris. Surtout, les méthodes présentées nécessitent des quantités minimes de tissus et les mitochondries. Une fois maîtrisé, les techniques décrites ici permettront aux chercheurs de déterminer un mécanisme potentiel d'un produit composé ou d'un gène sur la consommation mitochondriale d'oxygène dans un modèle animal couramment utilisé.
The authors have nothing to disclose.
The Fralin Life Science Research Institute and The Metabolic Phenotyping Core at Virginia Tech supported this work.
Sucrose | Sigma Aldrich | S7903 | Store at room temperature |
D-Mannitol | Sigma Aldrich | 63559 | Store at room temperature |
Potassium phosphate monobasic, minimum 99.0% | Sigma Aldrich | P5379 | Store at room temperature |
Magnesium chloride hexahydrate, ACS reagent, 99.0-102.0% | Sigma Aldrich | M9272 | Store at room temperature |
HEPES minimum 99.5% titration | Sigma Aldrich | H3375 | Store at room temperature |
EGTA | Sigma Aldrich | E4378 | Store at room temperature |
Essentially Fatty | Sigma Aldrich | A6003 | Store at 4°C |
Acid Free- BSA | |||
Pyruvic Acid, 98% | Sigma Aldrich | 107360 | Store at 4°C |
Succinic Acid | Sigma Aldrich | S9512 | Store at room temperature |
L(-) Malic Acid, BioXtra, ≥95% | Sigma Aldrich | M6413 | Store at room temperature |
L-Glutamic acid | Sigma Aldrich | G1251 | Store at room temperature |
N,N,N′,N′-Tetramethyl-p-phenylenediamine | Sigma Aldrich | T7394 | Store at room temperature |
99%, powder [TMPD] | |||
Palmitoyl L-carnitine chloride | Sigma Aldrich | P1645 | Store at -20°C |
Oligomycin A, ≥ 95% (HPLC) | Sigma Aldrich | 75351 | Store at -20°C |
Carbonyl cyanide 4-(trifluoromethoxy) | Sigma Aldrich | C2920 | Store at 2-8°C |
phenylhydrazone | |||
≥98% (TLC), powder [FCCP] | |||
Antimycin A from streptomyces sp. | Sigma Aldrich | A8674 | Store at -20°C |
Adenosine 5′-diphosphate monopotassium salt dehydrate [ADP] | Sigma Aldrich | A5285 | Store at -20°C |
Rotenone | Sigma Aldrich | R8875 | Store at room temperature |
Pierce™ BCA Protein Assay Kit | Thermo Scientific | 23225 | N/A |