The zebra finch (Taeniopygiaguttata) is a valuable model organism; however, early stages of zebra finch development have not been extensively studied. The protocol describes how to dissect early embryos for developmental and molecular applications.
Zebra Finch (Taeniopygia Guttata) становится все более важным модельным организмом во многих областях исследований, включая токсикологии 1, 2, 3, поведения и памяти и обучения 4,5,6. Как единственный певчих птиц с геномом, последовательность, Zebra Finch имеет большой потенциал для использования в исследованиях развития; Однако на ранних этапах развития Zebra Finch не были хорошо изучены. Отсутствие исследований в развитии Zebra Finch можно отнести к сложности рассекает небольшой яйцо и эмбрион. Следующий метод рассечения минимизирует эмбриональных повреждения тканей, что позволяет для исследования морфологии и экспрессии генов на всех этапах эмбрионального развития. Это позволяет как яркий поле и качество флуоресцентных изображений эмбрионов, использовать в молекулярных процедур, таких как в гибридизация (МОГ), пролиферации клеток анализов и экстракции РНК для количественного анализа, таких как количественного Рил-тайм ПЦР (qtRT-ПЦР). Эта техника позволяет исследователям изучать ранние этапы развития, которые ранее были труднодоступными.
Общая цель этой техники является получение Zebra Finch (Taeniopygia Guttata) эмбрионы из самых ранних стадиях эмбриогенеза для использования в широком диапазоне исследований развития. Zebra Finch стали преобладающим певчая птица модель организма и широко используются в различных областях, в том числе токсикологии 1,2, поведение 3, памяти и обучения 4,5,6, сравнительный нейроанатомию 7,8 и развития языка 9,10 . Как единственный певчих птиц с геномом, последовательность, Zebra Finch позволяет молекулярной и генетической изучение порядка Passeriformes, которая представляет более 50% известных видов птиц 11, 12,13.
Несмотря на использование взрослых и несовершеннолетних Zebra Finch в разнообразных областях, несколько исследования были проведены на эмбрионах Zebra Finch, особенно на ранних стадиях развития. Это может быть связано с небольшим размером их яиц вй эмбрионы, и их новое положение в качестве модельного организма 14,15,16 для исследований, в которых курица (Gallus Gallus Domesticus) ранее используемых в качестве преобладающей модели системы 17,18,19,20,21. Однако, как не-голосовых учащихся, куры не является подходящим модельной системой для изучения генетической основы вокального обучения, развития вокального обучения, наследственности, поведения, и ганглиев схемы корковой-базальной, участвующих в автомобильных обучения 10.
Важно отметить, что эмбрионы Zebra Finch гораздо более тонкий и более легко повредить, чем куриных эмбрионов во время вскрытия и молекулярной процедур. В частности, большая осторожность требуется при выполнении действия пермеабилизации на эмбрионах зяблик зебры. Сильные моющие средства и ферменты, которые не будут вредить куриного эмбриона может привести к повреждению эмбрионов Финч зебры. С точки зрения общего ухода, необходимо поставить Zebra Finch яйца в маленьких чашках перед размещением в инкубаторечтобы предотвратить их от разрушения при прокатке в процессе инкубации.
Zebra Finch поддаются поведенческих исследований, легко и плодотворно размножаться круглый год в плену, и вокальные учащиеся. Эти характеристики позволяют использовать Zebra Finch, чтобы удовлетворить потребность в качестве модельного организма, которая интегрирует развитие, генетику, и поведенческие аспекты языка. Методы вскрытия подробно изложено ниже, в сочетании с недавно разработанной промежуточной руководства, характерные для Zebra Finch 22, сделать Zebra Finch более полезными стандартизированная модель развития организм. Однако получение эмбрионов на ранних стадиях может быть сложной. Этот протокол позволяет исследователям легко получить эмбрионов ранних стадий. Исследования следственные скорейшей разработке и молекулярную основу с развитием сложных поведения в Zebra Finch, или токсикологических последствий для развития в других малых, воробьиных птиц найдете эта методология рассечение полезно.
Последние разработки в эмбрионального руководства промежуточной 22 и генома аннотации сделать Zebra Finch желательно модельный организм для исследований развития. Тем не менее, небольшой размер и хрупкость эмбрионов Zebra Finch, которые варьируются от 3 до 7 мм в несколько этапов 1 – 10 22, может сделать вскрытия трудно 11, 14. Обнаружение и чисто удаления эмбрионов от поверхности желтка может оказаться непростой задачей. Этот протокол обеспечивает достаточно подробную информацию для выполнения процедуры с легкостью. Этот протокол демонстрирует важные шаги, которые не правило, известны, но которые необходимы для обеспечения успешного вскрытия. Например, важно, чтобы оставить небольшой слой желтка между эмбриона и листа вес бумаги, чтобы предотвратить прилипание.
Оба также выявление и удаление эмбриона может быть затруднено. Для устранения идентификации эмбрион на поверхности желтка, пролить свет непосредственно над желтка после егобыли удалены из яйца, и посмотреть на желтке под углом 45 °, чтобы найти эмбрион. После того, как эмбрион находится, вырезать желток на вес бумаги заботиться, чтобы не оторвать эмбрион.
Если дальнейшие приложения включают изображений для анатомических различий, в гибридизация, или пролиферации клеток анализов, важно, чтобы удалить желточной оболочки на стадии 1 – 8 22 для лучшей визуализации структур. Если возникли трудности при удалении желток или желточной оболочки на ранних стадиях, исправить эмбрион в 4% PFA до мытья его в 1X PBS, чтобы уменьшить эмбриональных хрупкость. По предварительного удаления желточной оболочки во время вскрытия, как описано, структуры четко видны и сохранности в эмбрионах зяблик зебры после выполнения в гибридизация.
Ограничение EDU является то, что администрация объемов лекарственных над 478 нл приводит к эмбриональной смертности. Однако подавляющее диапазон доз позволяет varyinУровни г пролиферативной пометки клеток.
"Щелчок" реакция используется в этом наборе является меди (I), катализируемой-Алкины-азид-циклоприсоединения (Cu (I) AAC). В данном конкретном реакции, алкин содержащих аналог тимидина молекула (EDU) включен в активно делящихся клеток. Группа алкина в ОБР выступает из спиральной структуры ДНК, и обнаруживается под воздействием молекулы азида, конъюгированного с зеленым флуоресцентным, молекулы, которые связываются с свободного алкина группы. Зеленая флуоресценция показывает недавно пролиферирующих клеток в эмбрионе. Био-ортогональность азида и алкиновые группы предотвращает неспецифическую окрашивание, потому что эти активные формы не естественным образом присутствуют в организме. Кроме того, поскольку ДНК не должны быть денатурированный для того, чтобы протекания реакции, далее ДНК-зависимой анализ может быть легко выполнена 27.
Естественное ограничение этого метода является небольшой размер и фрагментСОСТОЯНИЯ эмбрионов зяблик зебры. Удаление желточной оболочки эмбрионов стадии 1 – 15 22 может привести к повреждению эмбриональных структур, если не выполняется с осторожностью. Тем не менее, этот протокол упрощает метод вскрытия, что позволяет исследователям использовать ранние эмбриональные стадии изучить структурные аномалии и экспрессию генов, которые не были ранее изучены в глубину. Этот протокол открывает путь для множества сотовых молекулярной анализов, которые позволят исследователям определить происхождение развития взрослых фенотипов. Например, можно будет изучить экспрессию генов вовлечены в вокальной обучения в различных условиях окружающей среды или после фармакологическое лечение на самых ранних стадиях развития 28 29,30,31. Хотя это и не показано в этой работе, этот метод позволяет потенциально для других процедур, таких как радиоактивные в гибридизация Zebra Finch на срезах тканей и электропорацию / в OVо хирургии 32, 33,34. Учитывая, что Zebra Finch был создан в качестве важного модельного организма в пределах огромного объема литературы, такие исследования дают неиспользованные возможности связать механизмы развития со взрослой физиологии и поведения, в частности, развития языка 7, 9.
The authors have nothing to disclose.
Авторы благодарят своих источников финансирования, программу в колледже Уильяма и Мэри Медицинского института Говарда Хьюза Бакалавриат Научное образование; Спонсор Грант: NIH (MSS); Число Грант: R15NS067566. Они также признают, поддержку со стороны колледжа Уильяма и Мэри, биологический факультет и колледж искусств и наук об оказании помощи в уходе за животными.
Chicken egg incubator | We use a Picture Window Hova-Bator Incubator, Circulated Air Model | ||
Click-iT EdU Alexa Fluor 488 Imaging kit | Invitrogen | C10337 | Detection of cell proliferation. |
Dissection microscope | We use Olympus SZ61 | ||
7'' Drummond capillary for Nanoject II injector | Drummond | 3-00-203-G/X | |
Drummond Nanoject II microinjector | Drummond | ||
Dumont Tweezers #55 | World Precision Instruments | 14099 | |
Ethanol (EtOH) | |||
50mL Falcon tube (polypropylene) | Fisher Scientific | 06-443-18 | |
FastPrep Lysis Matrix H tubes | MP biomedicals | 6917-100 | Used for RNA extraction, used to homogenize embryos |
Fiber optic illuminator lamps (High Intensity Illuminator) | Dolan-Jenner Industries | Fiber-Lite MI-150 | |
Glass vials with screw cap (DEPC treated) | Fisher Scientific | 03-338A | |
Microcentrifuge eppe tube (1.5 mL) | Fisher Scientific | 05-408-129 | |
Mineral oil | Sigma-Aldrich | M-8410 | |
Modeling Clay | Any brand | ||
Narshige PB-7 needle puller | Narshige | ||
Omni Bead Ruptor Homogenizer | OMNI International | 19-010 | Used for RNA extraction |
4% Paraformaldehyde (4% PFA): 20 mL 8% PFA (32g paraformaldehyde, 350mL sdd H2O, adjust pH to 7.6, 400mL sdd H2O), 20mL 2xPBS | Fixation of embryos. Caution, is harmful and do not inhale. | ||
Phosphate buffered saline (1xPBS): 200mL 10X PBS, 1800 mL Barnstead H2O, adjust pH to 7.4 | |||
Phosphate buffered saline (10xPBS): 800mL Barnstead, 2.013g KCL, 80.063g NaCl, 2.722g KH2PO4 monobasic, 14.196g Na2HPO4 dibasic, 200mL Barnstead H2O, adjust pH to 6.5 | |||
Phosphate buffered saline with 0.1% Tween-20 (1xPTw): 1800mL Barnstead H2O, 200mL 10X PBS, adjust pH to 7.4, 2mL Tween-20 | |||
35mL Plastic petri dish | Fisher Scientific | 08-757-100A | |
plastic wrap | Any brand | ||
Prepease RNA Spin Kit | PrepEase, Affymetrix | 78766 1 KT | Used for RNA extraction, used to homogenize embryos |
Reaction Mix: 875μL 1xPBS, 100mM 20μL CuSO4 (Kit Component E), 5μL Alexa Fluor 488 azide (Kit Component B), 100μL diluted reaction buffer additive (Kit Component F) | Invitrogen | C10337 | Detection of cell proliferation. |
sdd H2O | |||
Seed cup | We use it as a container when incubating eggs | ||
Stainless steel scalpel | |||
Standard nest box | We use Abba Plastic Finch Nestboxes | ||
4mL, Teflon Lined Cap, Glass Vials | Fisher Scientific | 02-912-352 | |
Transfer pipettes (polyethylene) | Fisher Scientific | 13-711-7M | |
4×4 weigh paper | Fisher Scientific | 09-898-12B |