The zebra finch (Taeniopygiaguttata) is a valuable model organism; however, early stages of zebra finch development have not been extensively studied. The protocol describes how to dissect early embryos for developmental and molecular applications.
פינק הזברה (guttata Taeniopygia) הפך אורגניזם מודל חשוב יותר ויותר בתחומים רבים של מחקר, כולל רעלים 1, 2, 3 התנהגות, וזיכרון ולמידת 4,5,6. כציפור השיר רק עם הגנום רצף, יש פינק הזברה פוטנציאל גדול לשימוש במחקרים התפתחותיים; עם זאת, מוקדם של פיתוח פינק זברה השלבים לא נחקרו היטב. היעדר המחקר בפיתוח פינק זברה ניתן לייחס את הקושי שלו לנתח את הביצה הקטנה ועובר. השיטה לנתיחה הבאה ממזערת את ניזק לרקמות עוברית, המאפשר חקירה של מורפולוגיה וביטוי גנים בכל שלבי התפתחות עוברית. זה מאפשר גם שדה בהיר והדמיה באיכות הקרינה של עוברים, השתמש בהליכים מולקולריים כגון הכלאה באתרו (ISH), מבחני התפשטות תאים, ומיצוי RNA למבחנים כמותיים כגון ריאה כמותייםl-Time PCR (qtRT-PCR). טכניקה זו מאפשרת לחוקרים ללמוד שלבים מוקדמים של פיתוח, שהיו קשה בעבר לגישה.
המטרה הכללית של טכניקה זו היא להשיג פינק זברה עוברים (guttata Taeniopygia) החל מהשלבים המוקדמים של עובר לשימוש במגוון רחב של מחקרים התפתחותיים. זברה פינק הפכו אורגניזם מודל ציפור שיר הדומיננטי והיה בשימוש נרחב במגוון תחומים, ובם רעלים 1,2, התנהגות 3, זיכרון ולמידת 4,5,6, neuroanatomy ההשוואתי 7,8, והתפתחות שפת 9,10 . כציפור השיר רק עם הגנום רצף, פינק הזברה מאפשר מחקר מולקולרי והגנטי של סדר הציפורי השיר, אשר מייצג מעל 50% ממיני ציפורים ידועים 11, 12,13.
למרות השימוש במבוגרים ופנקו זברה לנוער במגוון רחב של תחומים, כמה מחקרים שבוצעו בעוברים פינק זברה, במיוחד בשלבים מוקדמים של פיתוח. זו ניתן לייחס לגודל הקטן של הביצים שלהםnd עוברים, והמעמד החדש שלהם כ14,15,16 אורגניזם מודל למחקרים בהם את העוף (Gallus Gallus domesticus) שימש בעבר כ17,18,19,20,21 מערכת מודל דומיננטית. עם זאת, כלומדים שאינם קולניים, תרנגולות אינן מערכת מודל מתאימה ללימוד הבסיס הגנטי של למידה ווקאלית, פיתוח של למידה ווקאלית, תורשתיות, התנהגות, ומעגלי הגרעינים הבזליים-קליפת המוח המעורב בלמידה מוטורית 10.
חשוב לציין כי עוברים פינק זברה הם הרבה יותר עדין ויותר בקלות נפגע מעובר חומוס במהלך נתיחה ונהלים מולקולריים. בפרט, נדרשת זהירות רבה יותר בעת ביצוע פעולות permeabilization על עוברים פינק זברה. דטרגנטים חזקים ואנזימים שלא יפגעו עובר אפרוח יכולים לפגוע בעוברים פינק זברה. במונחים של טיפול באופן כללי, יש צורך לשים את הביצים פינק זברה בכוסות קטנות לפני ההשמה בחממהכדי למנוע מהם לפרוץ כאשר מתגלגלים במהלך דגירה.
זברה פינק נוחות למחקרים התנהגותיים, בקלות ובשטף גדול מתרבים בכל ימות שנה בשבי, והם לומדים ווקאלי. מאפיינים אלו מאפשרים את השימוש של פינק זברה כדי לענות על הצורך לאורגניזם מודל המשלב פיתוח, גנטיקה, והיבטים התנהגותיים של שפה. ניתוחי שיטות, כמפורט להלן, בשילוב עם מדריך הזמני שפותח לאחרונה ספציפי לפנק זברה 22, להפיק את פינק הזברה אורגניזם מודל ההתפתחותי סטנדרטי שימושי יותר ויותר. עם זאת, קבלת עוברים בשלבים מוקדמים יכולה להיות מרתיעה. פרוטוקול זה מאפשר לחוקרים לקבל עוברים בראשית התפתחות בקלות. מחקרים חוקרים את ההתפתחות המוקדמת ואת הבסיס ההתפתחותי המולקולרי של התנהגויות מורכבות בפנקו זברה, או את השפעות טוקסיקולוגי בפיתוח בקטן אחרים, ציפורים passerine ימצאו המתודולוגיה לנתיחה זה שימושי.
פיתוח אחרונים של מדריך עובריים בימוי 22 וביאור הגנום לעשות פינק הזברה אורגניזם מודל רצוי למחקרים התפתחותיים. עם זאת, בגודל ושבריריות הקטן של העוברים פינק זברה, אשר נעו מ 3 עד 7 מ"מ בשלבי 1 – 10 22, יכולים לעשות והניתוחים קשים 11, 14. איתור והסרה נקיה עוברים מפני שטח של החלמון יכול להיות מאתגר. פרוטוקול זה מספק פירוט מספיק כדי לבצע את ההליך בקלות. פרוטוקול זה מדגים את השלבים הקריטיים, כי הם בדרך כלל לא ידועים, אך נחוצים כדי להבטיח לנתיחה מוצלחת. לדוגמא, זה הכרחי כדי להשאיר שכבה קטנה של חלמון בין העובר והגיליון לשקול נייר כדי למנוע דבק.
שני זיהוי וההסרה של העובר יכולים להיות קשים. כדי לפתור זיהוי העובר על פני השטח של החלמון, להאיר ישירות מעל החלמון אחרי זה ישהוסר מהביצה, ולהסתכל על החלמון בזווית של ° 45 למצוא את העובר. ברגע שהעובר נמצא, לחתוך את החלמון בשוקל נייר נזהר שלא לקרוע את העובר.
אם יישומים נוספים כוללים הדמיה להבדלים אנטומיים, הכלאה באתר, או מבחני התפשטות תאים, חשוב להסיר את קרום vitelline בשלב 1 – 8 22 להדמיה טובה יותר של מבנים. אם נתקל בקשיים בעת הסרת החלמון או קרום vitelline בשלבים מוקדמים, לתקן את העובר בPFA 4% לפני שטיפה ב1X PBS להפחתת שבירות עוברית. על ידי הסרת ראשונה קרום vitelline במהלך הנתיחה כפי שתואר, מבנים גלויים לעין וללא שינוי בעוברים פינק זברה לאחר ביצוע הכלאה באתרו.
הגבלה של edu היא ממשל שכרכי מינון מעל 478 מוביל NL הרוג עוברי. עם זאת, טווח המינון העצום מאפשר varyinרמות גרם של תיוג תא שגשוג.
התגובה "לחץ" בשימוש בערכה זו היא הנחושת (AAC Cu (I)) (I) האיץ-alkyne-תזיד-cycloaddition. בתגובה הספציפית הזה, מולקולה אנלוגית תימידין המכיל alkyne (edu) משולבת באופן פעיל על ידי חלוקת תאים. קבוצת alkyne בedu בולטת החוצה ממבנה הסליל של ה-DNA, והוא זוהה על ידי חשיפה למולקולה אזיד מצומד למולקולה ירוקה, ניאון אשר נקשר לקבוצת alkyne בחינם. הקרינה הירוקה מראה תאים מתרבים לאחרונה בעובר. יו orthogonality של אזיד והקבוצות alkyne מונעים כתמים שאינם ספציפיים, כי מינים תגובתי אלה אינם נוכחים באופן טבעי ביצורים. כמו כן, כי ה-DNA לא צריך להיות מפוגל על מנת שהתגובה להתרחש, ניתוח ה-DNA תלוי נוסף יכול להיות מבוצע 27 בקלות.
מגבלה המובנית של שיטה זו היא בגודל הקטן וFragility של עוברים פינק זברה. הסרת קרום vitelline של עוברים בשלבים 1 – 15 22 יכול לגרום למבנים עובריים מזיקים אם אינו מבוצע בזהירות. עם זאת, פרוטוקול זה מפשט את השיטה לנתיחה, ומאפשר לחוקרים להשתמש בשלבים עובריים מוקדם לבחון אנומליות מבנית וביטוי גנים שלא נחקר בעבר בעומק. פרוטוקול זה מפותח את הדרך לשפע של מבחני סלולריים מולקולריים שיאפשר לחוקרים לקבוע את מקורותיה ההתפתחותי של פנוטיפים מבוגרים. לדוגמא, ניתן יהיה לבחון ביטוי גנים מעורב בלמידה ווקאלית בתנאים סביבתיים שונים או בעקבות טיפולים תרופתיים בשלבים המוקדמים של פיתוח 28, 29,30,31. למרות שלא הפגין במאמר זה, בשיטה זו פוטנציאל המאפשרת להליכים אחרים כגון רדיואקטיביים הכלאה באתרו על סעיפי זברה פינק רקמות וelectroporation / באובניתוח o 32, 33,34. בהתחשב בכך שפנק הזברה כבר נקבע כאורגניזם מודל חשוב בתוך גוף עצום של ספרות, במחקרים מסוג הזדמנויות שלא נוצל לקשר מנגנוני התפתחות בפיזיולוגיה והתנהגות בוגרים, בפרט התפתחות השפה 7, 9.
The authors have nothing to disclose.
המחברים מודים למקורות המימון שלהם, תכנית הווארד יוז הרפואי במכון לתואר ראשון מדע חינוך למכללת ויליאם ומרי; נותן חסות לגרנט: NIH (MSS); מספר גרנט: R15NS067566. הם גם מכירים תמיכה ממכללת ויליאם ומרי, החוג לביולוגיה במכללה לאמנויות ומדעים לקבלת סיוע בטיפול בבעלי חיים.
Chicken egg incubator | We use a Picture Window Hova-Bator Incubator, Circulated Air Model | ||
Click-iT EdU Alexa Fluor 488 Imaging kit | Invitrogen | C10337 | Detection of cell proliferation. |
Dissection microscope | We use Olympus SZ61 | ||
7'' Drummond capillary for Nanoject II injector | Drummond | 3-00-203-G/X | |
Drummond Nanoject II microinjector | Drummond | ||
Dumont Tweezers #55 | World Precision Instruments | 14099 | |
Ethanol (EtOH) | |||
50mL Falcon tube (polypropylene) | Fisher Scientific | 06-443-18 | |
FastPrep Lysis Matrix H tubes | MP biomedicals | 6917-100 | Used for RNA extraction, used to homogenize embryos |
Fiber optic illuminator lamps (High Intensity Illuminator) | Dolan-Jenner Industries | Fiber-Lite MI-150 | |
Glass vials with screw cap (DEPC treated) | Fisher Scientific | 03-338A | |
Microcentrifuge eppe tube (1.5 mL) | Fisher Scientific | 05-408-129 | |
Mineral oil | Sigma-Aldrich | M-8410 | |
Modeling Clay | Any brand | ||
Narshige PB-7 needle puller | Narshige | ||
Omni Bead Ruptor Homogenizer | OMNI International | 19-010 | Used for RNA extraction |
4% Paraformaldehyde (4% PFA): 20 mL 8% PFA (32g paraformaldehyde, 350mL sdd H2O, adjust pH to 7.6, 400mL sdd H2O), 20mL 2xPBS | Fixation of embryos. Caution, is harmful and do not inhale. | ||
Phosphate buffered saline (1xPBS): 200mL 10X PBS, 1800 mL Barnstead H2O, adjust pH to 7.4 | |||
Phosphate buffered saline (10xPBS): 800mL Barnstead, 2.013g KCL, 80.063g NaCl, 2.722g KH2PO4 monobasic, 14.196g Na2HPO4 dibasic, 200mL Barnstead H2O, adjust pH to 6.5 | |||
Phosphate buffered saline with 0.1% Tween-20 (1xPTw): 1800mL Barnstead H2O, 200mL 10X PBS, adjust pH to 7.4, 2mL Tween-20 | |||
35mL Plastic petri dish | Fisher Scientific | 08-757-100A | |
plastic wrap | Any brand | ||
Prepease RNA Spin Kit | PrepEase, Affymetrix | 78766 1 KT | Used for RNA extraction, used to homogenize embryos |
Reaction Mix: 875μL 1xPBS, 100mM 20μL CuSO4 (Kit Component E), 5μL Alexa Fluor 488 azide (Kit Component B), 100μL diluted reaction buffer additive (Kit Component F) | Invitrogen | C10337 | Detection of cell proliferation. |
sdd H2O | |||
Seed cup | We use it as a container when incubating eggs | ||
Stainless steel scalpel | |||
Standard nest box | We use Abba Plastic Finch Nestboxes | ||
4mL, Teflon Lined Cap, Glass Vials | Fisher Scientific | 02-912-352 | |
Transfer pipettes (polyethylene) | Fisher Scientific | 13-711-7M | |
4×4 weigh paper | Fisher Scientific | 09-898-12B |