The zebra finch (Taeniopygiaguttata) is a valuable model organism; however, early stages of zebra finch development have not been extensively studied. The protocol describes how to dissect early embryos for developmental and molecular applications.
De zebravink (Taeniopygia guttata) is uitgegroeid tot een steeds belangrijker modelorganisme in vele gebieden van onderzoek, waaronder toxicologie 1, 2, 3 gedrag, en het geheugen en het leren 4,5,6. Als enige zangvogel met een gesequenced genoom, de zebravink heeft een groot potentieel voor gebruik in ontwikkelingsstudies; echter, de vroege stadia van ontwikkeling zebravink niet goed bestudeerd. Gebrek aan onderzoek in zebravink ontwikkeling kan worden toegeschreven aan de moeilijkheid van het ontleden van de kleine ei en embryo. De volgende dissectie methode kunnen embryonaal weefsel schade, die zorgt voor het onderzoek van de morfologie en genexpressie in alle stadia van embryonale ontwikkeling. Dit kan zowel helderveld en fluorescentie beeldvorming van kwaliteit embryo, gebruiken moleculaire procedures zoals in situ hybridisatie (ISH), celproliferatie assays en RNA-extractie voor kwantitatieve assays zoals kwantitatieve real-time PCR (qtRT-PCR). Deze techniek kunnen onderzoekers de vroege stadia van ontwikkeling die voorheen moeilijk toegankelijk waren studeren.
Het algemene doel van deze techniek is om zebravink (Taeniopygia guttata) embryo's te verkrijgen vanaf de vroegste stadia van de embryogenese voor gebruik in een breed scala van ontwikkelingsstudies. Zebravinken zijn geworden van de overheersende zangvogel modelorganisme en zijn uitgebreid gebruikt in een verscheidenheid van terreinen, waaronder toxicologie 1,2, gedrag 3, het geheugen en het leren 4,5,6, vergelijkende neuroanatomie 7,8 en taalontwikkeling 9,10 . Als enige zangvogel met een gesequenced genoom, de zebravink maakt moleculaire en genetische studie van de Passeriformes orde, die meer dan 50% van de gekende vogelsoorten 11, 12,13 vertegenwoordigt.
Ondanks het gebruik van volwassen en jonge zebravink in een uiteenlopende reeks van gebieden, hebben weinig studies zijn uitgevoerd op zebravinken embryo's, met name tijdens de vroege stadia van ontwikkeling. Dit kan worden toegeschreven aan de geringe omvang van de eieren eennd embryo en de nieuwere status als modelorganisme 14,15,16 voor studies waarin de kip (Gallus gallus domesticus) eerder als overheersende modelsysteem 17,18,19,20,21. Echter, als niet-vocale leerlingen, kippen zijn niet geschikt modelsysteem voor het bestuderen van de genetische basis van vocale leren, ontwikkeling van de vocale leren, erfelijkheid, gedrag, en de corticale-basale ganglia circuits betrokken bij motorische leren 10.
Het is belangrijk op te merken dat de zebravink embryo's zijn veel gevoeliger en gemakkelijker beschadigd dan kippenembryo's tijdens dissectie en moleculaire procedures. In het bijzonder wordt een grotere zorgvuldigheid vereist bij het uitvoeren van permeabilization stappen op zebravink embryo's. Sterke reinigingsmiddelen en enzymen die niet schadelijk zou een kippenembryo kan zebravinken embryo beschadigen. In termen van algemene zorg, is het noodzakelijk om zebravink eieren in kleine kopjes in een incubator gebracht vóór plaatsingom te voorkomen dat ze breken bij het rollen tijdens incubatie.
Zebravink vatbaar zijn voor gedragsonderzoek, het hele jaar door in gevangenschap gemakkelijk en vruchtbaar ras, en zijn vocale leerlingen. Deze kenmerken maken het gebruik van zebravink tot de noodzaak van een modelorganisme dat ontwikkeling, genetica, en gedragsmatige aspecten van taal integreert pakken. De dissecties methoden hieronder beschreven, in combinatie met een recent ontwikkelde enscenering gids specifiek voor zebravinken 22, maken de zebravink een steeds nuttig gestandaardiseerde ontwikkelings modelorganisme. Echter, het verkrijgen van embryo's in een vroeg stadium kan ontmoedigend zijn. Dit protocol kunnen onderzoekers vroeg stadium embryo gemakkelijk te verkrijgen. Studies die de vroege ontwikkeling en de moleculaire ontwikkelingsbiologie basis van complexe gedragingen in zebravinken, of de toxicologische effecten op de ontwikkeling in andere kleine, zal zangvogels vinden dit dissectie methode bruikbaar.
Recente ontwikkeling van een embryologische enscenering gids 22 en genoomannotatie maken de zebravink een wenselijke modelorganisme voor ontwikkelingsstudies. Echter, de geringe omvang en de kwetsbaarheid van de zebravink embryo's, die variëren van 3 tot 7 mm in stappen 1 – kan 10 22, dissecties moeilijk 11, 14 maken. Lokaliseren en schoon verwijderen van embryo's van het oppervlak van de dooier kan een uitdaging zijn. Dit protocol biedt voldoende gedetailleerd zijn om de procedure uit te voeren met gemak. Dit protocol toont de kritische stappen die niet bekend staat, maar zijn noodzakelijk om een succesvolle dissectie waarborgen. Zo is het essentieel om een laagje eigeel tussen het embryo en vel papier wegen uit te sluiten plakken verlaten.
Zowel de identificatie en verwijdering van het embryo kan moeilijk zijn. Om problemen met het identificeren van de embryo op het oppervlak van de dooier, schijnen licht direct boven de dooier nadat zijverwijderd uit het ei, en kijk naar de dooier op een 45 ° hoek met de embryo vinden. Zodra het embryo ligt, snijd de dooier op weeg papier en zorg ervoor dat niet scheurt het embryo.
Als verdere toepassingen omvatten imaging anatomische verschillen, in situ hybridisatie of celproliferatie assays, is het belangrijk om de vitelline membraan te verwijderen in fase 1-8 22 voor een betere visualisatie van structuren. Als moeilijkheden ondervindt bij het verwijderen van de dooier of het vitelline membraan in een vroeg stadium, bevestig de embryo in 4% PFA vóór het wassen in 1X PBS om embryonale kwetsbaarheid te verminderen. Door eerst de vitelline membraan tijdens dissectie zoals beschreven, structuren zijn duidelijk zichtbaar en intact in zebravink embryo's na het uitvoeren van een in situ hybridisatie.
Een beperking van Edu is dat toediening van de dosering volumes meer dan 478 nl leidt tot embryonale fataliteit. Echter, de overgrote doseringstraject laat varying niveaus van proliferatieve cel tagging.
De "klik" reactie die in deze kit is de Koper (I)-gekatalyseerde-Alkyn-azide-Cycloadditiereacties (Cu (I) AAC). In dit specifieke reactie, is een-alkyn bevattende thymidine analoog molecuul (EDU) opgenomen door actief delende cellen. De alkyn groep in de EDU uitsteekt uit de helixstructuur van het DNA, en wordt gedetecteerd door blootstelling aan een azide molecuul geconjugeerd aan een groen, fluorescent molecuul dat bindt aan het vrije alkyn groep. De groene fluorescentie geeft de nieuw prolifererende cellen in de embryo. De bio-orthogonaliteit van het azide en alkyn groepen voorkomt niet-specifieke kleuring, omdat deze reactieve soorten niet van nature aanwezig in organismen. Ook, omdat het DNA niet te worden gedenatureerd zodat de reactie optreedt, kan verder DNA-afhankelijke analyse gemakkelijk uitgevoerd 27.
Een inherente beperking van deze werkwijze is de geringe omvang en fragiliteit van zebravink embryo's. Het verwijderen van de vitelline membraan van embryo stadia 1-15 22 kan leiden tot schadelijke embryonale structuren wanneer niet met de nodige voorzichtigheid. Echter, dit protocol vereenvoudigt de uitsnijmethode, waardoor onderzoekers vroege embryonale stadia om structurele afwijkingen en genexpressie die niet eerder bestudeerd onderzoeken. Dit protocol maakt de weg vrij voor een overvloed van cellulaire-moleculaire testen waarmee de onderzoekers om de ontwikkelingsdoelen oorsprong van volwassen fenotypes te bepalen. Zo zal het mogelijk zijn onderzocht genexpressie betrokken bij oefendoeleinden onder verschillende omgevingscondities of volgende farmacologische behandelingen in de eerste ontwikkelingsfase 28, 29,30,31. Hoewel niet aangetoond in dit artikel, deze methode mogelijk maakt voor andere procedures, zoals radioactieve in situ hybridisatie op zebravink weefsel secties en elektroporatie / in ovo operatie 32, 33,34. Gezien het feit dat de zebravink is opgericht als een belangrijk modelorganisme in een enorme hoeveelheid literatuur, zoals studies onbenutte kansen om ontwikkelingsstoornissen mechanismen koppelen met volwassen fysiologie en gedrag, in het bijzonder de ontwikkeling van taal 7, 9.
The authors have nothing to disclose.
De auteurs danken hun financieringsbronnen, Howard Hughes Medical Institute Undergraduate Science Education Program aan de Universiteit van William en Mary; Grant sponsor: NIH (MSS); Grant nummer: R15NS067566. Ze steun van het College of William and Mary, Departement Biologie en Hogeschool voor de Kunsten en Wetenschappen voor hulp bij de verzorging van dieren ook erkennen.
Chicken egg incubator | We use a Picture Window Hova-Bator Incubator, Circulated Air Model | ||
Click-iT EdU Alexa Fluor 488 Imaging kit | Invitrogen | C10337 | Detection of cell proliferation. |
Dissection microscope | We use Olympus SZ61 | ||
7'' Drummond capillary for Nanoject II injector | Drummond | 3-00-203-G/X | |
Drummond Nanoject II microinjector | Drummond | ||
Dumont Tweezers #55 | World Precision Instruments | 14099 | |
Ethanol (EtOH) | |||
50mL Falcon tube (polypropylene) | Fisher Scientific | 06-443-18 | |
FastPrep Lysis Matrix H tubes | MP biomedicals | 6917-100 | Used for RNA extraction, used to homogenize embryos |
Fiber optic illuminator lamps (High Intensity Illuminator) | Dolan-Jenner Industries | Fiber-Lite MI-150 | |
Glass vials with screw cap (DEPC treated) | Fisher Scientific | 03-338A | |
Microcentrifuge eppe tube (1.5 mL) | Fisher Scientific | 05-408-129 | |
Mineral oil | Sigma-Aldrich | M-8410 | |
Modeling Clay | Any brand | ||
Narshige PB-7 needle puller | Narshige | ||
Omni Bead Ruptor Homogenizer | OMNI International | 19-010 | Used for RNA extraction |
4% Paraformaldehyde (4% PFA): 20 mL 8% PFA (32g paraformaldehyde, 350mL sdd H2O, adjust pH to 7.6, 400mL sdd H2O), 20mL 2xPBS | Fixation of embryos. Caution, is harmful and do not inhale. | ||
Phosphate buffered saline (1xPBS): 200mL 10X PBS, 1800 mL Barnstead H2O, adjust pH to 7.4 | |||
Phosphate buffered saline (10xPBS): 800mL Barnstead, 2.013g KCL, 80.063g NaCl, 2.722g KH2PO4 monobasic, 14.196g Na2HPO4 dibasic, 200mL Barnstead H2O, adjust pH to 6.5 | |||
Phosphate buffered saline with 0.1% Tween-20 (1xPTw): 1800mL Barnstead H2O, 200mL 10X PBS, adjust pH to 7.4, 2mL Tween-20 | |||
35mL Plastic petri dish | Fisher Scientific | 08-757-100A | |
plastic wrap | Any brand | ||
Prepease RNA Spin Kit | PrepEase, Affymetrix | 78766 1 KT | Used for RNA extraction, used to homogenize embryos |
Reaction Mix: 875μL 1xPBS, 100mM 20μL CuSO4 (Kit Component E), 5μL Alexa Fluor 488 azide (Kit Component B), 100μL diluted reaction buffer additive (Kit Component F) | Invitrogen | C10337 | Detection of cell proliferation. |
sdd H2O | |||
Seed cup | We use it as a container when incubating eggs | ||
Stainless steel scalpel | |||
Standard nest box | We use Abba Plastic Finch Nestboxes | ||
4mL, Teflon Lined Cap, Glass Vials | Fisher Scientific | 02-912-352 | |
Transfer pipettes (polyethylene) | Fisher Scientific | 13-711-7M | |
4×4 weigh paper | Fisher Scientific | 09-898-12B |