The analysis of skeletal muscle tissues to determine structural, functional, and biochemical properties is greatly facilitated by appropriate preparation. This protocol describes appropriate methods to prepare skeletal muscle tissue for a broad range of phenotyping studies.
Skeletspier is een uniek weefsel vanwege zijn structuur en functie, welke specifieke protocollen voor weefselverzameltoestel vereist om optimale resultaten te verkrijgen van functionele, cellulaire, moleculaire en pathologisch evaluaties. Door de subtiele pathologische afwijkingen gezien bij aangeboren spieraandoeningen en het potentieel voor fixatie interfereert met de opname van deze functies, pathologisch onderzoek van bevroren spier voorkeur vaste spier bij de beoordeling skeletspier van aangeboren spierziekte. Bovendien, het potentieel om ernstige bevriezing artefacten in de spieren produceren vereist specifieke voorzorgsmaatregelen bij het invriezen van skeletspieren voor histologisch onderzoek die niet vaak worden gebruikt bij het invriezen van andere weefsels. Dit manuscript beschrijft een protocol voor snel invriezen van de skeletspieren met behulp isopentaan (2-methylbutaan) gekoeld met vloeibare stikstof om optimale skeletspieren morfologie behouden. Deze procedure is ook effectief voor freezing weefsel bedoeld voor genetische of proteïne-expressie studies. Verder hebben we onze invriesprotocol geïntegreerd in een bredere procedure die beschrijft ook de voorkeur methoden voor de korte termijn triage weefsel voor (1) enkele vezel functionele studies en (2) myoblast celkweek, met een focus op de minimale inspanning die nodig is om te verzamelen weefsel en het vervoer naar gespecialiseerd onderzoek of verwijzing labs om deze studies te voltooien. Kortom, dit manuscript geeft een overzicht van hoe vers weefsel effectief kan worden verdeeld voor een verscheidenheid van fenotypische studies, en biedt zo standard operating procedures (SOP's) voor pathologische studies in verband met aangeboren spierziekte.
Skeletal muscle is a unique tissue because of its structure and function, which can present a number of challenges when evaluating its pathology. While it is sufficient, and often even optimal, to evaluate most tissues following formalin fixation and paraffin embedding, this process leads to the production of cell shrinkage artifacts that impair the evaluation of critical phenotypes in congenital muscle disease (including myofiber size and shape). Additionally, frozen muscle is required when performing many histochemical stains (including the reduced nicotinamide adenine dinucleotide (NADH), cytochrome oxidase (COX), succinate dehyrogenase (SDH), adenosine triphosphatase (ATPase), and Oil Red O stains) that are essential for the detection of specific pathological abnormalities required to diagnose a variety of congenital myopathies, mitochondrial myopathies, and storage diseases. Many antibodies and molecular tools used to characterize muscle morphology and function have consequently been developed and optimized only for frozen tissue, which further limits the usefulness of fixed tissue preparations in studies of skeletal muscle biology. As a result, it has become standard practice to freeze skeletal muscle specimens for most clinical and research indications in the field of congenital muscle disease, despite the technical challenges that appropriate freezing might pose.
The freezing of skeletal muscle can be technically challenging due to the high likelihood of ice crystal formation within myofibers when an inappropriate freezing protocol is followed1. In most cases, freezing artifacts are encountered when the water content of the tissue is too high or when the freezing process is too slow. The water content of tissue can be accidentally increased by immersion in fluid, such as transport of the muscle in saline; or freezing can be compromised if the tissue has been entirely immersed in OCT. Both of these procedures can lead to catastrophic freezing artifacts in muscle tissue. Additionally, a number of small missteps in the freezing process may cause slow freezing or accidental thawing of samples after appropriate freezing, and these issues can similarly complicate pathological evaluation.
As new models and treatments for skeletal muscle disease are developed, it will become increasingly useful to use standard operating procedures (SOPs) to evaluate skeletal muscle phenotypes and treatment efficacy. This is particularly important for the pathological evaluation of congenital muscle diseases, as the recognition of subtle phenotypes seen in many of these disorders can be impaired by improper tissue preparation. This report represents an effort by a Congenital Muscle Disease Consortium to establish a skeletal muscle freezing SOP for the study of congenital muscle disease models.
The protocol presented here describes a strategy used in our clinical and research labs to optimize assessment of frozen muscle pathology, while also being suitable for a variety of protein-based and genetic studies. Specific strategies to prepare skeletal muscle specimens for electron microscopy are also presented. Additionally, as single fiber functional testing of frozen tissue is possible2,3, experts in these techniques have provided details on optimal tissue handling protocols. Unfortunately, the isolation of myoblast cell lines cannot be effectively performed on pre-frozen tissue, so a strategy is presented herein for the short-term storage and transport of muscle tissue for myoblast culture establishment at outside laboratories. Overall, the methods described here provide guidelines for the appropriate processing of muscle tissue for a variety of pathological, functional, molecular and cellular studies, regardless of the on-site capabilities of a given laboratory.
Skeletspier is een structureel en functioneel uniek weefsel, en gespecialiseerde voorbereiding procedures zijn noodzakelijk om de optimale beoordeling van de structurele en functionele parameters mogelijk te maken. Terwijl een groot aantal weefsels vaak voor pathologische studies in de klinische en onderzoek contexten zijn bevroren, bevriezen protocollen voor niet-spierweefsel meestal om de totale onderdompeling van het weefsel in oktober voor het invriezen. Zoals getoond in figuur 3, een dergelijk protocol is geschikt voor pathologische evaluatie van de skeletspieren en toch voldoende overeenstemming van de hier beschreven protocol dat dit een veel voorkomende fout. Het doel van dit artikel is een eenvoudig protocol voor de correcte afhandeling van de spier te bieden aan dit soort zaken te voorkomen. Advies is ook opgesteld op de correcte afhandeling van de spier voor off-site fysiologische en cellulaire studies in een poging om de overname van de hoge kwaliteit van de gegevens door externe kern laboratoria in gevallen vergemakkelijken wheopnieuw ter studies niet de voorkeur of mogelijk.
Zoals in dit protocol, elementen die absoluut essentieel voor de juiste bewerking van spieren voor pathologische studies omvatten het minimaliseren van het watergehalte van het weefsel, het verminderen van de temperatuur waarbij de spier wordt bevroren, en het verhogen van de snelheid waarmee het vriespunt wordt bereikt. Overmatig vocht in het weefsel of overmatig traagheid van het invriezen (geproduceerd door onvoldoende temperaturen of door een gebrek aan direct contact tussen de bevriezing middel en het weefsel, zoals ondervonden met vloeibare stikstof) zal leiden tot het bevriezen van artefacten die pathologische analyse kan aantasten. Als oktober levert een extra bron van weefselvocht, vele laboratoria plakmiddelen zoals tragacanth als inbedding substraat. Zelfs in gevallen waarin het vriespunt op de juiste wijze wordt uitgevoerd, moet ervoor worden gezorgd dat vervolgens per ongeluk ontdooien exemplaren voorkomen door contact met RT containers of instrumenten.Dus een succesvolle vriesproces vereist een zekere planning die vooraf koelen van alle instrumenten en de te gebruiken omvat. Bij het invriezen artefacten worden aangetroffen, is een werkwijze beschreven voor het herstel van het weefsel dat is voldoende voor de meeste pathologische evaluaties. Echter, deze vries / dooi cyclus niet perfect histologie bieden en heeft het potentieel om andere moleculaire of enzymatische studies van het weefsel (naast de tijd voor het opnieuw invriezen van het weefsel) beïnvloeden, zodat met geschikte eerste bevriezing praktijken verreweg de voorkeur . Wanneer invriezen artefact wordt aangetroffen op vooraf bevroren weefsel, maar de hierin beschreven techniek kan zeer nuttig zijn.
Fixatie en verwerking van weefsel voor EM kan specifieke technische uitdagingen die planning voorafgaand aan weefsel collectie vereisen. De meest voorkomende fout bij het verzamelen van monsters voor EM omvat het gebruik van weefsel fragmenten die te dik zijn glutaraldehyde doordringen. Glutaaraldehyd dringt slechts ongeveer 0,1 cm in het spierweefsel van een bepaald oppervlak moet ervoor worden gezorgd dat een dimensie van de EM monsters niet dikker dan 0,2 cm. Daarnaast, zoals EM is een uitstekend middel rechtstreeks gewaardeerd het contractiele apparaat, sommige onderzoekers hebben strategieën ontwikkeld om voorspanning of voorrek de spier voor bevestiging aan de meting van contractiele elementen dat bij een fysiologisch relevante spanning. Er is geen standaard protocol voor voorspanning, maar twee strategieën worden kort beschreven in dit protocol. Opgemerkt zij dat probeert voorspanning de spier kan onvoorspelbare resultaten tenzij zij gedaan in een zeer specifieke manier, en het kan de voorkeur verdienen om spieren vast in slappe toestand te artefactuele veranderingen in sarcomeer lengte te voorkomen door een afwijkende pre-spanprocedure 8,9. Voor spieren waarin dergelijke metingen zijn niet nodig (waaronder de meeste biopsies uitgevoerd voor klinische doeleinden), inspanningen voorspanning de spier algemeen niet gemaakt, en het hoofdeffect op spiermorfologie een niet-uniforme verdeling van sarcomeren in de spier.
Dit document is de eerste in een reeks SOP's voor het uitvoeren van tests op het gebied aangeboren spierziekte, en het vertegenwoordigt de inspanningen van meer dan 20 experts op het aangeboren spierziekte veld dat routinematig uitvoeren van cellulaire, moleculaire, functionele, fysiologische en pathologisch onderzoek. Een reeks van gepubliceerde SOP's zullen beschikbaar worden gesteld in het komende jaar, en de nodige protocollen en passende bekendmaking formaten voor elke besproken in een aangeboren spierziekte Consortium Workshop gehouden in april 2013 in Washington DC Het doel van deze SOP inspanning is te voorzien een routekaart voor de nodige testen en analyseren van monsters in de spier veld aangeboren ziekte tot 1) standaardisering van de praktijken en eindpunten gebruikt in ons vakgebied als much mogelijk, en 2) geven instructie op standaard praktijken voor nieuwe onderzoekers in ons vakgebied. Wij zijn van mening dat deze middelen de komst van nieuwe onderzoekers in onze onder-bestudeerde veld zal vergemakkelijken en aldus de reikwijdte van het onderzoek die kunnen worden uitgevoerd. Daarnaast zal er een standaardisatie van praktijken zeer nuttig zijn om gegevens over studies te vergelijken en eindpunten vast te stellen bij het plannen en uitvoeren van preklinische en klinische proeven.
Terwijl de belangrijkste focus van dit artikel heeft betrekking op de juiste invriezen en bereiding van weefsel voor verschillende studies, onze gezamenlijke groep besproken de nuttige eindpunten voor de pathologische analyse van monsters spier. Momenteel is er geen officiële consensus over de aanpak houden bij het uitvoeren pathologische analyse en een verscheidenheid van verschillende studies uitgevoerd om nieuwe bevindingen betrekking op voorgaande publicaties voor iedere respectieve ziekte. Dus we dachten dat het nuttig zou zijnstellen enkele algemene richtlijnen voor de planning van pathologische eindpunten in de spieren pathologie karakterisering. Voorafgaand aan het kwantificeren van de pathologie in een studie, moet nagedacht in gebracht: 1) de methode van fiber maat opmeten, 2) de mogelijkheid van een vezel-type-specifieke afwijkingen of effecten van de behandeling, 3) de mogelijkheid van afwijkingen of effecten die beperkt individuele spieren, en 4) een strategie voor het kwantificeren pathologische bevindingen die karakteristiek voor de ziekte onder studie. Vezelgrootte is een noodzakelijke eindpunt voor de meeste studies, en helaas is er een uitgebreide variatie in de manier waarop het wordt gekwantificeerd. Veel studies rapporteren deze resultaten met behulp van geautomatiseerde kwantificering die door proprietary imaging software, maar veel van deze programma's nemen sneltoetsen (zoals in de veronderstelling dat de vezels zijn cirkels of ellipsen) dat deze geautomatiseerde metingen onnauwkeurig kunnen maken. Het is noodzakelijk om te begrijpen hoe deze geautomatiseerde programma's maken hun metingen boordat hebben vertrouwen in de metingen, en we moedigen onderzoekers om deze gegevens op te nemen in papier-methoden. Daarnaast is de specifieke meting gebruikt om vezelgrootte duiden is uiterst variabel en sommige metingen zijn te verkiezen boven anderen 10,11. Een veelgebruikte eenheid vezelgrootte is de vezel doorsnede (CSA), vooral omdat onderzoekers uitvoeren fysiologische studies standaardiseren van resultaten CSA metingen verkregen met de instrumenten. Helaas, terwijl CSA metingen nauwkeurig reflecteren vezelgrootte in perfecte dwarsdoorsneden, zij uitvoerig afhankelijk vezeloriëntatie (voorzover lengte of schuin doorgesneden vezels kunstmatig hoge CSA metingen hebben) en zijn dus niet ideaal voor metingen vezelgrootte. Een voorkeur meting vezels grootte die minder afhankelijk vezel dwarsdoorsnede is de diameter van de minimum Feret (MinFeret diameter), die de meting van ee minor diameter in de spiercel 12. Deze meting is slechts weinig afhankelijk vezeloriëntatie is gewoonlijk de klinische gouden standaard voor vezels meting en onderzoekers ertoe bewegen naar het gebruik van deze techniek. Deze metingen kunnen vaak worden uitgevoerd met behulp van dezelfde software die CSA metingen genereert 13 en ook eenvoudig handmatig meten. Met betrekking tot de evaluatie van de pathologische gegevens naar soort vezel, specifiek spier, en in de context van pathologische bevindingen met betrekking tot de specifieke ziekte, deze zijn minder controversiële kwesties die alleen tijdens de planning van een onderzoek moet worden overwogen. Vezeltype kan worden geëvalueerd middels immunohistochemische kleuring of ATPase, maar het is nuttig om te overwegen die specifieke spieren en diersoorten specifieke mengsels van deze typen vezels (dus noodzakelijk verschillende verwachtingen en teststrategieën). Muscle specifieke pathologische betrokkenheid of werkzaamheid van de behandelingoptreden, en totaalgewicht spier vergeleken met controles kunnen worden gebruikt om de mate van heterogeniteit van de ziekte te identificeren alvorens over het spieren pathologisch evalueren. Tenslotte is het bekend dat veel spierziekten worden geassocieerd met specifieke pathologische afwijkingen (bijvoorbeeld nemaline staven nemaline myopathie) 14,15, en dus is ook nuttig om te overwegen of deze afwijkingen worden gevonden in een vezel-type of spier -specifieke verdeling bij het uitvoeren van de analyse 16,17. Over het algemeen, terwijl wij geen voorstellen doen voor een starre set van normen voor de evaluatie van de spier, geloven we dat deze kwesties voorafgaand aan de uitvoering van pathologische studies in elke skeletspier ziekte moet worden beschouwd.
The authors have nothing to disclose.
This publication is funded through Cure CMD, an Association Contre Les Myopathies (AFM) grant (project 16297), and the National Institutes of Health (grant numbers K08 AR059750 and L40 AR057721). We would also like to thank Dr. Julie Tetzlaff for her assistance in revising this manuscript.
For tissue freezing | |||
Liquid nitrogen Dewar with a liquid withdrawal device | Custom Biogenic Systems | Lab-5 Series | Any other liquid nitrogen dewar could substitute. |
Cold-conductive container | Fisher | 02-583A | |
Wide insulated container capable of holding liquid nitrogen | Nalgene | 4150-2000 | |
Oakton Temp 10 Thermocouple Thermometer | Thomas Scientific | 1228Y01 | Optional, but can be very useful in identifying the point at which isopentane is freezing. |
For single fiber functional testing | |||
Petri dish | Fisher Scientific | 08-757-11 | |
Sylgard coating | Ellsworth Adhesives | 3-6636 | |
Dissection stereomicroscope | Harvard Apparatus | 693101 | Any other dissection microscope could substitute. |
For cell culture | |||
Sterile laminar flow hood | Thermo Scientific | 51022485 | Any other cell culture hood could substitute. |
Materials | |||
For tissue freezing | |||
Plastic bags/containers | Nasco | B01009WA | |
Thermal safety gloves | Denville | G4162 | |
Face shield | Fisher Scientific | S47640 | |
Long forceps | Fisher Scientific | 12-460-807 | |
Marker | Staples | 125328 | |
For cell culture | |||
Sterile 50 mL conical tubes | Denville | C1060-P | |
PES filter unit, 500 mL, 0.22 µm | Denville | F5227 | |
Sterile forceps | Fisher Scientific | 644320 | |
Ice packs | Fisher Scientific | NC9909223 | |
Insulated Styrofoam box | Polar Tech | 207F | |
Packing tape | Staples | 795570 | |
Reagents | |||
Tissue Freezing | |||
Liquid nitrogen | Airgas | NI NF160LT350 | Store liquid nitrogen in containers designed for low-temperature liquids |
Isopentane (2-methylbutane) | Sigma | M32631-4L | Store Isopentane in a flammable materials cabinet. |
EM fixative (choose one) | The buffers without fixative should also be available, as EM-fixed tissues should be transferred from fixative to buffer after several hours or days if they are not immediately processed for EM. | ||
2.5% glutaraldehyde in 0.1M cacodylate buffer | Electron Microscopy Sciences | 16537-15 | |
Karnovsky's fixative (3% glutaraldehyde + 2% paraformaldehyde in 0.1M phosphate buffer) | Electron Microscopy Sciences | 15732-10 | |
For functional studies (if desired) | |||
Relaxing solution, containing (in mmol/L) | |||
40 BES | Sigma | B9879 | |
10 EGTA | Sigma | E4378 | |
6.56 MgCl2 | Sigma | M8266 | |
5.88 Na-ATP | Sigma | A3377 | |
1.0 DTT | RPI | D11000 | |
46.35 K-propionate | Make a solution by mixing proprionic acid (Sigma P1386) and KOH (Fisher P250) 1:1 | ||
15 creatine phosphate, pH 7.0 | Sigma | P7936 | |
0.4 leupeptin | Calbiochem | 10895 | |
0.1 PMSF | Sigma | P7676 | |
Skinning solution, containing | |||
Relaxing solution (See Above) | |||
0.5% Triton X-100 | Sigma | T8787 | |
Indicating silica granules | |||
Flat pieces of cork (1 x 1 inch) | Electron Microscopy Sciences | 63305 | |
Glycerol | Sigma | G2025 | |
For cell culture (if desired) | |||
Complete Growth Medium, containing (for 500 mL) | Sterilize by filtering the solution through a 500 mL 0.22 µm PES filter unit. Store at 4°C and use within 1 month. | ||
395 mL of high glucose Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium (DMEM) | Sigma | D5671 | |
100 mL of fetal bovine serum (FBS) | Sigma | F6178 | |
5 mL of 100X Penicillin-Streptomycin-Glutamine (PSG) | Sigma | G1146 | |
Storage requriements | |||
See the materials safety data sheet (MSDS) for all other reagents for storage specifications |