To obtain high-resolution images of fluorescently labeled cells within large tissues, ideally, the biological samples should be imaged without sectioning. 3DISCO is a straightforward tissue clearing procedure based on sequential incubation with organic solvents. Upon clearing, the organs become transparent allowing an end-to-end laser scan of the specimen.
Tissue clearing and subsequent imaging of transparent organs is a powerful method to analyze fluorescently labeled cells and molecules in 3D, in intact organs. Unlike traditional histological methods, where the tissue of interest is sectioned for fluorescent imaging, 3D imaging of cleared tissue allows examination of labeled cells and molecules in the entire specimen. To this end, optically opaque tissues should be rendered transparent by matching the refractory indices throughout the tissue. Subsequently, the tissue can be imaged at once using laser-scanning microscopes to obtain a complete high-resolution 3D image of the specimen. A growing list of tissue clearing protocols including 3DISCO, CLARITY, Sca/e, ClearT2, and SeeDB provide new ways for researchers to image their tissue of interest as a whole. Among them, 3DISCO is a highly reproducible and straightforward method, which can clear different types of tissues and can be utilized with various microscopy techniques. This protocol describes this straightforward procedure and presents its various applications. It also discusses the limitations and possible difficulties and how to overcome them.
생물학적 조직의 조직 학적 검사는 자연 환경에서 분자 / 세포의 성질을 이해하는데 중요한 접근법이다. 이상적으로, 전체 기관의 고해상도 영상은 가장 유익하고 바람직하다. 빛이 한 산란으로 인해 제한된 침투 깊이를 가지고 있기 때문에, 장기 고정 고해상도 현미경 이미징을 수행하기 위해 단면되어야한다. 따라서, 조직 학적 연구의 대부분은 기관의 작은 부분만을 나타내는 몇 조직 절편에서 수행된다. 일부 연구에서, 예를 들면, 뇌 또는 척수에있는 신경 세포의 연결을 추적하는 것을 목표로하는이 대상 기관의 모든 조직 섹션을 수집하고 3 차원 재건 군데. 그러나, 조직 절편과 개별 섹션의 이후의 영상은 여러 가지 제한 사항이 있습니다. 이들은되는 기계적인 왜곡에 시간과 조직의 불완전한 3D 재건을 선도하고, 어려운 포함결과 이미지의 정렬에 이거.
최근, 청소 및 이미지 그대로 투명한 기관은 이러한 단점 2,3에 중요한 솔루션으로 개발되었다. 비운 후, 전체 기관이 렌더링되는 투명 촬상 광을 여행 할 수 있도록 종단 그러한 다중 광자 또는 광 시트 현미경으로 레이저 주사 현미경을 사용하는 unsectioned 기관의 고해상도 이미지를 생성하기 위해 (도 1) ( 그림 2). 다양한 연구 그룹은 서로 다른 목적을 위해 그 자신의 조직 이미지에 할 수있는 새로운 조직 청산 프로토콜을 개발했습니다. 이러한 유기 용매 2-5, 8 청산 프로토콜을 기반으로 물 6,7 전기 영동 (가) 있습니다. 그 중, 용매의 3 차원 영상은 장기를 지우거나 3DISCO는 중추 신경계 (CNS) 기관, 면역 기관과 고형 종양을 포함하여 다양한 생물학 견본에 쉽게 적용 할 수있는 프로토콜입니다. 요금 지불에이온, 이러한 광 시트 형광 현미경 (LSFM), 다 광자 공 초점 레이저 주사 현미경과 같은 다른 현미경 기술과 결합 될 수있다. 3DISCO는 이러한 4 테트라 하이드로 퓨란 (THF) 및 디 벤질 에테르 (DBE)로 쉽게 사용할 수 싼 약으로 청소를 기반으로합니다. 전체 프로토콜은 3 ~ 4 시간 짧게 걸릴 수 있습니다. 따라서, 3DISCO 9를 완료하기 위해 개월 주 정도 걸릴 수 있습니다 기존의 조직 학적 방법에 비해 강력하고 빠른 기술이다.
조직의 청소 방법은 허가 기관에서 다른 조직 층의 굴절률을 일치시켜 영상의 빛의 산란을 감소하는 것을 목표로하고 있습니다. 결과적으로, 촬상 광은 깊은 조직으로 침투하고 표지화 된 세포 / 분자를 자극 할 수있다. 17 삭제 조직이 오래된 개념은 Dodt 및 동료 2로 그대로 마우스의 뇌에 기술의 첫 번째 정교한 신청 후 성장 주목을 받고있다. 그 이후로, 3DISCO, 무서 / 전자, ClearT2, CLARITY 및 SeeDB 3,4,7,18-20 포함한 새로운 청소 방법의 빠르게 성장하는 목록이 있습니다. 본질적으로, 그들은 모두 형광 라벨을 보존함으로써 깊은 조직 이미징을위한 투명한 기관을 렌더링하는 것을 목표로하고 있습니다. 그 중, 3DISCO는 가장 간단하고 재생 가능한 방법의 하나로서 의미합니다. 그것은 상대적으로 빠른 다른 청산 위에서 언급 한 방법 (1-5일 대 성인의 뇌 2 ~ 3 주에 각각) 21과 비교된다. 이미 성공을했습니다완전히 같은 뇌, 척수, 림프절, 비장, 폐, 고형 종양, 췌장, 및 유방 동맥 3,4,9 등의 다른 장기에 적용. 또한, 독립적 인 연구 그룹에서 여러 게시가 이미 영상은 22, 23를 결과를 얻으려면이 방법을 사용했다. 그럼에도 불구하고, 다른 조직의 청산 절차는 다른 조건에 유용 할 수 있습니다. 무서 / 전자 및 SeeDB 배아 조직 6,7에서 가장 잘 적용 할 수있는 반면 예를 들어, 그들은 이미징 동안 쉽게 처리 할 수 있습니다 물 기반의 청소 방법입니다. 반면, CLARITY는 복잡하고 비용이 많이 드는 청소 방법입니다. 그러나 특히 뇌 에이트와 같은 큰 조직에서, 항체 라벨링의 컨텍스트에서 유리할 수있다.
3DISCO에서 최상의 영상 결과를 얻을 수있는 가장 중요한 단계는 조직 지우기 전에 수행되는 조직의 라벨입니다. 그것은 가능한 가장 강한 형광 신호로 시작하는 것이 필수적입니다. 이 B 수전자 합성 염료, 바이러스 형질 전환 또는 항체 라벨에 의해 추적, 형광 단백질의 유전자 발현 등 다양한 방법으로 달성했다. 그것은 어떤 소거 절차는 조직의 형광 신호를 줄일 수 있음을 명심해야한다. 형광 신호가 처음에 충분히 강한 경우에 따라서, -는 지워 조직의 청산 이미징 전에 쉽게 감지 할 수없는, 즉 가난한 결과를 제공 할 것입니다.
개선을 기다리는 방법을 비운의 몇 가지 제한 사항이 있습니다. 중요한 제한은 맑게 시약 맑게 기관의 구조를 변경하기 때문에, 그들은 살아있는 조직에 사용될 수 없다는 것이다. 따라서, 이러한 광활성 mEos2 (24)와 같은 실험은 고정 및 지우기 전에 수행해야합니다. 청소시, 밝고 광 안정성 단백질의 형광 신호의 슈퍼 해상도 이미징이 가능해진다. 또한, 때문에 청소 프로토콜은 감소형광 단백질의 강도, 허가 기관은 장기간 저장할 수 없습니다. 그것은 어떤 기관은 소거 힘들어하는 것이 중요합니다. 해부 장기 혈액 세포 (예, 비장, 간)의 높은 금액을 유지하는 경우 특히, 그들은 취소하고 이미지에 상대적으로 어렵습니다. 그런 성인 설치류의 뇌와 같은 큰 조직을위한 완벽한 청소를 달성하기 위해 상대적으로 어렵습니다. 이러한 조직은, 다른 한편으로는, 형광 신호를 감소시킬 수있는 긴 배양 시간을 필요가있다. 또, 현미경 방법의 개발은 화상 큰 투명 장기 한번에 고해상도에서 해결되어야하는 대기 필요하다 할 수있다. 이 기술의 또 다른 중요한 한계는 조직의 표시입니다. 유전이나 바이러스 표현을 통해 강한 형광 신호가 적합하지만,하지 모든 세포 또는 분자는 유전자 또는 바이러스 성 표시 할 수 있습니다. 반면에, 두꺼운 조직의 항체 라벨은 간단한 절차 또는하지 PO 없습니다대부분의 경우 ssible. 그것은 3 (몇 주에 몇 일) 특별한 permeabilization 프로토콜과 긴 배양 시간이 필요합니다. 그것은 조직이 때문에 탈수 및 탈지 주로 지운 후에 (척수 조직에 대해 측정) 각 차원에서 ~ 20 % 줄어들 것을 명심하는 것이 중요하다. 이 수축 ratiometrically 발생하고 정량화 단계에서 수정해야합니다. 제시된 결과에서 관찰 된 바와 같이, 형광 표지 구조는 지워 조직에서 단백질의 무결성의 표시입니다, 그대로 유지됩니다. 예 Focusclear – 어느 CLARITY 또는 80 % 글리세롤에서 사용되기 때문에, 최종 맑게 조직의 소수성 특성 때문에 상기 항체로 염색 할 수없는 또는 물 함유 용액에 포함. 마지막으로, 영상 데이터의 절대적인 크기를 분석하는 도전이다. 전체 쥐 뇌 세포의 해상도로 스캔하는 경우 예를 들어, 원하는 STR을 추적하고 정량화하는 것은 매우 어려울 것이다uctures (예를 들면, 신경 세포 나 교세포 네트워크) 및 자동화 된 방법으로 다른, 샘플을 비교합니다. 연구진은 새로운 청소 방법을 찾아 것을 목표로하면서 요약하면, (다양한 조직을 청소의 어려움이 큰 지역의 높은 해상도의 영상, 복잡한 데이터 분석) 위의 여러 가지 문제가 동시에 개선해야한다.
결론적으로, 3DISCO를 포함하여 최근에 개발 된 조직 청소 기술, 우아 그대로 기관의 고해상도 3D 영상이 지금 가능하다는 것을 보여줍니다. 이러한 방법을 사용하여, 과학자들은 그대로 기관에서 세포와 분자의 해부학 적 정보를 얻을 수 있습니다. 투명한 기관에 이러한 선구적인 3D 영상 연구는 복잡한 해부학 히스과 질병에 조직 / 장기의 분자 조직을 해독하는 연구자의 증가를 격려.
The authors have nothing to disclose.
우리는 렉틴의 염료의 꼬리 정맥 주입으로 개선 된 혈관 영상의 경험을 공유하기위한 스크립트 나레이션, N. 비엔 – 리에 참여하기 위해, 원고의 중요한 읽기 B. 빙괼 (제넨 테크)을 C.는 Hojer 감사합니다, M Solloway (제넨텍 ) 췌장 영상에 사용 된 마우스의 경우. GFP-M 라인은 R. Littman의 (NYU)에 의해 J. Sanes (세인트 루이스의 워싱턴 대학) 및 CX3CR1-GFP 마우스에 의해 만들어졌습니다. 작품은 제넨 테크 사에 의해 지원됩니다
Thy-1 GFP (GFP-M) mouse | can be obtained from Jackson | ||
CX3CR1 GFP mouse | can be obtained from Littman lab at NYU | ||
TgN(hGFAP-ECFP) mouse | can be obtained from Jackson | ||
Paraformaldehyde | Sigma | P6148 | |
Na2HPO4 | Mallinckrodt | 7917-16 | |
NaH2PO4 | (Mallinckrodt, 7892-04) | ||
2-2-2 Tribromoethanol | Sigma | T48402 | |
2-Methyl-2-butanol | Sigma | 152463 | used to prepare Avertin solution |
Saline | Braun | ||
Tetrahydrofuran | Sigma | 186562-12X100ML | |
Dichloromethane | Sigma | 270997-12X100ML | |
Dibenzyl ether | Sigma | Sigma, 108014-1KG | |
Benzyl alcohol | Sigma | 305197-100ML | |
Benzyl benzoate | Sigma | B6630-250ML | |
Lectin FITC | Sigma | L0401-1MG | |
anti-CC10 | Santa Cruz | SC-9772 | 0.388888889 |
Heparin | APP pharmaceuticals | 504001 | used in perfusion |
Glass vials | VWR | 548-0554 | |
Forceps | FST | 11251-10 | |
Mini Rotator | VWR | 100498-878 | |
Aluminum Foil | Fisherbrand | 01-213-104 | |
100mL Media Storage Bottles | Kimax Media Bottles | EW-34523-00 | |
Minipuls evolution perfusion pump with MF4* medium flow pump head | Gilson, Inc | F110701 and F117606 | |
Microscopy slide | VWR | 48311-703 | |
FastWell | Grace Bio-Labs | FW20 | |
Cover slip | Corning | 2940-245 | |
Glass petri dish | Corning Pyrex | 3160-101 | |
Dental cement | Lang Dental | 1223PNK | |
Quantofix Peroxide Test Strips | Sigma | 37206 | |
Amira with RT resolve microscopy module |
Visage Imaging | image analysis software | |
Imaris | Bitplane imaging | image analysis software | |
ImageJ | NIH | freeware |