To obtain high-resolution images of fluorescently labeled cells within large tissues, ideally, the biological samples should be imaged without sectioning. 3DISCO is a straightforward tissue clearing procedure based on sequential incubation with organic solvents. Upon clearing, the organs become transparent allowing an end-to-end laser scan of the specimen.
Tissue clearing and subsequent imaging of transparent organs is a powerful method to analyze fluorescently labeled cells and molecules in 3D, in intact organs. Unlike traditional histological methods, where the tissue of interest is sectioned for fluorescent imaging, 3D imaging of cleared tissue allows examination of labeled cells and molecules in the entire specimen. To this end, optically opaque tissues should be rendered transparent by matching the refractory indices throughout the tissue. Subsequently, the tissue can be imaged at once using laser-scanning microscopes to obtain a complete high-resolution 3D image of the specimen. A growing list of tissue clearing protocols including 3DISCO, CLARITY, Sca/e, ClearT2, and SeeDB provide new ways for researchers to image their tissue of interest as a whole. Among them, 3DISCO is a highly reproducible and straightforward method, which can clear different types of tissues and can be utilized with various microscopy techniques. This protocol describes this straightforward procedure and presents its various applications. It also discusses the limitations and possible difficulties and how to overcome them.
生物组织的组织学检查是了解分子/细胞的性质在它们的自然背景下的根本途径。理想情况下,整个器官的高分辨率成像是最翔实和期望。因为光具有有限的穿透深度,因散射1,固定机构具有为了进行高分辨率显微成像进行切片。因此,大多数的组织学研究在几个组织切片代表器官,只有一小部分被执行。在一些研究中, 例如,那些旨在描绘出在大脑或脊髓神经细胞的连接,从靶器官的所有组织切片被收集并成像的三维重建。然而,组织切片及个别段落的后续成像有各种限制。这些措施包括为费时,并导致组织的一个不完整的三维重建,由于机械变形和困难IES中所产生的图像的对准。
近日,结算及成像完整透明的器官已经发展成为一个显著的解决这个缺点2,3。后结算,整个器官呈现透明,允许成像光的旅行端-端( 图1)使用激光扫描显微镜诸如多光子或光片的显微镜,以产生unsectioned器官的高分辨率的图像( 图2)。各研究组已经开发了新的组织信息交换的协议,以便能够像他们感兴趣的用于不同目的的组织。这些措施包括有机溶剂2-5,基于8清算协议水中6,7和电泳。其中,溶剂的3维成像清除器官或3DISCO是在多种生物样品,包括中枢神经系统(CNS)的器官,免疫器官和实体瘤的一种容易应用的协议。在ADDIT离子,它可以与诸如光片荧光显微镜(LSFM),多光子及共聚焦激光扫描显微镜不同的显微技术相结合。 3DISCO是基于与现成的和便宜的试剂,如四氢呋喃(THF)和二苄基醚(DBE)4清零。整个协议可以采取短至3-4小时。因此,3DISCO是一个强大的和快速的技术相比,可能需要几个星期到几个月才能完成9传统的组织学方法。
组织信息交换的方法的目标是通过在清除器官匹配不同的组织层的折射率,以减少成像光的散射。其结果,成像光可以穿透深入到组织中,刺激标记的细胞/分子。组织清理17这个老概念已经深入人心越来越多的关注技术对完整的老鼠大脑中的第一个成熟的应用程序通过DODT和同事2后。从那以后,有一个快速成长的新的结算方法,包括3DISCO,爱生雅/ E,ClearT2,清晰度和SeeDB 3,4,7,18-20列表。从本质上讲,它们都旨在通过保留荧光标记来呈现透明的器官深层组织成像。其中,3DISCO脱颖而出作为最直接的和可重复的方法之一。这是比较快的比较(分别为1-5天,而2-3周为成人的大脑,)上述其他结算方法21。它已经被成功完全适用于不同的器官,如脑,脊髓,淋巴结,脾,肺,实体瘤,胰腺和乳腺3,4,9。此外,一些出版物由独立的研究小组已经用这种方法来获得成像效果22,23。然而,不同的组织清算程序可能是有利的条件不同。例如,当的Sca / e和SeeDB适用最好在胚胎组织中6,7,它们是水基的结算方法,这可能是更容易在成像过程中进行处理。相比之下,清晰度是一个复杂和昂贵的结算方法。但它可以是有利的抗体标记的情况下,特别是在大型组织如脑8。
以从3DISCO最好的成像效果最关键的一步就是组织标签,这是该组织清算之前完成。至关重要的是从最强的荧光信号成为可能。这可以bE在各种方式,包括荧光蛋白的转基因表达实现的,通过合成染料,染病毒或抗体标记跟踪。但应记住的是,任何结算过程将减少组织中的荧光信号。因此,如果荧光信号不够强的开头- 即它是不容易检测到的结算成像的组织清除前将提供糟糕的结果。
有清正在等待改进方法的一些限制。一个重要的限制是,由于清除试剂改变清除器官的结构,它们不能在活组织中。因此,实验如与光活化mEos2 24应固定并清算之前进行。清算后,由光明和耐光蛋白质的荧光信号的超分辨成像成为可能。另外,因为信息交换协议削弱了荧光蛋白的强度,则清除器官不能存储长时间。要注意,一些器官更难被清除是很重要的。特别是,如果解剖的器官保存大量的血细胞( 如脾,肝),他们是比较难以清除和形象。它也是相对更难实现一个完整的清理大型组织,如成年啮齿类动物的大脑。这样的组织,可能需要较长的培养时间,这可能,另一方面,降低了荧光信号。此外,显微镜方法的发展,可以像大型透明机关立即在高分辨率是等待需要解决的问题。该技术的另一个重要的限制是组织标记。虽然通过遗传或病毒表达强烈的荧光信号是理想的,不是每一个细胞或分子可以通过基因或病毒标记。在另一方面,厚组织抗体标记不是一个简单的过程,甚至不是宝ssible在大多数情况下。它可能需要特殊的通透协议和潜伏期较长时间(数天至数周)3。同样重要的是要记住,该组织主要是清除由于脱水和脱脂后收缩〜20%,在每一个维度(测定脊髓组织)。均成比例发生这种收缩并应在量化步骤进行校正。所观察到的在所呈现的结果中,荧光标记的结构保持不变,这是蛋白质的完整性在清除组织的指示。因为最终清除组织的疏水性质的,它不能被进一步抗体染色或嵌入在含水溶液如 Focusclear -这是在净度,或80%的甘油。最后,它是分析成像数据的压倒性的大小是一个挑战。例如,当整个鼠脑进行扫描,可在细胞的分辨率,这将是非常难以追踪和量化所需的STRuctures( 例如 ,神经元或神经胶质细胞网络),并比较在不同的样品中的自动化方法。总之,尽管研究人员的目标,找出新的结算方法,上述(清不同组织的难度,成像在高分辨率的较大的区域,以及复杂的数据分析)的各种挑战,应并联改善。
总之,最近开发的组织清算技术,包括3DISCO,优雅地表明,完整器官的高分辨率三维成像成为可能。使用这些方法,科学家可以在完整的器官获得的细胞和分子的解剖学信息。在透明的器官,这些开拓性的三维成像研究激发了越来越多的研究人员破译复杂的解剖和组织/器官的健康和疾病的分子组织。
The authors have nothing to disclose.
我们感谢C.霍耶的手稿的批判性阅读,B.宾格尔(基因技术公司)参与剧本的叙述,边北路-LY与尾静脉注射外源凝集素染料的共享提高了血管成像的经验,和M Solloway(Genentech公司),用于在胰腺成像中使用的小鼠。 GFP-M线被创造了由J.萨内斯(华盛顿大学圣路易斯分校)和CX3CR1-GFP小鼠由R.利特曼(NYU)。这项工作的支持,Genentech公司
Thy-1 GFP (GFP-M) mouse | can be obtained from Jackson | ||
CX3CR1 GFP mouse | can be obtained from Littman lab at NYU | ||
TgN(hGFAP-ECFP) mouse | can be obtained from Jackson | ||
Paraformaldehyde | Sigma | P6148 | |
Na2HPO4 | Mallinckrodt | 7917-16 | |
NaH2PO4 | (Mallinckrodt, 7892-04) | ||
2-2-2 Tribromoethanol | Sigma | T48402 | |
2-Methyl-2-butanol | Sigma | 152463 | used to prepare Avertin solution |
Saline | Braun | ||
Tetrahydrofuran | Sigma | 186562-12X100ML | |
Dichloromethane | Sigma | 270997-12X100ML | |
Dibenzyl ether | Sigma | Sigma, 108014-1KG | |
Benzyl alcohol | Sigma | 305197-100ML | |
Benzyl benzoate | Sigma | B6630-250ML | |
Lectin FITC | Sigma | L0401-1MG | |
anti-CC10 | Santa Cruz | SC-9772 | 0.388888889 |
Heparin | APP pharmaceuticals | 504001 | used in perfusion |
Glass vials | VWR | 548-0554 | |
Forceps | FST | 11251-10 | |
Mini Rotator | VWR | 100498-878 | |
Aluminum Foil | Fisherbrand | 01-213-104 | |
100mL Media Storage Bottles | Kimax Media Bottles | EW-34523-00 | |
Minipuls evolution perfusion pump with MF4* medium flow pump head | Gilson, Inc | F110701 and F117606 | |
Microscopy slide | VWR | 48311-703 | |
FastWell | Grace Bio-Labs | FW20 | |
Cover slip | Corning | 2940-245 | |
Glass petri dish | Corning Pyrex | 3160-101 | |
Dental cement | Lang Dental | 1223PNK | |
Quantofix Peroxide Test Strips | Sigma | 37206 | |
Amira with RT resolve microscopy module |
Visage Imaging | image analysis software | |
Imaris | Bitplane imaging | image analysis software | |
ImageJ | NIH | freeware |