חיידקי ליסטריה הוא פתוגן חיידקים גראם חיובי משמש לעתים קרובות כמודל עיקרי לחקר טפילות תאית. הדמיה מאוחר L. חיידקי לשלבי זיהום בהקשר של מסכי RNA התערבות קטנים מאפשר למחקר העולמי של מסלולים הסלולר נדרשים לזיהום חיידקים של תאי מארח יעד.
ניתן לתפוס פתוגנים תאיים חיידקים ככלים מולקולריים לנתח מפלי איתות הסלולר בשל יכולתם לתמרן להפליא ולחתור תחת פונקציות תא הנדרשות להדבקת רקמות יעד מארח. בין החיידקים פתוגנים אלה, חיידקי ליסטריה הוא מיקרואורגניזם גראם חיובי ששמש כפרדיגמה לטפילות תאית באפיון של תגובה חיסונית תאית, ואשר מילאו תפקידים מרכזיים בגילוי מסלולים המולקולריים שליטה דינמיקת סחר cytoskeletal וקרום. במאמר זה, אנו מתארים assay Microscopical חזק לצורך זיהוי של שלבים מאוחרים של זיהום סלולארי L. חיידקי המבוססים על תיוג הניאון של InlC, חלבון מופרש חיידקים שמצטבר בציטופלסמה של תאים נגועים; assay זה יכול להיות בשילוב למסכים אוטומטיים תפוקה גבוהה קטנים מפריעים RNA כדי להשחירacterize מסלולי איתות תאיים מעורבים בוויסות מעלה מטה או לזיהום.
החיידק גראם החיובי חיידקי ליסטריה הוא פתוגן שמקורן במזון שפולש לתאי מארח, משבש vacuole ההפנמה ומשכפל בציטופלסמה של תאי מארח 1. L. חיידקי הקלות של מניפולציה בהקשר המעבדה (צמיחה מהירה, הרעילות נמוכה לאנשים בריאים) קשור עם ההתמדה של תכונות ארסיות חיידקים שנצפו בדגמים סלולריים ובעלי חיים (פעילות המוליטית, ריבוי תאי דם לבנים) התירו השימוש הראשוני שלה ב1960s כמודל עיקרי ל המחקר של טפילות תאית ולהקמתן של היסודות התיאורטיים של חסינות הסלולר נגד זיהום 2. בסוף 1980s ותחילת 1990, הנתיחה של מחזור החיידקים תאיים 3, כמו גם האפיון המולקולרי של ארסי חיידקי גורמים החשובים ביותר 4-7 העדיף את השימוש של L. חיידקי ככלי מולקולרי מרכזי למניפולציה וגם החתיךy של פונקציות תא מארחות. נוכחותם של לא אלים (innocua ל ') ומינים ארסיים (חיידקי L.) בסוג ליסטריה סללו את הדרך למחקרים גנומית השוואתיים 8 זה, יחד עם ההקמה האחרונה של L. המלא חיידקי transcriptome 9, גדלו ההבנה של האבולוציה שלנו ל ' חיידקי כהפתוגן אנושי וכמערכת מודל לזיהום לומדים 10.
חיידקי L. גורם הפנמתו לתוך תאי מארח על אינטראקציה של חלבוני פני השטח של חיידקי InlA וInlB עם קולטני תא המארח שלהם E-cadherin והמטרופוליטן, בהתאמה 11-12. מחקרים מבוססי מועמד ראשוניים הובילו לזיהוי של הקישור catenins-אקטין α / β כמרכיב משמעותי של מסלול InlA פלישת 13 ושל phosphoinositide 3-קינאז (PI 3-K) כמפעיל קריטי של InlB- casca פלישה תלויהדה 14-15. מבחני proteomic ומבוססי פונקציונליים אפשרו לאחר מכן את זיהוי של גורמי רומן cytoskeletal 16 ושליחים שני שומנים 17 דרושים לפלישת תא מארח. מחקרי תעתיק 18 ופרוטאומיקה מבוססת ספקטרומטריית המסה כמותית 19 לאחרונה שופכים אור חדש בנוגע להפעלה של מפלי מארח איתות והדיכוי של מערכת החיסונית במהלך L. חיידקי לזיהום. ביולוגיה של מערכות המבוססת על גישות איון של קבוצות גדולות של גנים (kinomes, הגנום מלא) על ידי RNA התערבות קטן השתקה (siRNA) לאחרונה פתחה אפיקים חדשים לניתוח המארח הגלובלי איתות מפלים בהקשר של תפקודים תאיים ספציפיים, כולל phagocytosis ו הפנמת הפתוגן 20. מסכי siRNA הגנום כבר בוצעו בעבר לחקור מפלים סלולריים הנדרשים לזיהום של L. חיידקי בדרוזופילה phagocytic </eמ '> תאי S2 21-22, אבל זה סוג של ניתוח לא שבוצע בתאים שאינם phagocytic, המייצגים מטרות קריטיות לזיהום בגוף חי.
יש לנו אופטימיזציה פרוטוקול לזיהוי Microscopical של שלבים מאוחרים של זיהום על ידי ל חיידקי שמתאימים ללימודי siRNA תפוקה גבוהה של כניסת חיידקים בתוך תאי אפיתל. assay שלנו מנצל L. פולשני מאוד חיידקי לזן שמציג מוטציה נקודתית בPrfA, רגולטור תעתיק העיקרי של L. חיידקי ארסי גורמי 6: מוטציה זו (בשם PrfA *) הופכת PrfA פעיל 23 constitutively ומובילה לביטוי מוגבר של חלבוני פלישת InlA וInlB, ולכן העדפת כניסת חיידקים בתאים שאינם phagocytic אחרת גרוע נגועים. קריאת הנתונים שלנו לזיהום מבוסס על זיהוי של הצטברות cytosolic של InlC חלבון החיידקים המופרש: מולקולה זו היאמפעיל pleiotropic שבא לידי ביטוי באופן מועדף על ידי ל 'התוך cytoplasmic חיידקי 9 ובו משתתף לא רק בתא תא אל החיידקים להתפשט 24 אך גם מודולציה תגובות חיסונית מארח 25. ניאון התיוג של הפרשת InlC ידי חיידקים תאיים לא רק מאפשר להבחין נגוע מהתאים שאינם נגועים באופן ברור, אלא גם מייצג readout נקודת סיום שיכול לשמש כדי לנתח לאחר מכן זיהום בשלבים השונים שלה: כניסה, בריחת vacuolar, חיידקי cytosolic ריבוי והתפשטות תא אל התא. פרוטוקול מבוסס מיקרוסקופיה זה יכול להיות בשילוב למסכי siRNA לכן ללמוד מסלולי הסלולר מעורבים בזיהום של תאי מארח של ל ' חיידקי.
מספר פרמטרים הם קריטיים להצלחתו של פרוטוקול InlC איתור שלנו, כוללים השימוש בשורות תאים בריאים מוצגות ציטופלסמה גדולה מספיק כדי לאפשר זיהוי חד משמעי של אות InlC. ב assay אנו מציגים במאמר זה אנו מציעים את השימוש בתאי הלה CCL2, שהם גם מתאימים במיוחד עבור assay שלנו בעקבות ההארכה של …
The authors have nothing to disclose.
מחקר במעבדה פ Cossart נתמך על ידי מכון פסטר, Institut National de la סנטה et de la משוכלל ונדיר Médicale, Institut National de la משוכלל ונדיר Agronomique, ERC Advanced Grant (233,348), Nationale de la משוכלל ונדיר סוכנות הידיעות (גרנט מ.י.- SignRupVac), קרן לואי ז'נטה וFondation Le Roch Les Mousquetaires. AK הוא נמען של מלגה מInfectieuses פסטר בפריז הבינלאומית באוניברסיטה לתואר השלישי תכנית / Institut החוליים קרנו. אנו מודים ג'ייסון מרסר לייעול פרוטוקול transfection הסלולרי.
Name of Material/ Equipment | Company | Catalog Number | Comments/Description |
Bacto Brain Heart Infusion | BD | 237500 | For liquid BHI preparation |
Bacto Agar | BD | 214010 | Supplement to liquid BHI for BHI agar plates |
Heat-Inactivated Fetal Bovine Serum | Biowest | 51830-500 | |
DMEM | Invitrogen | 61965-026 | |
Lipofectamine RNAiMax | Invitrogen | 13778-100 | |
Gentamicin | Sigma | G1397-10ML | |
Formaldehyde (16%) | EMS | 15710 | Prepare fresh before each experiment |
Anti-Rabbit Alexa Fluor 546 | Invitrogen | A-11035 | |
DAPI | Invitrogen | D-1306 | |
Phalloidin Dy647 | Dyomics | 647-33 | |
siRNA Scramble | Dharmacon | D-001810-10 | |
siRNA Met | Dharmacon | L-003156-00-0005 | |
Black 384-well microscopy cell culture plate | Corning | 3985 | |
AxioObserver Z1 microscope | Zeiss | 431007 9901 | |
sCMOS camera | Andor | Neo | |
Metamorph analysis software | Molecular Devices | 4000 | |
CellProfiler analysis software | Broad Institute | Public software available at http://www.cellprofiler.org/ |