Личинок дрозофилы являются привлекательным модельной системой для живого изображения из-за их полупрозрачной кожицей и мощных генетики. Этот протокол описывает, как использовать в PDMS устройство однослойный, называемый 'личинка чип "для живого изображения клеточных процессов в нейронах 3-й возрастной стадии личинок дрозофилы.
Онлайн изображений является важным методом для изучения биологических процессов клеток, хотя это может быть сложным в живых животных. Полупрозрачный кутикула личинки дрозофилы делает его привлекательным модельным организмом для живых визуальных исследований. Тем не менее, важной задачей для живых методов визуализации является неинвазивным иммобилизации и позиционировать животное на микроскоп. Этот протокол представляет собой простой и легкий в использовании метод иммобилизации и отображения личинок дрозофилы на полидиметилсилоксана (PDMS) микрофлюидных устройства, которое мы называем "чип личинка". Чип личинка состоит из плотного облегающие PDMS микрокамере, который прилагается к тонкой покровного стекла, которое, по заявлению вакууме с помощью шприца, обездвиживает животное и приносит брюшной структуры, такие как нервной цепочки, сегментных нервов и тела стены мышцы, в непосредственной близости от покровного стекла. Это позволяет для изображений с высоким разрешением, а главное, позволяет избежать использования ЭНАsthetics и химических веществ, что облегчает изучение широкого круга физиологических процессов. Так как личинки восстановить легко от иммобилизации, они могут быть легко подвергнуты нескольких сеансов обработки изображений. Это позволяет продольных исследований с течением времени курсов колеблется от нескольких часов до нескольких дней. Этот протокол описывает шаг за шагом, как подготовить чипа и, как использовать микросхему для живого изображения нейронных событий в 3-й возрастной стадии личинок. Эти мероприятия включают в себя быстрое продвижение транспортов с органелл в аксонов, ответов кальция травмы, а покадровой исследований торговле фото-кабриолет белков на большие расстояния и временных масштабах. Другое применение чипа является изучение регенеративные и дегенеративные ответов на аксонов травмы, так что вторая часть этого протокола описывает новый и простой процедуры за причинение вреда аксоны в пределах периферических нервов с помощью сегментной нерва давки.
Плодовая муха, дрозофилы, была использована в качестве модельного организма для более чем 100 лет, и доказал важную роль в определении фундаментальной сигнализации и путей развития, которые являются консервативными от беспозвоночных к человеку. Онлайн изображений является важным подход к изучению клеточных механизмов, а также простой план тело и полупрозрачные кутикула личинки дрозофилы делает его привлекательным система для живого изображения, особенно, так как есть много генетических инструментов, доступных для выражения дневно с тегом белков в специфические типы клеток.
Важной задачей для живых методов визуализации является неинвазивным иммобилизации и позиционировать животное для микроскопии. Традиционные подходы включают иммобилизации рассечение 1,2 или использование хлороформа, оба из которых убить животное. В анестетики эфир 4 и изофлуораном 5-8 также использовались. В то время как анестетики имеют много преимуществ, Они также тормозят нервную деятельность и важную физиологию (включая сердцебиение) 9-11, следовательно, может повлиять на процесс изучал и создать нагрузку на животных. Есть также проблемы безопасности человека для работы с эфиром и изофлуораном.
Мы разработали метод, свободного от наркотиков, чтобы обездвижить личинок дрозофилы в один слой PDMS микрожидкостных устройств, который мы называем «личинка чип '12. Этот протокол описывает, как получить или сделать чип личинка, и как использовать его для живого изображения в ранней постановке 3-м возрастной стадии личинок. Чип состоит из плотного облегающие микрокамеры, который при приложении вакуума с помощью шприца, удерживающую животное через нежной механической силы. Метод иммобилизации приносит брюшной структуры, такие как нервной цепочки, сегментных нервов и тела стены мышц, в непосредственной близости от покровным стеклом. Это позволяет высоким разрешением таких структур с высокой числовой апертурыамплитуды (большом увеличении) цели.
Преимущества чип личинки над другими традиционными методами, включают следующее: (я) использование чипа личинки заменяет использование химических веществ, что позволяет в естественных изображений наркозу животных. (II) Личинки восстановить сразу после освобождения из чипа (в отличие от периода восстановления с 2 часами для изофлуораном 8,13). Это позволяет для работы с изображениями с широким охватом временных масштабах, начиная от миллисекунд до нескольких минут, до нескольких часов и дней. (III) Использование PDMS, который представляет собой проницаемый материал газа, дает возможность для непрерывного диффузии кислорода / воздуха из окружающей среды в организм личинки. (IV) чип просто и удобно в использовании, и (V) его можно использовать повторно, и может быть изготовлен при минимальных затратах.
В дополнение к инструкции по использованию чипа личинка, этот протокол приведу несколько примеров ее использования для изучения нейронных событий в 3-й возрастной стадии личинок. К ним относятся Живая съемка Axonaл транспорт, ответы кальция травмы, а покадровой исследования торговле фото-кабриолет белков на большие расстояния и временных масштабах.
Другое применение чипа является изучение нейронных ответов на аксонов травмы. Для этого дополнительный процедура описана (в части 3) за причинение вреда аксоны в пределах периферических нервов с помощью сегментной нерва давки. Этот простой анализ может выполняться как быстро и воспроизводимо при стандартной диссекции стереомикроскопа, что позволяет в течение многих животных, чтобы быть обработаны одновременно. Сотовые ответы на травмы могут быть изучены живого изображения в чипе личинки.
Создание или получение чип личинка:
Чип личинка состоит из PDMS блока (именуется «чип PDMS '), прикрепленной к покровным стеклом. Протокол на шаге 1 описывается процедура изготовления и использования личинка чипы, предполагая, СУ-8 плесень доступно. СУ-8 форма микроизготовленном по фотолитографически рисунка толстую СУ-8 слой фоторезиста 140 мкм на кремниевой пластины (подробнее см. Ghannad-Резаи и др.. 12). Как микротехнологий из СУ-8 плесени требуется доступ к специализированным оборудованием, мы рекомендуем заказывать его из микротехнологий объекта (например,. Объект ЛНФ в Университете штата Мичиган 14), или из литейных цехов, отправляя им дизайн микросхемы, которая предоставляется в качестве дополнительного файла. Если кто-то хочет изменить дизайн чипа PDMS (например, для использования с личинками различных размеров), САПР программное обеспечение, которое обрабатывает DXF файлов (например, AutoCAD) могут быть использованы. СУ-8 плесень также может быть сделано в доме, следуя инструкциям в Mondal др.. 27 Многие читатели, возможно, будет удобно просто получить PDMS чип образца опробовать технику до изготовления собственные чипы. Это будет сделано в свободном доступе по запросу.
Использование микрожидкостной 'личинки чипе "для живого изображения:
Способ иммобилизации на чипе личинки избегает использования анестетиков, а вместо этого включает в себя давление, посредством применения вакууме, чтобы ограничить движение животного. В то время как животные могут выжить иммобилизации в чипе для нескольких часов 12, более короткий период иммобилизации (5-15 мин) рекомендуется. Это достаточно времени для работы с изображениями многих клеточных событий, представляющих интерес, в том числе изменений в внутриклеточного кальция, или быстрой аксонального транспорта. Это также достаточно времени для желаемых манипуляций в живых животных, такие как лазерная основе микрохирургии, фотообесцвечивания и photoconverСион.
Для изучения событий в продольном направлении в течение более длительного периода времени в одном животном, животные могут быть размещены в чип и отображаемого несколько раз, разделенные периодами отдыха. Виноградный сок агаром идеально подходят для отдыха между сессиями изображений, так как они обеспечивают простой источник пищи и повышенной влажности. Несколько сессий визуализации влияют личиночной выживаемости до такой степени, так как каждая сессия несет в себе определенный риск для повреждения животное (см. часть 2 в устранении неполадок, ниже). Животные могут быть регулярно в образ> 5 раз в течение двух дней с выживаемости более 50%. Так как животные не под наркозом, они здоровы и подвижные сразу после освобождения вакуума в чипе. Там поэтому нет необходимости в время восстановления между сессиями изображений, так что расстояние между время между сессиями является гибкой и может быть скорректирована с целями эксперимента.
Поиск и устранение неисправностей:
Наиболее распространенным техническая являетсяподает в суд с чипом личинки и методы их решения являются:
(1) Животное движется слишком много. Слишком много мобильность может помешать целей визуализации. Наиболее распространенные причины для этого в чипе личинки являются) животное слишком мал для чипа, или б) применяется во время стадии иммобилизации вакуумного давления находится под угрозой. Чип личинка описано в данном протоколе предназначен для раннего поставил 3-й стадии личинок. Оптимальный размер для животного является 3,5-4 мм в длину (вдоль передне-задней оси). Чтобы убедиться, что давление вакуума достаточно, тянуть шприцев 2-2,5 мл, или пока не почувствуете сопротивление в ручке. Одним из признаков, что вакуум работает в том, что небольшие пузырьки в канале периметра можно видеть медленно движется к источнику вакуума. Еще одним свидетельством является то, что покровное всегда должны путешествовать с чипом, когда чип подъема за верхнюю (и это рекомендуемый метод для транспортировки в камеруПосле того, как личинки позиционируется и вакуум включен). Вакуум может быть нарушена, если есть трещины в трубопроводе, или если есть нефть в трубе. Это можно легко решить путем замены 23 г дозирования кончик иглы и полиэтилен-50 трубки (от шагов 1.6-1.14).
(2) животное погибает после изображений в чипе. Эта процедура предназначена, чтобы вызвать минимальное напряжение на животное, и животные дикого типа генотипа имеют выживаемость> 90%, даже после часа иммобилизации на чипе 12. Так как некоторые генотипы могут быть менее устойчивыми к стрессу чипа, сначала проверьте, что животных дикого типа (например, кантон S) выжить технику иммобилизации. а) Наиболее распространенной причиной для летальности является неправильное положение личинки (см. рис 2G-H). Если части кутикулы, головы или трахеи не совсем в камере, то они могут быть повреждены во время иммобилизации, иличинка, что слишком велико для чипа (> 4 мм) меньше шансов выжить. б) реже причиной летальности является использование слишком большого давления или вакуума при загрузке чип. При правильной установке в чипе, давление, создаваемое с помощью вакуума хорошо переносится. Однако избыточное давление, либо из вакууме или в начальной стадии позиционирования животное может быть проблемой. Лучше всего, чтобы узнать степень нажима, необходимого эмпирически испытаний с дикого типа личинок нужного размера. с) если слишком много Галокарбоновое масло охватывает трахею животного животное может потенциально иметь проблемы с долгосрочного выживания. Масло играет несколько важных функций в микросхеме: важно для создания вакуума, оптики во время съемки, и она противодействует высушивание в чипе. Однако чрезмерное масла следует избегать. (Это может также привести к нефти в трубопроводе и шприца, ущерба вакуум). Предложенные пальто протокол просто брюшной стороне личинки маслом, то гemoves излишки масла путем размещения личинки на чистую покровного прежде, чем перейти конечном покровного для работы с изображениями. г) фототоксичность можно испытать от изображений сессии. Как и в любой живой применения изображений, он идеально подходит для использования короткие сроки экспозиции с низкой интенсивности лазерного света, который лучше всего достигается с помощью высокочувствительного камеру или детектор. Постарайтесь свести к минимуму освещение с ультрафиолетовым светом, в том числе широкого спектра света, созданного источников ртути легких.
Другие вопросы и будущие направления:
Поскольку этот метод не использует обезболивающие, сердце животного продолжает бить. Это создает некоторую неизбежную мобильность, которая влияет изображений в некоторых местах больше, чем другие. Приведенные примеры показывают, что брюшной нервной, сегментные нервы, и тело стены могут быть легко отображены без вмешательства со стороны сердца. В случаях, когда сердцебиение влияет изображений, регулярные движения иногда может быть исправлена для св программное обеспечение для анализа (например, стабилизатор изображения плагин для ImageJ). Это хорошо работает, когда отдельные объекты движутся на быстро масштабе времени (например ~ 1 мкм / с для быстрой аксонов транспорта) или на очень медленном масштабе времени (минут до нескольких часов). Тем не менее, когда объект (ы) объекты движутся с диапазоном скоростей и направлений, это может быть труднее для коррекции сердечных сокращений индуцированной движений.
Другой проблемой является небольшая изменчивость в оптике от животного к животному или между нескольких сеансов изображений одного и того же животного в чипе. Чем глубже объектом интереса в пределах животного, тем больше это изменение будет. Сегментные нервы и брюшной нервной, как правило, слишком глубоко в то животного, подлежащего отображаемого на регулярной микроскопом. Однако мягкий давление, испытываемое в чипе личинки толкает эти структуры очень близко к кутикулы и покровного стекла. Точное расстояние этих структур от покровного стекла будет иметь небольшие вариации из трIAL к суду. Изменение объектов закрыть кутикулы, например, клеточных тел сенсорных нейронов, меньше. Поэтому очень важно, особенно для проведения измерений интенсивности, чтобы использовать большое количество животных и независимых испытаний для учета изменчивости в оптике.
Хотя примеры, показанные здесь были сосредоточены на процессах в нейронах, подход должен быть поддаются визуализации любую структуру в животное, которое может быть предъявлен в течение фокусировки глубине объектива микроскопа. Это включает в себя кутикулу, стенки тела мышцы, и их NMJs. Трахеи на брюшной стороне животного и потенциально части пищеварительного тракта также может быть отображены. Животное также может быть расположен с его спинной стороне в сторону покровного стекла на короткий срок визуализации структур вблизи поверхности спинного. Способность изображений структур глубоко внутри животного ограничено рабочее рассто ние объектива микроскопа используется. Структуры, такие как имaginal диски недоступны большом увеличении (например, 40X) целей.
Личинка чипы, описанные в данном протоколе предназначены для личинок в начале 3 стадии й возрастной стадии (размером от 3,5-4 мм). Однако многие интересные вопросы требуют визуализации на различных личиночной стадии. Меньшие чипы для размещения 2-й стадии личинок, или более крупные чипы для размещения поздно 3-й возрастов могут быть легко разработаны, используя тот же принцип. (Дополнительный Рисунок 1 содержит легко изменяемую файл DXF получения кремниевых форм с измененными размерами камеры). Простой принцип обратимого уплотнение может даже быть применены к другим организмов, таких как C. Элеганс или данио, с основной вариант является размер камеры. Полезный будущее направление заключается в разработке чип, который может обездвижить много животных сразу, чтобы использовать для целей скрининга. Правда, для этого, дизайн должны были бы быть значительно отличаетсяот текущего устройства, где вопросы позиционирования животное в чипе необходимо решать с для каждого животного независимо.
Нерв давка анализа для изучения ответов травмы в личиночной периферических нервов:
Нерв давка анализа, описанного здесь личинок нервов сегментных простой метод для введения травмы периферических аксонов у дрозофилы. Преимущества этого метода относятся: а) это просто проводить с помощью стандартных инструментов, найденных в лаборатории Drosophila (стереомикроскоп СО источника и щипцов 2), б) он может быть быстро проведены для многих животных, делая биохимический анализ нервных стволов после травмы возможно 14, в) молекулярные и клеточные реакции на этой травмы являются высокая воспроизводимость 14,15,28, и может быть использован, чтобы обнаружить процессы, которые также важны для позвоночных нейронов 29,30.
Альтернативные методы ранив нейронов является на общса мощного лазерного, например импульсно-УФ или фемтосекундного лазерного, разорвать аксон через лазерной микрохирургии 17,31-33. Чип личинка является идеальным методом для позиционирования животное для такого микрохирургии. Однако из-за небольших различий в оптике между испытаний, обсужденных выше, способ на основе лазера может быть более трудно воспроизвести в личинок, особенно в личиночной нервов сегментных. Кроме того, лазер повреждение аксонов требует больше времени, чтобы позиционировать каждое животное, следовательно, является более трудным проводить в большом масштабе (с большим количеством животных).
Поиск и устранение неисправностей:
Наиболее часто встречаются технический вопрос от нервного давке это смерть от повреждения внутренних органов. При проведении давку, важно, чтобы не прищемить брюшной нервной, слюнные железы, или кишечник. Важно также, чтобы не проколоть кожицу. Эти вопросы лучше избегать, принося щипцы под углом 45 ° к кутикулы Surfacе (см. Рисунок 3).
Качество щипцов имеет большое влияние от эффективности давке и выживания после этого. Мы рекомендуем номер Dumostar 5 щипцов. Чтобы сохранить свою остроту, щипцы должны быть обработаны с осторожностью, не используется в других целях, и заменены, как только они становятся тупыми или согнуты.
Размер животного может также влиять на эффективность давке. Мелкие животные (менее 3 мм в длину) имеют гораздо меньше шансов пережить травму. С крупных животных, (странствующий 3-й возрастов), это более трудно найти нервы и избежать повреждения крупных слюнных желез и кишечника, и остается меньше времени для изучения ответов травмы до окукливания. Нерв давка наиболее эффективно проводится в начале 3-го возрастной стадии личинок (которые являются ~ 3-4,5 мм в длину вдоль передне-задней оси).
Источник питания, что животное поднимается на могут повлиятьСила кутикулы и выживания после давки. Рекомендуется разводить животных в пище, сделанные из стандартного рецепта дрожжи-глюкозы.
Лучший метод для обучения, как эффективно сделать давки является практика на многих животных, в первую очередь с первичной целью достижения выживание (и не окукливания) 24 ч после давки. Начинающие обычно имеют скорость низкая выживаемость (например, 10%), но как только техника узнал, выживаемость может достигать ~ 90%.
Другие вопросы и будущие направления:
Давка анализ обеспечивает мощный метод для изучения прорастания аксонов проксимальнее места повреждения и дегенерации аксонов и синапсов дистальнее места повреждения. В то время как скорости дегенерации варьироваться между различными типами нейронов, они очень воспроизводимым в пределах заданного типа нейронов, обеспечивая свидетельствует о воспроизводимости травмы анализа.
В отличие от этого, "регенеративный" прорастанияответ наблюдается в проксимальных аксонов является более сложным для изучения. Все аксоны в сегментной нерва инициировать обширная прорастания близко к месту повреждения (например, см. рисунок 6 и рисунок 3). Однако степень прорастания может варьироваться от нейрона к нейрону, и трудно оценить количественно. Аналогичная степень и изменчивость прорастания можно наблюдать после нескольких очаговых поражений одиночных мотонейронов в сегментных нервов, введенных с помощью лазера на красителе УФ импульсного. Мы интерпретируем что nondiscriminate направленность прорастания связано с отсутствием сигналов наведения в сегментарных нервов. В противоположность этому, сенсорного нейрона аксоны поврежденные лазером близко к их клеточных тел пройти новый рост аксонов в том же направлении, что была утрачена аксона 34. Аксоны в этом регионе животного, вероятно, подвержены более конкретной информацией о местоположении для руководством регенерирующих аксонов. Окружающая среда в сегментных нервов вряд ли будет иметь много resemblanсе в окружающую среду, что аксоны первоначально перемещаться во время их руководством в зародыше, следовательно, не будет иметь информацию для руководства регенерирующие аксоны.
Еще одно ограничение для изучения регенерации с помощью сегментарную нерв раздавить анализа является то, что потерпевшие сенсорные и мотонейронов аксоны еще есть значительное расстояние, чтобы покрыть (0,25-1 мм) для достижения своей цели, а также ограниченные сроки (<3 дня) до претерпевает животных окукливание. Недавнее исследование выявило генетическую манипуляцию prothoraciotropic рецептора гормона, который утраивает продолжительность 3-й возрастной стадии личиночной стадии 35. Эта манипуляция продлит сроки для значительно изучения восстановления и дегенерацией нейронов после травмы, до 9, а не 3 дней. Это может быть достаточно долго, чтобы наблюдать новые события, такие как повторное подключение потерпевшего аксона с его постсинаптической цели, особенно если травма индуцируется близко к синаптической финал.
The authors have nothing to disclose.
Эта работа была поддержана Национальным научным фондом, (грант № IOS-0842701 на CAC), и Национального института здоровья (R00MH080599 чтобы BY, R21 NS062313 к NC, и NS069844 к CAC). Мы хотели бы выразить признательность Джеймс Schutt, Эмили Хан, и Лени Truong для технической поддержки, а также со-центр Блумингтон для мух линий. Все фишки были изготовлены на Лурье Nanofabrication фонда в университете штата Мичиган.
0.5 mm Polyethylene tubing | Fisher scientific | 14-170-11B | Polyethylene tubing, I.D. = 0.023’’, O.D. = 0.038’’ |
1 mm Polyurethane tubing | Fisher scientific | BB521-63 | Polyurethane tubing, I.D. = 0.063’’, O.D. = 0.125’’ |
barb to barb connector | Bio Rad | 732-8300 | 0.8 mm barb to barb connector |
3-way stopcock valve | Bio Rad | 732-8104 | Screw on valve for the syringe |
Syringe (20 ml) | Fisher scientific | 14-817-33 | Screw on 20 ml syringe for generating vacuum |
Dispensing needles, 23 G (.4mm I.D., .6mm O.D.) | McMaster-Carr | 75165A684 | Needle for outlet connection |
Dispensing needles, 21 G, (.6mm I.D., .8mm O.D.) | McMaster-Carr | 75165A679 | Needle for outlet connection |
Halocarbon oil | Sigma | H8898 | Halocarbon oil 700 |
Dumostar Number 5 Forceps | Roboz | RS-498 | For nerve crush |
PDMS Kit (Base and curing agent) | Ellsworth | 184 SIL ELAST KIT 0.5KG | Dow Corning Sylgard 184 Silicone Encapsulant 0.5 kg Kit Clear |
Glass Coverslips | Fisher scientific | 12-544-C | 24 x 40 mm (thickness according to recommendation for your microscope objective) |
Disposable Plastic Cup (9 oz.) | |||
Plastic coffee stirrer stick | |||
Razor Blade | |||
Grape juice agar plates | See http://cshprotocols.cshlp.org/content/2007/4/pdb.rec10925 for recipe |