Млекопитающих покров содержит растворителей извлекаемые липиды, которые могут обеспечить химические составы характеристику отдельных видов. Эта статья представляет собой рутинную метод разделения широкие классы липидов, выделенных из покровных тканей с помощью тонкослойной хроматографии и определение профиля триацилглицерида матрицей-лазерной десорбцией / ионизации время-пролетным масс-спектрометрии.
Покров млекопитающих включает сальных желез, которые секретируют масл нистое вещество на поверхности кожи. Выработку кожного сала является частью иммунной системы, которая защищает от болезнетворных микробов. Аномальные производство кожного сала и химический состав также клинический симптом определенных кожных заболеваний. Кожное сало содержит сложную смесь липидов, в том числе триацилглицеридов, который является видоспецифические. Широкие химические свойства, проявляемые различных классов липидов препятствуют конкретные определения кожного сала композиции. Аналитические методы липидов обычно требуют химических derivatizations, которые трудоемки и увеличение расходов на подготовку образца. Эта статья описывает, как извлечь липиды от кожного покрова млекопитающих, отдельных широких классов липидов методом тонкослойной хроматографии, и профиль содержимое триацилглицерида помощью матрицы-активированная лазерная десорбция / ионизация время пролета масс-спектрометрии. Этот надежный метод позволяет непосредственно определитьиз триацилглицерида профилей между видами и отдельными лицами, и она может быть легко применен к любой таксономической группы млекопитающих.
Млекопитающих покровных тканей включают эпидермис, кератиновых структур (например, волос и ногтей), и экзокринных желез. Экзокринных желез сальных типа связаны с волосяными фолликулами, которые совместно именуемые пилосебационного комплекса 1. Сальные железы выделяют маслянистое экссудата на поверхности кожи называют кожного сала. Кожное сало состоит в основном из глицеролипидов (например триацилглицериды [Теги]), свободные жирные ацилы (FFAs), стериновый / восковые эфиры, и сквален. Химический состав кожного сала является видоспецифичным 2. Помимо того, что часть врожденной иммунной системы и предоставление антимикробной функцию 3, сальные липиды влияют важные физиологические процессы, включая испарительного потери воды через кожу 4, сотовой целостности и генной регуляции 5 и абсорбции лекарственного средства 6. Сальные композиции липидов также может служить признаком болезни. Измененные показатели и количество сальных бдорожные классы липидов клинические признаки заболевания, такие как обыкновенные угри, перхоть 7 8, себорейный дерматит 8, 9 астеатоз, среди прочих 10. Эпидермальные и волосы ткани включают переменные профилей, содержащих стерол и производные, теги FFAs, керамиды, фосфолипиды, и другие мелкие липидные компоненты. Поскольку покровных липиды могут функционировать в болезненных процессов, определение разницы в химическом составе меток между здоровых и больных индивидуумов могут быть полезны для клинического диагноза болезни.
Липиды обычно определяется как нерастворимые в воде органические соединения либо с неполярной или неполярный-полярных заместителей 11. Липидные структуры могут быть длинные углеводородные цепи, кислородсодержащие алканы (в том числе восковых эфиров, FFAs, спирты, кетоны и альдегиды), или сложные кольцевые структуры, такие как холестерин 12. Есть восемь основных классов липидов, основанные на структуре (FFAs, glycerolipiDS [GL], глицерофосфолипиды [GP], сфинголипидов [SP], стеролов липидов [ST], prenol липиды [PR], saccharolipids [SL] и поликетиды [PK]), которые обладают широкий спектр химических свойств в зависимости от класс 13. В связи с широким изменением химических свойств классов липидов, прямой профилирование без предварительного производных липидных молекул желательно. Один из методов возникающих в липидного исследования является тонкослойной хроматографии (ТСХ) в сочетании с матрицей-активированная лазерная десорбция / ионизация время-пролетным масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) 14.
MALDI-TOF MS широко используется в протеомного исследований для идентификации белков и связать их с конкретными аминокислотных последовательностей из-за высокоточных пептид ионной масс "отпечатков пальцев", полученных от трипсиноподобных переваривается белков 15. MALDI-TOF MS также может быть использован в профиль другие биомолекулы, включая классы липидов, таких как метки 16-18. MALDI требует использования матрицы, типчески органическое соединение, содержащее ароматические и сопряженные структуры двойной связи. Молекулы матричные служить, чтобы мягко передать энергию лазера в анализируемых, способствовать перенос протона, и производить однозарядные газофазных ионов 19-21. Ионы подвергаются поле высокого напряжения в высоком вакууме и ускоренного в масс-анализатора TOF где ионы затем отделяют различиями в скоростях, которые пропорциональны их массы к заряду соотношениях. Даже очень крупные биомолекулы могут быть ионизованы с малыми повреждениями, производя однозарядные молекулярные частицы ионов для упрощенного анализа спектра. Умение анализировать липидных молекул непосредственно, без предварительного получения производных способствовало готовый принятие MALDI-TOF MS в липидомных исследований 18.
Эта статья представляет собой обычного способа, чтобы изолировать и проанализировать покровных липиды из волос, сальных выделений и plagiopatagium Восточного красного битой (Lasiurus borealiс). Это используется для определения изменения межвидовых в Бат-покровных липидов выяснить патологический процесс в Бело-Нос синдрома (WNS) 22. WNS является грибковое заболевание летучих мышей и вызвано вновь описанных психрофильных видов Geomyces destructans 23-25. WNS вызвало гибель более 5 миллионов североамериканских летучих мышей пещерных и угрожает вымирание уязвимых видов рукокрылых, с потенциальными экономическими последствиями миллиардов долларов в ущерб сельскохозяйственной отрасли 26,27. Для исследования действия, описанные в G. destructans инфекции, липиды экстрагировали из волос и крыла тканей восточных красных летучих мышей и разделяют на широких классов липидов с помощью ТСХ, чтобы изолировать фракцию TAG для последующего анализа с помощью MALDI-TOF MS. Метки содержат короткие ацильных цепей и легко обнаруживаются по MALDI-TOF MS с небольшим вмешательством матрицы.
Эта статья представляет собой простой и надежный способ отделения широкие классы липидов, выделенных из кожного покрова млекопитающих препаративной ТСХ и определения профилей TAG на MALDI-TOF MS, без затрат времени производных из липидных молекул. Критические шаги в производстве качественного спектры тегов с MALDI-TOF MS включают: 1) успешного извлечения соединения с минимальным загрязнением или окисления, 2) достаточное разделение и изоляцию с помощью хроматографии и 3) Высокое разрешение и масс точность по MALDI-TOF МС.
Эта статья демонстрирует способ путем извлечения и разделения нейтральную липидной фракции из plagiopatagium Восточного красного летучей мыши, чтобы получить TAG MS профили. Хотя настоящее исследование использовало летучая мышь видов (Mammalia: Chiroptera) эти методы могут быть расширены для изучения покровных липиды любых видов млекопитающих. Бат покров характеризуется тем, что в основном холестерин, с меньшими количествами тэгов, FFAs, SquaLene и стериновый / восковые эфиры. Отношения Кожное сало липидов в летучих мышей отличаются от людей в этом сквален присутствует в небольших количествах (в отличие от до 16% у людей), в то время как уровень холестерина происходит в больших соотношениях (1 – 7% у людей, но 26 – 62% у летучих мышей) 22 , 31. Человека волосы содержат около 3% Метки, в то время как отношения до 28% находятся в Восточной волос красный битой. Экстракцию липидов из образцов с битами аналогично для других видов. Хотя в данном исследовании, ватные шарики, пропитанные растворителем используются для удаления кожного сала, также можно инвертировать флакона или пробирку, содержащую растворитель, на поверхность покровов несколько раз. Специализированный пленочные изделия также обеспечить альтернативные средства для извлечения поверхности липидов 32. Важной частью надлежащего экстракции липидов является сведение к минимуму загрязнения с кожи масла. Это легко сделать, сохраняя бутылку сжать метанолом и распыления все стекла и посуду, вытирая посуду с тканью между всеми образцами и носить перчатки. Окисление ое полиненасыщенные ацилы предотвращается путем добавления ВНТ, и она должна быть использована независимо от температуры образцы хранятся в.
Анализ Биомолекулы обычно требует хроматографического шаг к отдельных молекул, представляющих интерес от загрязнений. ТСХ используется в этом методе, что позволяет избежать требования измерительная аппаратура для газовой или жидкостной хроматографии и требует меньше технического опыта для достижения надежных и воспроизводимых результатов. В зависимости от липидного класса интереса многие различные подвижные фазы могут быть включены. Кроме того, использование ВЭТСХ-пластинах и сканирующей денситометрии могут быть использованы для достижения количественных результатов. В то время как варианты ТСХ методов слишком много, чтобы перечислить здесь, некоторые общие подвижные фазы, используемые в липидной ТСХ включают хлороформ: метанол: вода для разделения фосфолипидов и гликолипидов или изооктан: этиловый эфир для разделения неполярных липидов 28. С точки зрения разделения тегов из других классов липидов, Н: E: такlvent система работает стабильно и обеспечивает сопоставимые результаты.
Еще одно преимущество для использования TLC является то, что полосы интерес, могут быть быстро профилированные с помощью MALDI-TOF MS без предварительного дериватизации аналитов. В этом исследовании кремнезем извлекают из ТСХ пластине, и аналит элюировали из нее ультразвуком в растворителе и последующей центрифугирования для отделения адсорбента и испарение элюирующего растворителя. Кроме того, матрица может быть нанесен непосредственно на анализируемых полос, разделенных на пластинах ТСХ и затем непосредственно анализировали с помощью MALDI-TOF MS 33. Успешное профилирование по MALDI-TOF MS действительно полагается на достаточном пробоподготовки и квалификации оператора с настройкой и калибровки прибора. Прибор должен быть откалиброван в день с стандартов в отношении молекулярной соответствующий диапазон веса для молекул, представляющих интерес. Подходит чувствительность и разрешение (например, ≥ 10000) оборудования также должны быть confirmeг в день с АКТГ.
Сальные липидные компоненты, найденные на поверхности кожного покрова млекопитающих может играть определенную роль в колонизации бактериальными / грибковых патогенов. Поэтому знание химического состава среди видов и особей может содержать сведения о процессах на человека и животных заболеваний. Внутривидовые различия между больными и здоровыми лицами может представлять клинические признаки, которые помогают в обнаружении заболеваний и диагностики. Кроме того, если конкретные соединения, которые ингибируют рост микроорганизмов присутствуют, то они могут быть определены для использования в лечении и профилактике заболеваний.
The authors have nothing to disclose.
Помощь была оказана Скотт Трис, Katelyn Arter, Джереми Ragsdell, Тони Ламарк Джеймс, Эми Фишер, Ханна Блэр, и Шайенн Gerdes при разработке лабораторных методов. Мы хотели бы поблагодарить Медина-Боливар лаборатория (Луис Х. NOPO-Olazabal; Арканзас Biosciences институт) за помощь в ТСХ сканирования денситометрии. MALDI-TOF MS используется для данного проекта была осуществлена через NSF EPSCoR, НИИГ: Арканзас АКТИВАМИ Инициатива P3 Center (EPS-0701890) в Институте Арканзас Biosciences. Финансирование было предоставлено через рыболовства США и охотничьего хозяйства / штата Арканзас дикой природы Грант, Национального Спелеологического общества, и центр для североамериканского Бат исследованию и сохранению в Университете штата.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
Butylated Hydroxytoluene | MP Biomedicals, LLC | 101162 | www.mpbio.com |
TLC Flexible Plates | Whatman | 4410-222 | www.whatman.com |
ACTH | Sigma-Aldrich Chem. Co. | A8346-5X1VL | www.sigmaaldrich.com |
Triolein | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 44895-U | |
TLC Lipid Standard | TLC 18-1 | www.nu-chekprep.com | |
MALDI TAG Standard | Nu-Check Prep., Inc. | NIH Code 53B | |
MALDI TAG Standard | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 17810-1AMP-S | |
Glass Vials with Teflon Cap | U.S. National Scientific Co. | B7800-2 | www.nationalscientific.com/ |
DHB | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 50862-1G-F | |
CHCA | Sigma-Aldrich Chem. Co. | C8982-10X10 mg | |
Sebutape | CuDerm | S100 |