Tégument des mammifères contient des lipides solvant extractible qui peuvent fournir des compositions chimiques caractéristiques de chaque espèce. Cet article présente une méthode de routine pour la séparation de larges classes de lipides isolés à partir de tissus tégumentaires en utilisant la chromatographie en couche mince et détermination du profil de triacylglycéride par désorption / ionisation laser à temps de vol par spectrométrie de masse assistée par matrice.
Le tégument de mammifère comprend des glandes sébacées qui sécrètent une substance huileuse à la surface de la peau. La production de sébum est une partie du système immunitaire inné qui est protectrice contre les microbes pathogènes. La production de sébum anormale et la composition chimique sont également un symptôme clinique de maladies spécifiques de la peau. Le sébum contient un mélange complexe de lipides, y compris les triacylglycérides, ce qui est spécifique à l'espèce. Les propriétés chimiques présentées par les grandes classes de lipides diverses gênent la détermination spécifique de la composition du sébum. Techniques d'analyse des lipides exigent généralement des dérivations chimiques qui sont échantillon frais de préparation augmentation de main-d'œuvre et. Cet article décrit comment extraire les lipides de tégument de mammifère, de larges classes de lipides séparées par chromatographie sur couche mince, et le profil le contenu de triacylglycéride par désorption laser assistée par matrice / ionisation temps de vol spectrométrie de masse. Cette méthode robuste permet une détermination directedes profils de triacylglycéride entre les espèces et les individus, et il peut être aisément appliqué à n'importe quel groupe taxonomique des mammifères.
Tissus tégumentaires mammifères comprennent l'épiderme, les structures kératiniques (par exemple, des cheveux et ongles) et les glandes exocrines. Glandes exocrines de type sébacé sont associées à des follicules pileux, qui sont collectivement désignés comme l'unité pilo-sébacée 1. Les glandes sébacées libérer un exsudat huileux sur la surface de la peau appelée sébum. Le sébum est composé en grande partie de glycérolipides (par exemple triacylglycérides [tags]), acyles gras libres (AGL), les esters de stérol / cire, et le squalène. La composition chimique du sébum est spécifique à l'espèce 2. En plus de faire partie du système immunitaire inné et fourniture de la fonction antimicrobienne 3, lipides sébacés affectent les processus physiologiques importants, y compris la perte par évaporation de l'eau par la peau 4, l'intégrité cellulaire et la régulation des gènes 5, et la drogue absorption 6. Les compositions de lipides sébacés peuvent également servir de marqueurs de maladies. Ratios modifiés et les montants des sébacée bclasses de lipides de la route sont les signes cliniques de maladies telles que l'acné vulgaire 7, 8 pellicules, la dermatite séborrhéique 8, 9 astéatose, entre autres 10. tissus épidermiques et cheveux comprennent des profils variables contenant des stérols et dérivés, TAG, FFA, les céramides, les phospholipides, et d'autres composants lipidiques mineures. Étant donné que les lipides tégumentaire peuvent fonctionner dans des processus pathologiques, la détermination des différences dans la composition chimique des TAGs entre les individus sains et malades peut être utile pour le diagnostic clinique de la maladie.
Les lipides sont généralement définis comme étant des composés organiques insolubles dans l'eau avec des substituants soit non polaire ou non polaire polaires 11. structures lipidiques peuvent être des chaînes longues d'hydrocarbures oxygénés, des alcanes (y compris les esters de cire, des acides gras libres, des alcools, des cétones et des aldéhydes) ou des structures cycliques complexes tels que le cholestérol 12. Il ya huit principales classes de lipides sur la base de la structure (AGL, glycerolipids [GL], glycérophospholipides [GP], sphingolipides [SP], stérols lipides [ST], lipides prénol [PR], saccharolipids [sl], et polykétides [PK]), qui présentent un large éventail de propriétés chimiques en fonction de la classe 13. En raison de la grande variation dans les propriétés chimiques des classes de lipides, de profil direct sans dérivation avant de molécules lipidiques est souhaitée. Un procédé émergent dans la recherche de lipides est la chromatographie en couche mince (TLC) en combinaison avec désorption laser assistée par matrice / spectrométrie de ionisation à temps de vol de masse (MALDI-TOF MS) 14.
MALDI-TOF MS est largement utilisé dans la recherche pour identifier des protéines de protéomique et de les associer à des séquences spécifiques d'acides aminés en raison de la très grande précision peptide de masse d'ions générés «empreintes» de protéines digérées à la trypsine 15. MALDI-TOF MS peut également être utilisé pour le profil d'autres classes de biomolécules, y compris les lipides tels que TAG 16-18. MALDI nécessite l'utilisation d'une matrice, typquement un composé organique qui contient des structures double liaison aromatiques et conjugués. Les molécules de la matrice servent à transférer doucement l'énergie du laser pour les analytes, de promouvoir le transfert de protons, et de produire des ions à charge unique en phase gazeuse de 19 à 21. Les ions sont soumis à un champ de haute tension sous vide poussé et accélérés dans un analyseur de masse TOF où les ions sont ensuite séparés par des différences dans les vitesses qui sont proportionnels à leurs rapports masse sur charge. Même de très grosses biomolécules peuvent être ionisées avec peu de fragmentation, la production d'espèces moléculaires d'ions à charge unique pour l'analyse du spectre simplifié. La capacité à analyser les molécules lipidiques directement sans dérivation avant a favorisé l'adoption immédiate de MALDI-TOF MS dans la recherche lipidomiques 18.
Cet article présente une méthode de routine pour isoler et analyser les lipides tégumentaire de la chevelure, les sécrétions sébacées et plagiopatagium de la chauve-souris rouge de l'Est (Lasiurus borealis). Il est utilisé pour déterminer les variations interspécifiques de chauves-souris lipides tégumentaire d'élucider le processus de la maladie du syndrome du nez blanc (WNS) 22. WNS est une maladie fongique des chauves-souris et est causée par les espèces nouvellement décrites psychrophiles Geomyces destructans 23-25. WNS a causé la mort de plus de 5 millions de chauves-souris nord-américaines de la grotte et menace de l'extinction des espèces de chauves-souris vulnérables, avec des impacts économiques potentiels de milliards de dollars de dommages à l'industrie agricole 26,27. Pour étudier les étapes de G. destructans infection, les lipides ont été extraits à partir des tissus pour les cheveux et les ailes de chauve-souris rouges de l'Est et séparés en de larges classes de lipides par chromatographie sur couche mince afin d'isoler la fraction de DAT pour une analyse ultérieure par MALDI-TOF MS. TAG contiennent de courtes chaînes acyle et sont facilement détectés par MALDI-TOF MS avec peu d'interférences de matrice.
Cet article présente une méthode simple et robuste pour séparer les grandes classes de lipides isolés à partir de tégument mammifère par CCM préparative et la détermination des profils de TAG par MALDI-TOF MS, sans dérivation de temps des molécules lipidiques. Les étapes essentielles de la production de spectres de la qualité de TAG avec MALDI-TOF MS comprennent: 1) l'extraction réussie du composé à la contamination ou oxydation minimale; 2) séparation suffisante et l'isolement par chromatographie, et 3) de haute résolution et une précision de masse par MALDI-TOF MS.
Ce document illustre la méthode par extraction et la séparation de la fraction lipidique neutre du plagiopatagium de la chauve-souris rouge de l'Est pour obtenir des profils MS TAG. Bien que la présente étude a utilisé une espèce de chauve-souris (Mammalia: Chiroptera), ces méthodes peuvent être étendues à étudier lipides tégumentaires de toutes les espèces de mammifères. Bat tégument se caractérise par une prédominance de cholestérol, avec des quantités plus faibles de TAG, FFA, squalene, et stérol / esters de cire. Ratios sébum lipidiques dans battes diffèrent des humains en ce que le squalène est présent en faibles quantités (par opposition à un maximum de 16% chez l'homme), tandis que le cholestérol se produit dans des proportions plus importantes (1-7% dans l'homme, mais de 26 à 62% en chauves-souris) 22 , 31. Cheveux humains contiennent environ 3% TAG, tandis que les ratios jusqu'à 28% se trouvent dans les cheveux de chauve-souris rouge de l'Est. L'extraction des échantillons lipidiques des chauves-souris est similaire pour d'autres espèces. Bien que dans la présente étude des boules de coton imbibé de solvant sont utilisés pour enlever le sébum, on peut également inverser un tube ou flacon échantillon contenant un solvant sur la surface des multiples temps de tégument. Produits spécialisés de bande fournissent également d'autres moyens pour extraire les lipides de surface 32. Une partie essentielle d'une bonne extraction des lipides est de minimiser la contamination par les huiles de la peau. Ceci est facilement réalisé en gardant une bouteille squeeze avec du méthanol et de pulvérisation toute la verrerie et les ustensiles, ustensiles essuyant avec un tissu entre tous les échantillons et portant des gants d'examen. Oxydation oacyles polyinsaturés f est empêchée par l'addition de BHT, et il doit être utilisé quelle que soit la température des échantillons sont stockés à.
analyse des biomolécules nécessite généralement une étape chromatographique à séparer les molécules d'intérêt de contaminants. TLC est utilisé dans le présent procédé, ce qui évite les exigences d'instrumentation pour gaz ou Chromatographie en phase liquide et nécessite moins d'expérience technique pour obtenir des résultats fiables et reproductibles. En fonction de la classe de lipides d'intérêt, de nombreux différentes phases mobiles peuvent être incorporés. En outre, l'utilisation de plaques HPTLC et densitométrie à balayage peut être utilisée pour obtenir des résultats quantitatifs. Bien que les variations de méthodes TLC sont trop nombreux pour les énumérer ici, certaines phases mobiles couramment utilisés dans les lipides CCM comprennent le chloroforme: méthanol: eau pour la séparation des phospholipides et des glycolipides ou iso-octane: l'éther éthylique pour la séparation des lipides non polaires 28. En termes de séparation mots-clés à d'autres classes de lipides, le H: E: Une sortesystème lvent fonctionne de manière cohérente et fournit des résultats comparables.
Un autre avantage de l'utilisation TLC est que les bandes d'intérêt peuvent être profilées rapidement en utilisant MALDI-TOF MS, sans dérivatisation préalable des analytes. Dans cette étude, la silice est retirée de la plaque de CCM, et l'analyte est élué de celle-ci par sonification dans un solvant et centrifugation subséquente à séparer l'adsorbant et l'évaporation du solvant d'élution. En variante, la matrice peut être appliquée directement sur des bandes d'analytes séparés sur des plaques de CCM et ensuite analysés directement par MALDI-TOF MS 33. Profilage succès par MALDI-TOF MS ne repose sur la préparation d'échantillon suffisante et la compétence de l'opérateur avec réglage et l'étalonnage de l'instrument. L'instrument doit être étalonné tous les jours avec les normes couvrant la gamme de poids moléculaire approprié pour les molécules d'intérêt. La sensibilité et la résolution appropriée (par exemple ≥ 10 000) de l'équipement devraient également être ConfirméD par jour par l'ACTH.
Les constituants lipidiques sébacées présentes à la surface du tégument mammifères peuvent jouer un rôle dans la colonisation par des bactéries pathogènes fongiques /. Par conséquent la connaissance de la composition chimique des espèces et des individus peut fournir des indices sur les processus de maladies humaines et animales. Différences intraspécifiques chez les personnes saines et malades peuvent représenter des signes cliniques qui aident à la détection de la maladie et le diagnostic. De plus, si des composés spécifiques qui inhibent la croissance microbienne sont présents, ceux-ci peuvent être identifiés pour une utilisation dans le traitement des maladies et la prévention.
The authors have nothing to disclose.
Assistance a été fournie par Scott Treece, Katelyn Arter, Jeremy Ragsdell, Tony Lamarck James, Amy Fischer, Hannah Blair, et Cheyenne Gerdes lors de l'élaboration de méthodes de laboratoire. Nous tenons à remercier le Laboratoire Medina-Bolivar (Luis H. Nopo-Olazabal, Arkansas Biosciences Institute) de l'aide pour TLC densitométrie à balayage. MALDI-TOF MS utilisé pour ce projet a été fourni par la NSF EPSCoR, RII: Initiative ASSET Arkansas P3 Center (EPS-0701890) à l'Institut des biosciences de l'Arkansas. Le financement a été assuré par un des États-Unis Pêches et Wildlife Service / Arkansas State Wildlife Grant, la Société nationale de spéléologie et le Center for American Bat recherche et la conservation du Nord à l'Indiana State University.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
Butylated Hydroxytoluene | MP Biomedicals, LLC | 101162 | www.mpbio.com |
TLC Flexible Plates | Whatman | 4410-222 | www.whatman.com |
ACTH | Sigma-Aldrich Chem. Co. | A8346-5X1VL | www.sigmaaldrich.com |
Triolein | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 44895-U | |
TLC Lipid Standard | TLC 18-1 | www.nu-chekprep.com | |
MALDI TAG Standard | Nu-Check Prep., Inc. | NIH Code 53B | |
MALDI TAG Standard | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 17810-1AMP-S | |
Glass Vials with Teflon Cap | U.S. National Scientific Co. | B7800-2 | www.nationalscientific.com/ |
DHB | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 50862-1G-F | |
CHCA | Sigma-Aldrich Chem. Co. | C8982-10X10 mg | |
Sebutape | CuDerm | S100 |