Bu protokol, su bazlı tespiti için alternatif adımlar olarak teğet akış boş elyaf ultrafiltrasyon numune konsantrasyonu sisteminin kullanımı ve ısı ayrışma açıklar<em> Cryptosporidium</em> Ve<em> Giardia</emEPA Method 1623 kullanarak> türler.
Cryptosporidium ve Giardia türlerin neden olan su kaynaklı ishal salgınları dünyada protozoa en yaygın ikisidir. Daha iyi bu patojenlerin prevalans karakterize etmek için, EPA Method 1623 geliştirilen ve ABD içme sularında bu organizmaların düzeylerini izlemek için kullanılan 12 sağlamaktadır. Metodu, üç ana bölümden oluşur; birinci ham yüzeyi su en az 10 L süzüldü edildiği Örnek konsantrasyonudur. Organizmalar ve tuzağa enkaz sonra filtreden yıkandı ve daha örnek konsantre santrifüje edilir. Yöntemin ikinci bölümü konsantre su numunesi özellikle konsantre enkaz gelen parazitler belirli çıkarılması için izin ookistleri Cryptosporidium ve Giardia kistleri bağlamak immunomanyetik boncuk için uygulanan bir immunomanyetik ayırma işlemi kullanır. Bunlar (oo) kistler sonra bir asit ayrışma Proce tarafından manyetik boncuk ayrıdırDure. Yöntemin son bölümü (oo) kistler bir slayt, lekeli uygulanır ve mikroskop ile numaralandırılan immünofloresan boyama ve numaralandırmasıdır.
Envirochek filtreleri (Pall Corporation, Ann Arbor, MI), Envirochek HV filtreler (Pall Corporation), Filta-Max filtreler (Idexx, Westbrook, MA): Yöntem 1623 suda ookistleri Cryptosporidium ve Giardia kistleri yakalamak için dört halka örnek konsantrasyonu sistemleri vardır veya Sürekli Akış Santrifüj (Haemonetics, Braintree, MA). Ancak, Cryptosporidium ve Giardia (oo) kist kurtarma 1,14 kullanılan su kaynağı matrisi ve filtreleri bağlı olarak büyük farklılıklar var. Yeni teğet akış boş elyaf ultrafiltrasyon (HFUF) sistemi kısa bir süre Cryptosporidium ookistleri geri at daha verimli ve daha sağlam olması gösterilmiştir ve çeşitli su matrislerinden Giardia kistleri, dahası, diğer kapsül filtre seçeneği daha ucuzdurs ve aynı anda birden fazla patojen 1-3,5-8,10,11 konsantre olabilirsiniz. Ayrıca, Hill ve arkadaşları tarafından daha önceki çalışmalarda doğrudan Envirochek HV filtreleri 4 ile karşılaştırıldığında önemli ölçüde HFUF Cryptosporidium ookistleri kurtarma geliştirilmiş olduğunu göstermiştir. Mevcut yöntem ek olarak modifiye metodu performansını iyileştirmek için rapor edilmiştir. Isı ile ayrışma asidin ayrılması prosedüre değiştirilmesi bazı matrisler 9,13 içinde manyetik boncuklar Cryptosporidium ayırma daha etkili olduğu gösterilmiştir.
Bu protokol, ısı ile ayrışma adım yeni HFUF filtrasyon sistemini kullanan bir modifiye Yöntem 1623 açıklanmaktadır. Bu modifiye Yöntemi ile HFUF kullanımı mevcut EPA Method 1623 filtreleme seçenekleri için daha ucuz bir alternatif olduğunu ve bir çok mikroorganizma konsantrasyonunu izin vererek daha fazla esneklik sağlar.
Teğetsel akış boş elyaf ultrafiltrasyon Cryptosporidium ookistleri ve su Giardia kistlerinin başlangıç konsantrasyonu için alternatif ve etkili bir tekniktir. İçi boş elyaf ultrafiltrasyon geleneksel filtreler daha ucuzdur. Farklı su matrisler çeşitli Cryptosporidium ookistleri ve Giardia kistleri konsantre yeteneğine sahiptir yana EPA Method 1623 için kullanılan mevcut filtrasyon teknikleri için yararlı bir alternatiftir. Diğer çoğu filtrasyon yöntemleri olduğu gibi, boş elyaf ultrafiltrasyon son derece bulanık örnekleri ile kirlenme eğilimli. Yüksek basınçlı su filtresi kirlenme sonucu olurdu; bu nedenle filtrasyon çalışması sırasında basıncı izlemek için tavsiye edilir. Cryptosporidium ookistleri ve Giardia kistler ek olarak, oyuk-fiber ultrafiltrasyon bakteri ve virüsler 1-3,5,8 konsantre yeteneğine sahip olduğu gösterilmiştir. İçi boş elyaf ultrafiltrasyon oBu yöntemde utlined tek bir örnek olarak birden organizmalar konsantre etmek için kullanılabilir. Bu, 200 ve 250 ml arasında nihai bir hacim elde etmek (oo) kist kaybına neden olabilir bu ekstra santrifüj adımları böylece konsantrasyon prosedürü kritik son adım, (adım 2.2) kaçınılmalıdır olduğu dikkat çekicidir. Retentat şişe içine tüm ookistleri veya kistler zorlamak için yeterince sıvı hacmi söz konusu olamayacağından Ancak, şişe hacmi çok düşük bırakabilirsiniz verimleri üzerindeki olumsuz etkileri olabilir. Bu nedenle, 200 ve 250 ml arasında bir nihai hacmi sağlamak için tavsiye edilir.
Isıl ayrışma Yöntem, 1623 yılında asit ayrışma adıma bir alternatiftir. Bu alternatif adım Cryptosporidium ookist kurtarma geliştirmek ve nehir veya su reaktif 9 ya izole, yöntem farklılıkları azaltmak için gösterilmiştir. Asit ve ısı ayrışma yöntemlerinin yan yana karşılaştırma göstermiştir ki çözülme için ısı kullanımıte immunomanyetik boncuklar organizmalar Cryptosporidium ve Giardia hem de yüksek ortalama kurtarma üretti. Buna ek olarak, Cryptosporidium ve Giardia kurtarma hassasiyeti asit ayrışma 9 ile karşılaştırıldığında ısı ayrışma ile işlenen örneklerin daha iyiydi.
Konsantrasyonu adım olarak HFUF ile birleşmesiyle bir çok mikroorganizma konsantre olma yeteneği sunarak daha fazla esneklik sağlar. Buna ek olarak mevcut Yöntem 1623 filtreleme seçenekleri daha az pahalı bir alternatif.
The authors have nothing to disclose.
Biz onun teknik destek için bu yazının ve Doug Hamilton eleştiri için Ann Grimm ve Michael Zimmerman teşekkür etmek istiyorum.
Equipment/Reagent | Vendor | Catalog # |
Asahi Kasei Rexeed 25 S/R wet hollow-fiber ultrafilters | Dial Medical | REXEED25S/R |
I/P 73 (Masterflex R-3603), or equivalent | Cole Parmer | EW-06408-73 |
L/S 24 (Masterflex Platinum-Cured), or equivalent | Cole Parmer | EW-96410-24 |
L/S 15 (Masterflex Platinum-Cured), or equivalent | Cole Parmer | EW-96410-15 |
L/S 36 (Masterflex Platinum-Cured), or equivalent | Cole Parmer | EW-96410-36 |
I/P Precision Brushless Drive | Cole Parmer | EW-77410-10 |
I/P Easy Load Pump Head | Cole Parmer | EW-77601-10 |
Black HDPE Tee, 1/4″x 3/8″ x 3/8″ | US Plastics | 62064 |
Masterflex T-connector L/S 15-25 | Cole Parmer | EG-30613-12 |
Nalgene heavy-duty pp 1 L bottle | Cole Parmer | EW-06257-10 |
10 ml pipettes | Fisher Scientific | 13-678-11C |
Nalgene filling/venting cap for 1/4″ tubing, 53B | Cole Parmer | EW-06258-10 |
Pressure gauge | Cole Parmer | A-680-46-10 |
Straight coupling, NPT(F), 1/4″ | Cole Parmer | EW-06469-18 |
NPT branch tee, natural pp | Cole Parmer | A-30610-75 |
Pinch clamps, 1/2″ | Cole Parmer | EW-06833-00 |
Custom fit DIN adapters | Molded Products Corp | MPC-855NS.250 |
Ring stand | Fisher Scientific | 14-670B |
Ring stand clamps | Fisher Scientific | 05-769-6Q |
Keck ramp clamp, 14mm | Cole Parmer | EW-06835-10 |
Sodium polyphosphate | Sigma Aldrich | 305553 |
Sodium thiosulfate pentahydrate | Sigma Aldrich | 72050 |
Antifoam Y-30 emulsion | Sigma Aldrich | A5758 |
Tween-80 | Sigma Aldrich | P1754 |
10 L Collapsible high-density polyethylene cubitainer | VWR | IR314-0025 |
Centrifuge bottle rack | Fisher Scientific | 05-663-103 |
250 ml conical centrifuge tubes | Corning | 430776 |
Disposable funnel | Cole Parmer | U-6122-10 |
Wash bottle | Cole Parmer | U-06252-40 |
Centrifuge | Beckman Coulter | Allegra X-15R |
Swinging bucket rotor | Beckman Coulter | ARIES SX4750 |
Centrifuge bucket adapters for 250 ml conical tubes | Beckman Coulter | 349849 |
200 μl large bore pipette tips | Fisher Scientific | 02-707-134 |
VacuShield Filter | Gelman | 629-4402 |
5 ml pipettes | Fisher Scientific | 13-678-11D |
Dynabeads: Cryptosporidium/Giardia combo kit | IDEXX | 73002 |
50 ml conical centrifuge tubes | Falcon | 352098 |
Dynal L10 flat sided tubes | IDEXX | 74003 |
Timer | VWR | 23609-202 |
Dynal MPC-6 magnet | IDEXX | 12002D |
1 ml pipettes | VWR | 53283-700 |
1.5 ml low adhesion microcentrifuge tubes | Fisher Scientific | 02-681-320 |
1000 μl pipette & corresponding barrier tips | Gilson | P1000/DF1000ST |
100 μl pipette & corresponding barrier tips | Gilson | P100/DF100ST |
9 inch Pasteur pipettes | VWR | 14672-412 |
Dynal MPC-S magnet | IDEXX | 12020D |
Vortex | VWR | 14216-188 |
Dynabeads rotator mixer | IDEXX | 94701 |
Heat block | Fisher Scientific | 11-718-2 |
Lab Armor Beads | Lab Armor | 42370-750 |
Digital thermometer | Fisher Scientific | 15-077-60 |
Phosphate-buffer saline 1X pH 7.4 (1X PBS) | Sigma | P4417 |
Single Spot slides | IDEXX | 30201 |
Cover glass | Corning | 287018 |
EasyStain direct kit | BTF | – |
10 μl pipette & corresponding barrier tips | Gilson | P10 & DF10ST |
4′,6′-Diamidino-2-phenyl indole dihydrochloride (DAPI) | Sigma | D9542 |
Clear nail polish | Fisher Scientific | S30697 |
Methanol | Fisher Scientific | L6815 |
Kimwipes | Kimberly Clark | 34155 |
Incubator | Boekel Scientific | 133000 |
slide warmer | Fisher Scientific | 11-474-521 |
Immersion oil, Type A ND= 1.515 | Nikon | MXA20234 |
Nikon 90i microscope with DIC capabilities | Nikon | MBA 77000 |
Plan APO 100X oil objective | Nikon | MRD01901 |
Plan Achro 20X | Nikon | MRL00202 |
FITC filter | Nikon | 96302 |
DAPI filter | Nikon | 96301 |
X-cite fluorescence illuminator | Nikon | 87540 |
Lens paper | Nikon | 76997 |
Biohazard disposable bag | Fisher Scientific | 01-829D |
Biohazard sharps container | Fisher Scientific | 14-827-117 |
3 % hydrogen peroxide | VWR | BDH3540-2 |
Bleach | Fisher Scientific | 1952030 |
Wypall | Kimberly Clark | 34790 |